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对粪便样品的代谢组筛查是对婴儿过敏的牛奶蛋白过敏的临床试验的替代方法
牛奶蛋白过敏（CMPA）是食物过敏的最复发性儿科疾病之一，这是幼儿时期发生的。诊断并不容易，需要口服食物挑战测试（OFC）。在寻找可以用作CMPA的生物标志物的可能的肠道代谢产物时，评估了来自怀疑CMPA的婴儿的粪便样品的24个代谢组谱。儿童先前被诊断出患有OFC。粪便样品，并使用FT-Orbitrap质谱仪直接通过超高分辨率质谱（HRMS）直接分析。代谢组谱，该分析在区分样品以提出诊断方面并不有效。然后，在负面分析模式下获得的特定M/Z范围的代谢组谱成功地经受了正交部分最小二乘判别分析（OPLS-DA），该分析在没有CMPA的情况下将两组分开。模型拟合为R²= 0.88，在测试中具有Q²= 0.52的预测能力，其置换为2000排列，显着性p值<0.05。在这项初步研究中，使用代谢组谱获得的模型显示出显着的验证值，这表明有可能区分两组感兴趣的验证值，这表明其用作CMPA患者的可能诊断工具。
o r i g i n a l r e s a r c h剖析免疫细胞，血浆代谢产物和冠状动脉粥样硬化之间的因果关系：Mendelian Rando
背景：循环免疫细胞和代谢产物与冠状动脉粥样硬化有关，但是特定的因果关系以及代谢物作为介质的作用仍不清楚。方法：来自免疫细胞GWAS数据集的摘要统计数据（n = 3,757），循环代谢物（n = 8,299）和冠状动脉粥样硬化（病例n = 51,589;对照n = 343,079）使用BiDirectirectional Mendelal Mendelal Mendelal Mendelal Mendelal Mendelal Mendelal Ryneral分析。两步和多元孟德尔随机化被用来识别介导的代谢产物，并以逆差异加权（IVW）为主要方法。结果：我们确定了九种免疫细胞表型，包括特定的T细胞和单核细胞种群，与冠状动脉粥样硬化有显着的因果关系。此外，鉴定出41个跨四个代谢途径的血浆代谢产物，包括3-羟基-2-乙基丙酸和反式2-己烯酰甘氨酸甘氨酸甘氨酸。调解分析表明，3-羟基-2-乙基丙酸酯介导了IgD+ CD24+ B细胞对冠状动脉粥样硬化的影响（介导效应：0.961; 95％CI：95％CI：0.955-0.967），而Trans-2-Hexenoylglycine调节+ CD24+ b-b-b-cellsiors+ b-b-b-cellsiors+ b-b-cellsiiors， （中介效应：0.983; 95％CI：0.981–0.986）。结论：关键的免疫细胞表型和血浆代谢产物与冠状动脉粥样硬化有关。3-羟基-2-乙基丙酸和反式2-己烯酰基甘氨酸甘氨酸在调节B细胞功能中的作用表明了预防和治疗的潜在治疗靶标。关键字：免疫细胞，冠状动脉粥样硬化，血浆代谢产物，孟德尔随机化，B细胞功能
对生长的代谢限制解释了发展
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本于2024年6月19日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.10.15.562389 doi：Biorxiv Preprint
MAP3K15的代谢作用：来自23andMe研究数据库和遗传驱动招募的遗传和表型见解
MAP3K15先前与2型糖尿病（T2D）的保护相关联，促使人们对MAP3K15抑制剂的发展感兴趣，这是糖尿病的潜在治疗选择。全面基因组跨基因组关联研究（GWAS）荟萃分析和功能丧失（LOF）负担测试方法，牵涉到与T2D的关联大大受益于大型样本量。直接面向消费者的基因测试公司23andMe，Inc。是世界上最大的研究同意基因数据库。我们利用各种遗传分析方法利用23andMe数据库进一步告知MAP3K15的代谢作用。我们发现，MAP3K15 LOF载体在高多基因风险的个体中的中位数诊断中表现出4.5岁的显着延迟，并发现了MAP3K15 LOF的新型负担关联与保护高胆固醇的负担。我们通过建立能力来扩大这些发现，以招募同意参与者的能力，因为他们未知的遗传学（特别是MAP3K15中的单个LOF变体，RS148312150），并获得了中位数胆固醇和LDL/HDL/HDL Rafier in Map3k15的临床实验室证据。我们的发现证明了23AndMe数据库的发现能力，包括同意参与者招聘以告知治疗发现和开发的可行性。
生长的代谢约束解释了与行为相关的发育温度尺度的突触连通性
