癌细胞增殖并促进血管生成。[10] NEU5AC并不是唯一具有生物学重要性的神经氨酸。neu5,9AC 2也已被指出在调节糖蛋白的免疫系统和稳定性方面起着作用。在癌症发展,自身免疫性状况和感染中可能作用。[11]由于存在额外的乙酰官能团,与NEU5AC相比,与NEU5AC相比,这些角色归功于不同的特征,例如增加的疏水性,大小和氢键。[12]在癌细胞中也观察到了NEU5,9-AC 2的表达。[13] neu4,5ac 2仅在某些脊椎动物中表达,例如单人类,[14]豚鼠[15]和马[16],在破坏细菌和病毒活性中起着作用。由于存在于NEU4,5AC 2中存在的突出的4位乙酰基组构成的结合位点中的空间障碍,因此存在破坏。[14,16]
摘要:人类唾液 - 酸性结合免疫球蛋白样凝集素-9(SIGLEC-9)是在几个免疫细胞上表达的糖免疫检查点受体。SIGLEC-9与含糖酸(唾液聚糖)的唾液酸的结合已充分记录,以调节其作为抑制受体的功能。在这里,我们首先使用良好的三维核磁共振(NMR)方法分配了SIGLEC-9 V-SET结构域(Siglec-9 D1)的氨基酸骨架。然后,我们将溶液NMR和分子动力学模拟方法结合在一起,以解释Siglec-9与天然配体α2,3和α2,62,6 siAllyl乳糖胺(SLN)(SLN)(SAIALYL LEWIS X(SALEX)(SALEX)和6-O硫的分子细节,并与两个固定型结合,并将其与两个固定型结合。正如预期的那样,在规范的唾液酸结合位点的F和Gβ链之间容纳了neu5ac。在NEU5AC的C9位置添加杂型支架9 N -5-(2-甲基噻唑-4-基)噻吩磺酰胺(MTTS)会产生与位于Siglec-9的N-末端区域的疏水性残基的新相互作用。同样,在neu5ac的C5位置添加芳族取代基(5- n-(1-二苯基 - 1 H-1 H- 1,2,3-三唑-4-基)甲基(BTC))稳定在SigleC-9中存在长长的B'-c loop的构象。这些结果暴露了负责SIGLEC-9对这两个改良的唾液聚糖的增强的亲和力和特异性的基本机制,并阐明了针对Siglec-9的下一代修改后的Sialoglycans的合理设计。■简介
摘要:人类唾液 - 酸性结合免疫球蛋白样凝集素-9(SIGLEC-9)是在几个免疫细胞上表达的糖免疫检查点受体。SIGLEC-9与含糖酸(唾液聚糖)的唾液酸的结合已充分记录,以调节其作为抑制受体的功能。在这里,我们首先使用良好的三维核磁共振(NMR)方法分配了SIGLEC-9 V-SET结构域(Siglec-9 D1)的氨基酸骨架。然后,我们将溶液NMR和分子动力学模拟方法结合在一起,以解释Siglec-9与天然配体α2,3和α2,62,6 siAllyl乳糖胺(SLN)(SLN)(SAIALYL LEWIS X(SALEX)(SALEX)和6-O硫的分子细节,并与两个固定型结合,并将其与两个固定型结合。正如预期的那样,在规范的唾液酸结合位点的F和Gβ链之间容纳了neu5ac。在NEU5AC的C9位置添加杂型支架9 N -5-(2-甲基噻唑-4-基)噻吩磺酰胺(MTTS)会产生与位于Siglec-9的N-末端区域的疏水性残基的新相互作用。同样,在neu5ac的C5位置添加芳族取代基(5- n-(1-二苯基 - 1 H-1 H- 1,2,3-三唑-4-基)甲基(BTC))稳定在SigleC-9中存在长长的B'-c loop的构象。这些结果暴露了负责SIGLEC-9对这两个改良的唾液聚糖的增强的亲和力和特异性的基本机制,并阐明了针对Siglec-9的下一代修改后的Sialoglycans的合理设计。■简介
摘要:粘蛋白O-聚糖siAllyl TN抗原(STN,NEU5ACα2-6GALNACα1 -O -ser/Thr)是与不同类型的癌症相关的抗原,通常与转移和较差的预后风险有关。尽管努力开发具有高特异性和免疫疗法特异性的抗STN抗体,但引发高糖结构的高亲和力抗体的挑战限制了它们的有效性,导致滴度较低和较短的保护持续时间。缺乏对抗STN抗体特异性的实验结构见解,阻碍了它们对癌细胞识别的优化。在这项研究中,我们使用了一种全面的结构方法,结合了X射线晶体学,NMR光谱,计算方法,聚糖/糖肽微阵列和生物物理技术,以彻底研究L2A5的STN识别分子基础L2A5,这是一种新型的抗细流的抗细胞抗细胞抗抗细胞Monoclonal Antoclonal antibody(MAB)。我们的数据明确地表明,L2A5片段抗原结合(FAB)特异性结合了核心STN部分。nmr和X射线结构数据提出了与Ser或Thr和L2A5 Fab相关的STN部分形成的复合物的相似结合模式。糖部分类似地在mAb的副群中定向,而neu5ac部分建立了与受体和Galnac部分的密钥相互作用,提供了其他接触。此外,L2A5对与癌症相关的MUC1和MUC4粘蛋白衍生的STN糖肽表现出良好的特异性,这可能有助于其对肿瘤细胞的选择性靶向。关键字:聚糖,唾液酸,抗体,NMR,X射线晶体学■简介这种新发现的知识有望在诊断和针对STN表达癌症(例如乳腺癌,结肠直肠癌和膀胱癌)的诊断中的合理改善和潜在应用,从而改善患者护理。
