胰腺腺癌(PDAC)是一种快速发展的癌症,对免疫疗法的反应较差。肿瘤内三级淋巴结构(TLS)与罕见的长期PDAC幸存者有关,但是TLS在PDAC中的作用及其在较大的较大肿瘤微环境的背景下仍然未知。,我们产生了一个空间多膜大图,其中包括与联合免疫疗法治疗的患者的26个PDAC肿瘤。使用机器学习支持的H&E图像分类模型和无监督的基因表达矩阵分解方法用于空间转录组学,我们表征了跨越不同形态和免疫疗法的TLS壁ni中的细胞状态。无监督的学习产生了TLS特异性的空间基因表达特征,该信号与PDAC患者的生存率有了显着关联。这些分析表明,病理反应者中与TLS相关的肿瘤内B细胞成熟,并通过空间蛋白质组学和BCR分析证实。我们的研究还确定了病理免疫反应的空间特征,揭示了TLS成熟与IgG/IgA分布和细胞外基质重塑共定位。
摘要 基于牛津纳米孔技术 (ONT) 的甲基化测序因其快速准确地对脑肿瘤进行分类而受到越来越多的认可。这一过程对于最佳患者治疗至关重要。然而,目前广泛的临床应用受到对新鲜冷冻活检的需求而不是标准福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本的限制。我们的研究探讨了 FFPE 对 DNA 甲基化的影响,并提出了一种基于 ONT 的 FFPE 肿瘤分类的开发和验证方案。我们提出了一种实用的解决方案,用于在常规临床环境中精确诊断脑肿瘤,并在护理点及时做出治疗决策,而不会干扰手术室标准。关键词:肿瘤分类、牛津纳米孔技术、表观遗传分析、DNA 甲基化、FFPE 活检样本、中枢神经系统肿瘤、精准医学、病理学。准确分类肿瘤类型和亚型对于促进全面精准的患者治疗至关重要 1-3 。例如,世界卫生组织 (WHO) 对中枢神经系统 (CNS) 肿瘤的分类涵盖 10 多个主要肿瘤类别,每个类别又包含许多亚类,总共有 100 多个不同的实体,需要不同的治疗方法,并且与不同的预后和临床病程相关 4。这些肿瘤实体在形态、空间和遗传特征上经常表现出相似性 5–7,因此难以区分它们。此外,神经病理学家可能会对组织病理学结果提供不同的解释,这增加了该过程的主观性 8。另一方面,表观遗传学,特别是 DNA 甲基化——已被证明是一种强大而稳定的工具,可准确区分绝大多数这些肿瘤亚型 2,因此基于甲基化的分类已纳入 2021 年 WHO 对 CNS 肿瘤的分类 4。因此,检查肿瘤甲基化模式最近已成为临床诊断程序的一部分,基于甲基化的分类器已经可用于中枢神经系统肿瘤和肉瘤,其他用于不同肿瘤类型的分类器正在开发中 9 。然而,将 DNA 甲基化纳入脑肿瘤的诊断检查已被证明具有挑战性。评估这些甲基化模式的“金标准”方法是 DNA 杂交阵列,例如 Infinium MethylationEPIC 阵列 10 ,但它具有明显的缺点,包括费用高、周转时间长、所需起始材料量大(最低 500ng DNA,最好是 1ug DNA),需要积累多个样本才能获得结果,并且需要训练有素的人员,这与临床需求通常要求的短时间范围不符 。
此外,细胞色素P450酶成为心血管系统炎症环境的重要建筑。它们的代谢产物影响白细胞募集,粘附分子表达和血管环境中的细胞因子合成,充当炎症反应的介体和调节剂。这种炎症性串扰开发了一种有利于动脉粥样硬化,高血压和缺血性心脏病的环境,通过与其他心血管疾病特征相互作用,例如氧化应激和内皮功能障碍。超出其本能的代谢范围,细胞色素P450在心血管健康和疾病中发挥作用[5]。许多内源性和外源性因素,例如饮食成分,药物药物,激素波动,遗传变异型等,都显着塑造其作用。血管活性代谢物平衡受这些调节剂的影响,这对CYP表达和活性具有重大影响。这使人患有心血管功能障碍和疾病状态[6]。
1 UKM 医学分子生物学研究所 (UMBI),马来西亚国民大学,56000,蕉赖,吉隆坡,马来西亚; 2 马来西亚卫生部国立卫生研究院医学研究所传染病研究中心细菌学组。 FAF:fariharesearchjourney@gmail.com SRR:srosz77@gmail.com HM:hui-min@ppukm.ukm.edu.my 运行标题:TUBERCULOSIS IN MALAYSIA * 通讯地址:UKM 医学分子生物学研究所 (UMBI), Universiti Kebangsaan Malaysia, 56000, Cheras, Kuala Lumpur, Malaysia。 +60391456321(HM);电子邮件:hui-min@ppukm.ukm.edu.my (HM) 摘要 在马来西亚,尽管采取了疾病控制和预防措施,结核病仍然是一个公共卫生问题。本综述探讨了马来西亚肺结核 (PTB) 的时间线、流行病学、管理和该国疾病的前景。PTB 于 20 世纪初首次在马来亚报告,并导致高发病率和死亡率。随着 1961 年国家结核病控制计划的建立以及每个州综合医院的胸科诊所,死亡率成功降低。尽管如此,PTB 发病率在 2011 年后稳步上升,马来西亚目前是该病的流行国家。PTB 诊断根据卫生部的临床实践指南进行,包括胸部 X 光、痰培养和抗生素敏感性测试。患者根据世卫组织的指导方针接受治疗。虽然该国近年来耐药病例减少了 0.02%;但已报告两例广泛耐药结核病病例。该国已报告了所有主要的结核分枝杆菌谱系(印度洋-大洋洲;东亚(包括北京)、东非-印度和欧-美洲)。与沙巴和砂拉越相比,北京菌株家族在马来西亚半岛的流行率更高,这表明两地病原体的进化存在差异。大多数抗生素耐药菌株都含有 rpoB 、 katG 、 embB 和 pncA 突变。在诊断、应用程序和警报系统中越来越多地使用分子平台和人工智能来进行更好的监测,并实施全民治疗,对于该国在 2035 年实现无结核病状态至关重要。关键词:肺结核、马来西亚、结核病时间表、结核病流行病学、马来西亚的结核分枝杆菌谱系、结核病控制举措
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