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发现RNA ADP核糖基化逆转酶揭示了可能针对有毒攻击的防御模块
摘要核酸ADP-核糖基化及其在催化和水解中的杂化酶在生命的所有王国中都普遍存在。然而，目前不Xpleder Xpled ，其在哺乳动物和细菌pH y生物学中的作用包括 - 植物间冲突。 R ecently, se v eral e xamples of enzymatic sy stems f or RNA ADP-ribosylation ha v e been identified, sho wing that all major types of RNA species, including messenger RNA, ribosomal RNA, and transfer RNA, can be targeted by ADP -ribosyltransf erases (ARTs) whic h at tac h ADP-ribose modifications either to nucle- obases, the backbone核糖或磷酸盐末端。 对于属于宏观域，ARH或Nadar Superf Amilies的RNA ADP-核糖基化的可抗性知之甚少。 在这里，我们表征了ADP-核糖基y drolase对RNA物种ADP-核糖基化的drolytic活性。 我们证明了Nadar ADP-核糖基Y drolase是唯一能够在磷酸末端RNA ADP-核糖基上不活跃的同时，唯一能够对鸟氨酸RNA RNA碱基ADP-核糖基化。 此外，我们揭示了含宏域的PARG酶是唯一具有具有2'-H y DRO Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl rNA ADP-核糖基催化催化催化sed b y pseudomonAsAsAsAsuginosa效应的特定和有效性的Drolase类型。 moreo ver，使用Rhsp2 /细菌作为e茎，我们证明了par g酶可以作为对抗Xins抗菌RNA-T的保护性免疫酶的作用。，其在哺乳动物和细菌pH y生物学中的作用包括 - 植物间冲突。R ecently, se v eral e xamples of enzymatic sy stems f or RNA ADP-ribosylation ha v e been identified, sho wing that all major types of RNA species, including messenger RNA, ribosomal RNA, and transfer RNA, can be targeted by ADP -ribosyltransf erases (ARTs) whic h at tac h ADP-ribose modifications either to nucle- obases, the backbone核糖或磷酸盐末端。对于属于宏观域，ARH或Nadar Superf Amilies的RNA ADP-核糖基化的可抗性知之甚少。在这里，我们表征了ADP-核糖基y drolase对RNA物种ADP-核糖基化的drolytic活性。我们证明了Nadar ADP-核糖基Y drolase是唯一能够在磷酸末端RNA ADP-核糖基上不活跃的同时，唯一能够对鸟氨酸RNA RNA碱基ADP-核糖基化。此外，我们揭示了含宏域的PARG酶是唯一具有具有2'-H y DRO Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl rNA ADP-核糖基催化催化催化sed b y pseudomonAsAsAsAsuginosa效应的特定和有效性的Drolase类型。moreo ver，使用Rhsp2 /细菌作为e茎，我们证明了par g酶可以作为对抗Xins抗菌RNA-T的保护性免疫酶的作用。
炎性型靶向疗法作为主动脉动脉瘤和解剖的新型治疗选择：临床前证据的系统评价
血吸虫病是一种全球流行的，使人衰弱的疾病，受化学疗法控制不佳，不存在疫苗。尽管人们可能会随着反复的感染和治疗而发展的部分耐药性，但一些动物，包括棕色大鼠（Rattus Norvegicus），只是半疗法的，并且具有自然保护。为了理解这种保护的基础，我们探讨了棕色大鼠对棕色大鼠感染的免疫反应的性质。感染会导致IgG与复杂型N-聚糖一起产生寄生虫糖蛋白，其中含有核心α2-木糖和核心α3-凝胶（核心xyl/FUC）的非哺乳动物型修饰。这些表位在血吸虫和成年蠕虫的表面上表达。重要的是，这些表位的IgG可以通过体外补体依赖性过程杀死血吸虫。此外，受感染的恒河猴和感染的棕色大鼠的血清能够以含有核心xyl/fuc的糖肽抑制的方式杀死血吸虫。这些结果表明，棕色大鼠和恒河猴中对棘体感染的保护性抗体包括对表面表达的N-聚糖中核心Xyl/FUC表位的IgG反应，并提高了可能开发出可与这种疾病作用的新型Glyco疫苗的潜力。
