1 delactología工业学院(CONICET-UNL),化学工程学院,国立大学圣菲大学,圣塔菲大学,阿根廷,2蒂加斯加斯(Moorepark),摩尔帕克(Moorepark)和APC微生物爱尔兰,爱尔兰,科特(Cork),爱尔兰,爱尔兰3号健康和科学事务 Instituto de Productos Lácteos de Asturias—Consejo Superior de Investigaciones Científicas (IPLA-CSIC), Villaviciosa, Asturias, Spain, 5 Department of Food Science and Human Nutrition, Division of Nutritional Sciences, 260 Edward R. Madigan Laboratory, University of Illinois, Urbana, IL, United States, 6 Functional Foods Forum, Faculty of Medicine, University of伊利诺伊大学伊利诺伊大学乌尔巴纳 - 坎普恩大学(Urbana-Champaign),伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana),伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana),美国伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana-Champaign),美国伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana-Champaigndelactología工业学院(CONICET-UNL),化学工程学院,国立大学圣菲大学,圣塔菲大学,阿根廷,2蒂加斯加斯(Moorepark),摩尔帕克(Moorepark)和APC微生物爱尔兰,爱尔兰,科特(Cork),爱尔兰,爱尔兰3号健康和科学事务 Instituto de Productos Lácteos de Asturias—Consejo Superior de Investigaciones Científicas (IPLA-CSIC), Villaviciosa, Asturias, Spain, 5 Department of Food Science and Human Nutrition, Division of Nutritional Sciences, 260 Edward R. Madigan Laboratory, University of Illinois, Urbana, IL, United States, 6 Functional Foods Forum, Faculty of Medicine, University of伊利诺伊大学伊利诺伊大学乌尔巴纳 - 坎普恩大学(Urbana-Champaign),伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana),伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana),美国伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana-Champaign),美国伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana-Champaigndelactología工业学院(CONICET-UNL),化学工程学院,国立大学圣菲大学,圣塔菲大学,阿根廷,2蒂加斯加斯(Moorepark),摩尔帕克(Moorepark)和APC微生物爱尔兰,爱尔兰,科特(Cork),爱尔兰,爱尔兰3号健康和科学事务 Instituto de Productos Lácteos de Asturias—Consejo Superior de Investigaciones Científicas (IPLA-CSIC), Villaviciosa, Asturias, Spain, 5 Department of Food Science and Human Nutrition, Division of Nutritional Sciences, 260 Edward R. Madigan Laboratory, University of Illinois, Urbana, IL, United States, 6 Functional Foods Forum, Faculty of Medicine, University of伊利诺伊大学伊利诺伊大学乌尔巴纳 - 坎普恩大学(Urbana-Champaign),伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana),伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana),美国伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana-Champaign),美国伊利诺伊州乌尔巴纳(Urbana-Champaign
作者的完整清单:本杰明·伯里(Bourrie);艾伯塔省大学,农业食品和营养科学原谅,安德鲁;艾伯塔省大学,亚历山大农业食品与营养科学Makarowski;艾伯塔省大学,保罗农业食品与营养科学科特; Teagasc Food Research Center Moorepark Richard,Caroline;艾伯塔省大学,本杰明,农业食品和营养科学愿意;艾伯塔大学,农业食品与营养科学
收到2024年2月2日; 2024年5月7日接受;于2024年6月7日发布:1 Doherty应用微生物基因组学,微生物学和免疫学系,墨尔本大学Peter Doherty感染与免疫学研究所,792 Elizabeth Street,Melbourne VIC 3000,澳大利亚澳大利亚墨尔本街792号; 2爱尔兰科克摩尔帕克的Teagasc食品研究中心; 3爱尔兰科克大学科克大学科克大学科克大学的APC微生物组和微生物学院; 4 Vistamilk SFI研究中心,爱尔兰科克Teagasc Moorepark。*信件:John G. Kenny,John。Kenny@teagasc。IE关键字:Amplicons;数据库;长阅读测序;微生物组;纳米孔; rRNA。缩写:COV,变异系数; ESV,精确的序列变体; Grond,基因组衍生的核糖体操纵子数据库; GTDB,基因组分类数据库; IQR,四分位数范围;它的内部转录垫片; NR,非冗余; ONT,牛津纳米孔技术; RRN,16S-ITS-23S rRNA操纵子; rRNA,核糖体RNA; SD,标准偏差; Taxlca,集群中所有序列的最低祖先; Taxmaj,最低的分类学等级,其中所有序列中的所有序列都具有简单的多数协议; Taxrep,集群代表序列的源基因组分类学; UMIS,唯一的分子标识符。数据语句:文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据,代码和协议。本文的在线版本可以使用两个补充表。001255©2024作者
