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“一种用于研究替代方案的 CRISPR-dCas13 RNA 编辑工具......
“一种用于研究可变剪接的 CRISPR-dCas13 RNA 编辑工具” Yaiza Núñez-Álvarez 1§*、Tristan Espie--Caullet 1,2,6§、Géraldine Buhagiar 2,6、Ane Rubio-Zulaika 3、Josune Alonso-Marañón 3、Elvira Perez-Luna 2,6、Lorea Blazquez 3-5、Reini F. Luco 1,2,6 * 1. 蒙彼利埃大学人类遗传学研究所，CNRS UMR9002，法国蒙彼利埃。 2. 巴黎萨克雷研究大学居里研究所，CNRS UMR3348，91401 奥赛，法国。 3. 西班牙Biogipuzkoa健康研究所神经科学系，20014圣塞瓦斯蒂安 4. 西班牙巴斯克科学基金会Ikerbasque，48009毕尔巴鄂5. CIBERNED，ISCIII（CIBER，西班牙科学与创新部卡洛斯三世研究所），28031 马德里，西班牙 6. 由抗癌联盟支持的团队。 § 这些作者贡献相同* 通讯作者：：ynunez@biotech-foods.com 和 reini.luco@curie.fr 摘要 可变剪接允许从同一基因产生多个转录本，从而使蛋白质库多样化，并在编码基因组有限的情况下获得新的功能。它可以影响多种生物过程，包括疾病。然而，由于在生理背景下剖析每个剪接异构体的精确作用的局限性，其重要性长期以来一直被低估。此外，识别关键调控元件以纠正有害的剪接异构体也同样具有挑战性，这增加了解决可变剪接在细胞生物学中的作用的难度。在这项工作中，我们利用 dCasRx（一种靶向 CRISPR-dCas13 直系同源物的催化无活性 RNA），以经济高效的方式有效地切换内源转录物的可变剪接模式，而不会影响整体基因表达水平。此外，我们展示了 dCasRx 剪接编辑系统的一个新应用，用于识别特定剪接事件的关键调控 RNA 元素。通过这种方法，我们正在扩展 RNA 工具包，以更好地了解可变剪接的调控机制及其在各种生物过程（包括病理状况）中的生理影响。关键词 可变剪接； CRISPR-dCas13，dCasRx；剪接编辑；顺式调节 RNA 元件、RNA 基序。
课程vitae
1998-2022访问教授，中心经济学和盖斯蒂安，弗朗索伊斯·德·佩特罗尔研究所（IFP学校），法国Rueil-Malmaison，2012-2013-2013：访问高级研究员，格兰瑟姆气候变化研究所，伦敦气候变化，2012年，英国伦敦经济学学院，2012年：巴塞罗那游客研究员，巴塞罗那陪同下：萨里能源经济中心（S.E.E.C.), Department of Economics, University of Surrey, Guildford, UK 2003: Visiting Professor, Thammasat University, Bangkok, Thailand 1998-2003: Visiting Research Fellow, Insititute for Advanced Studies Carinthia, Klagenfurt, Austria ADDITIONAL RESPONSIBILITIES (SELECTED): 2023-Present: Head, Energy Economics Division, Energy Studies Institute, NUS 2024 Advisor on Air Travel Demand, UK Climate Change Committee （CCC）2020-2022：审稿人，政府间气候变化小组（IPCC）2018年至今：科学委员会，能源历史杂志，2017 - 2022年负责人，增长与创新研究计划负责人，GRI，LSE 2014-2020：副编辑：新帕尔格雷夫词典，Ensial Paper Ensigy 2010-2013：Global Eveneral Insport，全球经济学评估：全球全球范围：全球范围：PRESTIC 1988888. http://repec.org/
高能物理的量子计算
