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推出用于活细胞分析的 Incucyte® AI 细胞健康分析软件模块
无标记细胞活力分析。用浓度不断增加的抗 CD20 抗体利妥昔单抗和生物仿制药 Truxima ® 处理 Ramos B 细胞淋巴瘤细胞系，并使用 Incucyte ® AI 细胞健康分析量化细胞死亡。生物仿制药 mAb 利妥昔单抗和 Truxima ® 诱导 Ramos 细胞死亡的功效相似。未经处理的细胞是健康的，被归类为活细胞（绿色分割），而经过处理的细胞则显示部分细胞死亡（红色分类）。
实时活细胞成像助力抗体药物偶联物成功开发
摘要 ADC 是一种新型疗法，可在癌症治疗中提供精准性和有效性。了解作用方式、抗体活性和细胞毒性药物的有效性将有助于生成新的 ADC。活细胞成像提供的多功能性（无论是通过 Incucyte 还是更高分辨率的旋转盘共聚焦显微镜）可用于捕捉成功药物设计的基本特征，并增加获得成功治疗候选药物的可能性。
细胞间CRISPR筛查显示癌细胞吞噬作用的调节剂
✉函数和材料请求应发给迈克尔·C·巴西克（Michael C. Bassik）。bassik@stanford.edu。作者贡献R.A.K.和M.C.B.构思并设计了这项研究。R.A.K. 为全基因组CRISPR筛选设计了癌症 - 巨噬细胞共培养系统。 R.A.K. 在S.L.的帮助下，在Ramos细胞和J774细胞中进行了CRISPR屏幕。 和K.S.和B.M. 在KARPAS-299细胞中进行了CRISPR屏幕。 Y.N. 在J.S.的建议下，在NSG小鼠中进行了体内小鼠实验。 a.m.m. 和A.A.B. 通过I.L.W.的建议进行了合成小鼠实验。 和F.V.-C。 D.F. 生成了APMAP同源模型。 J.A.S. 在C.C.的建议下分析了不同癌症类型中差异表达的TCGA数据。 L.J.-A. 分析了单细胞RNA-sequering数据。 R.A.K. 和M.G. 进行了incucyte分析以验证CRISPR淘汰赛。 R.A.K，M.G。 和S.L. 克隆的sgrna载体和产生的基因敲除细胞系。 R.A.K. 进行了蛋白质印迹，共聚焦显微镜和药物滴定。 M.G.，S.L。 和R.A.K. 进行了流式细胞仪分析。 R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。R.A.K.为全基因组CRISPR筛选设计了癌症 - 巨噬细胞共培养系统。R.A.K. 在S.L.的帮助下，在Ramos细胞和J774细胞中进行了CRISPR屏幕。 和K.S.和B.M. 在KARPAS-299细胞中进行了CRISPR屏幕。 Y.N. 在J.S.的建议下，在NSG小鼠中进行了体内小鼠实验。 a.m.m. 和A.A.B. 通过I.L.W.的建议进行了合成小鼠实验。 和F.V.-C。 D.F. 生成了APMAP同源模型。 J.A.S. 在C.C.的建议下分析了不同癌症类型中差异表达的TCGA数据。 L.J.-A. 分析了单细胞RNA-sequering数据。 R.A.K. 和M.G. 进行了incucyte分析以验证CRISPR淘汰赛。 R.A.K，M.G。 和S.L. 克隆的sgrna载体和产生的基因敲除细胞系。 R.A.K. 进行了蛋白质印迹，共聚焦显微镜和药物滴定。 M.G.，S.L。 和R.A.K. 进行了流式细胞仪分析。 R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。R.A.K.在S.L.的帮助下，在Ramos细胞和J774细胞中进行了CRISPR屏幕。和K.S.和B.M.在KARPAS-299细胞中进行了CRISPR屏幕。Y.N. 在J.S.的建议下，在NSG小鼠中进行了体内小鼠实验。 a.m.m. 和A.A.B. 通过I.L.W.的建议进行了合成小鼠实验。 和F.V.-C。 D.F. 生成了APMAP同源模型。 J.A.S. 在C.C.的建议下分析了不同癌症类型中差异表达的TCGA数据。 L.J.-A. 分析了单细胞RNA-sequering数据。 R.A.K. 和M.G. 进行了incucyte分析以验证CRISPR淘汰赛。 R.A.K，M.G。 和S.L. 克隆的sgrna载体和产生的基因敲除细胞系。 R.A.K. 进行了蛋白质印迹，共聚焦显微镜和药物滴定。 M.G.，S.L。 和R.A.K. 进行了流式细胞仪分析。 R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。Y.N.在J.S.的建议下，在NSG小鼠中进行了体内小鼠实验。