就像单个多肽链可以自变成复杂的3D结构一样,单个DNA可以自折入DNA折纸。大多数DNA折纸结构(即支架堆盖和DNA瓷砖系统)都使用数百个短单链DNA。因此,这些结构带来了分子间结构固有的挑战。如果折纸结构是由一个DNA链构造的,涉及分子间相互作用的许多组装挑战可以解决,在一个DNA链中构建,折叠与浓度无关,折叠结构对核酸酶降解具有更耐药性,并且可以在成本千分之一的情况下以工业尺度以一千分之一的范围实现合成。本评论讨论了单链DNA折纸中采用的设计原理和考虑因素及其潜在的好处和缺点。
摘要:线粒体DNA(mtDNA)特别容易受到体细胞诱变的影响。潜在机制包括DNA聚合酶γ(POLG)误差和诱变剂(例如活性氧)的作用。在这里,我们研究了瞬时过氧化氢(H 2 O 2脉冲)对培养的HEK 293细胞MtDNA完整性的影响,并应用了Southern印迹,超深的短读和长阅读测序。在野生型细胞中,在H 2 O 2脉冲后30分钟,出现线性mtDNA片段,代表双链断裂(DSB),其末端的特征是短GC拉伸。完整的超涂层mtDNA物种在治疗后2-6小时内重新出现,并在24小时后几乎完全回收。与未经处理的细胞相比,H 2 O 2处理的细胞中BRDU掺入较低,这表明快速恢复与mtDNA复制无关,而是由单链断裂(SSB)快速修复和DSB生成的线性片段的降解所驱动的。遗传失活在外丝酶中降解的遗传降解有效POLG P.D274A突变细胞导致线性mtDNA片段的持续性,对SSB的修复无影响。总而言之,我们的数据突出了SSB修复和DSB降解的快速过程与氧化损伤后MTDNA的重新合成较慢之间的相互作用,这对MTDNA质量控制具有重要意义,对MTDNA质量控制和潜在的体细胞mTDNA删除。
摘要:受自然发生的调节机制的启发,这种机制允许在基因表达和生物途径中实现具有可编程延迟的复杂时间脉冲特征,我们在此展示了一种在基于 DNA 的链置换反应 (SDR) 中实现时间编程脉冲输出信号的策略。为了实现这一点,我们合理设计了输入链,一旦与目标双链结合,就可以逐渐降解,从而产生脉冲输出信号。我们还设计了阻断链,以抑制链置换并确定产生脉冲反应的时间。我们表明,通过控制阻断链和输入链的降解率,我们可以在 10 小时的范围内精细地控制延迟脉冲输出。我们还证明,通过利用输入链和阻断链的降解反应的特异性,可以在同一溶液中正交延迟两种不同的脉冲反应。最后,我们在此展示了这种延迟脉冲 SDR 的两种可能应用:DNA 纳米结构的时间编程脉冲装饰以及基于 DNA 的图案的顺序出现和自擦除形成。
DNA模板链中的一个特定碱基三联体为5'Agt 3'。此序列对应于密码子:O3'UCA 5。问题22(2分)以下哪项是密码子不正确的?它永远不会代码多个氨基酸;它是遗传密码的基本单位;它代码甲硫氨酸停止;它可能与另一个密码子相同的氨基酸编码;或它由三个核苷酸组成。将mRNA转化为多肽的主要结构的准确性取决于:核糖体与mRNA的结合,反密码子与密码子的键,核糖体的A和P位点的形状,氨基酸与TRNA的附着;或以上所有选项。模板链以3'至5'的方向读取,而mRNA则以5'至3'方向读取。在mRNA中发现的相应密码子将是UCA。
toehold介导的链位移的单分子力光谱Andreas Walbrun 1,*,Tianhe Wang 2,*,Michael Matthies 2,Petršulc2,3,Friedrich C. Simmel 2,+ Matthias Rief,Matthias Rief 1慕尼黑技术大学生物科学系综合蛋白质科学中心(CPA),Ernst-Otto-Fischer-STR。8,85748德国Garching。 电子邮件:matthias.rief@mytum.de 2。 慕尼黑技术大学,TUM自然科学学院,生物科学系,AM COULOMBWALL 4A,85748 GARCHING,德国。 电子邮件:simmel@tum.de 3。 亚利桑那州立大学生物设计学院的分子科学和分子设计与生物仪中心,美国亚利桑那州南卡利斯特大街1001号,美国亚利桑那州坦佩市85281,美国 *这些作者同样贡献:安德烈亚斯·沃尔布伦(Andreas Walbrun) (TMSD)在动态DNA纳米技术中广泛使用,并且是多种基于DNA或RNA的反应电路的基础。 以前的研究通常依赖于散装荧光测量值来研究TMSD的动力学,该动力学仅提供有效的,散装平均的反应速率,并且无法在单个分子甚至碱基对的水平上解决该过程。 