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Sharmin等人的线粒体由驱动蛋白3 ...
图3（a）：针对HMPV（PDB ID：5WB0）的抗病毒化合物和对照的分子动力学仿真结果（2000 ns）。模拟图表示平均（a）RMSD和（b）RMSF值，表明结构稳定性和灵活性。模拟图显示（D）SASA，（E）氢键形成和（F）结合自由能，说明了相互作用强度和分子暴露。循环（c）循环（rog）值的平均（c）半径被注释以突出结合的紧凑性。在测试的化合物中，Remdesivir展示了最稳定，最有效的结合，由低RMSD，高氢键和强结合自由能的支持。
脂肽的结构影响其体外抗 SARS-CoV-2 的抗病毒活性和作用方式
摘要 微生物脂肽由非核糖体肽合成酶合成，由疏水脂肪酸链和亲水肽部分组成。这些结构多样的两亲分子可以与生物膜相互作用并具有各种生物活性，包括抗病毒特性。本研究旨在评估 15 种不同脂肽对严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的细胞毒性和抗病毒活性，以了解它们的构效关系。非离子脂肽的细胞毒性通常比带电脂肽更强，阳离子脂肽的细胞毒性低于阴离子和非离子变体。在 100 µg/mL 时，六种脂肽将受感染的 Vero E6 细胞中的 SARS-CoV-2 RNA 降低至无法检测到的水平，而另外六种脂肽实现了 2.5 至 4.1 个对数的减少，三种没有显着影响。表面活性素、白线诱导因子 (WLIP)、芬尤金和卡泊芬净成为最有前途的抗 SARS-CoV-2 药物。详细分析显示，这四种脂肽影响了病毒生命周期的各个阶段，包括病毒包膜。表面活性素和 WLIP 显著降低了复制试验中的病毒 RNA 水平，与中和血清相当。表面活性素独特地抑制了病毒出芽，而芬尤金影响了感染前细胞治疗后的病毒结合。与其他药物相比，卡泊芬净的抗病毒作用较低。确定了影响脂肽细胞毒性和抗病毒活性的关键结构特征。含有大量氨基酸的脂肽，尤其是带电（优先为阴离子）氨基酸，表现出强大的抗 SARS-CoV-2 活性。这项研究为设计具有低细胞毒性和高抗病毒功效的新型脂肽铺平了道路，可能带来有效的治疗方法。
Tucaresol：具有两种不同抗病毒机制的临床阶段口服候选药物
Tucaresol：一种具有两种不同抗病毒机制的临床阶段口服候选药物。Christopher L. Penney*、Boulos Zacharie**、Jean-Simon Duceppe*** 摘要：自 1981 年艾滋病疫情爆发以来，全球约有 8600 万人感染艾滋病毒，目前全球约有 3900 万人感染该病毒。然而，艾滋病毒感染者数量分布不均，全球三分之二的感染者集中在撒哈拉以南非洲地区。由于病毒对药物具有耐药性，最有效的治疗方法需要三种药物联合使用，从而增加了治疗的复杂性和成本。因此，许多艾滋病毒感染者或有感染风险的人无法预防或治疗这种可能致命的疾病。艾滋病毒无法治愈[1]。Tucaresol 是一种口服临床阶段药物，通过保护或重建 CD4+ T 辅助免疫细胞发挥宿主靶向抗病毒作用。我们在此报告，Tucaresol 还表现出对感染 HIV 的人外周血单核细胞的体外活性。尽管这种体外抗病毒活性并不强，但 Tucaresol 出色的安全性和生物利用度以及低分子量支持在人体内达到相关药物浓度以实现显著的体内活性。先前报道的 1b/2a 期 HIV 临床试验中病毒血症稳定证明了这一点 [2]。Tucaresol 的显著体内活性可能来自 CD4+ T 辅助细胞的共刺激和对病毒感染细胞的直接活性之间的协同作用。Tucaresol 的全体外病毒筛选进一步揭示了对人类疱疹病毒 6B、人乳头瘤病毒 11、麻疹病毒和乙型肝炎病毒的弱而直接的抗病毒活性。关键词：Tucaresol、HIV、T 辅助细胞、CD4 受体。 ---------------------------------------------------------------------------------------------- * ChemThera Sciences 联合创始人。联系方式：clpenney09@gmail.com
基于AI的机器学习设计针对COVID-19
摘要在发现和开发新型药物样分子中用于治疗疾病已经变得更加至关重要。最近被感染的人遇到了死亡率或严重续集的重大风险。研究人员可以使用大量的化学，生物学和临床数据。因此，基于AI的机器学习算法可用于发现分子的特定化学数据特性生理活性之间的联系。这些数据也可用于开发模型，以预测特定病毒基因型与患者对治疗的临床反应的关系。在本文中，基于AI的机器学习技术已用于抗病毒研究。病毒宿主相互作用，药物抗药性预测以及新的抗病毒药物和疫苗的开发都可以从机器学习技术中受益。冠状病毒是针对抗病毒研究的本机学习评估中最重要的考虑因素，该研究表明，对98％的准确分析比其他方法高。关键字：抗病毒复合发现，机器学习，Covid 19病毒
ACAT抑制剂抑制SARS-COV-2复制并增强抗病毒T细胞活性
1中国医学科学院牛津研究所，牛津大学，牛津大学，牛津大学，牛津大学，英国2号，纳菲尔德医学系，牛津大学牛津大学，牛津大学，牛津大学，英国3英国感染与免疫学和免疫与移植研究所，UCL，UCL，伦敦，伦敦，金dom，Kingdom，4个皇后和分子医学学院，英国皇后科学院。 London, United Kingdom, 6 Departments of Molecular Medicine and Neuroscience, The Scripps Research Institute, San Diego, California, United States of America, 7 Skaggs Graduate School of Chemical and Biological Sciences, The Scripps Research Institute, San Diego, California, United States of America, 8 The Pirbright Institute, Woking, United Kingdom, 9 Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan, 10东京科学大学应用生物学系，日本诺达，11个研究中心，日本东京国立传染病研究所，日本东京，12个呼吸医学部和牛津卫生研究所，牛津生物医学研究中心，诺夫菲尔德医学院，牛津大学，牛津大学，牛津大学，牛津大学，美国联合王国，美国牛津大学。