a.m.m.和A.A.B.通过I.L.W.的建议进行了合成小鼠实验。和F.V.-C。 D.F.生成了APMAP同源模型。J.A.S. 在C.C.的建议下分析了不同癌症类型中差异表达的TCGA数据。 L.J.-A. 分析了单细胞RNA-sequering数据。 R.A.K. 和M.G. 进行了incucyte分析以验证CRISPR淘汰赛。 R.A.K，M.G。 和S.L. 克隆的sgrna载体和产生的基因敲除细胞系。 R.A.K. 进行了蛋白质印迹，共聚焦显微镜和药物滴定。 M.G.，S.L。 和R.A.K. 进行了流式细胞仪分析。 R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。J.A.S.在C.C.的建议下分析了不同癌症类型中差异表达的TCGA数据。L.J.-A. 分析了单细胞RNA-sequering数据。 R.A.K. 和M.G. 进行了incucyte分析以验证CRISPR淘汰赛。 R.A.K，M.G。 和S.L. 克隆的sgrna载体和产生的基因敲除细胞系。 R.A.K. 进行了蛋白质印迹，共聚焦显微镜和药物滴定。 M.G.，S.L。 和R.A.K. 进行了流式细胞仪分析。 R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。L.J.-A.分析了单细胞RNA-sequering数据。R.A.K. 和M.G. 进行了incucyte分析以验证CRISPR淘汰赛。 R.A.K，M.G。 和S.L. 克隆的sgrna载体和产生的基因敲除细胞系。 R.A.K. 进行了蛋白质印迹，共聚焦显微镜和药物滴定。 M.G.，S.L。 和R.A.K. 进行了流式细胞仪分析。 R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。R.A.K.和M.G.进行了incucyte分析以验证CRISPR淘汰赛。R.A.K，M.G。 和S.L. 克隆的sgrna载体和产生的基因敲除细胞系。 R.A.K. 进行了蛋白质印迹，共聚焦显微镜和药物滴定。 M.G.，S.L。 和R.A.K. 进行了流式细胞仪分析。 R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。R.A.K，M.G。和S.L.克隆的sgrna载体和产生的基因敲除细胞系。R.A.K. 进行了蛋白质印迹，共聚焦显微镜和药物滴定。 M.G.，S.L。 和R.A.K. 进行了流式细胞仪分析。 R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。R.A.K.进行了蛋白质印迹，共聚焦显微镜和药物滴定。M.G.，S.L。 和R.A.K. 进行了流式细胞仪分析。 R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。M.G.，S.L。和R.A.K.进行了流式细胞仪分析。R.A.K. 和S.L. 执行了RNA-sequest，D.Y. 和K.L. 分析了RNA测序数据。 D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。R.A.K.和S.L.执行了RNA-sequest，D.Y.和K.L.分析了RNA测序数据。D.Y. 帮助设计了寡核苷酸子图和K.S. 克隆了子图。D.Y.帮助设计了寡核苷酸子图和K.S.克隆了子图。R.A.K. 和M.C.B. 写了手稿。 所有作者都讨论了结果和手稿。R.A.K.和M.C.B.写了手稿。所有作者都讨论了结果和手稿。
使用人IPSC衍生的细胞类型的商业可用来源启用高通量3D细胞的测定
具有人IPSC衍生细胞类型的三维（3D）球体已成为一种有希望的药物筛查和疾病模型的体外模型系统。最近的出版物表明，IPSC衍生的皮质球体具有更大的“大脑般”复杂性，并且是HTS的强大测定平台。A.示意图，用于设计自己的ICELL神经球，用于“脑中的大脑”研究； B.细胞在ULA板上自组装，在24-28小时内形成3D结构； C.来自25K细胞输入的神经球直径约为400 µm。D. 384W中的图像，在incucyte上，带有掩模用于分析（黄色）或cal6染料； E.具有APOE 4/4细胞的AD疾病模型产生峰值计数较低和幅度较高的Ca2+痕迹。已知药物的治疗可以逆转表型。F. GFP-Microglia是优化共培养的有用工具；但是，并非所有条件都支持纳入MGL；一旦进入，该模型对于神经炎症很有用。
EDIT-202，一种多路复用 CRISPR-Cas12a 基因......
