免疫系统中主要的组织相容性复合物(MHC)I类和II类分子的关键作用已得到很好的确定。本研究旨在开发一种新型的机器学习框架,用于通过MHC I类和II类分子预测抗原肽表现。通过整合大规模质谱数据和其他相关数据类型,我们基于深度学习提供了预测模型ONMIMHC。我们使用独立的测试集对其性能进行了严格的评估,ONMIMHC在MHC-I任务中的PR-AUC得分为0.854,Top20%-PPV为0.934,这表现优于现有方法。同样,在MHC-II预测的域中,我们的模型ONMIMHC的PR-AUC得分为0.606,TOP20%-PPV为0.690,表现出优于其他基线方法。这些结果证明了我们模型ONMIMHC在准确预测MHC-I和MHC-II分子之间的肽MHC结合后的优势。凭借其出色的准确性和预测能力,我们的模型不仅在一般的预测任务中出色,而且在预测新抗原针对特定癌症类型的新抗原方面也取得了显着的结果。特别是对于子宫菌群子宫内膜癌(UCEC),我们的模型成功地预测了新抗原,对普通人类等位基因具有很高的结合概率。这一发现对于开发针对UCEC的个性化肿瘤疫苗非常重要。
Simeon C. Calvert * * S.C.Calvert@tudelft.nl;部门 运输与规划;代尔夫特技术大学,荷兰Stevinweg 1,2628cn,Delft,荷兰。 orcid:0000-0002-1173-0071本作者的论文版本已在日记的允许下获得,目前正在审查和出版过程中。 摘要 - 本文提出了对自治系统进行有意义的人类控制(MHC)操作的一致性,并提出了用于MHC的操作原理并引入了其应用程序的通用框架。 在实践中使用了多种不同看似分歧的扩展,用于使用MHC,这项工作旨在在实践中带来一致性和融合使用。 在各个领域的自治系统的增加集成强调了维持人类控制的迫切需要,以确保负责任的安全,问责制和这些系统的道德操作。 MHC的概念为人类对自主系统的控制和评估提供了理想的概念,同时考虑了人类和技术能力。 通过对各个领域和相关概念的现有文献和调查的分析,MHC操作的原则是为旨在在其系统中实施MHC的研究人员和从业人员提供的切实准则。 所提出的框架剖析了系统及其子系统的通用组件与不同级别的自主技术附近的不同代理,利益相关者和过程保持一致。Simeon C. Calvert * * S.C.Calvert@tudelft.nl;部门运输与规划;代尔夫特技术大学,荷兰Stevinweg 1,2628cn,Delft,荷兰。orcid:0000-0002-1173-0071本作者的论文版本已在日记的允许下获得,目前正在审查和出版过程中。摘要 - 本文提出了对自治系统进行有意义的人类控制(MHC)操作的一致性,并提出了用于MHC的操作原理并引入了其应用程序的通用框架。在实践中使用了多种不同看似分歧的扩展,用于使用MHC,这项工作旨在在实践中带来一致性和融合使用。在各个领域的自治系统的增加集成强调了维持人类控制的迫切需要,以确保负责任的安全,问责制和这些系统的道德操作。MHC的概念为人类对自主系统的控制和评估提供了理想的概念,同时考虑了人类和技术能力。通过对各个领域和相关概念的现有文献和调查的分析,MHC操作的原则是为旨在在其系统中实施MHC的研究人员和从业人员提供的切实准则。所提出的框架剖析了系统及其子系统的通用组件与不同级别的自主技术附近的不同代理,利益相关者和过程保持一致。该框架是域 - 不可思议的,强调了MHC原则的普遍适用性,而与技术背景无关,为更安全,更负责任的自主系统铺平了道路。关键字:有意义的人类控制;自主系统;人机相互作用;道德AI
