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PTEN 和 DNA-PK 决定人类乳腺癌对 WEE1 抑制的敏感性和恢复率
摘要 AZD1775 抑制 WEE1 激酶在临床癌症试验中显示出良好的效果，但缺乏预测 AZD1775 反应的标志物。我们在这里通过全局蛋白质组/转录组分析了一组人类乳腺癌 (BC) 细胞系对 AZD1775 的反应，并确定了两组基底样 BC (BLBC)：“PTEN 低”BLBC 对 AZD1775 高度敏感，在去除 AZD1775 后无法恢复，而“PTEN 高”BLBC 恢复了。AZD1775 诱导 DNA-PK 磷酸化，保护细胞免受复制相关的 DNA 损伤并促进细胞恢复。DNA-PK 或 PTEN 的删除，或 DNA-PK 的抑制通过消除复制停滞使恢复中的 BLBC 对 AZD1775 敏感，从而允许尽管 DNA 受损但仍进行复制。这与 CHK1 活性降低、细胞周期蛋白 E 水平升高和细胞凋亡有关。总之，我们确定 PTEN 和 DNA-PK 是 AZD1775 反应中复制检查点阻滞的重要调节因子，并将 PTEN 定义为有效 WEE1 癌症治疗的有希望的生物标记物。
如何靶向缺乏PTEN的前列腺癌-orca
摘要◥目的：这项WASA对新检查点激酶1（CHK1）抑制剂SRA737的I/II期试验与Gemcitabine结合使用。其目标是建立安全性，推荐的2阶段剂量（RP2D），药代动力学专业和SRA737的临床活动。患者和方法：晚期实体瘤患者在第2、3、9、9、10、16和17天与口服SRA737一起在28天的周期中接受剂量升级队列，并在第1、8和15天和15天进行吉西替滨。持续治疗直到进展。每个膨胀队列包括20例特异性遗传定义的肿瘤患者。结果：确定RP2D为500 mg SRA737与低剂量（250 mg/m 2）吉西他滨结合使用。143名入学患者，77例以至少500 mg SRA737
种系PTEN基因型依赖性表型差异在前脑机体的早期神经发育过程中
使用10倍基因组学铬单细胞3'试剂盒（版本3.1），每个样品捕获了6,000至10,000个细胞以进行库和测序生成。在器官解离，单细胞悬浮液，凝胶珠和乳液油被添加到10x基因组单细胞芯片G中。在液滴产生后，将样品转移到PCR 8管条（USA Scientific）中，使用SimpleiaMp热循环液（Appliam appliiamp appliamp cyscler（USA Scientific）进行反转录反应（USA Scientific）。cDNA。根据10倍基因组用户指南，使用Silane Dynabead清理cDNA。将纯化的cDNA放大了11个循环，然后使用spriselect珠
伏立诺他通过上调 PTEN 诱导乳腺癌细胞 G2/M 细胞周期停滞
摘要。– 目的：乳腺癌 (BC) 是全世界女性中最常见的癌症类型。人们提出了各种方法来治疗这种疾病，但没有一种单一的药物被证明是有效的。因此，了解不同药物的分子机制变得势在必行。本研究旨在评估厄洛替尼 (ERL) 和伏立诺他 (SAHA) 在诱导乳腺癌细胞凋亡中的作用。还根据一些癌症相关基因的表达谱评估了这些药物的作用；PTEN、P21、TGF 和 CDH1。材料和方法：在本研究中，乳腺癌细胞 (MCF-7) 和 MDA-MB-231 以及人羊膜细胞 (WISH) 用两种浓度 (50 和 100 µM) 的厄洛替尼 (ERL) 和伏立诺他 (又名 SAHA) 处理 24 小时。收获细胞用于下游分析。通过流式细胞仪分析DNA含量和细胞凋亡，并进行qPCR以评估不同癌症相关基因的表达。结果：结果表明，与正常细胞和对照相比，ERL和SAHA在24小时后将两种乳腺癌细胞都抑制在G2/M期。对于细胞凋亡，随着两种所用药物的浓度增加，BC细胞显示出升高的总细胞凋亡水平（早期和晚期），在24小时处理中，ERL的最有效浓度为100µM。在对照细胞中，SAHA被证明是在100µM浓度下最有效的药物，在24小时处理中细胞凋亡百分比范围为1.7-12％。