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Sanger 生命之树 HMW DNA 碎片化：用于 PacBio HiFi 的 Diagenode Megaruptor®3
本方案描述了使用 Diagenode Megaruptor®3 从 MagAttract v.1、Plant MagAttract v.1 或 Plant MagAttract v.2 Sanger Tree of Life HMW DNA 提取方案中对 HMW DNA 进行片段化。该过程对于从生命之树计划涵盖的所有分类群中提取 DNA 非常有效，DNA 被剪切成平均 12-20 kb 大小的片段。然而，具有挑战性的样本包括那些浓度高或粘度大的样本，以及 DNA 提取后含有污染物或杂质的样本。该方案的输出是剪切的 DNA，可以使用手动或自动 SPRI 方案将其用于碎片 DNA 清理。该协议已更新为 Sanger Tree of Life HMW DNA Fragmentation：Diagenode Megaruptor® 3 for LI PacBio，以处理由 Sanger Tree of Life HMW DNA Extraction：Automated MagAttract v.2、Automated Plant MagAttract v.3 和 Automated Plant MagAttract v.4 协议产生的样本。
桑格生命树Hmw DNA碎片：li pacbio
该协议描述了使用diaganodeMegaruptor®3的植物Magattract v.3或植物Magattract V.4植物Magattract V.4植物Magattract V.4植物Magattract V.4植物Magattract v.4使用iaganodeMegaruptor®3的生命HMW DNA提取方案的片段化。此过程对于从生命之树计划所涵盖的所有分类组中的DNA提取物中清除和较短的片段去除非常有效，DNA剪切成平均片段大小范围为12-20 kb。但是，高度浓缩或粘性样品具有挑战性。该协议的输出是剪切的DNA，可以用手动或自动化的SPRI协议针对碎片的DNA清除。该协议改编自Sanger Life Tree HMW DNA片段：Pacbio Hifi的diaganodeMegaruptor®3，以处理由Sanger Life Tree HMW DNA提取的样本HMW DNA提取：自动化MagAttract v.2，自动化植物Magattract V.3，自动化工厂Magattract V.3和自动化工厂Magattrack V.4协议。
小基因组的桑格方法。博士...
技术背后的概念相似。它将荧光核苷酸一一添加到DNA模板螺纹中，该螺纹在NGS和Sanger序列中生长DNA聚合酶（也称为二氧基或CAPS电泳序列）。由每个添加的核滴荧光标签定义。
开源软件Staden软件包Sangen软件包Sanger测序结果分析
DNA的核苷酸序列包含有关生物体遗传特征的信息，尤其是单核苷酸多态性（SNP），显示DNA中一个核苷酸序列的差异也可能影响表型变化。因此，有必要精确地读取核苷酸序列信息，以改善家养动物的经济特征。Sanger测序是DNA测序方法之一，被广泛用于验证全基因组关联研究结果以及对中小型实验的DNA序列的分析。已经开发了几个程序来分析此类测序结果，其中一个开源程序之一是Staden软件包（https://staden.sourceforge.net），这是一个开源程序之一，是一个有用的程序，具有与其他需要许可证费用的商业化计划相比具有很高的成本优势。通过Staden软件包中安装的PreGAP4和GAP4程序，序列组装和用户提供的设置进行编辑分析
挥发性有机化合物和微生物之间的关系是由Sanger测序和GC – IMS确定的原始绵羊奶奶酪
摘要：最近，消费者对全球工匠奶酪的兴趣有所增加。不同的自摄取和特征性的乳酸细菌（LAB）的能力产生香气以及对奶酪中挥发性有机化合物（VOC）（VOCS）的识别是在选择具有最佳芳族特性的菌株时考虑的重要方面。这项工作的目的是确定孤立的VOC和微生物之间的关系（乳酸乳酸菌乳酸菌，lactiplantibacillus plantarum，Leuconostoc梅森特罗氏菌和乳酸乳酸乳酸菌hordniae）使用准确性和替代方法中的生羊奶奶酪（成熟和奶油天然）。将Sanger测序与实验室识别与气相色谱结合到离子迁移率光谱法（GC – IMS）以确定VOC时，我们描述了奶酪并区分每种微生物在其伏叶片中的潜在作用。每个实验室的贡献都可以根据其不同的VOC文件来描述。显示了每种奶酪中实验室行为之间的差异，尤其是参与奶油奶酪的实验室之间的差异。仅乳酸乳杆菌亚种。 hordniae和L. mesenteroides在de Man Rogosa和Sharpe（MRS）培养物中显示出相同的VOC PRE，但对于不同的奶酪，在脱脂牛奶培养物中的VOC生产中显示了两个差异。 乳酸乳酸乳酸亚乳突的发生。 据报道，奶酪的大杂草是第一次据报道。仅乳酸乳杆菌亚种。hordniae和L. mesenteroides在de Man Rogosa和Sharpe（MRS）培养物中显示出相同的VOC PRE，但对于不同的奶酪，在脱脂牛奶培养物中的VOC生产中显示了两个差异。乳酸乳酸乳酸亚乳突的发生。据报道，奶酪的大杂草是第一次据报道。奶酪的大杂草是第一次据报道。
