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μMap-Red：通过红光光催化进行邻近标记
摘要：现代邻近标记技术在理解生物分子相互作用方面取得了重大进展。然而，当前的工具主要使用与复杂生物环境不兼容的激活模式，限制了我们在动物模型中研究细胞和组织水平微环境的能力。在这里，我们报告了 μ Map-Red，这是一个邻近标记平台，它使用红光激发的 Sn IV 二氢卟酚 e6 催化剂来激活苯基叠氮化物生物素探针。我们通过展示体外通过多层组织的光子控制蛋白质标记来验证 μ Map-Red，然后我们将我们的平台应用于纤维素以标记 EGFR 微环境，并通过 STED 显微镜和定量蛋白质组学验证性能。最后，为了展示复杂生物样本中的标记，我们在小鼠全血中部署了 μ Map-Red 来分析红细胞表面蛋白。这项工作代表了在复杂组织环境和动物模型中基于光的邻近标记方法的重大进步。
越南能源部门的净零
本报告已为由联合国项目服务办公室（UNOPS）管理的能源过渡合作伙伴关系（ETP）准备，这是专业服务的一部分，作为THMCO/ETP/2023/001的一部分，“针对越南能源领域的Net-Zero诊断研究，越南，在越南，在专业服务合同的框架内。关于联盟E4SMA（意大利）是项目负责人，专门研究能源和气候建模和对决策者的支持。能量建模实验室（丹麦）支持模型开发。越野培训与咨询（越南）负责利益相关者的参与和沟通。贡献者Alessandro Chiodi，Maurizio Gargiulo，Maryse Labriet，Pham Hoang Luong，由Luca Faust，Ioannis Vrochidis，Steve Pye（E4SMA），IDAGRæstedJensen，Jenneth Karlsson（能源建模实验室），Mary Pham thar和Viet viet viet viet viet vore。致谢我们感谢工业和贸易部石油，天然气和煤炭部（MOIT）的密切合作和支持。我们还感谢所有积极参与咨询并在整个研究中提供有见地的评论的利益相关者。免责声明在“越南能源部门的净零”报告中是在“针对越南能源部门的净零”项目的项目下制备的，仅针对东南亚能源过渡伙伴关系（ETP）。报告中表达的发现和意见是作者的发现，不一定反映任何相关政府或组织的观点。未经ETP事先书面许可，任何部分都不能复制，引用或分发给任何第三方。
福祉经济 - 丹麦的未来经济学？
1。一个简短的序言。arj。不为什么我们还应该阅读并了解有关经济学和测量方法的更多信息？这只是冷，无聊，干燥，优化的利润，并且对于少数人来说？对于许多人来说，我们宁愿谈论健康，气候以及我们通常如何使世界变得更健康，更好的地方。在讨论财务，预算和投资时，我们经常遇到这种反应。此案也是如此，金融辩论只是关于技术和条款，利润和增长，而不是关于人的。，但经济学是力量，经济能力和影响力可以积极地创造变革。如果我们想要。公正的愿景和愿意以不同和积极的方式使用经济的意愿是本出版物的本质：仔细研究有机会改变经济的机会，专注于福祉而不是短期利润，将投资用于健康和福祉，并以新的和更好的方式使用，以便我们在经济上取得更多的成长而不是增长。我们建立了一个总体观念，即经济的中心必须对人和地球都很好 - 以及三个主要的实现：
研究项目提供 Azrieli 研究中心 CHU Sainte-Justine