在所使用的两种乳腺癌细胞系中，坏死也呈剂量依赖性。我们进一步评估了 PTEN 、 P21 、 TGF- β 和 CDH1 的表达谱。在 MCF-7 中，数据表明对于 TGF- β 、 PTEN 和 P21 ，最有效的治疗是浓度为 100 µM 的 SAHA，而对于 CDH1 ，最有效的浓度是 100 µM 的 ERL。在 MDA-MB-232 中也观察到了类似的情况，其中对于 TGF- β 、 PTEN 和 P21 ，最有效的治疗是浓度为 100 µM 的 SAHA，而对于 CDH1 ，最有效的浓度是 50 µM 的 SAHA。结论：我们的结果揭示了 ERL 和 SAHA 在调节癌症相关基因表达中的作用，尽管这些数据需要进一步研究。
通过破坏Akt/tspyl5/pten阳性反馈回路，靶向耐药肺癌干细胞
比WT-Tspyl5的Div>（图下面面板5e）。Tspyl5天冬氨酸突变剂（T120D-TSPYL5）是磷酸-T120-TSPYL5的模拟物，其作用类似于野生型Tspyl5：T120D-Tspyl5表现出核和细胞质定位，并且CD44和ALDH1均以其表达升高。其他苏氨酸残基Tspyl5突变体（T177A，T326A和T409A）的功能和细胞内分布与WT-TSPYL5的功能和细胞内分布没有差异（补充图5a，b;图5d，e）。T120 Tspyl5突变也显示出H460细胞中合适的自我更新和EMT电位（补充图 6）。 完全表明，T120时的Tspyl5磷酸化对于TSPYL5稳定和核易位以及随后在CSC-NSCLC细胞中CD44和AldH1的表达至关重要。T120 Tspyl5突变也显示出H460细胞中合适的自我更新和EMT电位（补充图6）。完全表明，T120时的Tspyl5磷酸化对于TSPYL5稳定和核易位以及随后在CSC-NSCLC细胞中CD44和AldH1的表达至关重要。
通过NF1/PTEN损失驱动的高风险肿瘤中MCL1和BCL2抑制MCL1和BCL2介导的协同黑色素瘤细胞死亡
黑色素瘤尚未开发出高治疗失败的风险和有效疗法。在这里我们表明，NF1和PTEN的功能丧失突变会导致斑马鱼中的黑色素瘤，代表了带有PTEN损失的NF1突变黑色素瘤的第一种动物模型。MEK或PI3K抑制剂由于途径之间的串扰而单独给出时，几乎没有活性，并且同时给予高毒性。MTOR抑制剂，Sirolimus，Everolimus和Temsirolimus是经过测试的最活跃的单个药物，可诱导肿瘤抑制自噬，但不是凋亡。由于添加BCl2抑制剂Venetoclax导致了MCL1的补偿性上调，因此我们建立了由Sirolimus，Venetoclax和Mcl1抑制剂S63845组成的三药组合。这种耐受性良好的药物组合有效并协同诱导斑马鱼和人NF1/PTEN降低的黑色素瘤细胞的凋亡，从而为NF1/PTEN-PTEN-PTEN-DEEFEERIENT患者提供了临床前证据，证明了早期阶段的临床试验是合理的。
MTOR途径基因MTOR，RHEB，DEPDC5，PTEN和TSC1对皮质神经元发育和功能有收敛性和不同影响
。cc-by-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年1月6日。 https://doi.org/10.1101/2023.08.11.553034 doi：Biorxiv Preprint
PI3K/mTOR 肿瘤抑制基因的通路特异性基因组编辑表明，PTEN 缺失导致头颈癌对西妥昔单抗产生耐药性
