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内大陆架内部潮汐饱和度...
摘要：在此，我们开发了一个框架来理解第一部分中提出的观测结果。在这个框架中，由于随着水深 H 的减小幅度受限，内潮在变浅时会饱和。从这个框架可以推导出内潮平均能量的估计值；具体来说，能量 h APE i 、能量通量 h FE i 和能量通量发散 › xh FE i 。由于我们观察到耗散 h D i ' › xh FE i ，我们也将 › xh FE i 的估计值解释为 h D i 。这些估计值代表了内潮在内大陆架饱和时的能量参数化。参数化完全取决于深度平均分层和水深测量。总结一下，h APE i 、h FE i 和 › xh FE i 的跨陆架深度依赖性与冲浪区浅滩表面重力波的依赖性类似，这表明内陆架是内潮汐的冲浪区。针对一系列数据集对我们的简单参数化进行的测试表明，它具有广泛的适用性。
使用CRISPR Prime编辑
使用CRISPR Prime编辑Steven Erwood 1,2，Teija M.I.的饱和变体解释。bily 2，†，Jason Lequyer 1,3，†，Joyce Yan 2，Nitya Gulati 1,2，Reid A.Brewer 2,4，Liangchi Zhou 2，Laurence Pelletier 1,3，Evgueni A. Ivakine 2,4，*，Ronald D. Cohn 1,2,4,5 1。加拿大多伦多多伦多大学分子遗传学系2.遗传学和基因组生物学计划，加拿大安大略省多伦多的病儿童研究所医院3.Lunenfeld-Tanenbaum研究所，加拿大安大略省多伦多山医院4.加拿大多伦多多伦多大学生理学系5。多伦多大学儿科和生病儿童医院，加拿大多伦多的医院†这些作者在过去十年中向Zhenya.ivakine@sickkids.ca摘要贡献了同样的贡献，在过去的十年中，下一代测序在临床实践中已广泛实施。 然而，由于经常确定具有不确定意义的遗传变异（VU），因此对这种变体的缩放功能解释的需求变得越来越明显。 一种解决此问题的方法是饱和基因组编辑（SGE），它允许对单核苷酸变体进行缩放的多重功能评估。 但是，SGE的当前应用依赖于同源指导的维修（HDR）引入感兴趣的变体，这受到较低的编辑效率和低产品纯度的限制。 此外，我们设计了一种基因组编辑策略，该策略允许基因基因座的单倍体化，该策略允许几乎任何细胞类型中的孤立变体解释。多伦多大学儿科和生病儿童医院，加拿大多伦多的医院†这些作者在过去十年中向Zhenya.ivakine@sickkids.ca摘要贡献了同样的贡献，在过去的十年中，下一代测序在临床实践中已广泛实施。然而，由于经常确定具有不确定意义的遗传变异（VU），因此对这种变体的缩放功能解释的需求变得越来越明显。一种解决此问题的方法是饱和基因组编辑（SGE），它允许对单核苷酸变体进行缩放的多重功能评估。但是，SGE的当前应用依赖于同源指导的维修（HDR）引入感兴趣的变体，这受到较低的编辑效率和低产品纯度的限制。此外，我们设计了一种基因组编辑策略，该策略允许基因基因座的单倍体化，该策略允许几乎任何细胞类型中的孤立变体解释。在这里，我们对SGE进行了改编的CRISPR质量编辑，并证明了其在理解溶酶体储存障碍尼曼 - 佩克病C1（NPC）的NPC1基因中变体的功能意义的实用性。通过将饱和素编辑（SPE）与临床相关的测定相结合，我们在NPC1单倍体HEK293T细胞中的功能评分和解释了256种变体。为了进一步证明该策略的适用性，我们使用SPE和细胞模型单倍体化在BRCA2基因中的功能上为465个变体分数。我们预计我们的工作将可以翻译成具有适当的细胞测定法的任何基因，从而可以更快，准确地诊断，改善遗传咨询，并最终确切地精确的患者护理。引言精度或个性化药物必然是基于对人群中发现的遗传变异的强烈理解。因此，人类疾病基因中发现的VU的优势是实现
通过中IIR量子级联激光的ISB过渡的低强度饱和 引用：Rodani T.，Osmenaj E.，Cazzaniga A.，Panighel M.，Africh C.＆Cozzini S.朝扫描隧道显微镜图像的公开化。 高... 中用于准阶段匹配的微流体设备 微生物组对主机社区动态的影响 β-氯环己烷触发神经炎症活性，表观遗传组蛋白翻译后修饰和认知功能障碍 STAT3抑制作用通过恢复肌肉干细胞中的自噬来恢复老化肌肉的再生 在... 之后，富含二氨基蛋白的意大利面的潜在益生元作用 肠道轴调节能量的新机制 电解质门控石墨烯Terahertz振幅调节器 基于空腔的纠缠光子的来源 - 纳米光子晶体D形纤维设备，用于标签... Terahertz光电检测中可伸缩的单层... 2D金属和有机框架中的带结构工程 纳米颗粒的仿生合成 开发基于约瑟夫森连接的单光子微波检测器，用于轴突检测实验 纳米... 的硅设计，建筑物和气体吸附 材料加速平台（地图）：加速材料研发以应对紧急社会挑战 在软X射线照射下Fapbbr3钙钛矿的降解和自我处理
