•KAPA终端维修和A-tailing(Erat)readymix•KAPA连接redymix•KAPA HIFI HOTSTART READYMIX(2 x)
2. Roche Sequencing Solutions, Inc. KAPA HyperCap Design Share NHL 面板基因列表。访问日期:2023 年 10 月 23 日。https://sequencing.roche.com/content/dam/diagnostics_microsites/sequencing/master-blueprint/en/resources/pdfs/sell-sheets/kapa-hypercap-ds-nhl-panel-gene-list.pdf 3. Bermejo C、Agarwal P、Chien R 等人。KAPA HyperCap Design Share NHL 面板可实现对非霍奇金淋巴瘤循环肿瘤 DNA 的高灵敏度纵向检测。罗氏白皮书。访问日期:2023 年 10 月 23 日。https://sequencing.roche.com/content/dam/diagnostics_microsites/sequencing/master-blueprint/en/resources/pdfs/white-papers/longitudinal-detection-of-circulating-t umor-dna-white-paper-mc--11981.pdf 4. Chien, R. KAPA 生物信息学分析用于纵向检测循环肿瘤 DNA。罗氏白皮书。访问日期:2023 年 10 月 23 日。https://sequencing.roche.com/content/dam/diagnostics_microsites/sequencing/master-blueprint/en/resources/pdfs/white-papers/kapa-bioinformatics-analysis-for-longit udinal-detection-of-circulating-tumor-dna-white-paper-mc--12095.pdf 5. Roche Sequencing Solutions, Inc. (2021)。KAPA HyperCap cfDNA 工作流程 v1.1:使用说明。访问日期:2023 年 10 月 23 日。https://elabdoc-prod.roche.com/eLD/api/downloads/cbc03242-4122-ec11-0b91-005056a772fd?countryIsoCode=pi 6 Roche Sequencing Solutions Inc (2023) KAPA HyperCap Workflow v3 4:使用说明 访问日期:2023 年 10 月 23 日
图3。有效的转换可提供高库的产量,而不会放大。使用多种市售解决方案构建了无PCR WGS库:KAPA HyperPrep(超声控制),WatchMaker DNA库准备碎片,Kapa Exprus,Kapa Evoplus,Kapa Evoplus,Nebnext Ultra Ultra II FS DNA库Prep和Illumina DNA Prep。Na12878人类基因组DNA的300 ng(所有评估套件)或75 ng(仅钟表者)被用作输入。工作流程进行了优化,通过调整碎片和结合后清理参数来提供类似尺寸的最终库。(a)使用Novaseq 6000输出数据绘制插入大小分布。(b)最终无PCR库的产量,如qPCR所测量。制表剂解决方案提供适用于WGS的插入大小,而无需锯齿状图案,并且产量超过了其他准备,包括超声处理。
a) OMV b) Todd Energy c) Liquigas d) KineƟc Well Services Ltd e) Horizon Energy Services Limited f) Port Taranaki g) Marshall Projects h) Technix i) Western Energy Services Ltd j) Tegel k) Beach Energy l) Westside m) Flexgas n) New Plymouth Underwater o) Warner ConstrucƟon p) Kapa SoluƟons q) Dynamech r) Condor Energy
GoTaq® Endure qPCR 在抑制剂丰富的样品中表现出色,即使在具有挑战性的条件下也能保证一致可靠的扩增。抑制剂以所示浓度加入,并使用 300bp DNA 靶标进行扩增。表格显示了平均 ΔCq 值,表示有抑制剂的反应和无抑制剂的反应之间的 Cq 差异。竞争产品 B1(SsoAdvanced Universal Probe Supermix)、R1(KAPA Probe Force)、Q1(PerfeCTa qPCR ToughMix)、T1(Path-ID™ qPCR Master Mix)表现出更大的可变性,而 GoTaq® Endure 保持了一致的结果。
图 3. 与手动提取相比,从 MagNA Pure 24 和 MagNA Pure 96 系统提取的 cfDNA 具有更高的测序覆盖率和更少的重复读取。使用 MagNA Pure 24 cf ds 4000 hp 方案、MagNA Pure 96 cfdna ds 4000 方案或手动方案,从 4 mL 血浆中分离的 cfDNA 制备靶标富集文库。使用 KAPA HyperPrep Kit 和 SeqCap EZ Human Oncology Panel (2.75 Mb),将每个样本的 cfDNA 总产量用作 HyperCap 2.0 工作流程的输入。在捕获靶标之前,对文库进行多路复用;每次捕获都包含从三个提取工作流程中获得的样本。在 NextSeq 500 (2 x 75 bp) 上进行测序。在分析之前,将原始读取随机下采样至 6M。每个条形图代表 5 次重复提取的平均值;误差线表示标准差。
Nils R. Sandell Jr. 博士主席独立顾问专业知识指挥与控制;通信;制导、导航与控制;信息融合与管理;ISR、跟踪与识别;低可观测性;建模、仿真与分析;科技管理;系统工程 经验 独立顾问 2016 年至今 国防高级研究计划局战略技术办公室主任,2013 年 - 2016 年 独立顾问 2010 年 - 2013 年 BAE 系统公司先进信息技术副总裁,2004 年 - 2010 年 ALPHATECH INC. 总裁兼首席执行官,1979 年 - 2004 年 麻省理工学院 电气工程和计算机科学副教授,1976 年 - 1979 年 电气工程和计算机科学助理教授,1974 年 - 1976 年 教育 麻省理工学院 电气工程博士 电气工程硕士 明尼苏达大学 电气工程学士 荣誉 美国自动控制委员会 Donald P. Eckman 奖 美国空军指挥官公共服务奖 美国国防部杰出公共服务奖 Eta Kapa Nu;Tau Beta Pi