成功的申请者将加入 CHU Sainte-Justine 研究中心的 Marín-Juez 实验室，在这里申请者将可以使用最先进的设施和技术平台，包括先进的成像平台（光片、旋转盘共聚焦、多光子、STED 超分辨率等）、基因组学（DropSeq、10x、Illumina Novaseq、Visium）、IPSC 细胞重编程和生物信息学平台。CHU Sainte-Justine 研究中心提供了一个蓬勃发展的科学环境，成功的申请者将有机会与多学科科学团队合作并与才华横溢的临床医生和研究人员合作。研究项目描述我们之前已经确定冠状动脉网络再生是心脏再生的关键决定因素（Marín-Juez 等人，PNAS 2016；Wang 等人，Development 2024）。我们的工作揭示了冠状动脉网络补充的控制机制，包括支持心肌细胞再生和介导冠状动脉-心外膜相互作用的血管支架的形成（Marín-Juez 等人，Dev Cell 2019；El-Sammak 等人，Circ Res 2022）。基于这些发现，我们现在旨在阐明心脏内皮、心外膜和免疫系统成分如何协同调节组织补充，以及它们在心肌细胞再生中发挥作用的具体机制。所需培训和个人资料我们正在寻找具有生物科学博士学位和组织修复/再生、细胞、分子生物学或遗传学实验室经验的候选人。以前与斑马鱼、成像和组织学打交道的经验非常有价值，但并非必不可少。强烈鼓励具有共聚焦/光片成像和/或基因组工程经验的候选人申请。具有出色协作和沟通技巧的申请人将获得优先考虑。
使用光子芯片-Munin
应将对应关系发给BSA（balpreet.singh.ahluwalia@uit.no）结构化照明显微镜（SIM），可在高速下对亚细胞结构进行实时细胞超分辨率成像。目前，Linear Sim使用自由空间光学器件以所需的光图形来照亮样品，但是这种布置容易错过一致性，并为显微镜增加了成本和复杂性。在这里，我们提出了一种基于光子芯片的替代2D SIM方法，其中显微镜中的常规玻璃样品载玻片被平面光子芯片所取代，该平面光子芯片既可以固定并照亮样品。光子芯片将SIM的光照明路径的足迹降低到约4x4 cm 2。芯片上的一系列光学波导以不同的角度创建了站立的干扰模式，从而通过evanevanevanecent磁场照亮了样品。高折射率氮化硅波导允许在成像空间分辨率中增强2.3倍，超过了SIM的通常2x极限。总而言之，CSIM提供了一种简单，稳定且负担得起的方法，用于在大型视野上执行2D超分辨率成像。光学显微镜的空间分辨率通过衍射有效地限制了可实现的分辨率横向约250 nm，而轴向为500 nm的1,2。超级分辨率荧光显微镜的出现（通常称为纳米镜检查）证明了欺骗衍射极限的能力，将显微镜的横向分辨率向下延伸到只有几个纳米3。因此，超分辨率成像的下一个飞跃可以通过增加纳米镜方法的吞吐量来实现。在现有的光学纳米镜检查方法4-8中，结构化照明显微镜（SIM）9,10对于大多数明亮的荧光团作品。，而不是在SIM中照亮样品，而是在SIM中照亮了正弦激发模式，可以照亮样品，并在摄像机上捕获荧光发射。通常使用样品平面上的两个或三个梁的干扰来生成正弦激发光。通过乘法在频率空间中代表卷积，混合了两个函数的空间频率，在样品平面上结合了照明和对象函数。以这种方式，由于频率下转换与所得荧光发射为Moiré边缘模式，因此在物镜的通过频带的通过频带下方可以提供高频，未解决的内容。要从Moiré模式中提取高频含量，需要三到五个相移的结构化照明才能改善沿一个轴的分辨率。对于各向同性分辨率，必须重复该过程的激发模式的3个方向（角度），对于2D（3D）SIM重构，总共有9（15）个图像。由于SIM只需要9（15 for 3d）图像即可在广泛的视野上创建一个超分辨率图像，因此此方法本质上是快速的，这使其成为实时细胞光学纳米镜检查的最流行方法之一。，尽管STED和SMLM方法在单个单元格的水平上提供了出色的图像，但是当需要许多细胞的高速图像以建立统计影响时，这些技术会遭受低吞吐量。在常规模拟中，照明和开发高分辨率方法，例如刺激激发耗竭（STED）显微镜技术4,5和单分子定位显微镜（SMLM）6-8，从而使分辨率降低到几十纳米量，在生命科学中发现了新的发现可能性。在现有的超分辨率显微镜技术中，SIM提供了最快的时间分辨率，并且与标准标签和低光毒性的兼容性SIM方法指向实际高通量纳米镜检查方向。为了充分利用快速SIM成像技术的实用性，可实现的空间分辨率，方法的吞吐量和SIM的系统复杂性需要改进。
用双标记的自我快速，全细胞DNA-Paint成像...
