2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 确诊病例数超过严重急性呼吸道综合征 (SARS),截至本文发表时,全球确诊病例已超过 73,435 例,死亡人数超过 2,000 人,几乎全部发生在中国。相比之下,2003 年的 SARS 导致 774 人死亡,同样主要发生在中国,中国是两次疫情的中心。COVID-19 和 SARS 都传播到各大洲,感染动物和人类,并使用类似的机制进入和感染细胞。在前线,对 COVID-19 的战术应对与 SARS 类似,但存在一个主要区别:在 SARS 爆发后的 17 年里,出现了一种强大的新工具,可能有助于将这种病毒控制在合理的范围内——即人工智能 (AI)。几乎没有人会否认人工智能正在引起医疗保健领域的范式转变,将人工智能应用于当前的 COVID-19 疫情可能会很有价值,例如,预测下一次疫情的地点。这一应用实际上就是加拿大公司 Blue Dot 尝试做的事情,因此被广泛报道为第一个在 12 月底披露疫情消息的组织。为应对最新疫情,出现了各种其他人工智能应用,包括 BenevolentAI 和伦敦帝国理工学院,它们报告称,一种获批用于治疗类风湿性关节炎的药物巴瑞替尼可能对这种病毒有效,而总部位于香港的 Insilico Medicine 最近宣布,其人工智能算法设计了六种可以阻止病毒复制的新分子。但人工智能在多大程度上真正达到了能够及时、大规模地提供有效见解和解决方案以帮助遏制当前疫情的程度?正如世卫组织传染病部门执行主任所说,
Ashmika Nagsen Shailaja Kamble 和 Akshata Arun Mitkar DOI:https://dx.doi.org/10.22271/phyto.2023.v12.i5d.14745 摘要 植物的使用可以补充当代制药技术,从而导致全球对传统药用植物的分析增加。随着计算机科学的进步,网络分析和筛选等计算机模拟方法已被广泛用于深入了解这些植物的药理作用机制。通过实施网络药理学、计算机模拟筛选和药代动力学筛选,可以增加候选药物中的活性物质数量,并揭示治疗植物的作用方式。本研究重点是利用瑞士 ADME 计算机模拟 ADME 工具对胡芦巴中存在的次级代谢产物进行药理学和药物遗传学表征。研究人员可利用这些研究的结果进行体外和体内研究,从而揭示传统草药的药理作用机制。关键词:药用植物,葫芦巴(Trigonella foenum-graecum),次生代谢产物,药理特性,瑞士 ADME 1. 简介古代文明拥有关于利用药用植物作为草药的广泛知识。在欠发达国家,超过 80% 的人口依赖传统医药,草药是维持生计、居住、穿衣、调味、芳香和药用的重要资源(Divya 和 Mini,2011;Manoj Kumar Mishra,2016;Gurib-Fakim,2006;和 Brijesh 和 Madhusudan,2015)[12, 31, 20, 3]。药用植物药物研发的探索取得了重大进展,并为各种药理学目标提供了重要见解,包括治疗癌症、疟疾、心血管疾病、糖尿病和神经系统疾病等疾病。古印度医学体系阿育吠陀推荐使用多种药用植物来治疗各种疾病。胡芦巴就是这样一种植物,在印地语中通常称为葫芦巴或 methi,因其药用价值而被利用。葫芦巴是一种豆科草本半干旱作物,属于豆科植物,以生产复杂的化学化合物而闻名。植物次生代谢产物是一组分子量较低的有机化合物,由植物合成,以促进与生物环境的相互作用并作为防御机制。这些次生代谢产物已显示出良好的治疗价值,并广泛应用于医疗实践。胡芦巴的具体用途已在多项研究中得到记录。这些特性包括其抗氧化活性(Dixit P 等人,2005 年)[13]、抗糖尿病活性(Shani J 等人,1974 年)[39]、抗癌特性(Kaviarasan S,Anuradha CV,2007) [25]、降低胆固醇作用 (Stark A, Madar Z,1993) [41]、抗菌活性 (Dash BK et al., 2011) [9]、改善消化 (Platel K, Srinivasan K, 2000)、保护胃肠道 (Platel K, Srinivasan K, 2000) [37]、治疗肥胖症 (Handa T et al., 2005) [21]、抗炎作用 (Sharififara F. et al.,2009) [40] 和抗高血压作用 (Talpur N. et al.,2005) [42]。通过建立快速便捷的化学成分预测途径并进行体内和体外药理学实验进行验证,可以显著提高评估药用植物化学活性的有效性 (Yi F et al ., 2016) [48] 。瑞士 ADME 网站是一个有价值的工具,它有助于计算物理化学描述符并预测小分子的 ADME 参数、药代动力学特性、类药性质和药物化学友好性。在本研究中,我们的目标是使用瑞士 ADME (http://www.swissadme.ch/index.php) 来评估个体 ADME 行为并解释结果。
