英国生物库队列中的遗传关联分析。进行了有害变异基因折叠分析,以测量 ANGPTL3、ANGPTL4 和 APOC3 失活与 CAD 的关联。使用固定效应 IVW 估计量将这些结果与先前的研究进行了荟萃分析。
方法:我们从欧洲血统最大的全基因组关联研究(GWAS)中选择了T1DM的遗传仪器和七个CVD进行MR分析。三种互补方法:使用逆差异加权(IVW),加权中位数和MR-Egger进行MR估计。通过
腹腔疾病在2019年冠状病毒疾病患者中表现出更高的患病率。然而,共同-19对乳糜泻的潜在影响仍然不确定。考虑了肠道微生物群改变,Covid-19和乳糜泻之间的显着关联,采用了两步的孟德尔随机方法来研究Covid-19和腹腔疾病之间的遗传因果关系,以及肠道菌群作为潜在的介体。我们采用了全基因组关联研究来选择与暴露有关的遗传仪器变量。随后,这些变量被用来评估Covid-19对腹腔疾病风险及其对肠道菌群的潜在影响的影响。采用两步的孟德尔随机方法实现了潜在因果关系的检查,包括:1)COVID-19感染,住院COVID-19和关键的Covid-19对腹腔疾病风险的影响; 2)肠道菌群对乳糜泻的影响; 3)肠道微生物群在covid-19和腹腔疾病风险之间的介导影响。我们的发现表明,临界值得联盟-19和腹腔疾病的风险升高(反向差异加权[IVW]:p = 0.035)之间存在显着关联。此外,我们观察到批评-19与victivallaceae的丰度之间存在逆相关性(IVW:p = 0.045)。值得注意的是,增加的维多拉曲科的丰度对腹腔疾病的风险具有保护作用(IVW:p = 0.016)。总而言之,我们的分析提供了支持关键covid-19和降低维多拉曲科的因果关系的遗传证据,从而增加了腹腔疾病的风险。
背景:调节免疫系统是影响疾病发展的肠道菌群(GM)的关键度量。GM在非小细胞肺癌(NSCLC)上的因果作用以及是否可以通过免疫细胞介导的因果关系仍然未知。方法:我们进行了两步,两样本的孟德尔随机研究,采用逆差异加权方法(IVW)方法研究了GM对NSCLC的因果作用以及GM和NSCLC缔合之间免疫细胞的介导效应。结果:MR分析确定了6属对NSCLC的保护作用(Bacteroides,Roseburia,Alistipes,Alistipes,甲烷抗逆转录病毒,Ruminocococcus Gauvreaeauii组和peptoccoccus)。此外,有暗示性与NSCLC相关的38个免疫细胞性状。值得注意的是,调解MR说明了肽属属在NSCLC上的因果作用(总效应IVW:OR = 0.790,95%CI [0.657,0.950],P = 0.012)在HLA DR + CD4 + CD4 + CD4 + panel(-05%CI(-05%)(-95%)(-95%CI)中,由CD45介导了很大的比例。 -0.005]; p = 0.037),占总效果的14.4%。结论:研究表明GM和NSCLC之间存在因果关系,这可能是由免疫细胞介导的。
在许多学科(例如个性化医学)中,随着时间的推移估算异质治疗效果(HTE)至关重要。现有的此任务的作品主要集中在基于模型的学习者上,这些学习者适应了特定的机器学习模型和调整机制。相比之下,模型不足的学习者(所谓的元学习者)在很大程度上没有探索。在我们的论文中,我们提出了几个元学习者,这些学习者可以与型号不合时宜,因此可以与任意机器学习模型(例如变形金刚)结合使用,以随着时间的推移估算HTES。然后,我们提供了一项全面的理论分析,该分析表征了不同的学习者,并使我们能够洞悉特定的学习者何时更可取。此外,我们提出了一种新颖的IVW-DR-LEARNER,即(i)使用双重稳健(DR)和正交损失; (ii)利用我们得出的逆变量权重(IVW),这些权重稳定了DR-als。由于DR-loss中的反质量反应产物,我们的IVW减小极端轨迹,导致估计方差较低。我们的IVW-DR-LEARNER在我们的实验中取得了卓越的性能,尤其是在重叠率较低和长期视野的方案中。