使用EXO-CIP™快速PCR清理套件处理的PCR扩增子对基因组编辑效率进行快速分析，然后是Sanger测序
对于CRISPR/CAS工作流程，核酸酶和相应GRNA的选择直接影响基因组编辑后的indel频率的计算。当前用于评估编辑效率的当前METH OD使用来自转染的细胞的合并GDNA的PCR扩增，然后是基于测序或基于测序的基于测序或基于不匹配的裂解的分析分析的变性和重新启动的indneal indneal indneal DNA（4）。为加快编辑效率的确定并避免昂贵的NG测序，“通过分解来跟踪Indels”（Tide）（5）和“ CRISPR编辑的推断”（ICE）方法（6）是开发用于使用sanger sequenc dna sequenceenc dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna（ice）方法（ICE）方法（ICE）方法（ICE）。但是，要使这些方法可靠，分析的PCR产品必须具有高质量（例如，单个频带，没有底漆和DNTP）。在本文中，我们证明了通过Exo-CIP快速PCR清洁套件方法清理的扩增子质量匹配，该方法是通过使用ICE软件工具进行批处理分析的传统基于旋转柱的套件来实现的，从而启用了更快，更高的推出方法，以制备旋转后的样品，用于旋转后的样品。
多细胞，IVT衍生的，未修饰的人类转录组，用于纳米直接RNA分析
协议使用Oligo名称序列（5'→3'）IVT FWD PRIMER PCR NANOPORE_IVT_T7_FORWARD_FORED_PRIMER TAATACGACTCACTATAGCGCGGGCGGCGGTTTTTTTTTTTTTTTCTGTGTGTGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGTTGTTGTGCT IVT REV PIRER PIRER PRIMER PCR NANOPORE_IVTRIMERER_TRIMERERIMERERIMer Sanger Seq的ActTGCCTGTCGCTTCTTCTC PCR F PRIMER在Chr1上：23792793 Sanger_Chr1：23792793_f ccgtgtgtggtggtggtgtgtgtgtgtggt pcr r pcr r Primer for sanger seq for sanger seq in Chr1：23792793 sanger_chr1：2379327927927927992799279999279999999999999999999999999999.23999999999999999999. caggtagcagccaaacaggt pcr f primer for sanger seq for chr2：117817639 sanger_chr2：117817639_f gggaggcatgtctcatcatcaagaagca pcr r primer，用于sanger seq的sanger seq in Chr2：117817639 sanger_chr2：117817639 sanger_chr2： AAACTAAATGGCTGAAGTTCAAAGA PCR F primer for Sanger seq at Chr19:2917188 Sanger_Chr19:2917188_F ACTGTGGACGAAAAGCACCT PCR R primer for Sanger seq at Chr19:2917188 Sanger_Chr19:2917188_R sanger seq的tccgacactgctcgcattt pcr f primer在CHR3：19950940 sanger_chr3：19950940_f ggacatggctagtcgaggc pcr r启动sanger seq at ch ch chr3：19950940 sanger_chr3：19950940 sanger_chr3：199505 seq chr4：109816233 