人类血清和血浆的核磁共振 (NMR) 光谱除了代谢物和脂蛋白外,还显示两种特征信号 GlycA 和 B,它们来自急性期蛋白表面聚糖的乙酰基,是炎症过程的良好标志物。在这里,我们报告了在人类血清中观察到的糖蛋白聚糖 NMR 信号的全面分配,结果显示 GlycA 和 GlycB 信号分别来自 N -聚糖的 Neu5Ac 和 GlcNAc 部分。常规测定的急性期糖蛋白浓度与 NMR 光谱中的独特特征有很好的相关性(R 2 高达 0.9422,p 值 <0.001),可以在 10 – 20 分钟的采集时间内同时定量几种急性期炎症蛋白(图 1)。[1] 这在 COVID-19 和心源性休克患者的血清样本中得到了体现,与健康对照组相比,几种急性期蛋白发生了显着变化。
神经氨酰酸 ( 1 ) 结构中存在的多种功能团使得其化学结构相对容易修改。所获得的衍生物在与神经氨酸酶(负责唾液酸水解的酶)相互作用的程度和方式以及病毒进入细胞的渗透性方面有所不同。下面介绍了一些修饰 Neu5Ac ( 3 ) 化学结构的方法:C-1 位酰胺化( 6 - 神经氨酸酶抑制剂)、C-3 位氟化( 7 - 神经氨酸酶抑制剂)、C-4 和 C-9 位叠氮化( 8 和 10 - 与大配体结合的便捷底物)、C-5 位脱乙酰胺( 9 - 合成酰胺衍生物的底物)、C-2 位脱水( 12 )以及 C-7 和 C-8 处羟基的醚化( 11 - 潜在的神经氨酸酶抑制剂)[3]。
聚糖参与细胞和有机生物学的基本方面,例如受体介导的细胞与正常过程和病原过程的基础的细胞相互作用。的确,细胞表面上的聚糖的致密层(糖蛋白)可以从某些细胞上的质膜延伸超过30 nm。细胞表面蛋白因此被嵌入在聚糖基质中。聚糖的各种功能与它们的各种结构相匹配。Glycans can be conjugated to proteins (to form glycoproteins , proteoglycans and glycosylphos- phatidylinositol (GPI)-anchored proteins) and lipids (to form glycolipids), or they can be secreted without conju- gation to other macromolecules (in the form of glycos- aminoglycans such作为透明质酸)。In humans, glycans are primarily constructed from ten monosaccharides: glucose (Glc), galactose (Gal), N -acetylglucosamine (GlcNAc), N -acetylgalactosamine (GalNAc), fucose (Fuc), xylose (Xyl), sialic acid (Neu5Ac), glucuronic acid (GlcA), mannose (Man) and id酸酸(IDOA)。通过与内质网和高尔基体相关的酶,将这些单糖的组装到聚糖中。单糖通过一种糖的异构碳和另一种羟基的糖苷碳连接在一起。糖苷键相对于异体碳(α与β)的方向影响聚糖的整体形状。因此,例如,乳糖galβ1-4Glc的符号是指通过葡萄糖C4上的β-糖苷键与羟基的半乳糖相关的。仅考虑这些因素,就有
摘要:多形性胶质母细胞瘤 (GBM) 是一种恶性、高度侵袭性的 IV 级脑肿瘤,可迅速渗入附近组织,由于其预后不良和治疗方法有限而引起了广泛关注。在 GBM 中,几乎所有肿瘤细胞都表现出异常的细胞表面糖基化模式,这是由于其生物合成或合成后修饰过程的改变。由于神经节苷脂 (GG) 被认为是肿瘤相关抗原,我们在此对从 GBM 样本中提取和纯化的天然神经节苷脂混合物进行了全面分析。为此,我们对高效离子淌度分离质谱 (IMS MS) 进行了彻底优化,以发现 GBM 特异性结构并评估其作为肿瘤标志物或可能的相关抗原的作用。根据电荷状态、碳水化合物链长度、唾液酸化程度和神经酰胺组成,通过 IMS 分离 GG,鉴定出不少于 160 种不同成分,是之前鉴定结构数量的 3 倍。检测到的 GG 和脱唾液酸 GG 的特点是神经酰胺和聚糖组成具有高度异质性,包含多达五个 Neu5Ac 残基。发现肿瘤以相等且高比例的 GD3 和 GT1 形式为主,神经酰胺中 C24:1 脂肪酸的含量较高。通过仅出现一个迁移率特征和诊断性碎片离子,使用碰撞诱导解离 (CID) 进行的 IMS 串联质谱首次揭示了新提出的 GT1c(d18:1/24:1) 的存在,作为一种潜在的 GBM 标记物。关键词:人类多形性胶质母细胞瘤、神经节苷脂、生物标志物、离子迁移分离/质谱法 (IMS MS)、碰撞诱导解离