尖端技术疫苗组学是免疫遗传学和免疫基因组学两门学科与系统生物学和免疫分析知识的结合,用于设计针对传染病的疫苗。在我们目前的研究中,我们结合 B 细胞和 T 细胞表位预测,然后进行分子对接,研发了一种针对 β 冠状病毒非结构蛋白 4 的基于表位的肽疫苗。在这里,我们收集了 β 冠状病毒同源非结构蛋白 4 的蛋白质序列,并通过系统发育研究调查其中存在的保守区域,以确定蛋白质最具免疫原性的部分。在目标蛋白质的已识别区域中,来自 38-47 区域的肽序列 IRNTTNPSAR 和来自 76-90 位置的序列 PTDTYTSVYLGKFRG 分别被视为最潜在的 B 细胞和 T 细胞表位。此外,该预测的T细胞表位PTDTYTSVY和PTDTYTSVYLGKFRG分别与MHC等位基因蛋白HLA-A*01:01和HLA-DRB5*01:01相互作用,IC 50值较低。这些表位与MHC I分子和MHC II分子的α螺旋表位结合槽完美契合,结合能分别为-725.0 Kcal/mole和-786.0 Kcal/mole,显示出与MHC分子结合的稳定性。该MHC限制性表位PTDTYTSVY在世界人口覆盖率中也显示出50.16%的良好保守性。该MHC I HLA-A*01:01等位基因也存在于58.87%的中国人口中。因此,经过进一步的实验研究,表位IRNTTNPSAR和PTDTYTSVYLGKFRG可被视为冠状病毒肽基疫苗的潜在肽。
MHC还支持社区团体和组织利用当地媒体机会进一步扩大竞选活动的影响力。定制资产(例如海报,广播广告),MHC很乐意协助可行的开发。任何使用药物意识徽标或消息传递的新通信资产都需要由MHC批准。请与您的社区支持与发展计划团队代表联系以下信息,以支持及时批准。1。出版物的目的。2。目标受众。3。您打算交流的关键消息。4。在哪里/如何使用资产。5。它将用于多长时间。6。当您需要批准时。
关于麦格劳-希尔建筑麦格劳-希尔建筑 (MHC) 是麦格劳-希尔公司的一部分,它将设计和建筑行业的人员、项目和产品联系在一起,为业主、建筑师、工程师、总承包商、分包商、建筑产品制造商、供应商、经销商、分销商和邻近市场提供服务。一个多世纪以来,MHC 一直是可靠和值得信赖的信息来源,也是北美领先的建筑项目和产品信息、计划和规范、行业新闻、市场研究以及行业趋势和预测提供商。近年来,MHC 还成为可持续性和互操作性等关键领域的行业领导者。通过印刷版、在线版和活动,MHC 提供各种工具、应用程序和资源,嵌入客户的工作流程中,为他们提供提高生产力、成功率和竞争力所需的信息和情报。麦格劳-希尔建筑公司凭借 Dodge、Sweets、《建筑实录》、《工程新闻记录》(ENR)、GreenSource 和 SNAP 的强大支持,为全球建筑行业超过一百万客户提供服务。如需了解更多信息,请访问 www.construction.com。
利用免疫系统治疗恶性肿瘤已成为癌症疗法的强大工具,近年来,FDA批准的免疫疗法爆炸了。作为针对肿瘤的细胞毒性活性的主要介质,CD8 T细胞是当前治疗的重点,例如免疫检查点抑制(1),CAR-T细胞疗法(2)和癌症疫苗(3)。有效的CD8 T细胞反应的产生是一个复杂的过程,涉及免疫系统的多个组成部分。树突状细胞(DCS)在有效的CD8 T细胞反应对肿瘤的策划中起着核心作用(4,5)。在最基本的水平上,T细胞介导的抗癌免疫反应集中在DC抗原表现周围。此过程始于肿瘤衍生的抗原的直流捕获,这些抗原被细胞内载于MHC分子。然后将这些肽MHC复合物(PMHC)转运到细胞表面,以启动并激活肿瘤流血淋巴结内的效应T细胞。虽然在DCS Primes CD8 T细胞上加载到MHC I类分子上的抗原,而MHC II类分子对抗原的呈现可以启用CD4 T助手(Th)细胞。“ CD4帮助”,特别是