西妥昔单抗是一种靶向 EGFR 的单克隆抗体，是治疗局部晚期或转移性头颈部鳞状细胞癌 (HNSCC) 的标准疗法。然而，尽管 90% 以上的 HNSCC 病变中 EGFR 过度表达，但大多数 HNSCC 患者对西妥昔单抗治疗没有反应。此外，临床上没有可用的生物标记来预测对西妥昔单抗的敏感性或耐药性。在这里，我们试图通过识别 PI3K-mTOR 信号网络特异性西妥昔单抗耐药机制来推进 HNSCC 的精准医疗方法。我们首先分析了 HNSCC TCGA 数据集中参与 PI3K-mTOR 信号通路的基因的基因组变异频率。在实验中，我们利用 CRISPR/Cas9 基因组编辑方法系统地探索了控制 PI3K-mTOR 通路的每个肿瘤抑制基因 (TSG) 的基因组改变对未表现出 PIK3CA 突变的 HNSCC 病例中西妥昔单抗耐药性的贡献。值得注意的是，我们发现许多 HNSCC 病例表现出多个 TSG 的通路特异性基因拷贝数丢失，这些 TSG 通常抑制 PI3K-mTOR 信号传导。其中，我们发现工程和内源性 PTEN 基因缺失均可介导对西妥昔单抗的耐药性。我们的研究结果表明，在 HNSCC 中非常普遍的 PTEN 基因拷贝数丢失可能导致独立于 EGFR 的持续 PI3K/mTOR 信号传导，从而代表了一种有希望的机制生物标志物，可预测这种癌症类型中西妥昔单抗的耐药性。需要进一步的前瞻性研究来调查 PTEN 缺失对西妥昔单抗临床疗效的影响。
2025; 16（6）：1987-2000。 doi：10.7150/jca.106190研究论文CKS2沉默影响多发性骨髓瘤的增殖和凋亡。
多发性骨髓瘤（MM）是一种普遍的浆细胞恶性肿瘤，代表了一种威胁生命的血液学疾病，具有明显的临床发病率。尽管对全球健康负担有了公认的影响，但确切的分子发病机理仍未完全阐明。通过RNA测序进行的转录组分析表明，多发性骨髓瘤中细胞周期蛋白依赖性激酶调节亚基2（CKS2）的显着上调。通过对患者衍生标本中CKS2表达的定量分析进行临床验证。选择了两个已建立的MM细胞模型（MM.1S和RPMI-8226）进行功能表征。使用CCK-8代谢分析和EDU DNA掺入分析对细胞增殖动力学进行了定量，并使用流式细胞仪评估来评估凋亡指数。建立了一种异种移植小鼠模型，以研究CKS2介导的体内肿瘤发生，并通过途径相关蛋白表达的蛋白质印迹分析补充。对人基碱数据库的生物信息学询问确定了推定的CKS2相互作用，随后通过共免疫沉淀测定法和共焦免疫荧光显微镜进行了验证。通过AlphaFold2通过AlphaFold2预测的分子相互作用界面的结构建模，通过Pymol渲染实现了三维可视化。在这项研究中，我们证明了MM.1和RPMI-8226细胞系中的CKS2敲低可显着抑制细胞增殖和诱导的凋亡。机械研究表明，CKS2耗尽通过PTEN/AKT/MTOR信号轴调节细胞的增殖和凋亡。相反，CKS2过表达增强了恶性增殖，同时抑制了凋亡过程，并在骨髓瘤发病机理中确立了其功能作用。值得注意的是，共免疫沉淀测定法证明了CKS2和硫氧还蛋白（TXN）之间的直接蛋白质 - 蛋白质相互作用，随后的功能验证表明TXN似乎充当了CKS2稳定性的关键上游调节因子。这些发现将CKS2建立为骨髓瘤细胞稳态的关键调节剂，并将其确定为有前途的治疗靶标，需要进一步的临床前验证。
LncRNA PTENP1/miR-21/PTEN 轴调节癌症中的 EMT 和耐药性：DNA 损伤反应中细胞命运的动态布尔模型
摘要：众所周知，microRNA-21 (miR-21) 靶向磷酸酶和张力蛋白同源物 (PTEN)，促进癌症的上皮-间质转化 (EMT) 和耐药性。最近的证据表明，PTEN 激活其假基因衍生的长链非编码 RNA PTENP1，进而抑制 miR-21。然而，PTEN、miR-21 和 PTENP1 在 DNA 损伤反应 (DDR) 中的动态仍不清楚。因此，我们通过整合来自各种癌症的已发表文献提出了一个动态布尔网络模型。我们的模型与乳腺癌、肝细胞癌 (HCC) 和口腔鳞状细胞癌 (OSCC) 的实验结果显示出良好的一致性，阐明了 DDR 激活如何从 S 期过渡到 G2 检查点，从而导致一系列细胞反应，例如细胞周期停滞、衰老、自噬、细胞凋亡、耐药性和 EMT。模型验证强调了 PTENP1、miR-21 和 PTEN 在调节 EMT 和耐药性方面的作用。此外，我们的分析揭示了九个新的反馈回路，其中八个是正反馈回路，一个是负反馈回路，由 PTEN 介导，与 DDR 细胞命运决定有关，包括与耐药性和 EMT 相关的通路。我们的工作为研究 DDR 后的细胞反应提供了一个全面的框架，强调了在癌症治疗中靶向 PTEN、miR-21 和 PTENP1 的治疗潜力。