1 欧洲核子研究中心 (CERN)，CH-1211 日内瓦，瑞士 2 CQTA，德国电子同步加速器 DESY，Platanenallee 6，15738 Zeuthen，德国 3 塞浦路斯研究所基于计算的科学技术研究中心，20，Constantinou Kavafi str.，2121 尼科西亚，塞浦路斯 4 IBM Quantum，IBM Research – 苏黎世，8803 R¨uschlikon，瑞士 5 塞浦路斯大学物理系，PO Box 20537，1678 尼科西亚，塞浦路斯 6 IBM Quantum，IBM Research - 1101 Kitchawan Rd，Yorktown Heights，NY，美国 7 LBNL 物理部门 - M/S 50A5104 1 Cyclotroner Rd Berkeley，CA，美国 8 德国电子同步加速器 DESY，Notkestrasse 85, 22607 汉堡，德国 9 亚琛工业大学，Templergraben 55, 52062 亚琛，德国 10 TIF 实验室，Dipartimento di Fisica，米兰大学和 INFN Sezione di Milano，意大利米兰 11 柏林洪堡大学物理学研究所，牛顿海峡15，12489 柏林，德国 12 ⟨ aQa L ⟩ 应用量子算法，莱顿，荷兰 13 橡树岭国家实验室物理分部，橡树岭，田纳西州，37831，美国 14 奥维耶多大学科学学院计算机科学系，33007，阿斯图里亚斯，西班牙 15 莱布尼茨汉诺威大学理论物理研究所，30167 汉诺威，德国 16 德国联邦物理技术研究院，38116 不伦瑞克，德国 17 跨学科研究领域“物质构建模块和基本相互作用”（TRA Matter）和亥姆霍兹辐射与核物理研究所（HISKP），波恩大学，Nußallee 14-16，53115 波恩，德国 18 大学理论物理研究所因斯布鲁克大学，6020 因斯布鲁克，奥地利 19 奥地利科学院量子光学与量子信息研究所，6020 因斯布鲁克，奥地利 20 德国慕尼黑大学物理系和阿诺德索末菲理论物理中心 21 德国慕尼黑量子科学与技术中心 22 洛桑联邦理工学院（EPFL）物理研究所，CH-1015 洛桑，瑞士 23 巴黎萨克雷大学，CNRS/IN2P3，IJCLab，91405 奥赛，法国 24 约克大学物理与天文系，加拿大安大略省多伦多，M3J 1P3 25 帕多瓦大学物理与天文系，V. Marzolo 8, I-35131 帕多瓦，意大利 26 INFN - Sezione di Padova，Via Marzolo 8，35131 帕多瓦，意大利 27 Nikhef – 国家亚原子物理研究所，科学园 105，1098 XG 阿姆斯特丹，荷兰 28 马斯特里赫特大学引力波与基础物理系，6200 MD 马斯特里赫特，荷兰 29 东京大学国际基本粒子物理中心 (ICEPP)，7-3-1 本乡，文京区，东京 113-0033，日本 30 IBM Quantum，IBM 德国研究与开发有限公司 - Schoenaicher Str. 220，71032 Boeblingen，德国 31 巴斯克地区大学 UPV/EHU 物理化学系，Box 644，48080 毕尔巴鄂，西班牙 32 多诺斯蒂亚国际物理中心，20018 多诺斯蒂亚-圣塞瓦斯蒂安，西班牙 33 EHU 量子中心，巴斯克大学 UPV/EHU，PO Box 644，48080 毕尔巴鄂，西班牙 34 IKERBASQUE，巴斯克科学基金会，Plaza Euskadi 5，48009 毕尔巴鄂，西班牙 35 特伦托大学物理系，via Sommarive 14, I–38123, Povo, 特伦托，意大利 36 INFN-TIFPA 特伦托基础物理和应用研究所，via Sommarive 14, I–38123，特伦托，意大利 37 Instituto Superior T´ecnico，Dep. F´ısica，葡萄牙里斯本 38 先进材料物理与工程中心 (CeFEMA)，Instituto Superior T´enico，葡萄牙里斯本， 39 材料与新兴技术物理实验室 (LaPMET)，葡萄牙 40 费米国家加速器实验室，Kirk and, Pine St, Batavia, IL 60510, USA 41 Instituut-Lorentz, Universiteit莱顿, PO Box 9506, 2300 RA Leiden, 荷兰