1。Schnitzbauer，J。等。用DNA-Paint的超分辨率显微镜。nat。原始。12.6，1198-1228（2017）。 2。 Reinhardt，S。C.等。 Ångström-分辨率荧光显微镜。 自然617.7962，711-716（2023）。 3。 Jungmann，R。等。 用DNA-Paint和Exchange-Paint多路复用3D细胞超分辨率成像。 nat。 方法11.3，313-318（2014）。 4。 Auer，A。 使用基于FRET的探针快速，无背景的DNA绘制成像。 纳米lett。 17.10，6428-6434（2017）。 5。 Chung，K。K.等。 荧光DNA-Paint，可更快，低背景超分辨率成像。 nat。 方法19.5，554-559（2022）。 6。 Knemeyer，J。P。等。 基于染料二聚化的自淬灭DNA探针，用于鉴定分枝杆菌。 int。 J. Environ。 肛门。 化学。 85，625-637（2005）。 7。 Kessler，L。F.等。 自淬灭的荧光团二聚体，用于DNA涂料和st型显微镜。 angew。 化学。 int。 ed。 Engl。 E202307538（2023）。 8。 Bollmann，S。等。 有机荧光团的二聚体形成在变性条件下报告了生物分子动力学。 物理。 化学。 化学。 物理。 13.28，12874-12882（2011）。 9。 nat。 10。 nat。12.6，1198-1228（2017）。2。Reinhardt，S。C.等。Ångström-分辨率荧光显微镜。自然617.7962，711-716（2023）。3。Jungmann，R。等。 用DNA-Paint和Exchange-Paint多路复用3D细胞超分辨率成像。 nat。 方法11.3，313-318（2014）。 4。 Auer，A。 使用基于FRET的探针快速，无背景的DNA绘制成像。 纳米lett。 17.10，6428-6434（2017）。 5。 Chung，K。K.等。 荧光DNA-Paint，可更快，低背景超分辨率成像。 nat。 方法19.5，554-559（2022）。 6。 Knemeyer，J。P。等。 基于染料二聚化的自淬灭DNA探针，用于鉴定分枝杆菌。 int。 J. Environ。 肛门。 化学。 85，625-637（2005）。 7。 Kessler，L。F.等。 自淬灭的荧光团二聚体，用于DNA涂料和st型显微镜。 angew。 化学。 int。 ed。 Engl。 E202307538（2023）。 8。 Bollmann，S。等。 有机荧光团的二聚体形成在变性条件下报告了生物分子动力学。 物理。 化学。 化学。 物理。 13.28，12874-12882（2011）。 9。 nat。 10。 nat。Jungmann，R。等。用DNA-Paint和Exchange-Paint多路复用3D细胞超分辨率成像。nat。方法11.3，313-318（2014）。4。Auer，A。使用基于FRET的探针快速，无背景的DNA绘制成像。纳米lett。17.10，6428-6434（2017）。5。Chung，K。K.等。 荧光DNA-Paint，可更快，低背景超分辨率成像。 nat。 方法19.5，554-559（2022）。 6。 Knemeyer，J。P。等。 基于染料二聚化的自淬灭DNA探针，用于鉴定分枝杆菌。 int。 J. Environ。 肛门。 化学。 85，625-637（2005）。 7。 Kessler，L。F.等。 自淬灭的荧光团二聚体，用于DNA涂料和st型显微镜。 angew。 化学。 int。 ed。 Engl。 E202307538（2023）。 8。 Bollmann，S。等。 有机荧光团的二聚体形成在变性条件下报告了生物分子动力学。 物理。 化学。 化学。 物理。 13.28，12874-12882（2011）。 9。 nat。 10。 nat。Chung，K。K.等。荧光DNA-Paint，可更快，低背景超分辨率成像。nat。方法19.5，554-559（2022）。6。Knemeyer，J。P。等。基于染料二聚化的自淬灭DNA探针，用于鉴定分枝杆菌。int。J. Environ。肛门。化学。85，625-637（2005）。 7。 Kessler，L。F.等。 自淬灭的荧光团二聚体，用于DNA涂料和st型显微镜。 angew。 化学。 int。 ed。 