尽管致命的 COVID-19 患者外周炎症强烈，但粘膜抗病毒反应延迟
1 伦敦帝国理工学院国家心肺研究所，伦敦，英国；2 爱丁堡大学炎症研究中心，爱丁堡，英国；3 格拉斯哥大学医学研究委员会病毒研究中心，格拉斯哥，英国；4 利物浦大学临床感染、微生物学和免疫学系，利物浦，英国；5 利物浦大学医院 NHS 基金会热带和传染病科，利物浦健康伙伴，利物浦，英国；6 爱丁堡大学罗斯林研究所，爱丁堡，英国；7 伦敦卫生与热带医学院临床研究系，伦敦，英国；8 国家健康与护理研究所，利物浦大学健康与生命科学学院感染、兽医学和生态科学研究所，新发和人畜共患感染健康保护研究组，利物浦，英国；9 呼吸医学，Alder Hey 儿童医院，利物浦，英国；英国爱丁堡皇家医院重症监护室
将抗病毒药物与 BET 抑制剂联合使用有利于对抗 SARS‐CoV‐2 感染
和对 SARS-CoV-2 生命周期至关重要的病毒蛋白，并证明了溴结构域和末端外结构域蛋白 2 和 4 (BRD2/BRD4) 与 SARS-CoV-2 的 E 蛋白相互作用。另一项利用 CRISPRi 筛选的研究表明，BRD2 抑制会下调血管紧张素转换酶 2 (ACE2) 表达，并通过下调干扰素刺激基因 (ISG) 来控制 COVID-19 患者的过度活跃免疫反应。6 此外，Gilham 等人报道，溴结构域和末端外结构域蛋白家族 (BET) 抑制剂阿帕贝龙 (RVX-208) 通过降低 ACE2 表达来阻断 SARS-CoV-2 感染，7 而 Qiao 等人表明，使用 BET 抑制剂对雄激素受体的转录抑制也会导致 SARS-CoV-2 感染减少。8
构建可诱导杆状病毒CRISPR/Cas9抗家蚕BmNPV病毒系统
1 中国科学院上海植物生理生态研究所，分子植物科学卓越创新中心，昆虫发育与进化生物学重点实验室，上海 200032；liuyujia@cemps.ac.cn (YL)；sqchen@sibs.ac.cn (SC)；yangdehong@cemps.ac.cn (DY)；lmtang2016@cemps.ac.cn (LT)；yangxu@cemps.ac.cn (XY)；yhwang@cemps.ac.cn (YW)；xy384@outlook.com (XL) 2 中国科学院大学，北京 100049 3 沈阳农业大学生物科学与技术学院蚕桑系，沈阳 110866； chendongbin@stu.syau.edu.cn 4 山东农业大学林学院，泰安 271018；ZhangXiaoqian7@aliyun.com 5 中国科学院武汉病毒研究所，国家病毒学重点实验室，武汉 430071；Wangml@wh.iov.cn * 通讯地址：huzh@wh.iov.cn (ZH)；yphuang@sibs.ac.cn(YH)
反复快速检测策略对 SARS-CoV-2 居家抗病毒治疗效果的影响
正如一贯所证明的那样，定期进行的快速检测可以帮助确定个人是否被感染和是否具有潜在传染性，从而为个人及其整个社区带来重大益处。对个人的另一个好处是，可以在感染期间足够早地进行阳性检测，以便用抗病毒疗法治疗可以有效抑制严重疾病的发展，特别是在 PCR 吸收有限且收到结果的延迟很大的情况下。在这里，我们提供了一个定量说明，说明在不同时间间隔进行的快速检测可以在多大程度上带来辉瑞新疗法 (Paxlovid) 带来的好处。我们发现，更常规地进行检测的策略（即每隔一天或每三天一次）与住院风险的降低有关，相应地，受感染人群中受益于治疗的比例更高。我们进一步观察到，减少从检测呈阳性到治疗的延迟和增加治疗覆盖率对平均治疗效益有关键影响，这表明获得治疗的重要性。
机器学习技术适用于筛查轻度创伤性脑损伤的患者
1中国医学科学院牛津研究所，牛津大学，牛津大学，牛津大学，牛津大学，英国2号，纳菲尔德医学系，牛津大学牛津大学，牛津大学，牛津大学，英国3英国感染与免疫学和免疫与移植研究所，UCL，UCL，伦敦，伦敦，金dom，Kingdom，4个皇后和分子医学学院，英国皇后科学院。 London, United Kingdom, 6 Departments of Molecular Medicine and Neuroscience, The Scripps Research Institute, San Diego, California, United States of America, 7 Skaggs Graduate School of Chemical and Biological Sciences, The Scripps Research Institute, San Diego, California, United States of America, 8 The Pirbright Institute, Woking, United Kingdom, 9 Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan, 10东京科学大学应用生物学系，日本诺达，11个研究中心，日本东京国立传染病研究所，日本东京，12个呼吸医学部和牛津卫生研究所，牛津生物医学研究中心，诺夫菲尔德医学院，牛津大学，牛津大学，牛津大学，牛津大学，美国联合王国，美国牛津大学。