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摘要 细胞内高浓度的核苷酸 ( NTP ) 和低浓度的脱氧核苷酸 ( dNTP ) 之间的不平衡对 DNA 聚合酶从 dNTP 构建 DNA 时提出了挑战。目前认为,DNA 聚合酶通过空间门模型区分 NTP,该模型涉及 B 家族 DNA 聚合酶中聚合酶活性位点的酪氨酸和核苷酸的 2 ′ -羟基之间的冲突。借助活性位点具有 UTP 或 CTP 的 B 家族聚合酶的晶体结构、分子动力学模拟、生化分析和酵母遗传学,我们已经确定了聚合酶的指状结构域感知聚合酶活性位点中 NTP 的机制。与之前提出的极性过滤器相反,我们的实验表明,指状结构域中的氨基酸残基通过空间位阻感知核糖核苷酸。此外,我们的结果表明,掌状结构域中的空间门和指状结构域中的传感器在区分 NTP 时都很重要。结构比较表明,传感器残基在 B 家族聚合酶中是保守的,我们假设在所有类型的 DNA 聚合酶中都应考虑指状结构域中的传感器。

区分核苷酸

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