热蛋白质组分析 (TPP) 和高通量蛋白质组整体溶解度变化 (PISA) 检测等高通量技术的进步彻底改变了我们对药物-蛋白质相互作用的理解。尽管有这些创新,但缺乏用于对稳定性和溶解度变化数据进行交叉研究分析的综合平台,这是一个重大瓶颈。为了解决这一差距,我们推出了 DORSSAA(基于稳定性/溶解度变化检测的药物-靶标相互作用组学资源),这是一个交互式且可扩展的基于网络的平台,用于系统分析和可视化蛋白质组稳定性和溶解度变化检测数据集。目前,DORSSAA 拥有 480,456 条记录,涵盖 37 种细胞系和生物体、39 种化合物和 40,004 个潜在蛋白质靶标。通过其用户友好的界面,该资源支持比较药物-蛋白质相互作用分析并促进可操作治疗靶标的发现。我们利用白血病细胞系联合治疗中 DHFR-甲氨蝶呤相互作用和药物-靶标相互作用的两个案例研究,证明了 DORSSAA 在跨实验条件识别蛋白质-药物相互作用方面的实用性。该资源使研究人员能够加速药物发现并增强我们对蛋白质行为的理解。
热蛋白质组分析 (TPP) 和蛋白质组整体溶解度变化 (PISA) 等高通量技术的进步彻底改变了我们对药物-蛋白质相互作用的理解。尽管有这些创新,但缺乏用于对稳定性和溶解度变化数据进行交叉研究分析的综合平台,这是一个重大瓶颈。为了解决这一差距,我们推出了 DORSSAA(基于稳定性/溶解度变化分析的药物靶标相互作用组学资源),这是一个基于网络的交互式平台,用于系统分析和可视化蛋白质组稳定性和溶解度变化分析数据集。DORSSAA 拥有 480,456 条记录,涵盖 37 种细胞系和生物体、39 种化合物和 40,004 个潜在蛋白质靶标。通过其用户友好的界面,该资源支持比较药物-蛋白质相互作用分析并促进可操作治疗靶标的发现。我们通过白血病细胞系联合治疗中 DHFR-甲氨蝶呤相互作用和药物-靶标相互作用的两个案例研究,证明了 DORSSAA 在跨实验条件识别蛋白质-药物相互作用方面的实用性。该资源使研究人员能够加速药物发现并增强我们对蛋白质行为的理解。
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疫苗有效性(VE)估计值来自对Covid-19疫苗有效性研究的持续系统综述。由于全球的Omicron变体的优势,本文档中的图仅限于在Omicron变体是主要循环变体的时期进行的研究。该地块的先前版本(在2021年11月18日至2022年6月2日之间定期发布)也显示了三角洲变体的结果,而早期版本(2021年11月18日之前)显示了所有研究的结果,而不论当时的主要变体。这些早期版本可在“查看 - 中心资源”页面(https://view-hub.org/resources)上找到。有关系统审查方法以及结果表的完整详细信息也可以在“查看 - 中心资源”页面上找到:
动脉粥样硬化性心血管疾病 (CVD) 是一种慢性疾病,随着时间的推移缓慢发展,当出现不良反应时通常会进展至晚期状态 (1) 。尽管过去几十年来欧洲一些国家的 CVD 死亡率已显著下降,但 CVD 仍然是全球发病和死亡的主要原因 (2-5) 。据统计,发达国家目前占所有 CVD 死亡率的 80%。预计未来几十年因 CVD 造成的伤残调整生命年 (DALY) 数量将增加,从 1990 年的 8500 万 DALY 损失增加到 2020 年全球 1.5 亿 DALY 损失,仍然是盈利能力丧失的主要身体原因 (6-9) 。生活方式、不良的饮食习惯、缺乏身体活动和心理压力都与 CVD 密切相关 (10) 。根据世界卫生组织 (WHO) 的数据,改善生活方式可以挽救 75% 以上的心血管疾病死亡病例 (6, 11, 12)。尽管只有
摘要摘要:我们开发了 xOmicsShiny,这是一款功能丰富的 R Shiny 应用程序,它使生物学家能够全面探索跨实验和数据类型的组学数据集,重点是在通路层面揭示生物学见解。数据合并功能可确保灵活探索跨组学数据,例如转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学。通路映射功能涵盖广泛的数据库,包括 WikiPathways、Reactome 和 KEGG 通路。此外,xOmicsShiny 为日常组学数据分析提供了多种可视化选项和分析任务,即 PCA、火山图、维恩图、热图、WGCNA 和高级聚类分析。该应用程序使用可定制的模块来执行各种任务,生成交互式图表和可发布的图表。这种动态模块化设计克服了 R Shiny 工具加载缓慢的问题,并允许研究和开发人员社区轻松扩展它。可用性和实施:R Shiny 应用程序公开发布于:http://xOmicsShiny.bxgenomics.com 。研究人员可以将自己的数据上传到服务器或使用预加载的演示数据集。源代码在 MIT 许可下提供于 https://github.com/interactivereport/xOmicsShiny 以供本地安装。该应用程序的完整教程可在 https://interactivereport.github.io/xOmicsShiny/tutorial/docs/index.html 获得。联系方式:yuhenry.sun@biogen.com 或 baohong.zhang@biogen.com 补充数据:补充数据可在 bioRxiv 在线获得。