• 使用 SLEEK ™ 方法，用工程化的 AsCas12a 编辑 iPSC，敲入 CD16 和 mbIL-15。3 同时，还用 AsCas12a 编辑 iPSC，敲除 CISH 和 TGFβR2。然后将 iPSC 克隆分化为 iNK 细胞。流式细胞术证明 DKI iNK 细胞表面表达 CD16 和 mbIL-15。• 使用 Incucyte ® 成像 NucLight Red 标记的 SK-OV-3 细胞进行 3D 肿瘤球体杀伤试验，以评估 iNK 细胞的细胞毒性。通过在基础培养基中培养野生型 (WT) 和 DKI iNK 细胞 21 天（不含支持细胞因子）来测量体外持久性。 • 非肥胖糖尿病 (NOD) 严重联合免疫缺陷 (scid) γ (NSG) 小鼠接种 0.25x 10 6 荧光素酶 (luc) 表达 SKOV-3 细胞系 (SKOV-3-luc) 卵巢肿瘤细胞。小鼠接受单次腹膜内 (IP) 剂量 500 万 WT iNK 或 EDIT-202 细胞，多次 IP 剂量 2.5 mg/kg 曲妥珠单抗 (TRA)。使用 Perkin Elmer 生物发光体内成像系统 (IVIS) 计算肿瘤负荷。披露
转铁蛋白受体 1 靶向
(◀图 4) B. 与 pHrodo 染料结合的双环和转铁蛋白与细胞一起孵育 18 小时，并在 Incucyte 上进行分析。C. 和 D. 将 HT1080 细胞接种过夜。将细胞在无血清培养基中孵育 60 分钟，温度为 37 °C。对于 D. 细胞在 37 °C 下用载体 (0.1% DMSO) 或 Dyngo 4a (30 µM) 预处理 30 分钟。然后将细胞与结合的双环 (1.0 µM；红色) 在 4 °C 下孵育 1 小时。然后将细胞转移到 37 °C 下 1.5 分钟以进行内吞。洗涤后，在 -20 °C 下用 80% 丙酮固定和透化细胞 10 分钟。然后将细胞在 10% 山羊血清中封闭 1 小时，并用一抗 (指示) 标记。然后用二抗（绿色）和 Hoechst（蓝色）清洗细胞并标记。三重培养孔的代表性图像。放大 40 倍。（▲ 图 5）A. 和 B. 新鲜分离的人类近端曲小管细胞接种在 transwell 插入物中，Bicycles 测试浓度为 10μM。通过质谱法测量极化细胞的跨上皮吸收和分泌通量。结果标准化为基线 FITC 标记的转铁蛋白摄取（AB 和 BA）。测量单层完整性（80-120 Ω.cm 2 跨上皮电阻）作为质量控制。
Spheroscan：用于球体图像分析的用户友好的深度学习工具。
近年来的抽象背景，三维（3D）球体模型在科学研究中变得越来越流行，因为它们提供了一种与生理相关的微环境，可以模仿体内条件。与传统的二维细胞培养方法相比，它可以更好地了解3D球体测定法具有优势，因为它可以更好地了解细胞行为，药物功效和毒性。但是，使用3D球体测定法受到了用于球体图像分析的自动化和用户友好的工具的阻碍，这会对这些测定的可重复性和吞吐量产生不利影响。为解决这些问题的结果，我们开发了一种完全自动化的，基于Web的工具，称为Spheroscan，该工具使用了带有卷积神经网络（R-CNN）的名为“掩码区域”的深度学习框架进行图像检测和细分。为了开发一个可以从一系列实验条件中应用于球体图像的深度学习模型，我们使用使用Incucyte Live细胞分析系统和常规显微镜捕获的球体图像训练了该模型。使用验证和测试数据集对经过培训模型的性能评估显示出令人鼓舞的结果。结论Spheroscan允许轻松分析大量图像，并提供交互式可视化功能，以更深入地了解数据。我们的工具代表了球体图像分析的重大进步，并将促进科学研究中3D球体模型的广泛采用。可在https://github.com/funtionalurosology/spheroscan上获得有关Spheroscan的源代码和详细的Spheroscan教程。
