在线https://mpra.ub.uni-muenchen.de/119193/ mpra纸编号119193,发布于2023年11月28日15:45 UTC
在线https://mpra.ub.uni-muenchen.de/120157/ mpra纸编号120157,发布21 2月21日,2024年10:19 UTC
日期:2023 年 8 月 28 日 致:参与者、受益人、退休人员、参与雇主、钢铁承包商协会、克利夫兰建筑雇主协会和国际桥梁、结构和装饰铁工人协会第 17 分会,俄亥俄州克利夫兰。2006 年《养老金保护法案》(“PPA”)是一部联邦法律,它修订了《雇员退休收入保障法》和《国内税收法典》,除其他事项外,还根据计划的精算状况对多雇主养老金计划施加了额外的资金规则。PPA 要求精算师对多雇主养老金计划进行评估,以确定养老金计划是否存在当前或预计的资金不足。对于钢铁工人地方工会 17 号退休基金 (“退休基金”),精算师证明该退休基金在 2008 年 5 月 1 日至 2015 年 4 月 30 日期间每年都处于危急状态。自 2015 年和 2016 年计划年度起,退休基金被认定为处于危急和衰退状态。2017 年 2 月 1 日,根据 MPRA 授权的暂停计划实施,该计划减少了支付给计划中许多参与者的福利,从而降低了总体负债。MPRA 暂停生效后,退休基金再次被认定处于危急状态。
摘要 13 尽管测序革命已然到来,但迄今为止测序的大部分基因组仍然缺乏有关转录因子结合位点在调控 DNA 上的排列的任何信息。15 大规模并行报告基因检测 (MPRA) 有可能通过测量由调控区域的数千个突变变体驱动的基因表达水平来显著加速我们的基因组注释。然而,对此类数据的解释 18 通常假设调控序列中的每个碱基对都独立地对基因 19 表达作出贡献。为了能够以考虑调控序列上远距离碱基之间可能存在的相关性的方式分析这些数据,我们开发了深度学习 21 自适应调控序列标识符 (DARSI)。该卷积神经网络利用 22 MPRA 数据直接从原始调控 DNA 序列预测基因表达水平。通过利用这种预测能力,DARSI 系统地识别了转录因子在单碱基对分辨率下在调控区域内结合的位点。为了验证其预测,我们将 DARSI 与精选数据库进行了对比,证实了其在预测转录因子结合位点方面的准确性。此外,DARSI 预测了新的未映射结合位点,为未来的实验铺平了道路,以确认这些结合位点的存在并识别靶向这些位点的转录因子。因此,通过自动化和改进调控区域的注释,DARSI 生成了可付诸实践的预测,这些预测可以为理论-实验循环的迭代提供信息,旨在实现对转录控制的预测性理解。
2022 年 4 月 19 日致:参与者和受益人、国际桥梁、结构和装饰铁工人协会第 568 地方工会、北美国际劳工联盟第 616 地方工会、缴款雇主、西马里兰承包商协会、养老金福利担保公司和劳工部长。 谨此通知您,2022 年 3 月 31 日,计划精算师向美国财政部和计划发起人证明,该计划在 2022 年 1 月 1 日开始的计划年度处于危急和下降状态。联邦法律要求您收到此通知。 危急和下降状态 危急和下降状态是《2014 年多雇主养老金改革法案》(MPRA)创建的一种新的养老金计划资金状况类别。该计划被视为处于危急和下降状态,因为它存在资金或流动性问题,或两者兼而有之。更具体地说,该计划的精算师确定该计划很可能在未来 20 年内破产。破产的计划必须将福利支付减少到该计划可用资源可以支付的最高水平。如果这些资源不足以支付法律规定的福利水平,该计划必须向 PBGC 申请财务援助。PBGC 将向该计划贷款支付保证水平的福利所需的金额。有关 PBGC 福利保证的更多信息,请参阅年度资金通知。 康复计划 在 MPRA 通过之前,联邦法律已经要求处于危急状态的养老金计划采用旨在恢复计划财务健康的康复计划。受托人在 2008 年通过了一项康复计划。这是该计划处于危急状态的第十五年,也是处于危急和下降状态的第七年。法律允许处于危急状态的养老金计划减少甚至取消被称为“可调整福利”的福利作为康复计划的一部分。如果计划的受托人确定需要削减福利,您将在未来收到单独的通知,说明并解释削减的影响。任何可调整福利的削减(除了取消最近的福利增加,如下所述)都不会降低参与者在正常退休时应支付的基本福利水平。您应该知道,无论计划将来是否削减可调整福利,自 2008 年 4 月 26 日起,计划在处于危急状态时不得支付一次性福利(或超过单一人寿年金每月支付金额的任何其他付款)。MPRA 法律通常允许养老金计划除了削减或取消可调整福利外,还可以提议暂停参与者(包括处于受薪状态的参与者(退休人员))的累积福利。暂停累计福利的数额是有限制的,并且在暂停之前,法律要求拟议的福利暂停必须提交给财政部长并获得其批准,并提交包括退休人员在内的参与者投票。