Engl。 E202307538（2023）。 8。 Bollmann，S。等。 有机荧光团的二聚体形成在变性条件下报告了生物分子动力学。 物理。 化学。 化学。 物理。 13.28，12874-12882（2011）。 9。 nat。 10。 nat。85，625-637（2005）。7。Kessler，L。F.等。 自淬灭的荧光团二聚体，用于DNA涂料和st型显微镜。 angew。 化学。 int。 ed。 Engl。 E202307538（2023）。 8。 Bollmann，S。等。 有机荧光团的二聚体形成在变性条件下报告了生物分子动力学。 物理。 化学。 化学。 物理。 13.28，12874-12882（2011）。 9。 nat。 10。 nat。Kessler，L。F.等。自淬灭的荧光团二聚体，用于DNA涂料和st型显微镜。angew。化学。int。ed。Engl。 E202307538（2023）。 8。 Bollmann，S。等。 有机荧光团的二聚体形成在变性条件下报告了生物分子动力学。 物理。 化学。 化学。 物理。 13.28，12874-12882（2011）。 9。 nat。 10。 nat。Engl。E202307538（2023）。 8。 Bollmann，S。等。 有机荧光团的二聚体形成在变性条件下报告了生物分子动力学。 物理。 化学。 化学。 物理。 13.28，12874-12882（2011）。 9。 nat。 10。 nat。E202307538（2023）。8。Bollmann，S。等。有机荧光团的二聚体形成在变性条件下报告了生物分子动力学。物理。化学。化学。物理。13.28，12874-12882（2011）。9。nat。10。nat。Mortensen，K。I.，Churchman，L。S.，Spudich，J.A.和Flyvbjerg，H。单分子跟踪和超分辨率显微镜的优化定位分析。方法，7.5，377-381（2010）。Helmerich，D。A.等。 照片处理指纹分析绕过10 nm的分辨率障碍。 方法19.8，986-994（2022）。 11。 Huisken，J。等。 通过选择性平面照明显微镜在实时胚胎深处的光学切片。 科学305.5686，1007-1009（2004）。Helmerich，D。A.等。照片处理指纹分析绕过10 nm的分辨率障碍。方法19.8，986-994（2022）。11。Huisken，J。等。通过选择性平面照明显微镜在实时胚胎深处的光学切片。科学305.5686，1007-1009（2004）。
开放博士学位学生 /博士后职位：HIV-1大会和成熟电话：2024年5月28日，传染病系，海德尔伯>病毒学< / div>
开放博士学位学生 /博士后职位：HIV-1组装和成熟会致电：2024年5月28日，海德堡大学传染病系，病毒学系为PhD学生提供职位，并在所有职业生涯水平上为逆转录病毒复制中的组装，成熟和入场后的活动提供职位。研究将在DFG资助的合作研究中心1129（https://www.sfb1129.de/）的Hans-GeorgKräusslich和BarbaraMüller组中进行。我们的小组研究了HIV-1组装的多个方面，成熟以及进入以及逆转录病毒复制的早期阶段。HIV-1组装发生在专门的膜微区域生产者细胞的质膜上。颗粒最初以不成熟的非感染形式释放。与颗粒释放，病毒蛋白酶对主要结构多蛋白的蛋白水解裂解导致病毒形态的急剧改变。然而，蛋白酶激活和调节的机理以及成熟过程仍然很少理解。成熟的，锥形的衣壳最近被公认为是HIV-1复制后进入后事件的关键编排（Müller等，2022）。我们正在研究颗粒形成的结构和动态方面，特别关注蛋白酶激活和随后的变化（Schimer等，2015； Hanne等，2016; Qu等人。2021）。复杂的组装，成熟和进入后事件通过传统批量方法逃脱分析。因此，我们使用高级显微镜以高时间或空间分辨率可视化单个粒子水平的事件。与Briggs组合作获得的数据（Qu et al。，2021）令人惊讶地揭示了不仅帽子蛋白晶格，而且还表明，矩阵（MA）晶格在蛋白水解成熟后都会进行结构重排，这表明MA在现实事件中目前不知名的作用。这涉及活细胞成像，FRET/FLIM，Sted和MinFlux纳米镜以及相关的光和电子显微镜和冷冻电子显微镜，后者与其他组合作。这些研究将与病毒学和细胞生物学方法以及计算模拟相辅相成，以研究蛋白酶激活和成熟的过程及其生物学后果。