摘要环境温度决定了poikilothermic动物的发育速度，但尚不清楚这是否对脑线接线和Func+ON有后果。在视觉系统中，果蝇温度尺度的突触+c连接+vity，但是这种缩放的基本原因，跨神经回路的缩放性的一般性以及func+onal inal ninca+for行为的含量尚不清楚。在这里，我们结合了解剖学，Func+Onal和Theore+Cal方法，以洞悉依赖温度依赖的突触+C缩放的性质和后果。我们表明，突触+c缩放会导致不同的弹性亚电路中的异质弹性+效果，对气味驱动的行为产生了巨大的后果。第一个原则模型对神经系统和生物体的发展施加了不同的代谢约束，解释了这些发现，并概括以预测在生态相关的温度周期下的大脑布线。我们的数据认为，代谢约束决定了神经子电路内突触+c缩放的程度，并且在Synap+C合作伙伴的可用性时，Resul+ng电路架构和func+on con+ngent是con+ngent。突触+C缩放与合作伙伴的可用性之间的这种复杂相互作用强调了温度依赖性发育率+城市对poikilothermothermic动物行为的复杂影响。
Wu等。 2024年。“用于成像活细胞中代谢物的遗传编码的荧光DNA适体”。美国化学学会杂志。 doi：
背景/客观遗传编码的荧光蛋白和荧光RNA传感器是对细胞中生物分子成像的必不可少的工具。为扩展工具箱并改善了这种类型的传感器的普遍性和稳定性，我们在此报告了遗传编码的荧光DNA适体（GEFDA）传感器，该传感器将荧光DNA Aptamer用于二甲基糖红（Dimethylindole Red）与ATP APTAMER联系起来。
脂肪因子和细菌代谢产物：连接肥胖和肠道菌群营养不良的关键分子桥与靶标
摘要：脂肪因子是脂肪组织产生的必需介质，并发挥多种生物学功能。特别是脂联素，瘦素，抵抗素，IL-6，MCP-1和PAI-1在脂肪组织与其他参与代谢，免疫和血管健康的器官之间的串扰中发挥了特定的作用。在肥胖症期间，脂肪因子失衡发生并导致低度促进症状状态，促进与胰岛素抵抗相关的糖尿病及其血管并发症。肥胖与肠道菌群营养不良之间的因果关系已证明。The deregulation of gut bacteria communities characterizing this dysbiosis influences the synthesis of bacterial substances including lipopolysaccharides and specific metabolites, generated via the degradation of dietary components, such as short-chain fatty acids, trimethylamine metabolized into trimethylamine-oxide in the liver and indole derivatives.新兴证据表明，这些细菌代谢物调节脂肪因子生产和作用涉及的信号通路。本综述总结了肠道细菌衍生的代谢产物与肥胖中脂肪因子失衡之间的分子联系的当前知识，并强调了它们在与氧化应激，炎性，炎症，胰岛素抵抗和血管疾病有关的关键病理机制中的作用。鉴于脂肪因子和细菌代谢物之间的这种相互作用，该评论强调了它们的相关性（i）是伴有临床生物标志物，以更好地探索肥胖和肠道菌群中的代谢，炎症和血管并发症和肠道微生物群体疾病的疾病，以及（ii）的目标，以实现新的抗毒性和抗抗Antipy Antipy Antipy Antiply Antipleant和（II）。
调查尼日利亚西南州气候因素与疟疾传播动态之间的关系
此预印本版本的版权持有人于2025年3月10日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.03.03.03.25323221 doi：medrxiv preprint
半导体分布的弹性供应链框架和需求风险推断的实证研究
通过基因组挖掘和合成生物学对新型代谢机制的分析和重建，以及通过结构修饰，修饰和优化的新结构的小分子药物的开发可以为突破分子靶向药物的开发而破坏瓶颈。靶向具有重要活性，独特结构或/和广泛临床应用的天然药物分子家族，揭示体内生物转化并分析分子机制可以进一步促进天然产物的发展。近年来，一些技术和科学发展，包括改进分析工具，基因组挖掘和工程策略以及微生物文化的进步，为自然产品相关研究注入了新的机会。在这里，我们旨在汇编创新的原始研究和审查文章，以阐明代谢转换，潜在靶标，天然产物的分子机制及其与人类代谢的关联。
引用出版物（APA）：摘自Tilburg，A。Y. Y，Cao，H。，Meuleen，S。B.，Solopova，A.代谢工程
代谢工程和合成生物学方法已经繁荣了生物技术领域，其中主要重点是大肠杆菌和酿酒酵母作为微生物的工作试验。在近年来，作为生产宿主的革兰氏阳性细菌乳酸菌和枯草芽孢杆菌的注意力越来越多。本评论将证明这些细菌可以设计的不同水平及其各种应用可能性。例如，工程化的乳酸乳杆菌菌株对生物医学应用显示出巨大的希望。此外，我们还提供了最新的合成生物学工具的概述，这些工具促进了这两种微生物的使用。