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或者,您可以使用依赖于 Sanger 测序的 EditCo 的 CRISPR 编辑推断 (ICE) 工具来分析单指导、多指导和敲入 CRISPR 编辑。值得注意的是,EditCo 的 ICE 工具目前是分析多指导衍生的 CRISPR 编辑的唯一公开可用选项。CRISPR 编辑推断 (ICE) 工具是一款免费的在线软件,可分析 Sanger 测序数据以确定编辑效率。在使用 ICE 之前,必须准备编辑和对照 DNA 样本进行 Sanger 测序。该协议提供了如何设计引物、分离基因组 DNA 和进行 PCR 的说明。这些说明可用于每个靶标使用一个 sgRNA(或 cr:tracr)或每个靶标使用多个 sgRNA(即 EditCo 的多指导设计)的敲除实验。该协议也可用于敲入实验。如果您需要 Sanger 测序引物,可以联系 Technicalsupport@editco.bio。请注意,Sanger 引物建议是使用标准生物信息学算法计算得出的。EditCo 并未对其进行功能验证。

基因分型

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