sanger_chr4：109816233_f atgtttttcgaggcgggcggggggcgggg pcr r primer primer for sanger seq for chr4：109816233 sanger_chr4：109816233 CHR1：35603333 PSMB2_PSEUDOU_F_PRIMER TGTTTGGGTACCTCTCTACCAC PCR PCR PCR F PRIMER PRIMER for SANGER SEQ在Chr1上：35603333333333 psmb2_pseudou_r_r_r_r_r_r_r_r_r_primer aggacatgatgatgatgatgatgatgttaggtaggaggagccc
工程永生的细胞快速启动指南
1。Editco建议尽快（在1-3个段落内）尽快对细胞进行基因分型。要评估您编辑的单元格的基因型，您可以使用下一代测序（NGS）或Sanger测序。用于单个指南淘汰赛和CRISPR编辑，如果您想使用NGS分析基因型，我们建议使用Crispresso。ngs启动序列可在质量控制报告中为您的项目提供，您可以使用Editco的CRISPR编辑（ICE）工具来分析单指，多指定和敲门CRISPR编辑，该工具依赖于Sanger测序。值得注意的是，Editco的ICE工具是目前唯一用于分析多指南派生CRISPR编辑的公开选项。对于Sanger测序，将根据要求提供PCR引物。您可以联系technicalsupport@editco.bio，以获取有关您的订单的Sanger Primer建议。 请注意，我们的Sanger底漆建议是使用标准生物信息学算法计算的。 它们未通过Editco在功能上验证。 有关如何隔离基因组DNA，PCR扩大靶向区域以及为Sanger测序准备的说明，可以在我们的基因分型方案中获得。 分别在我们的ICE基因敲除和敲入分析方案中详细介绍了使用ICE评估敲除或敲入编辑效率的说明。 对于小敲门剂，我们建议通过Sanger测序和冰分析来识别细胞的编辑基因型。 对于大型敲击，可以使用PCR产物的Junction PCR和Sanger测序来识别插入的序列。您可以联系technicalsupport@editco.bio，以获取有关您的订单的Sanger Primer建议。请注意，我们的Sanger底漆建议是使用标准生物信息学算法计算的。它们未通过Editco在功能上验证。有关如何隔离基因组DNA，PCR扩大靶向区域以及为Sanger测序准备的说明，可以在我们的基因分型方案中获得。分别在我们的ICE基因敲除和敲入分析方案中详细介绍了使用ICE评估敲除或敲入编辑效率的说明。对于小敲门剂，我们建议通过Sanger测序和冰分析来识别细胞的编辑基因型。对于大型敲击，可以使用PCR产物的Junction PCR和Sanger测序来识别插入的序列。
基因分型
或者，您可以使用依赖于 Sanger 测序的 EditCo 的 CRISPR 编辑推断 (ICE) 工具来分析单指导、多指导和敲入 CRISPR 编辑。值得注意的是，EditCo 的 ICE 工具目前是分析多指导衍生的 CRISPR 编辑的唯一公开可用选项。CRISPR 编辑推断 (ICE) 工具是一款免费的在线软件，可分析 Sanger 测序数据以确定编辑效率。在使用 ICE 之前，必须准备编辑和对照 DNA 样本进行 Sanger 测序。该协议提供了如何设计引物、分离基因组 DNA 和进行 PCR 的说明。这些说明可用于每个靶标使用一个 sgRNA（或 cr:tracr）或每个靶标使用多个 sgRNA（即 EditCo 的多指导设计）的敲除实验。该协议也可用于敲入实验。如果您需要 Sanger 测序引物，可以联系 Technicalsupport@editco.bio。请注意，Sanger 引物建议是使用标准生物信息学算法计算得出的。EditCo 并未对其进行功能验证。
公司寡核苷酸合成 DNA/RNA 分析
DNA/RNA 分析 30 多年的 DNA Sanger 测序经验使 Microsynth 成为欧洲领先的测序供应商之一。该公司在瑞士、德国、法国和奥地利建立了 Sanger 测序实验室，能够在这些国家提供 Sanger 测序服务，其特点是速度无与伦比，并且提供环保的取货服务。此外，它还通过其 Ecoli Nightseq ® 设立了另一项行业标准。这是一项改变游戏规则的全新服务，可以更快、更经济高效地对大肠杆菌的质粒进行测序。Microsynth 提供的高质量下一代测序服务涵盖了 Illumina 的全系列测序平台 - 包括小 RNA、总 RNA 和 DNA 在内的一套全面的测序文库 - 可对从病毒到人类的所有生物体以及质粒进行 DNA 和 RNA 测序