摘要背景:据信怀孕的高血糖与妊娠阴性结局有关。然而,由于传统观察性研究固有的局限性,建立糖尿病(DM)和不良怀孕结果之间的因果关系是具有挑战性的。方法:我们的研究使用了两样本的孟德尔随机化(MR)技术来检查植物前糖尿病(PGDM)对不良妊娠结局的可能影响。摘要级数据来自欧洲血统和Finngen Biobank的基因组广泛关联研究(GWAS)。主要分析采用了随机效应乘法逆差异加权(IVW)技术来评估PGDM和不良结果之间的因果关系。异质性和多效性。灵敏度分析。另外,应用了包括MR-Presso和RadialMR在内的离群检测技术。结果:IVW方法的结果表明,PGDM和死产(SB)之间没有显着因果关系(OR(SE)= 0.99(0.001); P值= 0.992),流产(MIS)(或(se)= 0.97(0.97(0.016); P值= 0.125); 0.125),和02.02(或02) p值= 0.014)。多效性和异质性测试没有发现SB,MIS和PTB多效性的证据(MR – Egger截距P值= 0.296、0.525和0.532),没有观察到的SB,MIS和PTB的异质性异质性(Q-P值0.992999929,and MIS和PTB值),没有观察到的异质性。分别为0.931、0.999和0.065)。结论:我们的发现表明,PGDM与MIS,SB和PTB的可能性之间没有直接的因果关系。关键字:堕胎,糖尿病,母体糖尿病,妊娠结局,早产,自发性,死产,这篇文章为:hantoushzadeh S,hantoushzadeh S,Zaki-Dizaji M,Zaki-Dizaji M,Habibi D,Habibi D,Sahebi L,Sahebi L,Saheidian L,Saeidian Ah,Saeidian Ah,Dashtkoo Hah,Dashtkoo Hai M.Et。孕育糖尿病和不良妊娠结果:孟德尔随机研究。伊朗大四。2025; 28(2):81-87。 doi:10.34172/aim.33461
简介:先前的研究报告了三甲胺N-氧化物(TMAO)和帕金森氏病(PD)之间的潜在关联。这项研究的目的是检查循环TMAO及其前体的水平与使用两样本的孟德尔随机化(MR)方法之间的潜在关系。材料和方法:我们从三个全基因组社会研究(国际帕金森氏病基因组学,帕金森氏病,帕金森的研究:有组织的遗传学计划和Genepd和Finngen)中汇总了数据,以提取与单核苷酸多态性(SNP)(SNP)与TMAO,Carnitine,Carnitine和Betnitine的循环浓度相关。这些SNP被用作随机效应模型中的仪器变量,以评估TMAO循环浓度及其前体的循环浓度与帕金森氏病的风险,并通过估计的优势比与伴随的95%置信区间来评估循环变量。主要分析采用了反向差异加权(IVW)方法,该方法与MR-Egger回归分析相辅相成。结果:使用IVW方法进行的分析,该方法汇总了三个数据库的数据,并未显示循环浓度TMAO及其前体之间的因果关系,并且PD的风险(P> 0.05)。MR-Egger分析的结果进一步证实了这一发现。灵敏度分析表明,结果不受任何偏见的影响,异质性测试表明SNP之间没有显着差异。有必要进行进一步的调查,以确定这种关联是否确实存在。结论:这项研究没有发现循环浓度或其原始物质与PD风险之间的因果关系的任何结论性证据。
图2 SGLT1/2抑制神经退行性疾病和T2D的影响的MR估计和森林图。星号(*)表示IVS选择从r 2 <0.3到r 2 <0.1的变化时的连锁不平衡参数。 NSNP,单核苷酸多态性的数量; PVAL,P值;或优势比; CI,置信区间; HBA1C,血红蛋白A1C; AD,阿尔茨海默氏病; PD,帕金森氏病; MS,多发性硬化症; ALS,肌萎缩性侧索硬化症; FTD,额颞痴呆; LBD,路易身体痴呆症; T2D,2型糖尿病; SGLT,钠 - 葡萄糖共转运蛋白; IVW,逆差异加权。