高级数据科学家和生物信息学家 Intelligencia AI,希腊雅典 2023 年 - 分子特性(ADMET)预测;临床试验结果预测;癌症治疗反应预测;生物医学知识图谱 机器学习研究员 Insilico Medicine,阿联酋(远程) 2023 年 分子特性(ADMET)预测;梯度提升;循环神经网络 (RNN);不确定性量化;软件设计 高级机器学习工程师/技术主管 Deeplab,希腊雅典 2020 年 - 2022 年 使用图神经网络 (GNN) 进行早期药物发现的虚拟筛选 研发主管;项目管理(2 名机器学习工程师);研究实习生监督(5 名培训生);资金获取(NVIDIA 加速器计划 ∼ 20,000 欧元);JEDI Billion Molecules 抗击 COVID-19 竞赛(入围团队);传播(1 项专利申请;2 篇出版物);研究与实验(模型训练和数据管理);软件开发;与利益相关者的演示和交流 基于 EEG 的脑机接口 (BCI) 和深度神经网络 研发主管;算法团队工程管理(4 名 ML 工程师);项目管理;软件设计和架构 研究助理(博士后) 英国纽卡斯尔大学工程学院 2018–2020 上肢肌电假肢控制的运动和机器学习 研究助理(博士后) 英国爱丁堡大学信息学院 2017–2018 深度学习应用于密码学 软件工程师 英国爱丁堡大学社会与政治科学学院 2013–2016 神经政治研究中 fMRI 实验的软件设计和开发 助教/实验室演示者 英国爱丁堡大学信息学院 2013–2017 ML 与模式识别;概率建模与推理;入门应用 ML;数据挖掘与探索;神经计算研究助理 英国南安普顿大学声音与振动研究所 (ISVR) 2012 用于人工耳蜗用户降噪和增强语音清晰度的 ML 算法
• 员工:德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心,我担任该中心治疗学发现部门的副总裁兼临床开发主管,该部门对 DDR 和其他抑制剂有商业利益(IACS30380/ART0380 已授权给 Artios)• 担任以下公司的顾问:AbbVie、Acrivon、Adagene、Almac、Aduro、Amphista、Artios、Astex、AstraZeneca、Athena、Atrin、Avenzo、Avoro、Axiom、Baptist Health Systems、Bayer、Beigene、BioCity Pharma、Blueprint、Boxer、Bristol Myers Squibb、C4 Therapeutics、Calithera、Cancer Research UK、Carrick Therapeutics、Circle Pharma、Clovis、Cybrexa、Daiichi Sankyo、Dark Blue Therapeutics、Diffusion、Duke Street Bio、858 Therapeutics、EcoR1 Capital、Ellipses Pharma、EMD Serono、 Entos、F-Star、Genesis Therapeutics、Genmab、Glenmark、GLG、Globe Life Sciences、GSK、Guidepoint、Ideaya Biosciences、Idience、Ignyta、I-Mab、ImmuneSensor、Impact Therapeutics、Institut Gustave Roussy、Intellisphere、Jansen、Kyn、MEI pharma、Mereo、Merck、Merit、Monte Rosa Therapeutics、Natera、Nested Therapeutics、Nexys、Nimbus、Novocure、Odyssey、OHSU、OncoSec、Ono Pharma、Onxeo、PanAngium Therapeutics、Pegascy、PER、辉瑞、Piper-Sandler、Pliant Therapeutics、Prolynx、Radiopharma Theranostics、Repare、resTORbio、罗氏、Ryvu Therapeutics、SAKK、赛诺菲、Schrodinger、施维雅、 Synnovation、Synthis Therapeutics、Tango、TCG