结果:我们通过检查各种脊椎动物基因组的保守区域并与自信注释的人类特异性固定缺失重叠,从而确定了10,032个HCONDEL。我们发现,这些HCONDEL富含源自茎羊膜的保守序列。与转录,表观基因组和表型数据集重叠均暗示神经元和认知功能影响。我们在六种不同的人类细胞类型中使用MPRA表征了这些HCONDEL,包括诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞。我们发现800个HCONDEL显示出物种特异性的调节作用。尽管许多HCONDELS扰动转录因子 - 有效增强子中的结合位点,但我们估计30%创建或改善了结合位点,包括激活剂和阻遏物。
结果:我们通过检查不同脊椎动物基因组中的保守区域并与可靠注释的人类特异性固定缺失重叠,确定了 10,032 个 hCONDEL。我们发现这些 hCONDEL 富含删除源自干羊膜动物的保守序列。与转录、表观基因组和表型数据集的重叠都暗示了神经元和认知功能的影响。我们使用 MPRA 在六种不同的人类细胞类型中表征了这些 hCONDEL,包括诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞。我们发现 800 个 hCONDEL 显示出物种特异性的调节效应。虽然许多 hCONDEL 会扰乱活性增强子中的转录因子结合位点,但我们估计 30% 会创建或改善结合位点,包括激活剂和抑制剂。
转座元素(TES)占我们基因组的约50%,但是对TES如何影响基因组进化的知识仍然不完整。利用Encode4数据,我们提供了迄今为止对监管基因组贡献的最全面研究。我们发现236,181(〜25%)人类候选元素(CCRES)是te衍生的,自人小鼠裂口以来,人群分裂以来,有超过90%的血统特异性,占血统特异性ccr的8-36%。除了罪恶之外,TES中与CCRE相关的转录因子(TF)基序比偶然的预期源自祖先TE序列。我们表明,TE可以在其集成站点附近采用类似的监管活动。自人机差异以来,TE在30个检查的TF中贡献了3 - 56%的TF结合位点周转事件。最后,就MPRA活性和GWAS变体富集而言,TE衍生的CCR与非TE CCR相似。总的来说,我们的结果证实了TE在塑造人类调节基因组中发挥重要作用的观念。
摘要 在胚胎干细胞 (ESC) 中,核心转录因子 (TF) 网络建立了多能性所必需的基因表达程序。为了解决四种关键 TF 之间的相互作用如何促进小鼠 ESC 中的顺式调控,我们分析了两个由 SOX2、POU5F1 (OCT4)、KLF4 和 ESRRB 的结合位点组成的大规模并行报告分析 (MPRA) 文库。合成的顺式调控元件与具有可比结合位点配置的基因组序列之间的比较揭示了调控语法的某些方面。合成元件的表达受结合位点的数量和排列的影响。这种语法对基因组序列的作用很小,因为基因组序列的相对活性最好通过预测的结合位点占用率来解释,而与结合位点身份和定位无关。我们的结果表明,转录因子结合位点 (TFBS) 的影响受位点顺序和方向的影响,但在基因组中,TF 的整体占用率是活性的主要决定因素。
3. 任何人都可以提名个人进入名人堂或成为军团杰出成员。个人可以自我提名成为军团的荣誉上校、军士长或准尉。提名应转发给美国陆军军警学校 ATSJ-S 的军警长(收件人:Jim Lasure),14030 MSCOE Loop,Suite 1058,密苏里州伦纳德伍德堡 65473-8926,或 usarmy.leonardwood.mp-schl.mbx.dpo@army.mil NLT 2023 年 3 月 13 日(参见附件时间表)4. 入选名人堂的候选人将在 2023 年 9 月密苏里州伦纳德伍德堡举行的庆祝军警军团成立 82 周年的仪式上入选。那些被选为军团杰出成员或荣誉军团职位的人将通过在 USAMPS 社交媒体页面上公布他们的选择并在 MPRA 网页上的计划和奖项选项卡下列出来得到正式认可。