我们证明，可以设计中红外跨带过渡的吸收饱和，以10-20 kW cm 2的中等光强度和室温下。该结构由一系列具有明智设计的253 nm厚的GAAS/ALGAAS半导体异质结构的金属 - 气管导体 - 金属金属斑块组成。在低入射强度下，结构在强光 - 耦合方面起作用，并在接近8.9 L m的波长下表现出两个吸收峰。饱和作为向弱耦合方案的过渡，因此，在增加入射强度时向单峰吸收。与耦合模式理论模型进行比较解释了数据，并允许推断相关的系统参数。当泵激光器在空腔频率上调谐时，随着入射强度的增加，反射率会降低。相反，当激光器以极化频率调谐时，反射性非线性会随着入射强度的增加而增加。在这些波长下，系统模仿了MID-IR范围内可饱和吸收镜的行为，这是当前缺失的技术。
饱和基因组编辑解决了致病性 VHL 等位基因的功能谱
。CC-BY 4.0 国际许可证下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2023 年 6 月 10 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.06.10.542698 doi：bioRxiv 预印本
DDX3X 的饱和基因组编辑阐明了生殖系和体细胞变异的致病性
图 1 实验设计 A) 对于每个外显子，在 5' 和 3' 端设计两个独立的 sgRNA 和相关的 HDR 变体文库。B) 将 sgRNA 和 HDR 变体文库一起转染到表达 LIG4 -KO Cas9 的 HAP1 细胞中。sgRNA 指导 Cas9 介导的双链 DNA 切割到目标外显子。HDR 利用质粒文库作为修复模板，将单个感兴趣的 DDX3X 变体整合到每个细胞的内源位点中。每个供体模板还携带 1-3 个 NGG PAM 位点和原型间隔物的同义变化，防止重新切割。由于 DDX3X 是必需的，消除基因功能的变体会导致这些细胞死亡。我们在第 4、7、11、15 和 21 天对细胞进行取样，并对基因组 DNA 进行深度测序以量化变体的丰度。我们预计功能性错义（紫色）和同义变体（Syn，蓝色）仍然丰富，而功能丧失变体（LOF，红色）和有害错义（黄色）变体将从培养物中耗尽。
随机饱和诱变生成高度多样化的定向进化文库
为了了解每种野生型氨基酸对不同侧链性质的可及性，我们将所有 20 种氨基酸分为 8 类：非极性（NP、M、I、L、V、A）、极性不带电（PU、S、T、Q、N）、带正电荷（PC、R、K、L）、带负电荷（NC、D、E）、芳香族（Ar、F、T、Y）和三个特殊基团 P、C、G，由于其性质不同，每个基团仅由一个氨基酸组成。通过易错 PCR，每种野生型氨基酸都有一些不可接近的性质类别，如图 4c 所示。此外，在
内大陆架内潮汐饱和度。第一部分：观测
内大陆架是冲浪区和中大陆架之间的区域，表面和底部边界层 (BBL) 在此汇合甚至重叠 ( Lentz 1994 )。在这里，横岸风有助于跨内大陆架的输送 ( Fewings 等人 2008 )，而中大陆架的输送则由埃克曼动力学引起的沿岸风驱动。内大陆架的另一个先前未研究过的显著特征是，内大陆架是内潮汐几乎失去所有能量的区域。后者是我们在这里的重点，并引出了内大陆架作为内潮汐冲浪区的作用的新区分 ( Becherer 等人 2021 ，以下简称第二部分 )。这种内部冲浪区，其中内部潮汐以受水深限制的饱和状态存在，具有与表面重力波冲浪区类似的特征（Thornton 和 Guza 1983；Battjes 1988）。内部潮汐要么在当地产生（Sharples 等人 2001；Duda 和 Rainville 2008；Kang 和 Fringer 2010），要么在传播路径较长的偏远地区产生（Nash 等人 2012；Kumar 等人 2019），将大量能量传输到内架（Moum 等人 2007b；Kang 和 Fringer 2012）。在这里，能量被湍流耗散，产生斜压混合，从而导致水体转化。在内架上，内部潮汐在驱动
定量评估孔流体分布对复杂电导率饱和指数的影响
摘要诱导的极化方法（IP）方法具有强大的潜力，可以更好地表征我们星球的临界区域，尤其是在以多相流动为特征的区域中。散装，表面和正交电导率与孔隙水饱和度之间的功率 - 功率 - 差异可能可用于绘制地下水分含量分布。然而，已经观察到这些功率流行关系中的饱和指数n和p随着地材料的质地和孔隙流体的湿气而变化。实验室中的传统实验设置不允许独立可视化孔隙流体分布。因此，两个饱和指数的物理解释尚不清楚。我们使用粘土涂层的玻璃珠开发了一种新型的毫米 - 流体微型模型，该玻璃珠具有出色的可见性和高IP响应。通过实验室实验，我们同时确定了微型模块的复合电导率，并通过此类多孔材料获得了由排水和吸收产生的相应的孔隙尺度流体分布。基于晶粒的复杂表面电导的升级，进行了复杂电导率的有限元模拟，以确定理想的孔隙流体分布下的饱和指数。结果表明，饱和指数n和p因绝缘流体的神经节大小而变化。饱和指数n和p与饱和孔连接性的变化速率表现出功率差异关系，这是通过计算Euler特征的导数来计算的。这些发现为饱和指数与微观流体分布之间的关系提供了新的物理解释。
基于基因组编辑的功能评估和BRCA2单核苷酸变体的临床分类
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年12月15日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.12.14.571597 doi：Biorxiv Preprint
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