高级别胶质瘤的潜在新治疗方法
摘要：已证实重新利用的药物在体外可成功治疗高级别胶质瘤；然而，由于体外模型不能真实反映临床情况，因此其临床成功率有限。在本研究中，我们使用了两种不同的患者来源的肿瘤碎片（肿瘤核心 (TC) 和肿瘤边缘 (TM)）来生成异质性、临床相关的体外模型，以评估重新利用的药物（伊立替康、匹伐他汀、双硫仑、葡萄糖酸铜、卡托普利、塞来昔布、伊曲康唑和噻氯匹定）组合是否可以成功治疗高级别胶质瘤，每种药物都针对不同的生长促进途径。为了确保我们数据的临床相关性，我们使用了来自 11 位不同患者的 TC 和 TM 样本。我们的数据表明，在 100 µ m 或更低的浓度下，所有药物组合的 LogIC 50 值均低于替莫唑胺，其中一种组合在治疗 6 天后使 5 个 TM 样本的细胞存活率降至 4% 以下，几乎根除了癌症。替莫唑胺在 14 天的测定中无法阻止肿瘤生长，而组合 1 可以阻止肿瘤生长，组合 2、3 和 4 在较高剂量下减缓了肿瘤生长。为了验证细胞毒性数据，我们使用了两种不同的测定方法，终点 MTT 和实时 IncuCyte 寿命分析，以评估组合对患者 3 的 TC 片段的细胞毒性，两种测定中的细胞存活率相当。局部施用针对高级别胶质瘤不同生长促进途径的再利用药物组合，有可能转化为临床治疗高级别胶质瘤的新型治疗策略。
第五届 RAS 倡议研讨会，2024 年 10 月 8 日至 10 日，马里兰州弗雷德里克
ERK 磷酸化。接种细胞，第二天用 BBO-11818 处理。处理后两小时，通过 HTRF 评估 pERK 磷酸化。3D 活力。接种细胞，并在球体形成后 3 天用 BBO-11818 处理。处理后 4 天，通过 CTG 评估活力。长期 2D 克隆形成试验。接种细胞，第二天用 BBO-11818、BBO-10203（PI3K ⍺：RAS 破坏剂）和西妥昔单抗处理并孵育 14 或 15 天。每两周更换一次培养基和化合物。通过 Incucyte 活细胞分析系统每天两次测量汇合度。药代动力学 (PK) 和药效学 (PD)。单次口服 BBO-11818 后，在 GP2d 皮下肿瘤模型中进行剂量和时间反应 PK/PD 分析。收集血浆和肿瘤，使用 MSD 进行 PK 和 pERK 分析。体内疗效和生存研究。在具有 KRAS G12D 或 KRAS G12V 突变的细胞系衍生异种移植 (CDX) 或同源模型中，以所示剂量水平每日两次 (BID) 口服给药后评估 BBO-11818 疗效。BBO-10203 每日一次 (QD) 口服给药。抗 PD-1 或西妥昔单抗每周两次 (BIW) 通过腹膜内给药。计算肿瘤生长抑制 (TGI)、平均肿瘤消退 (REG) 和完全消退 (CR) 数。BrdU 掺入和裂解 caspase-3 测定。在采集肿瘤前 2 小时，在指定时间点，对 Capan-2 肿瘤小鼠进行单次口服指定治疗，并腹膜内注射 50 mg/kg BrdU。制备福尔马林固定的肿瘤并切片。对 BrdU 和裂解 caspase-3 进行免疫组织化学 (IHC)，并对 BrdU 和裂解 caspase-3 的阳性染色进行定量，以分别测量肿瘤细胞增殖和凋亡的水平。统计分析：对克隆形成试验进行双向重复测量方差分析，随后进行事后 Tukey 多重比较检验，直至第 14 天或第 15 天。使用 Dunnett 检验对载体组或指定组进行 PD 和 IHC 研究的单向方差分析和对疗效研究进行双向重复测量方差分析。