抽象目标:冠状动脉疾病仍然是主要由动脉粥样硬化驱动的全球发病率和死亡率的主要因素。遗传变异和脂肪细胞因子(如omentin-1和瘦素)在炎症途径和动脉粥样硬化过程中起关键作用。本研究旨在评估巴基斯坦人口中CDX2(A> G)变体,Omentin-1和瘦素与CAD风险的关联。方法:这项病例对照研究包括500例血管造影确认的CAD患者和500名年龄和性别匹配的健康对照。从所有贡献者那里获得了详细的人体测量,血压和空腹血液样本。使用TETRA-PRIMER扩增耐火突变系统 - 聚合酶链反应(ARMS-PCR)进行CDX2(A> G)变体的基因分型。通过使用酶 - 连接的免疫吸附测定法(ELISA)试剂盒评估omentin-1,瘦素和维生素-D的血清水平。统计分析是由SPSS版本23进行的。结果:对照组中AA基因型的频率(49.2%)明显高于CAD患者(32.4%),表明具有保护作用(P <0.001)。Ag基因型与CAD风险增加58%(OR = 1.58,95%CI:1.24-2.02)。与对照组相比,CAD患者(368±3.7 ng/ml vs. 615±6.5 ng/ml,p <0.001)的血清Omentin-1水平明显低于615±6.5 ng/ml,p <0.001),而CAD患者的瘦素水平显着升高(8.62±0.7 ng/ml vs. 4.02 ng/ml vs. 4.02±0.5 ng/ml,p <0.5 ng 0.001)。omentin-1和瘦素水平都与Ag和GG基因型显着相关,这表明对这些脂肪细胞因子产生遗传影响。结论:总结VDRG的启动子区域的CDX2(A> G)变体与CAD的更大风险有关,并且对脂肪因子水平(尤其是Omentin-1和瘦素)的影响可能在CAD发病机理中起着至关重要的作用。这些发现提供了对CAD分子机制的见解。
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1* Unisa STEM,南澳大利亚大学,Mawson Lakes,Adelaide 6,5095,SA,澳大利亚。7 2农业和食品,英联邦科学与工业研究8组织,26 Pembroke Rd,Marsfield,2122,新南威尔士州,澳大利亚。9 3澳大利亚精密健康中心,南澳大利亚大学,阿德莱德10号,澳大利亚,5000,澳大利亚。11 4 Unisa Allied Health and Human Expormast,南12澳大利亚大学,阿德莱德,SA,5000,澳大利亚。13 5南澳大利亚卫生与医学研究所(SAHMRI),南澳大利亚大学14号,阿德莱德大学,澳大利亚5000,澳大利亚。15 6南澳大利亚大学未来工业学院,莫森16湖,阿德莱德,5095,澳大利亚,澳大利亚。17 7应用人工智能研究所,迪金大学,75 Pigdons 18 Rd,Victoria,3216,澳大利亚墨尔本。19 8达利大学工程学院,达利2号,达利,671003,中国20号。21
IPUT 房地产 IVM Caring Capital Joh. Berenberg, Gossler & Co. KG Kairos Partners Kinnerton Credit Management A/S Kutxabank Gestión SGIIC SAU L&G Asset Management La Financière de l'Echiquier Lannebo Kapitalförvaltning LBP AM LocalTapiola Asset Management Ltd Maple-Brown Abbott Global Listed Infrastructure Mercy Investment Services, Inc. Messieurs Hottinguer & Cie Gestion Privée Metis Invest GmbH Miller/Howard Investments, Inc. Mirova NEI Investments Neter Capital Nextalia SGR SpA Nia Impact Capital Nordea Asset Management Norrsken VC Octagon Credit Investors, LLC Ofi Invest Asset Management Ownership Capital Paragon Partners Phitrust Pictet Asset Management Planet A Ventures PROSPERUS-INVEST LTD. Ring Capital Rivage Investment SAS Robeco Salm-Salm & Partner SHS Gesellschaft für Beteiligungsmanagement mbH