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最近,癌症免疫疗法的令人兴奋的进展已引入了癌症治疗的新时代,尤其是在许多实体瘤的治疗领域中(1)。免疫检查点抑制剂(ICI)主要包括抗胞毒性T-淋巴细胞相关蛋白4(CTLA-4)和反编程的细胞死亡1/编程死亡死亡配体(PD-1/PD-L1)(2)(2)。ICI改善了在实体瘤中的患者存活率,例如黑色素瘤,非小细胞肺癌,转移性尿路癌,肝细胞癌,胃癌(3-6)。但是,并非所有癌症患者都受到免疫疗法的好处。例如,只有大约5%的转移性三阴性乳腺癌患者获得了对PD-1/PD-L1阻断的阳性反应(7,8)。因此,对预测免疫疗法反应的相应生物标志物的研究对癌症患者具有很大的意义。 第三级淋巴结构(TLSS)是在慢性炎症和肿瘤发生过程中在非淋巴组织中形成的异位淋巴器官,其中包括B细胞和T细胞(9)。 TLSS中存在的免疫细胞增强了肿瘤抗原的表现,通过细胞因子扩增信号,并激活CD8+ T细胞以靶向和破坏肿瘤细胞(10,11)。 tlss是触发和维持对肿瘤的局部和全身T和B细胞反应的焦点的关键作用。 已经证明了从几种实体瘤鉴定出的 TLSS与ICIS治疗的癌症患者的结局相关(11-19)。 但是,缺乏用于TLSS评估的统一标准。因此,对预测免疫疗法反应的相应生物标志物的研究对癌症患者具有很大的意义。第三级淋巴结构(TLSS)是在慢性炎症和肿瘤发生过程中在非淋巴组织中形成的异位淋巴器官,其中包括B细胞和T细胞(9)。TLSS中存在的免疫细胞增强了肿瘤抗原的表现,通过细胞因子扩增信号,并激活CD8+ T细胞以靶向和破坏肿瘤细胞(10,11)。tlss是触发和维持对肿瘤的局部和全身T和B细胞反应的焦点的关键作用。TLSS与ICIS治疗的癌症患者的结局相关(11-19)。但是,缺乏用于TLSS评估的统一标准。通常,TLSS的存在或较高的密度表明接受ICIS治疗的癌症患者的预后有利(11-16,18)。值得注意的是,一些研究还报告说,在接受ICIS治疗的癌症患者中,例如头部和颈部鳞状细胞癌和结肠直肠癌的TLSS存在与PFS或OS的存在显着相关(20,21)。各种研究都采用了不同的标准,有些研究将TLSS归类为高密度或低密度(22-24),而其他研究则仅使用TLSS的存在或不存在作为评估的基准(23,25)。此外,TLSS成熟度的程度是某些研究中考虑的因素(26)。这些分类方法中的多样性可能会影响与TLSS相关的预后预测能力。因此,有必要进行更新,更全面的荟萃分析,以探讨用ICIS治疗的癌症患者中三级淋巴结构(TLSS)和临床结果之间的关联。这项研究的主要目的是通过分析通过ICIS治疗的癌症患者的第三纪淋巴样结构(TLS)和临床结果之间的关联来探索与免疫疗法相关患者中的预后生物标志物,以研究接受ICIS治疗的癌症患者的预后价值。
与欧洲人群相比,亚洲人表现出对代谢疾病,尤其是糖尿病的敏感性增加(1)。虽然这种差异归因于遗传差异,但在东亚和欧洲的祖先之间仅确定了有限数量的特定遗传变异。对433,540个东亚个体的具有里程碑意义的荟萃分析为几种先前未报告的糖尿病相关的变体提供了有力的证据,其中醛脱氢酶2(ALDH2)RS671 rs671出现了特别不值得的(2)。这种变体发生在约30% - 东亚人的50%,但不到欧洲血统的5%(3)。荟萃分析表明,ALDH2 RS671 G等位基因会增加糖尿病的风险,表明A等位基因具有潜在的保护作用(2)。虽然荟萃分析为这种遗传关联提供了令人信服的证据,但包括研究纳入研究的异质糖尿病诊断标准,对研究中混杂因素的调整有限,这表明需要使用标准化的临床测量进行其他验证。