摘要背景:焦虑症是最常见的精神障碍之一,但其潜在的生物学机制尚未完全阐明。近年来,遗传决定的代谢物(GDM)已被用来揭示精神障碍的生物学机制。然而,这种策略还没有应用于焦虑症。在此,我们通过孟德尔随机化研究探索了GDM与焦虑症的因果关系,总体目标是揭示生物学机制。方法:实施双样本孟德尔随机化(MR)分析以评估GDM与焦虑症的因果关系。以486种代谢物的全基因组关联研究(GWAS)为暴露对象,以焦虑症的四个不同的GWAS数据集为结果对象。值得注意的是,所有数据集均来自公开数据库。使用遗传工具变量(IV)探索每种代谢物的代谢物与焦虑症之间的因果关系。采用 MR Steiger 过滤法检验代谢物与焦虑症之间的因果关系。首先采用标准逆方差加权 (IVW) 方法进行因果关系分析,随后采用另外三种 MR 方法(MR-Egger、加权中值和 MR-PRESSO(多效性残差和与异常值)方法)进行 MR 分析的敏感性分析。使用 MR-Egger 截距和 Cochran's Q 统计分析评估可能的异质性和多效性。使用 Bonferroni 校正确定因果关联特征(P < 1.03 × 10 –4)。此外,使用基于网络的 MetaboAnalyst 5.0 软件进行代谢途径分析。所有统计分析均在 R 软件中完成。本研究使用了 STROBE-MR 清单来报告 MR 研究。结果:在 MR 分析中,确定了 85 个具有显著因果关系的 GDM。其中,4 个不同的焦虑症数据集中有 11 种代谢物相互重叠。Bonferroni 校正显示 1-亚油酰甘油磷酸乙醇胺(OR 固定效应 IVW = 1.04;95% CI 1.021–1.06;P 固定效应 IVW = 4.3 × 10 –5 )是最可靠的因果代谢物。由于采用了“留一法”分析,即使没有单个 SNP,我们的结果仍然稳健。MR-Egger 截距检验表明遗传多效性对结果没有影响(截距 = − 0.0013,SE = 0.0006,P = 0.06)。Cochran Q 检验未检测到异质性(MR-Egger. Q = 7.68,P = 0.742;IVW. Q = 12.12,P = 0.436)。 MR Steiger 进行的方向性测试证实了我们对潜在因果方向的估计
背景:根据最近的研究,动脉粥样硬化和肠道菌群是相关的。尽管如此,已经发现肠道菌群随着研究而有所不同,其功能仍在争论中,并且这种关系并未被证明是因果关系。因此,我们的研究旨在在不同的分类学水平上识别关键的肠道菌群分类单元(GM分类单元),即门,阶级,秩序,秩序,家庭和属,以研究与动脉粥样硬化的任何潜在因果关系。方法:我们采用了来自肠道微生物群的Mibiogen联盟中的汇总数据来进行复杂的两样本Mendelian随机分析(MR)分析。有关动脉粥样硬化统计的相关信息是从Finngen Consortium R8出版物中获取的。评估因果关系,利用的主分析技术是反向方差加权(IVW)方法。补充IVW,采用了其他MR方法,包括加权中位数,MR-EGGER,加权方法和简单模式。敏感性分析涉及Cochrane的Q检验,MR-Egger截距测试,MR-Presso全球测试和剩余分析的应用。结果:最后,在对动脉粥样硬化的211 gm分类单元进行了211 gm分类单元的风险进行MR研究之后,我们发现了20个名义联系和一个牢固的因果关系。Firmicutes(门ID:1672)(几率(OR)= 0.852(0.763,0.950),p = 0.004)仍然与较低的冠状动脉粥样硬化发生率有关,即使在Bonferroni校正后,也是如此。这项研究可以通过关注肠道菌群来提供有关动脉粥样硬化的治疗目标的新见解。结论:基于发现的数据,确定菲洛姆·菲尼科特斯与冠状动脉粥样硬化的发生率降低表现出因果关系。