•赫利牧场模型(Thornley,1998)是托管牧场的详细机械模型。•Basgra(Van Oijen等,2015)及其后代Basgra_n(Höglind等,2020)是多年的草原模型,包括分er动力学。•Prograss(Lazzarotto等,2009)的开发是为了捕获草/三叶草混合物中的相互作用。•PASIM的重点(Graux等,2011)是在气候变化条件下对牲畜生产的研究。•Modvege(Jouven等,2006)是一种机械模型,旨在捕获具有最小必需输入参数的主要过程。•Moorepark St Gilles(Ruelle等,2018)和Gras-Sim(Kokah等,2023)模型都扩展了土壤水和氮动力学和管理方面的模块。
1 博洛尼亚大学物理与天文学系,意大利博洛尼亚 40127;claudia.sala3@unibo.it 2 丹麦技术大学国家食品研究所基因组流行病学研究组,Kemitorvet, DK-2800 Kgs, 2800 Lyngby,丹麦;hamr@food.dtu.dk (HM);tnpe@food.dtu.dk (TNP);casper.sahl.poulsen@sund.ku.dk (CP);fmaa@food.dtu.dk (FMA);rshe@food.dtu.dk (RSH);sjpa@food.dtu.dk (SJP) 3 德国联邦风险评估研究所生物安全部,德国柏林 12277; Josephine.gruetzke@bfr.bund.de 4 高致病性病毒,ZBS 1,生物威胁和特殊病原体中心,罗伯特·科赫研究所,13353 柏林,德国;BrinkmannA@rki.de(AB);NitscheA@rki.de(AN) 5 APC 爱尔兰微生物组和 Vistamilk,Teagasc 食品研究中心,Moorepark,T12 YN60 Co. Cork,爱尔兰;paul.cotter@teagasc.ie(PDC);fiona.crispie@teagasc.ie(FC) 6 监测和实验室服务部,动物和植物健康机构,APHA Weybridge,Addlestone,Surrey,KT15 3NB,英国;Richard.Ellis@apha.gov.uk 7 博洛尼亚大学实验、诊断和专科医学系,40127 博洛尼亚,意大利; gastone.castellani@unibo.it 8 欧洲分子生物学实验室、欧洲生物信息学研究所、Wellcome Genome Campus、Hinxton、Cambridge CB10 1SD、英国;amid@ebi.ac.uk 9 国家兽医研究所,Ulls väg 2B, 75189 Uppsala,瑞典;mikhayil.hakhverdyan@sva.se 10 微生物实验室,CEDEX 03, 44311 Nantes,法国;soizick.le.guyader@ifremer.fr (SLG);julien.schae ffi er@ifremer.fr (JS) 11 博洛尼亚大学农业与食品科学系,40064 Ozzano dell'Emilia,意大利; gerardo.manfreda@unibo.it 12 流行病学和微生物基因组学,国家卫生实验室,L-3555 Dudelange,卢森堡;joel.mossong@lns.etat.lu (JM);catherine.ragimbeau@lns.etat.lu (CR) 13 南洋理工大学食品技术中心 (NAFTEC),南洋理工大学 (NTU),62 Nanyang Dr,新加坡 637459,新加坡;jschlundt@ntu.edu.sg (JS);moon.tay@ntu.edu.sg (MYFT) 14 博洛尼亚大学兽医学系,Via Tolara di Sopra 50,40064 Ozzano dell'Emilia,意大利 * 通讯地址:alessandra.decesare@unibo.it
1 中国科学院动物研究所,中国科学院动物生态与保护生物学重点实验室,北京,中国 2 中国科学院大学生命科学学院,北京,中国 3 新疆农垦科学院畜牧兽医研究所,石河子,中国 4 新疆农垦科学院,绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室,石河子,中国 5 中国农业大学动物科技学院,北京,中国 6 宁夏回族自治区农林科学院动物科学研究所,宁夏银川,中国 7 动物和草地研究与创新中心,Teagasc,Moorepark,Fermoy,科克,爱尔兰 8 意大利皮亚琴察天主教大学动物科学、食品与营养系 9 克尔曼 Shahid Bahonar 大学农学院动物科学系,伊朗克尔曼 10 伊朗德黑兰帕亚梅诺尔大学农业系 11 俄罗斯联邦莫斯科州 LK Ernst 畜牧业科学中心 12 奥地利维也纳兽医大学动物育种与遗传学研究所 13 捷克共和国伊赫拉瓦州立兽医研究所病毒学系 14 意大利巴里莫罗巴里大学生物科学、生物技术和生物制药系 15 德国吉森尤斯图斯-李比希大学动物育种与遗传学系 16 埃塞俄比亚亚的斯亚贝巴国际干旱地区农业研究中心 (ICARDA) 小反刍动物基因组学 17 英国诺丁汉大学生命科学学院中国农业科学院畜牧研究所,畜牧与牧草遗传资源联合实验室,中国北京 19 国际畜牧研究所(ILRI)畜牧遗传项目,肯尼亚内罗毕 20 国际畜牧研究所(ILRI)畜牧遗传项目,埃塞俄比亚亚的斯亚贝巴 21 爱丁堡大学罗斯林研究所热带畜牧遗传与健康中心(CTLGH),英国中洛锡安郡复活节布什 22 阿尔伯塔大学生物科学系,加拿大艾伯塔省埃德蒙顿 23 阿尔伯塔省政府鱼类和野生动物执法处法医科,加拿大艾伯塔省埃德蒙顿 24 芬兰自然资源研究所(卢克)生产系统,芬兰约基奥宁 25 卡迪夫大学生物科学学院,英国卡迪夫卡西斯公园 26 卡迪夫大学可持续场所研究所,英国卡迪夫荷兰乌得勒支 28 联邦科学与工业研究组织农业与食品,昆士兰生物科学区,圣卢西亚,布里斯班,昆士兰州,澳大利亚 † 这些作者对本研究贡献相同。 * 通讯作者:电子邮件:menghua.li@cau.edu.cn。副主编:Yuseob Kim