在特定种群中的研究,例如患有冠状动脉疾病或肥胖症的人群,已经报告了与变体相关的糖尿病风险增加的矛盾发现(4-6),进一步强调了系统调查在良好的特征群体中的重要性。aldh2是一种对酒精衍生的乙醛解毒至关重要的线粒体酶,在杂合载体中的活性降低了60%至80%,该突变的纯合子载体的降低约为90%(7)。这就提出了有关aldh2携带者通常会由于乙醛快速积累而导致的酒精敏感性症状,包括面部浮动,头痛和心动过速,导致饮酒量降低(3)。虽然一些孟德尔随机研究已经确定了Aldh2 rs671与酒精消耗之间的关联以及酒精摄入与糖尿病发展之间的因果关系,但直接联系这些因素的证据仍然有限(8-10)。最近的临床和实验证据表明,除了其对酒精消耗的影响之外,ALDH2 rs671多态性通过其在脂质过氧化物过氧化的醛中的酶促毒素中的作用而显着影响各种人类疾病,并参与了非甘油含量的过程(3)。
糖尿病是一个日益增长的公共卫生问题,其医疗保健成本和发病率很高。根据国际糖尿病联合会(IDF)报告的数据,中国的糖尿病患者数量最多,估计有1.41亿成年人在2021年患有该疾病,预计到2045年(1)到2045年。糖尿病微血管并发症是糖尿病最常见的并发症,主要是糖尿病肾脏疾病和糖尿病性视网膜病。糖尿病性肾脏疾病(DKD)是全球慢性肾脏疾病(CKD)和末期肾脏疾病(ESRD)的最常见原因,导致巨大的劳动和社会成本(2,3)。蛋白尿和肾功能降低是糖尿病患者DKD的显着临床病理特征(4)。典型的病理特征包括内皮细胞功能受损,足细胞疾病,肾小球肾小球膨胀,地下膜增厚,管状硬化症和管状间隙纤维化(5)。纤维化,氧化应激和凋亡是DKD肾损伤病理生理学的主要因素(6)。糖尿病性视网膜病是糖尿病患者失明的主要原因,进一步分为非增殖性视网膜病(NPDR)和增殖性视网膜病(PDR)。糖尿病性视网膜病是由代谢异常引起的(7)。典型的病理生理学包括视网膜毛细血管基底膜增厚,血管通透性增加,组织缺血的各种血管活性物质和新血管形成(8)。甲状腺功能减退症的诊断取决于血清TSH水平升高。NPDR通常以微型神经瘤形成和视网膜血管的较小扩张为特征,而PDR的特征是新生血管的特征。甲状腺功能减退症是由甲状腺功能减退症或甲状腺激素耐药的各种原因引起的一种全身性低代谢综合征(9)。病理学的特征是粘多糖在组织和皮肤中的积累,这表现为粘液水肿。甲状腺功能减退症的主要原因是自身免疫性障碍,甲状腺破坏,碘过量和使用抗甲状腺药物。甲状腺功能减退症通过增加心外膜血管渗透性和降低白蛋白淋巴引流而导致心包积液,从而导致心包腔中积液(10)。甲状腺功能减退症的治疗旨在恢复正常的甲状腺功能。甲状腺功能障碍(TD)和糖尿病(DM)是具有不同
头颈癌是全球第六个最常见的癌症(Warnakulasuriya,2009年),口服和口咽癌是最常见的亚型。烟草和酒精消耗(Hashibe等,2009),人乳头瘤病毒(HPV)感染(Ang等,2010)和特定的性行为(Heck等,2010)已被认为是口腔和口腔和口腔咽部癌症癌症危险因素。最近,人们对癌症与微生物组之间的联系越来越多。特别是,在肠道微生物组中已经观察到癌症相关的生物标志物(Cullin等,2021)。肠道菌群是肠道中存在的细菌种类的集合。肠道微生物在肿瘤中的作用可以分为局部和远端角色(Matson等,2021)。除了特异性肠道微生物在局部致癌作用中具有的重要作用外,肠道微生物还可以改变宿主的整体免疫系统,从而导致癌症(Castellarin等,2012; Amieva and Peek,2016)。肠道微生物与肠上皮之间存在天然的解剖屏障,主要由分泌肠道粘液的杯状细胞组成(Kim和Ho,2010)和产生抗菌肽的细胞(Salzman等人(Salzman et al。