气候变化破坏了高山生态系统中植物和土壤微生物养分循环的季节性耦合
fi g u r e 2在高山草原中评估的全范围植物和土壤特性的季节性动态。属性按最大季节进行分组：（a）春季； （b）夏天； （c）秋天。在灌木膨胀下，某些特性明显更高（ + s）或较低（-s）。AOA，氨氧化古细菌； AOB，氨氧化细菌； CBH，几核酸水解酶； GLC，β-葡萄糖酶； NAG，N-乙酰葡萄糖氨基酶； Per，过氧化物酶； Pho，磷酸酶；痘，苯酚氧化酶； URE，尿布； xyl，β-二基固醇酶。 出于可视化的目的，将所有变量缩放为平均值为0，标准偏差为1。 对未量化的数据进行统计分析n = 8。 有关更多详细信息，包括实际均值和SE，精确的P和χ2值，请参见表S1 – S3。AOA，氨氧化古细菌； AOB，氨氧化细菌； CBH，几核酸水解酶； GLC，β-葡萄糖酶； NAG，N-乙酰葡萄糖氨基酶； Per，过氧化物酶； Pho，磷酸酶；痘，苯酚氧化酶； URE，尿布； xyl，β-二基固醇酶。出于可视化的目的，将所有变量缩放为平均值为0，标准偏差为1。对未量化的数据进行统计分析n = 8。有关更多详细信息，包括实际均值和SE，精确的P和χ2值，请参见表S1 – S3。
Streptomyces Stramineus作者：Labeda等。 1997 ...
Genus: Streptomyces FH 6172 Species: stramineus Numbers in other collections: DSM 41783 Morphology: G R ISP 2 good saffron yellow A SP zinc yellow none G R ISP 3 good zinc yellow A SP zinc yellow none G R ISP 4 good zinc yellow A SP zinc yellow none G R ISP 5 sparse beige A SP none none G R ISP 6 good brown beige A SP none none ISP 7 G R good brown beige A SP none none Melanoid pigment: --+- NaCl resistance: % Lysozyme resistance: pH: Value- Optimum- Temperature : Value- Optimum- 28 °C Carbon utilization: Glu Ara Suc Xyl Ino Man Fru Rha Raf Cel + - - - + - - - - + Enzymes: Gel Cit Ure Arg Onp Trp Lys Odc VP Ind H2S + + + + - - + + - - - 2+ 3- 4（+）5（+）6- 7- 8- 9+ 10（+）11+ 12+ 13-14-15-16+ 17-18+ 19+ 20-评论：
靶向选择素，siglecs和哺乳动物聚糖
聚糖参与细胞和有机生物学的基本方面，例如受体介导的细胞与正常过程和病原过程的基础的细胞相互作用。的确，细胞表面上的聚糖的致密层（糖蛋白）可以从某些细胞上的质膜延伸超过30 nm。细胞表面蛋白因此被嵌入在聚糖基质中。聚糖的各种功能与它们的各种结构相匹配。Glycans can be conjugated to proteins (to form glycoproteins , proteoglycans and glycosylphos- phatidylinositol (GPI)-anchored proteins) and lipids (to form glycolipids), or they can be secreted without conju- gation to other macromolecules (in the form of glycos- aminoglycans such作为透明质酸）。In humans, glycans are primarily constructed from ten monosaccharides: glucose (Glc), galactose (Gal), N -acetylglucosamine (GlcNAc), N -acetylgalactosamine (GalNAc), fucose (Fuc), xylose (Xyl), sialic acid (Neu5Ac), glucuronic acid (GlcA), mannose (Man) and id酸酸（IDOA）。通过与内质网和高尔基体相关的酶，将这些单糖的组装到聚糖中。单糖通过一种糖的异构碳和另一种羟基的糖苷碳连接在一起。糖苷键相对于异体碳（α与β）的方向影响聚糖的整体形状。因此，例如，乳糖galβ1-4Glc的符号是指通过葡萄糖C4上的β-糖苷键与羟基的半乳糖相关的。仅考虑这些因素，就有