Crossover、TD2、Terremoto Biosciences、Tessellate Bio、Theragnostics、Terns Pharmaceuticals、Tolremo、Tome、Thryv Therapeutics、Trevarx Biomedical、Varian、Veeva、Versant、Vibliome、Voronoi Inc、Xinthera、Zai Labs 和 ZielBio • 资助/研究支持来自:Acrivon、Artios、AstraZeneca、Bayer、Beigene、BioNTech、Blueprint、BMS、Boundless Bio、Clovis、Constellation、Cyteir、Eli Lilly、EMD Serono、Forbius、F-Star、GlaxoSmithKline、Genentech、Haihe、Ideaya ImmuneSensor、Insilico Medicine、Ionis、Ipsen、Jounce、Karyopharm、KSQ、Kyowa、Merck、Mirati、Novartis、Pfizer、Ribon Therapeutics、Regeneron、Repare、Rubius、Sanofi、Scholar Rock、Seattle Genetics、Tango、Tesaro、Vivace 和 Zenith • 股东:Seagen
Student¹,助理教授,校长1。摘要:医学设计,发现和钦佩的计算方法。一般而言,医学发现大约需要12次和比隆的资本时间。它包括创建新的动作,将靶向蛋白质靶向,分析分子贸易,估计结合强度和药品包裹。计算机支持的药物设计(CADD)具有成本效益,并且没有一些自然试验。结构接地医学设计(SBDD)和配体接地医学设计(LBDD)是计算机支持的医学设计(CADD)方法的两种类型。sbdd样式剖析了大分子靶标3维结构信息(通常是蛋白质或RNA),以识别至关重要的斑点和关系,这些斑点和关系对于它们的独立自然功能很重要。LBDD样式集中在已知的抗生素配体上,以建立其生理化学包裹与抗生素条件之间的关系,这些抗生素与抗生素条件相关的抗生素调节是一种结构 - 劳存关系(SAR),可用于优化已知药物或指导新药物与高级劳动的设计的信息。关键字:计算机辅助药物设计,Inimilico设计,配体,药物发现3.介绍:几个抗生素胶囊可用,机械使用的杏仁时间比其他最大胶囊的时间更长,人类与环绕的微型有机体对感染的斗争是正在进行的,并且可能正在进行中,并且可能是为了供您使用。为此做出贡献是抗生素耐药性的一致上推力,导致需要品牌打屁股的新抗生素(1,2).closer来设计最近的抗生素,计算机辅助药物布局(CADD)可以与湿行战略相结合,以阐明湿lab策略以阐明耐药的目标,以搜索新的目标,并搜索新的小说和新的小说。解决抗生素耐药性问题的重要机会是确定最近的抗生素目标,该目标构成了对细菌生存至关重要的新型机制。作为一个实例,研究人员的生物信息学策略在计算上显示了许多数据库,并认识到7种参与细菌代谢途径的酶,除了在麦膜上放置在膜上的15种非同顺型蛋白质外,在gram nice细菌中,葡萄球菌(SA),这表明它们是潜在的目的。这种发现也可能有助于克服这种细菌常见抗生素的抗性,例如甲氧西林,氟喹诺酮类和黄唑烷酮。如今,诊断为新型抗生素靶标的A的一个例子是蛋白质血红素氧酶,与细菌的血红素代谢有关,以吸引铁。已有效地应用了CADD技术,以发现铜绿假单胞菌和奈瑟氏菌脑膜化肽的细菌血红素氧酶的抑制剂,从而使血红素氧酶作为抗菌对象的潜在位置(4,5)。
我们感谢参加TRESR和/或ATTACC的患者的无私和愿意参加临床研究。我们感谢整个Camonsertib研究团队对TRESR RP-3500-01和ATTACC RP-3500-03的贡献。我们还要感谢我们的合作伙伴实验室,《守护者》(Guardant Health)为这项研究提供的技术帮助和数据生成。我们感谢全球主要公司Onyx在排版和准备海报方面的支持。E.R是一名研究研究者。 J.S.R-F是一名研究研究员;并收到了高盛,Paige.ai,Repare Therapeutics和Persantis的咨询费;是Volition RX,Paige.ai,Repare Therapeutics,Personis和Bain Capital的科学咨询委员会的成员;是Grupo Oncoclinicas董事会成员;并且是Roche Tissue Diagnostics,Ventana Medical Systems,Astrazeneca,Daiichi Sankyo和Merck Sharp&Dohme的科学咨询委员会的临时成员。 