,2007))。因此,肠道微生物与免疫系统之间的接触受到限制。但是,特定的微生物会影响肠道屏障的完整性。益生菌调节免疫系统是一种潜在的抗肿瘤策略(Vétizou等,2015)。当这种完整性被破坏时,癌的数量越来越多,通过受损的肠道障碍循环(Rajagopala等,2017);此外,诱导了炎症或免疫抑制,在促进癌症中起间接作用(Yu and Schwabe,2017)。An example illustrating this distal role is that the gut microbiota can promote hepatocellular carcinoma and pancreatic cancer growth/progression/invasion and metastasis, which contain no known microbiome, by elevating cancer- promoting in fl ammatory microbial-associated molecular patterns such as lipopolysaccharides ( Dapito et al., 2012 ; Ochi et al., 2012 ).肠道微生物可以通过调节肠上皮屏障的原发性和继发性淋巴机构来调节免疫力,从而影响肿瘤微环境(Gopalakrishnan等,2018)。先前已经报道了肠道微生物与肠肿瘤敏感性之间的关联(Yachida等,2019)。肠道微生物群已被证明通过调节免疫细胞功能,影响炎症反应,调节免疫耐受性(Zhou等,2021)和产生代谢物(Zhang等,2019)。然而,肠道菌群与肠胃外肿瘤(尤其是口咽和口服癌症)之间的因果关系尚不清楚。Mendelian随机化(MR)是一种统计方法,用于根据工具变量(遗传变异)评估暴露与结果之间的因果关系,可以看作是随机对照试验(RCT)的自然类似物。因此,我们旨在研究肠道菌群是否与口服和与传统的黄金标准RCT相反,参与者根据其基因型分配,从而减少了反向因果关系和混杂因素(例如道德和社会经济因素)的影响。
先天免疫是宿主对病原体入侵的第一条防御线。病毒感染后,宿主细胞识别与结构一致的病原体相关的分子模式,这促使他们迅速启动一系列信号传导过程,从而导致I型Interferon(IFN)(IFN)和其他抗病毒物质产生(1)。在细胞质中传感病毒DNA后,CGA催化了ATP和GTP的环状GMP-AMP(CGAMP)的形成(2)。cgamp进一步激活刺痛,这是内质网上关键的淋巴结蛋白(3)。在微粒体中,激活的刺激性易位从内质网易位,募集伴侣分子TBK1,磷酸化的TBK1招募IRF3(4)。激活的IRF3从细胞质转移到细胞核,以启动I型IFN的产生并诱导抗病毒免疫反应(5,6)。伪造病毒(PRV)引起的人畜共患病伪造是危害猪养殖进一步生长的最危险的爆发之一(7)。伪标记病毒也被称为猪疱疹病毒,猪是PRV的天然容器(8)。PRV可以感染不同年龄的猪群,导致生殖疾病,流产,母猪的堕胎,猪的神经系统疾病和死亡,繁殖公猪的无菌性以及免疫促进性和免疫症状和生长迟缓(9)。PRV会感染许多哺乳动物,从而导致人类,家畜,狗和小鼠的发病率或急性死亡(10-12)。PRV是A HERPESVIRUS家族的成员,已经发展了与宿主免疫反应对抗的策略(15)。对PRV致病机制的研究对于预防和管理动物疾病以及由于PRV可能感染及其高致病性而导致的人的健康和安全至关重要。