区分核苷酸
摘要 细胞内高浓度的核苷酸 ( NTP ) 和低浓度的脱氧核苷酸 ( dNTP ) 之间的不平衡对 DNA 聚合酶从 dNTP 构建 DNA 时提出了挑战。目前认为，DNA 聚合酶通过空间门模型区分 NTP，该模型涉及 B 家族 DNA 聚合酶中聚合酶活性位点的酪氨酸和核苷酸的 2 ′ -羟基之间的冲突。借助活性位点具有 UTP 或 CTP 的 B 家族聚合酶的晶体结构、分子动力学模拟、生化分析和酵母遗传学，我们已经确定了聚合酶的指状结构域感知聚合酶活性位点中 NTP 的机制。与之前提出的极性过滤器相反，我们的实验表明，指状结构域中的氨基酸残基通过空间位阻感知核糖核苷酸。此外，我们的结果表明，掌状结构域中的空间门和指状结构域中的传感器在区分 NTP 时都很重要。结构比较表明，传感器残基在 B 家族聚合酶中是保守的，我们假设在所有类型的 DNA 聚合酶中都应考虑指状结构域中的传感器。
2024 年未来水资源大会要点
关键要点 • PFAS 是一个热门话题。最近宣布的 PFAS 联邦法规的影响，包括 4 ppt 的 MCL 痕量检测、五年补救时间表和超级基金（请参阅此处和此处的注释），仍在水务行业产生影响。我们看好 XYL 在补救方面的定位。TTEK 和 STN-CA 还讨论了他们作为 E&C 公司正在萌芽的补救机会。Aclarity 是几家有前途的 PFAS 销毁初创公司之一。 • 预计将有更多公用事业公司超过新的 4 ppt MCL。E&C 公司认为，将测试超过新的 4 ppt 限制的公用事业公司数量将比 EPA 初步预测的 5,000 家“多倍”，而补救最终将花费更多。 • 市场仍然没有经济的 PFAS 测试或可扩展的销毁技术。开发这两种能力的军备竞赛仍在继续。 • 有关水务行业如何从 AI 中受益的更多细节。今年，人们对水务行业如何利用人工智能来提高处理效率、检测无收益水、防止水管破裂和监测水质的兴趣大增。首先需要在网络中安装更多传感器来捕获越来越多的参数。• 雨水管理是水基础设施应对气候变化不可或缺的一部分。雨水意识和法规正在不断加强。小组成员认为雨水管理机会价值 150 亿美元，而且越来越需要促进跨系统/州的解决方案。• 数据中心的大量用水量正在受到严格审查。数据中心专家 Sam Allen 声称每次 ChatGPT 搜索都会使用一加仑水，引起了所有人的注意。行业正在将水利用效率 (WUE) 与电力使用效率 (PUE) 结合起来。
在微生物 CRISPR 干扰中使用缩短和随机 sgRNA 文库筛选新靶基因
摘要：CRISPR 干扰（CRISPRi）筛选已用于使用单分子向导 RNA（sgRNA）文库识别与特定表型相关的靶基因。在 CRISPRi 筛选中，包含原始靶标识别序列的随机 sgRNA 文库的大小很大（∼ 10 12 ）。在本文中，我们证明 sgRNA 中的靶标识别序列（TRS）的长度可以从原来的 20 个核苷酸（N 20 ）缩短到 9 个核苷酸（N 9 ），这仍然足以使 dCas9 抑制大肠杆菌木糖操纵子中的靶基因，无论其与启动子还是开放阅读框区结合。基于结果，我们构建了 TRS 长度 5′ 缩短的随机 sgRNA 质粒文库，并通过对从 Xyl − 表型细胞中纯化的 sgRNA 质粒进行桑格测序来识别木糖代谢靶基因。接下来，利用随机 sgRNA 文库筛选靶基因，以增强合成大肠杆菌细胞中紫色素的产生。通过分析深紫色菌落中 sgRNA 质粒中的 TRS 冗余度，选择了 17 个靶基因。其中，已知有 7 个基因（tyrR、pykF、cra、ptsG、pykA、sdaA 和 tnaA）可增加细胞内 L-色氨酸池（紫色素的前体）。17 个细胞中每个靶基因有一个缺失，紫色素的产量显著增加。这些结果表明，使用缩短的随机 TRS 文库进行 CRISPRi 可以简单且经济高效地进行基于表型的靶基因筛选。关键词：CRISPR 干扰、失活 Cas9、随机文库、缩短的 sgRNA、靶标识别序列、紫色素、基于表型的靶标筛选■简介
模拟试卷-IX
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