关于麦格劳-希尔建筑 麦格劳-希尔建筑 (MHC) 是麦格劳-希尔公司旗下子公司,连接设计和建筑行业的人员、项目和产品,为业主、建筑师、工程师、总承包商、分包商、建筑产品制造商、供应商、经销商、分销商和邻近市场提供服务。一个多世纪以来,MHC 一直是可靠和值得信赖的来源,一直是北美领先的建筑项目和产品信息、计划和规范、行业新闻、市场研究以及行业趋势和预测提供商。近年来,MHC 已成为可持续性和互操作性等关键领域的行业领导者。通过印刷版、在线版和活动版,MHC 提供各种工具、应用程序和资源,嵌入到客户的工作流程中,为他们提供提高生产力、成功率和竞争力所需的信息和情报。凭借 Dodge、Sweets、《建筑实录》、《工程新闻记录》(ENR)、GreenSource 和 SNAP 的支持,麦格劳-希尔建筑公司为全球建筑界的 100 多万客户提供服务。要了解更多信息,请访问我们的网站 www.construction.com。
肽与主要组织相容性复合物(MHC)分子之间的相互作用在自身免疫,病原体识别和肿瘤免疫方面是关键的。癌症免疫疗法的最新进展需求需要更准确的MHC结合肽计算预测。我们解决了与MHC结合的肽预测的普遍性挑战,从而揭示了当前基于序列的方法的局限性。我们利用几何深度学习(GDL)的基于结构的方法表明,在看不见的MHC等位基因的普遍性方面有望提高。此外,我们通过在结构(3D-SSL)上引入一种自我监督的学习方法来解决数据效率。在不暴露于任何绑定亲和力数据的情况下,我们的3D-SSL优于基于序列的方法,该方法在〜90倍的数据点上训练。最后,我们证明了基于结构的GDL方法对乙型肝炎病毒疫苗免疫肽疗法案例研究的结合数据的偏见。这项概念验证研究强调了基于结构的方法增强通用性和数据效率的潜力,对数据密集型领域(如T细胞受体特异性预测预测)具有重要意义,为增强对免疫反应的理解和操纵铺平了道路。
未来的运营环境可能需要在决策过程中有效地整合人类和人工智能 (AI) 系统。随着这些基于 AI 的系统被采用,确保大数据分析和决策支持系统保持适当的人类控制将变得越来越重要。有意义的人类控制 (MHC) 可以描述为及时做出明智的选择以影响基于 AI 的系统的能力,从而实现最佳的运营结果。有许多因素促成 MHC,包括选择自由和人类对情况和系统的充分理解。因此,为了确保适当应用 MHC,未来的敏捷指挥和控制系统设计将需要充分考虑人类判断和决策要求。在过去的一年里,北约 HFM-ET-178 探索了与 MHC 相关的广泛人为因素问题,并同意在计划于 2020 年举行的后续北约研讨会上调查其中的一部分。虽然由 HFM 小组领导,但未来的活动将跨小组进行,以产生全面的解决方案。本文讨论了在军事、人工智能系统中保持人为控制的重要性。它基于北约 HFM178 探索团队成员在 12 个月内开展的工作,旨在鼓励未来北约小组和活动之间的联系。
癌症是全球死亡的主要原因,常规治疗痛苦,复杂,对健康细胞产生负面影响。然而,癌症免疫疗法已成为一种有希望的交流。癌症免疫疗法的原理是对T细胞的重新激活,以抵抗在主要组织相容性复合物(MHC)上呈现肽抗原的肿瘤。这些肽抗原被鉴定出一组涉及免疫肽疗法学的OMICS技术,蛋白质组学,基因组学和生物信息学。的确,免疫肽学可以识别对癌症免疫疗法非常有用的新抗原。本综述探讨了免疫肽学对各种免疫疗法的使用,即基于肽的疫苗,免疫检查点抑制剂,溶瘤病毒和嵌合抗原受体T细胞。我们还讨论了新抗原的多样性如何允许发现新型的抗原肽,而后翻译后修饰的肽多样化的总体肽与MHC或所谓的MHC Ligandome结合。免疫肽学的发展正在保持最新和非常活跃,尤其是对于临床应用。免疫肽学有望快速,准确且可靠,可用于癌症免疫疗法。