B.A.C已通过阿斯利康,Abbvie,Actaute Therapeutics,Astellas,Bayer,Draginfly Therapeutics,Pfizer和Repare and then the Pepepeutics获得了Astrazeneca,Actaute Therapeutics,Actaute Therapeutics,Actaute Therapeutics,Actautics Therapeutics,并获得了研究资金。 s.l已从默克,阿斯利康,雷金伦,罗氏,雷神治疗,葛兰素史克林和西根获得了其机构的赠款或合同; Novocure,Merck,Astrazeneca,Glaxosmithkline,Eisai和Shattuck Labs获得的咨询费;付款或荣誉奖,以进行讲座,演讲,发言人的局,手稿写作或来自阿斯利康,葛兰素史克林和Eisai/Merck的教育活动;并参与Astrazeneca的数据安全监控委员会或顾问委员会。 A.Y. ,E.L。 ,M.CA.E.R是一名研究研究者。J.S.R-F是一名研究研究员;并收到了高盛,Paige.ai,Repare Therapeutics和Persantis的咨询费;是Volition RX,Paige.ai,Repare Therapeutics,Personis和Bain Capital的科学咨询委员会的成员;是Grupo Oncoclinicas董事会成员;并且是Roche Tissue Diagnostics,Ventana Medical Systems,Astrazeneca,Daiichi Sankyo和Merck Sharp&Dohme的科学咨询委员会的临时成员。B.A.C已通过阿斯利康,Abbvie,Actaute Therapeutics,Astellas,Bayer,Draginfly Therapeutics,Pfizer和Repare and then the Pepepeutics获得了Astrazeneca,Actaute Therapeutics,Actaute Therapeutics,Actaute Therapeutics,Actautics Therapeutics,并获得了研究资金。s.l已从默克,阿斯利康,雷金伦,罗氏,雷神治疗,葛兰素史克林和西根获得了其机构的赠款或合同; Novocure,Merck,Astrazeneca,Glaxosmithkline,Eisai和Shattuck Labs获得的咨询费;付款或荣誉奖,以进行讲座,演讲,发言人的局,手稿写作或来自阿斯利康,葛兰素史克林和Eisai/Merck的教育活动;并参与Astrazeneca的数据安全监控委员会或顾问委员会。A.Y. ,E.L。 ,M.CA.A.Y.,E.L。 ,M.CA.,E.L。 ,M.CA.M.CE已获得国家癌症研究所(NCI)指导的临床科学家研究职业发展奖;拜耳制药,DAVA肿瘤学,Taiho Pharmaceuticals,Seattle Genetics,Macrogenics和Daiichi Sankyo的个人费用;并持有Parthenon Therapeutics的股票期权。B.H已从Eisai获得酬金;曾在Amgen担任咨询或咨询角色;并从:Repare Therapeutics(Inst),Ideaya Biosciences(Inst),Amgen(Inst),Revolution Medicines(Inst),Astellas Pharma(Inst)获得研究资金。和S.Z.是监护人的雇员。D.U. ,I.K。 ,I.M.S。 ,J.D.S,J.Y,K.F,M.K,P.N,S.S,V.R和Y.X是Repare的员工,可能会持有股票和/或股票期权。 联系人:Ian Silverman(Isilverman@reparerx.com)缩写D.U.,I.K。 ,I.M.S。 ,J.D.S,J.Y,K.F,M.K,P.N,S.S,V.R和Y.X是Repare的员工,可能会持有股票和/或股票期权。 联系人:Ian Silverman(Isilverman@reparerx.com)缩写,I.K。,I.M.S。 ,J.D.S,J.Y,K.F,M.K,P.N,S.S,V.R和Y.X是Repare的员工,可能会持有股票和/或股票期权。 联系人:Ian Silverman(Isilverman@reparerx.com)缩写,I.M.S。 ,J.D.S,J.Y,K.F,M.K,P.N,S.S,V.R和Y.X是Repare的员工,可能会持有股票和/或股票期权。联系人:Ian Silverman(Isilverman@reparerx.com)缩写