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“一种用于研究可变剪接的 CRISPR-dCas13 RNA 编辑工具” Yaiza Núñez-Álvarez 1§*、Tristan Espie--Caullet 1,2,6§、Géraldine Buhagiar 2,6、Ane Rubio-Zulaika 3、Josune Alonso-Marañón 3、Elvira Perez-Luna 2,6、Lorea Blazquez 3-5、Reini F. Luco 1,2,6 * 1. 蒙彼利埃大学人类遗传学研究所,CNRS UMR9002,法国蒙彼利埃。 2. 巴黎萨克雷研究大学居里研究所,CNRS UMR3348,91401 奥赛,法国。 3. 西班牙Biogipuzkoa健康研究所神经科学系,20014圣塞瓦斯蒂安 4. 西班牙巴斯克科学基金会Ikerbasque,48009毕尔巴鄂5. CIBERNED,ISCIII(CIBER,西班牙科学与创新部卡洛斯三世研究所),28031 马德里,西班牙 6. 由抗癌联盟支持的团队。 § 这些作者贡献相同* 通讯作者::ynunez@biotech-foods.com 和 reini.luco@curie.fr 摘要 可变剪接允许从同一基因产生多个转录本,从而使蛋白质库多样化,并在编码基因组有限的情况下获得新的功能。它可以影响多种生物过程,包括疾病。然而,由于在生理背景下剖析每个剪接异构体的精确作用的局限性,其重要性长期以来一直被低估。此外,识别关键调控元件以纠正有害的剪接异构体也同样具有挑战性,这增加了解决可变剪接在细胞生物学中的作用的难度。在这项工作中,我们利用 dCasRx(一种靶向 CRISPR-dCas13 直系同源物的催化无活性 RNA),以经济高效的方式有效地切换内源转录物的可变剪接模式,而不会影响整体基因表达水平。此外,我们展示了 dCasRx 剪接编辑系统的一个新应用,用于识别特定剪接事件的关键调控 RNA 元素。通过这种方法,我们正在扩展 RNA 工具包,以更好地了解可变剪接的调控机制及其在各种生物过程(包括病理状况)中的生理影响。关键词 可变剪接; CRISPR-dCas13,dCasRx;剪接编辑;顺式调节 RNA 元件、RNA 基序。

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