疱疹病毒是编码病毒蛋白的一类免疫抑制病毒,可以通过不同的方式调节免疫反应并促进病毒免疫逃逸(13、14)。据报道,由PRV编码的各种Tegument蛋白可能调节由CGAS丁字裤信号通路介导的抗病毒先天免疫,从而促进病毒复制和潜在感染(16)。PRV Tegument蛋白UL21通过选择自噬途径结合CGA并诱导CGAS降解(17)。prv ul13靶向刺激和IRF3,并抑制DNA信号通路的激活(18,19)。蛋白酶体路线由于PRV US3而降低了BCLAF1,并且还可以防止ISGF3与ISRE结合的能力(20)。PRV UL42竞争性地将ISRE与ISGF3结合,并减少ISG的产生(21)。这些报告表明,PRV Tegument蛋白可以通过多种方式抑制宿主免疫反应。但是,PRV逃脱宿主先天免疫并调节I型IFN响应的更多机制尚不清楚。我们的研究表明,PRV Tegument蛋白US2是CGAS丁字途径的新调节剂,可防止IFN产生和抗病毒免疫,以响应PRV感染。虽然US2与STING相互作用并降低其稳定性,但US2缺乏率降低了由于PRV而降解的STING蛋白量。尤其是US2与E3泛素一起
最近进步[20,29,30]中的2D图像结构,以方法为例,例如在广泛的文本图像配对数据集中受过训练的扩散模型(例如,Laion-series [31]),在与文本提示符的一致性图像中取得了显着的前进。尽管取得了成功,但实现对图像产生的精确控制以满足复杂的用户期望仍然是严重的挑战。ControlNET [38]通过在特定条件数据集上进行微调修改Foun-odation-2D扩散模型来解决此问题,从而提供由用户特异性输入引导的微妙控制机制。另一方面,尽管有希望的进展[27,35],但与2D图像生成中遇到的那些相比,3D对象的生成更为复杂。al-尽管从透视感中观察到了进步,包括直接3D数据集[10,25]上的3D扩散模型,以及将2D扩散率提升到3D复位(例如NERF [21])通过SDS损失的技术优化[27],没有完全对生成Ob-Ob-ob-ob-ob-jects的控制。对初始文本提示或2D参考图像的依赖严重限制了发电的可控性,并且通常会导致质量较低。文本提示缺乏准确传达复杂3D设计的特异性;尽管2D参考图像可以告知3D重建,但它们并没有捕获3D结构的完整深度,可能导致各种意外的人类。此外,基于2D图像的个性化缺乏直接3D操纵可以提供的灵活性。这些障碍表明需要采取不同的策略。实现可控制的3D发电的直接想法是将控制网络调整为3D生成。但是,该策略遇到了重大障碍:(i)3D的控制信号本质上更为复杂,这使得与2D范式相比,有条件的3D数据集对构成的3D数据集进行了挑战; (ii)3D域中没有强大的基础模型,例如2D [20]的稳定扩散,阻碍了此时开发微调技术的可能性。结果,我们倾向于
引用黄,Tony P.,Zachary J. Heins,Shannon M. Miller,Brandon G. Wong,Pallavi A. Balivada,Tina Wang,Ahmad S. Khalil等。“针对单核苷酸 - 吡啶二酰胺PAM的紧凑型Cas9变体的高通量连续演变。”nat Biotechnol 41,no。1(2022):96-107。doi:10.1038/s41587-022-01410-2