我们在互动和国际科学环境中提供了具有生物医学相关性的退出和高度跨学科的研究主题，包括在国际竞争性的水平上与国家和国际合作伙伴的合作。这些项目是SFB1129的一部分，涉及研究中心内不同学科的群体的密切互动。实验室位于综合传染病研究中心（www.ciid-heidelberg.de），该研究还设有独特的最新IDIP成像平台（www.idip-heidelberg.org）。成功的博士生候选人将入学HBIGS国际研究生院（http://www.hbigs.uni-heidelberg.de/），以从该计划的出色科学培训中受益。PostDocs将有资格获得Heidelberg University Heitracks计划（https://www.uni-heidelberg.de/en/research/support-for-early-career-career-cresearch-careearcher-careercearchers/carifate-support）的结构化职业支持。申请人应具有相关学科的硕士学位或博士学位（分子和细胞生物学，生物化学，生物物理学或分子医学）。他们应该有兴趣使用各种方法解决基本的病毒学问题，并使用
耶鲁大学生物医学工程博士毕业生
Ryan Nguyen 用于揭示组织工程和癌症中的机械生物学现象的多尺度方法 Mak 2023 年 5 月 Kate Bridges 经食道超声心动图患者特定二尖瓣建模的图像分析和生物力学 Miller-Jensen 2023 年 5 月 Liang Yang 体外自组装网络的分析 Levchenko 2023 年 5 月 Yuqi Wang 揭示小鼠生殖系干细胞中 MILI 的功能和分子机制 Lin 2023 年 5 月 Alborz Feizi 用于高通量离体人体器官研究的工程工具 Tietjen 2023 年 5 月 David Dellal 先进机电器官保存平台的开发和验证 Sestan 2023 年 5 月 Kevin Ta 超声心动图心脏运动分析和分割的多任务学习 Duncan 2023 年 5 月 Alexandra Suberi mRNA 治疗的肺部递送 Saltzman 2023 年 5 月 Archer Hamidzadeh 使用基于 FRET 的生物传感器阐明细胞外信号调节激酶 (ERK) 动力学 Levchenko 2022 年 12 月 Dave O'Connor 脑内动态功能连接的定量分析 Constable 2022 年 12 月 Feimei Liu 扩展单域抗体库和应用 Carson 2022 年 12 月 Xingjian Zhang 癌症和镰状细胞病的生物物理特征 Mak 2022 年 12 月 Alexander Josowitz 用于局部递送小分子抑制剂的聚合物纳米粒子：胶质母细胞瘤和气道的应用 Saltzman 2022 年 12 月 Shawn Ahn 注意力神经网络在 3D 超声心动图心脏应变分析中的应用 Duncan 2022 年 12 月 Rebecca Byler 治疗皮肤利什曼病的局部贴剂开发的合理方法 Kyriakides 2022 年 12 月 Hao Xing 基于细胞和细胞外基质的方法研究糖尿病成纤维细胞并改善伤口愈合 Kyriakides 2022 年 5 月 Chang Liu 3D 组织模型中肿瘤细胞的迁移以及与 ECM 和基质的相互作用 Mak 2022 年 5 月 Zach Connerty-Marin 在纳米尺度上量化膜拓扑结构 Bewersdorf 2022 年 5 月 MinSoo Khang 鞘内递送 NP 用于治疗软脑膜转移 Saltzman 2022 年 5 月 Shi Shen 逆转录病毒的研究工程心脏组织中的重塑现象 Campbell 2022 年 5 月 Jenette Creso 心肌机械功能和疾病的多尺度建模 Campbell 2022 年 5 月 Juntang Zhuang 机器学习方法估计全脑有效连接组以识别自闭症 Duncan 2022 年 5 月 Margaret Elise Bullock 使用 HIV 基因表达随机模型探索染色质介导的转录噪声调控 Miller-Jensen 2022 年 5 月 Ann Chen 开发和提供基因组编辑疗法以改善胶质母细胞瘤治疗 Zhou 2022 年 5 月 Katherine Leiby 工程功能性远端肺上皮 Niklason 2022 年 5 月 Ons M'Saad 蛋白质在其超微结构背景下的光学显微镜检查 