XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemPestivirus
非典型猪瘟病毒 Fc 介导的 E2-二聚体亚单位疫苗在仔猪中诱导有效的体液和细胞免疫反应
摘要：仔猪先天性震颤（CT）A-II 型是由一种新出现的非典型猪瘟病毒（APPV）引起的，该病毒在猪群中流行，对养猪业构成严重威胁。本研究旨在构建与 Fc 片段融合的 APPV E2 亚单位疫苗并评估其在仔猪中的免疫原性。本文，在果蝇 Schneider 2（S2）细胞中表达的 APPV E2Fc 和 E2 ∆ Fc 融合蛋白在 SDS-PAGE 和蛋白质印迹试验中被证明可以形成稳定的二聚体。功能分析表明，aE2Fc 和 aE2 ∆ Fc 融合蛋白可以与抗原呈递细胞（APC）上的 Fc γ RI 结合，并且 aE2Fc 对 Fc γ RI 的亲和力高于 aE2 ∆ Fc。此外，还制备了基于 aE2、aE2Fc 和 aE2 ∆ Fc 融合蛋白的亚单位疫苗，并在仔猪中评估了它们的免疫原性。结果表明，与 IMS 1313VG 佐剂乳化的 Fc 融合蛋白比 IMS 1313VG 佐剂引发了更强的体液和细胞免疫反应。这些发现表明与 Fc 片段融合的 APPV E2 亚单位疫苗可能是针对 APPV 的有希望的疫苗候选物。
隔离，识别，分子表征
摘要本研究报告了奶牛场的流产，腹泻和牛奶生产急剧下降。该农场通常用进口疫苗接种了针对BVDV的疫苗，其中含有典型的Pestiviruses菌株（BVDV-1和BVDV-2）。从流产的母牛和显示持续性腹泻的奶牛中收集了总共13个血清样品，5个阴道排放样品和5个粪便样品。使用PCR筛选所有样品的潜在微生物原因（病毒或细菌）。在测试的23个样品中，只有一个阴道放电样品在预期的288 bp下产生了阳性的PCR结果。设计的引物是对基于5'-UTR的RTPCR测定法的高灵敏度，用于检测Pestiviruses。将PCR产品发送进行序列分析，并将结果提交给GenBank登录号＃OR425033，并设计为GERD/VSVRI/PESTI-GIRAFFE/2022。然后通过三个连续的盲传中成功地在MDBK细胞中成功分离并传播该病毒。在病毒后接种后2-3天观察到了一种明显的细胞质效应（CPE），其特征是感染后72小时，其特征是液泡，细胞舍入和簇形成。pcr均在每个段落上进行，并以预期的大小给出了一个特定的频带。通过序列比对和系统发育分析的进一步分析表明，分离株与Pestivirus长颈鹿密切相关，尤其是Pestivirus PG-2。这标志着该菌株在埃及的检测，隔离和表征的第一个记录。因此，这种流行是由埃及记录的新引入的菌株引起的。因此，进口的疫苗无法提供保护，需要更新当地的疫苗以包括此Pestivirus菌株。关键字：Pestivirus PG-2，PNS，MDBK，5`UTR，CPE，系统发育分析，PCR，BDV，
Anchorna：通过保守的锚固区域的完整病毒基因组对齐
动机：由于诸如长序列，大插入/缺失（跨越了几种100个核苷酸），大数量序列，序列差异和高计算复杂性，例如在二级结构预测的上下文中，因此全病毒基因组的多序列比对可能具有挑战性。标准比对方法通常会面临这些问题，尤其是在处理高度可变的序列或对选定子序列需要特定的系统发育分析时。我们提出了基于Python的命令行工具Anchorna，旨在在编码序列中识别保守区域或锚定。这些锚定定义分裂位置，指导复杂病毒基因组的比对，包括具有重要二级结构的那些。AnchORNA通过专注于这些关键的保守区域来提高全基因组对齐的准确性和效率。在设计培养在病毒家族中的底漆时，提出的方法特别有用。结果：AnchORNA引导的对准与3个对齐程序的结果进行了比较。利用55个代表性的Pestivirus基因组的数据集，AnchORNA确定了56个锚点，对于指导对齐过程至关重要。这些锚的合并导致了所有测试的对齐工具的显着改进，突出了Anchorna在增强对齐质量方面的有效性，尤其是在复杂的病毒基因组中。可用性：Anchorna可根据MIT许可在GitHub上的MIT许可证上，网址为https：//github.com/rnajena/anchorna，并在Zenodo上存档。该软件包包含一个带有Pestivirus数据集的教程，并且与支持Python的所有平台兼容。
本作品已获得 Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License 许可。摘要 猪瘟是由一种
本作品根据知识共享署名-非商业性使用 4.0 国际许可证进行授权。摘要猪瘟是由黄病毒科猪瘟病毒属的包膜 RNA 病毒引起的，而非洲猪瘟 (ASF) 是由非洲猪瘟病毒科非洲猪瘟病毒属的双链 DNA 病毒引起的。这两种疾病都是毁灭性的，并因死亡、生长迟缓和繁殖性能低下而给养猪业造成巨大损失。非洲猪瘟和猪瘟的临床症状非常相似；因此，必须进行实验室检测来区分这两种疾病。已经开发出用于诊断 CSF 的病毒分离、荧光抗体测试 (FAT)、抗原捕获抗体酶联免疫吸附试验 (ELISA)、逆转录聚合酶链反应 (RT-PCR)、病毒中和试验 (VNT) 和抗体 ELISA。为了检测 ASF，已经开发了 ELISA、化学发光免疫分析 (CLIA)、PCR、荧光素酶免疫沉淀分析 (MB-LIPS)、环介导等温扩增 (LAMP) 和重组酶聚合酶扩增 (RPA)。为了发展养猪业，需要快速诊断和有效的预防措施来帮助管理和消灭这两种疾病。猪已经通过疫苗接种得到了针对这些疾病的保护。必须通过严格的检疫措施防止 CSF 和 ASF 病毒的进入。早期发现和了解疾病的流行病学对于防止疾病传播和制定有效的管理策略都至关重要。本综述提供了对这两种疾病的病原体、流行病学、传播方式、临床症状、发病机制、诊断和控制策略的见解。关键词：控制、生长、死亡率、猪、病毒正确引用：Rai，S。（2024 年）。关于养猪业中古典猪瘟和非洲猪瘟的流行病学、诊断和控制的最新见解。农业与自然资源杂志，7(1)，127-144。DOI：https://doi.org/10.3126/janr.v7i1.73220 引言 在许多国家，养猪是家庭收入的主要来源。猪瘟对养猪业影响很大。该病是由黄病毒科疫病毒属的一种有包膜 RNA 病毒引起的。猪瘟是一种严重且造成经济损失的猪病，可以通过地方性和流行性方式感染家猪和野猪种群（Edwards 等人，2000 年）。由于肉类出口贸易限制以及该疾病造成的大面积动物死亡，猪瘟病毒（CSPV）在猪群中的存在会对肉类生产业产生严重的负面经济影响。非洲猪瘟病毒 (ASFV) 是非洲猪瘟病毒科中非洲猪瘟病毒属的成员（Gaudreault 等人，2020 年）。