在这项工作中,我们使用单分子力光谱(SMF)探索单分子水平的链位移过程的动力学,并具有由最先进的粗粒元模拟支持的光学陷阱。 此外,我们使用力研究了DNA入侵RNA的动力学,这一过程很少发生力。8,85748德国Garching。电子邮件:matthias.rief@mytum.de 2。慕尼黑技术大学,TUM自然科学学院,生物科学系,AM COULOMBWALL 4A,85748 GARCHING,德国。电子邮件:simmel@tum.de 3。亚利桑那州立大学生物设计学院的分子科学和分子设计与生物仪中心,美国亚利桑那州南卡利斯特大街1001号,美国亚利桑那州坦佩市85281,美国 *这些作者同样贡献:安德烈亚斯·沃尔布伦(Andreas Walbrun) (TMSD)在动态DNA纳米技术中广泛使用,并且是多种基于DNA或RNA的反应电路的基础。 以前的研究通常依赖于散装荧光测量值来研究TMSD的动力学,该动力学仅提供有效的,散装平均的反应速率,并且无法在单个分子甚至碱基对的水平上解决该过程。 在这项工作中,我们使用单分子力光谱(SMF)探索单分子水平的链位移过程的动力学,并具有由最先进的粗粒元模拟支持的光学陷阱。 此外,我们使用力研究了DNA入侵RNA的动力学,这一过程很少发生力。亚利桑那州立大学生物设计学院的分子科学和分子设计与生物仪中心,美国亚利桑那州南卡利斯特大街1001号,美国亚利桑那州坦佩市85281,美国 *这些作者同样贡献:安德烈亚斯·沃尔布伦(Andreas Walbrun) (TMSD)在动态DNA纳米技术中广泛使用,并且是多种基于DNA或RNA的反应电路的基础。以前的研究通常依赖于散装荧光测量值来研究TMSD的动力学,该动力学仅提供有效的,散装平均的反应速率,并且无法在单个分子甚至碱基对的水平上解决该过程。在这项工作中,我们使用单分子力光谱(SMF)探索单分子水平的链位移过程的动力学,并具有由最先进的粗粒元模拟支持的光学陷阱。此外,我们使用力研究了DNA入侵RNA的动力学,这一过程很少发生力。通过探测toehold结构的发夹的末端,我们可以通过微秒和纳米分辨率实时触发和观察TMSD。使用微流体测定法,我们将发夹暴露于触发链的溶液中,我们发现在负载下,TMSD的进行非常迅速,单步时间为1 µs。将不匹配引入入侵者序列使我们能够调节稳定性,以使入侵和重新染色在均衡中也发生,即使在负载下也是如此。这使我们能够在单个分子上研究数千个入侵/入侵事件,并分析入侵过程的动力学。将我们的发现推送到零载荷,我们发现DNA入侵DNA的单步速度比入侵RNA快的速度快四倍。我们的结果揭示了序列效应对TMSD过程的重要性,并且对于核酸纳米技术和合成生物学的广泛应用至关重要。关键字:肋骨调节器,脚趾介导的链位移,分支迁移,单分子力光谱
两个系统之间的主要区别是两个系统可以提供的度量范围和测量频率。离线SCM提供了一系列可用的施法器MEA Surements,因为没有空间或配置的限制,可以使用全范围的MEA Suring传感器,而在线SCM则必须与铸造过程和设备集成,从而限制了可以为空间和限制提供的测量范围,从而可以仅提供仅用于差异的测量值。但是,每当新的铸造序列开始时,在线系统每天可能是4或5次,而离线系统通常仅在停机时间使用,例如在常规维护活动中使用。
学习成果的目的3.10是与年轻人就大众文化和在线的性信息和图像的流行和影响进行对话,并帮助他们批判性地研究这可能如何影响他们对性,性规范和期望的新兴理解。首先要帮助学生反思自己对性关系的价值观和期望,以及他们认为是健康的成人性体验的特征,例如护理,同意,平等,尊重,信任,相互愉悦。然后,讨论流行文化和在线肯定中的信息和图像如何与其价值观和期望矛盾。
摘要 - 排序算法是数据处理中的基本工具。排序一直是算法研究人员的深层领域,许多资源已投资于分类算法的更多工作。为此,已经审查了许多现有的分类算法的算法复杂性性能。在本文中,实现了使用消息传递接口(MPI)和计算统一设备体系结构(CUDA)方法实现链排序算法。使用标准基准数据集对建议的工作进行了测试。提出的算法的主要思想是将输入数据集的元素分为几个其他临时子清单,以并行处理。使用MPI和CUDA实现的算法增强了算法的性能。使用MPI和19.9270分别使用CUDA获得的平均速度为3.9187。索引术语 - 链排序,消息传递接口,计算统一设备体系结构,加速
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