增生性糖尿病性视网膜病(PDR)是一个晚期糖尿病性视网膜病的阶段,是全球生产年龄人群中不可逆失明的主要原因(1,2)。以视网膜新血管形成为特征,导致严重的并发症,例如新生血管瘤,玻璃体出血和视网膜脱离,PDR的发病机理尚未完全阐明(3,4)。尽管影像学和管理方面最近取得了进步(5),但了解潜在的分子机制对于开发有效的疗法至关重要。氧化应激在糖尿病中显着加剧,在PDR发病机理中起关键作用(6)。它损坏了视网膜脉管系统中的线粒体结构和DNA,损害了细胞功能(7)。这种压力是新血管单位侮辱的关键因素,为PDR的核心病理生理基础。此外,由于防御机制受损,糖尿病患者更容易受到氧化应激的影响,进一步强调了氧化应激在包括PDR在内的糖尿病性视网膜病变的发育和进展中的作用,包括PDR(8)。单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ)通过对各种疾病的细胞和分子维度提供详细的见解,具有明显的晚期疾病研究(9,10)。其在单个细胞水平上剖析基因表达的能力揭示了PDR的复杂细胞景观,从而区分了患病状态和健康状态(11)。Hu等人进行的研究。为使用SCRNA-SEQ在研究PDR(12)中提供了宝贵的见解。这些作者强调了SCRNA-SEQ在基因表达方面的应用,从PDR患者的纤维血管膜中鉴定细胞群,并揭示了小胶质细胞在PDR的纤维血管膜中的新作用。这些研究共同强调了Scrna-Seq在揭开
2型糖尿病(T2DM)在21世纪(国际糖尿病联合会(IDF),2022年)以惊人的速度增长。T2DM及其并发症在所有地区都带来了沉重的疾病负担(Ali等,2022)。确定与T2DM发展有因果关系的因素可以为预防疾病提供重要的证据基础,并促进新治疗策略的发展。肠道菌群(GM)是一个复杂的生态系统,由大约4×10 13种共生细菌,原生动物,真菌,古细菌和病毒组成(Chen等,2021; Martino等,2022)。gm参与了人体的各种生理活性,例如代谢,炎症过程和免疫反应(Fan and Pedersen,2021; Gill等,2022)。越来越多的证据表明,转基因在T2DM等代谢疾病中起重要作用(Gurung等,2020)。T2DM患者患有代谢疾病和慢性炎症状态,并伴有GM障碍(Yang等,2021)。还发现了GM组成的变化与T2DM的发展以及相关并发症的显着关联(Iatcu等,2021),例如,门类细菌群/企业的不平衡与近距离渗透性相关联,与近距离渗透性相关联,并渗透性渗透性,伴有细胞质,伴有细胞质,并渗透性,并伴有细胞处理效果。随后的DM的炎症反应特征(Iatcu等,2021)。也已经报道了几种细菌,例如发酵乳杆菌,足底和酪蛋白,罗斯伯里亚肠道,akkermansia muciniphila和fragilis菌丝,通过降低流量疗法和维持肠道的速度(IIAT)(降低dm)的风险,通过降低DM发育的风险来发挥保护作用(20)。 尽管如此,有必要区分引起疾病的GM的特征以及疾病或其治疗引起的疾病的特征。 孟德尔随机化(MR)是评估可观察到的可修改暴露或危险因素与临床相关结果之间观察到的关系的因果关系的宝贵工具(Sekula等,2016)。 由于孟德尔的种族隔离和独立的分类法,它可以消除与传统观察性流行病学研究相比,可以消除混杂的偏见,并促进了出现的因果途径的分离表型分组风险也已经报道了几种细菌,例如发酵乳杆菌,足底和酪蛋白,罗斯伯里亚肠道,akkermansia muciniphila和fragilis菌丝,通过降低流量疗法和维持肠道的速度(IIAT)(降低dm)的风险,通过降低DM发育的风险来发挥保护作用(20)。尽管如此,有必要区分引起疾病的GM的特征以及疾病或其治疗引起的疾病的特征。孟德尔随机化(MR)是评估可观察到的可修改暴露或危险因素与临床相关结果之间观察到的关系的因果关系的宝贵工具(Sekula等,2016)。由于孟德尔的种族隔离和独立的分类法,它可以消除与传统观察性流行病学研究相比,可以消除混杂的偏见,并促进了出现的因果途径的分离表型分组风险