Bewersdorf 2022 年 5 月 Kevin Hu 活细胞中的多色各向同性超分辨率 Bewersdorf 2022 年 5 月 Samantha Rossano Synaptic使用正电子发射断层扫描的 SV2A 密度成像：参考区域分析的优化和 Carson 2021 年 12 月 Andrew Barentine 定量超分辨率显微镜 Bewersdorf 2021 年 12 月 Muhammad Khan 脑癌跨室钠成像 Hyder 2021 年 12 月 Allison Greaney 肺组织工程的改进：迈向功能性气管和肺置换 Niklason 2021 年 5 月 Siyuan Gao 高维脑成像数据的潜在因子分析 Scheinost 2021 年 5 月 Rita Matta 微血管信号在神经源性微环境的作用 Gonzalez 2021 年 5 月 Edward Han 血管生物人工内分泌胰腺的开发 Niklason 2021 年 5 月 Heather Liu PET 中的动力学建模、参数估计和模型比较：神经递质动力学的功能图像 Morris 2021 年 5 月 John Walsh 监测肿瘤进展和治疗反应的独特血管和代谢特征 Hyder 2021 年 5 月 Micha Sam Raredon 肺泡肺的单细胞系统工程 Niklason 2020 年 12 月 Luyao Shi 高级定量心脏核成像 Liu 2020 年 12 月 Amanda Alexander 研究 TLR4 诱导的巨噬细胞分泌中细胞间异质性的调节和后果 Miller-Jensen 2020 年 12 月 Jason Szafron 用于改进组织工程血管移植物设计的数学模型 Humphrey 2020 年 12 月 Lorenzo Sewanan 使用人类干细胞衍生的心肌细胞、enginCampbell 2020 年 12 月 Zach Augenfeld 自动使用 MRI 距离图通过术中锥形束 CT 分割进行多模态配准 Duncan 2020 年 5 月 Jeffery (Alex) Clark 表征微尺度异质性对心肌宏观机械功能的影响 u Campbell 2020 年 5 月 Ramak Khosravi 用于治疗先天性心脏病的组织工程血管移植物的数据驱动计算模型 D Humphrey 2020 年 5 月 Rebecca LaCroix 激酶定位对细胞信号传导和行为影响的研究 Levchenko 2020 年 5 月 Xiaoxiao Li 用于表征自闭症神经影像生物标志物的数据驱动策略 Duncan 2020 年 5 月 Ayomiposi Loye 用于骨科应用的块状金属玻璃 Kyriakides 2020 年 5 月 Ronald Ng 研究机械负荷在致心律失常性心肌病中的作用 Campbell 2020 年 5 月 Fan Zhang Layer卷积神经网络中的嵌入分析可改善不确定性估计和分类 Duncan 2020 年 5 月 Sean Bickerton 纳米粒子系统用于在体内生成调节性 T 细胞用于自身免疫性疾病治疗 Fahmy 2019 年 12 月 Nadine Dispenza 加速非线性梯度编码策略用于并行磁共振成像 Constable 2019 年 12 月 Alexander Svoronos 使用 pH 低插入肽 (pHL) 进行肿瘤靶向抑制致癌微小 RNA 用于癌症治疗 Engelman 2019 年 12 月 MaryGrace Velasco 用于深层组织应用的三维 STED 显微镜 Bewersdorf 2019 年 12 月 Shari Yosinski 用于片上实验室诊断的电子粒子操作 Reed 2019 年 12 月 Yang Xiao 微血管工程用于疾病建模和再生医学 Fan 2019 年 5 月 Alexander Engler 综合生理与系统设计全肺组织工程方法 Niklason 2019 年 5 月 Young-Eun Seo 用于局部递送 miRNA 抑制剂治疗胶质母细胞瘤的纳米粒子 Saltzman 2019 年 5 月 Zhuo Chen 用于分析巨噬细胞活化动力学的单细胞微芯片 Fan 2019 年 5 月 Ian Linsmeier 活性肌动球蛋白力学：无序网络中收缩的协同性和缩放性 Murrell 2018 年 12 月 Haiying (Allen) Lu 基于学习的心脏应变分析正则化 Duncan 2018 年 12 月