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将单步基因组关联研究与多组织转录组分析的整合在一起，为羊毛和体重特征的遗传基础提供了新的见解
抽象背景：羊毛和生长特征的遗传改善是绵羊行业的主要目标，但其潜在的遗传建筑仍然难以捉摸。To improve our understanding of these mechanisms, we conducted a weighted single-step genome-wide association study (WssGWAS) and then integrated the results with large-scale transcriptome data for five wool traits and one growth trait in Merino sheep: mean fibre diameter (MFD), coefficient of variation of the fibre diameter (CVFD), crimp number (CN), mean staple length (MSL),油腻的羊毛重量（GFW）和活体重（LW）。结果：我们的数据集包括7135个具有表型数据的人，其中1217个具有高密度（HD）基因型数据（n = 372,534）。这些动物的707种基因型是从Illumina Ovine单核苷酸多态性（SNP）54 Beadchip归为HD阵列的。这些特征的遗传力范围从0.05（CVFD）到0.36（MFD），并且特征遗传相关性之间的遗传性范围为-0.44（CNvs。lw）至0.77（GFW与LW）。通过从500个样品中使用RNA-seq数据进行整体化（代表16只动物的87种组织类型），我们检测到与六个特征相关的组织，例如肝，肌肉和胃肠道（GI）是LW的最相关组织，白细胞和巨噬细胞是CN的最相关细胞。对于六个性状，鉴定出54个定量性状基因座（QTL），涵盖了21个卵巢常染色体上的81个候选基因。多个候选基因显示出强大的组织特异性表达，例如通过进行全现象关联研究（PHEWAS）bnc1（与MFD）和CHRNB1（LW）分别在皮肤和肌肉中特别表达。
物种形成和适应的遗传基础：从基因座到致病突变
进化是小步前进还是大步前进？进化的可重复性如何？进化过程受到多大限制？回答进化生物学中这些长期存在的问题对于理解现存生物多样性如何进化以及预测未来生物和生态系统如何应对不断变化的环境都是必不可少的。了解自然种群表型多样化和物种形成的遗传基础是正确回答这些问题的关键。基因组测序技术的飞跃使得研究遗传结构以及识别自然种群中适应和物种形成的变异位点变得越来越容易。此外，基因组编辑技术的最新进展使得研究自然种群生物中每个候选基因的功能成为可能。在本文中，我们讨论了这些最新技术进步如何使分析致病基因和突变成为可能，以及这种分析如何帮助回答长期存在的进化生物学问题。本文是主题期刊“适应和物种形成的遗传基础：从位点到致病突变”的一部分。
分子基础和下游免疫后果的宿主相互作用
hal是一个多学科的开放访问档案，用于存款和传播科学研究文件，无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构，也可能来自公共或私人研究中心。
邀请申请在卓越中心的项目模式下纯粹的临时基础与一名博士学位研究员（PDF）订婚
申请被邀请在Bhubaneswar的Utkal University的高级材料和应用卓越中心（CAMA）的项目模式下，在项目模式下，纯粹的临时基础与一名博士学位研究员（PDF）参与。有兴趣履行资格的候选人可以通过电子邮件将其申请提交给以下方式：cama.coe@utkaluniversity.ac.in，或之前21.02.2025下午5.00时。基于资格和经验入围的候选人将通过电子邮件在布巴内斯瓦尔乌特卡尔大学化学系的化学系进行访谈/互动。基本的/理想的资格，经验，酬劳和参与任期如下：基本和理想的资格：至少博士学位。来自公认的研究所/大学的化学/化学科学/材料科学学位。在CAMA主题领域具有研究工作经验的候选人将是首选。最大年龄限制：候选人必须在面试之日少于40岁。总的埃默尔：卢比。每月50,000/ - （仅卢比仅5万卢比）。 职位的任期：最初的参与度为31.03.2025，并且可能会根据资助机构/大学的决定延长。每月50,000/ - （仅卢比仅5万卢比）。职位的任期：最初的参与度为31.03.2025，并且可能会根据资助机构/大学的决定延长。
在连续培养中进化的大肠杆菌菌株甲酸属依赖型的遗传和生物催化基础
Valley Delmech，Nadia Perthat，Oriane Monet，外国Marion，Darii Ecataria和Al。插入Methabolia，2022，72，pp.200-214。10.1016/j.ymben.2022.03.010。
双功能II型II-B CRISPR-CAS9
cas9链球菌（SPCAS9）通过启用由RNA引导的可编程DNA裂解，彻底改变了基因组编辑。但是，SPCAS9耐受DNA-RNA双链体中的不匹配，这可能导致有害的脱靶编辑。在这里，我们揭示了来自弗朗西斯氏菌（Francisella novicida）（FNCAS9）的Cas9具有独特的结构特征 - REC3夹具，其本质上是其内在的高保真DNA靶向。通过动力学和结构分析，我们表明REC3夹具与R环的PAM-DISTAL区域形成关键接触，从而在酶激活过程中施加了新的检查点。值得注意的是，F。Novicida编码了非规范的小CRIS相关RNA（Scarna），该RNA（Scarna）使FNCAS9能够抑制内源性细菌性脂蛋白基因，从而颠覆宿主的免疫检测。fncas9与Scarna的结构说明了部分R环的互补性如何阻碍REC3夹具对接并防止裂解以支持转录抑制。REC3夹具在II型-B CRISPR-CAS9系统中保存，指出了工程精确基因组编辑者或制定新型抗菌策略的潜在途径。这些发现揭示了FNCAS9高特异性和毒力的双重机制，对生物技术和治疗发展具有广泛的影响。
使用通用循环模型在气候变化方面的河流盆地未来温度变化的投影
背景和目标：乔丹由于其干旱的气候和人口密度高而面临水资源挑战。这项研究选择了Zarqa河流域的一般循环模型，以在四个时期的共享社会经济途径2-4.5和5-8.5方面投射未来的温度变化：2015-2040，2041-2060，2061-2060，2061-2080，以及2081-2100，评估气候对水资源的影响。方法：统计缩减模型促进了在四个不同的时间范围内两种共享社会经济途径的温度波动的投影。该模型的预测因子来自一般循环模型和重新分析数据集。结果表明，Zarqa河盆地温度与选定的一般循环模型之间存在很强的相关性。在校准期（1983-2000）和验证期（2001-2014）期间，该模型准确地反映了温度特征。对扎尔卡河盆地内六个站进行了预测。发现：在选定的一般循环模型中，联合Kingdm地球系统建模项目和Hadley Center全球环境模型3 - 全球耦合配置3.1预测温度最快的升高。高发射方案（共享社会经济途径5-8.5）预测温度的上升比低发射方案（共享的社会经济途径2-4.5）。的预测表明，扎卡河盆地的北部将比南部地区进行更大的变暖，而2090年代相对于2050年代，预期的会大幅度增加。最低温度在最高温度速率的两倍上升高。到2100年，共享社会经济途径中的最高温度预计将在3.44-4.91摄氏度上升高，而在共享的社会经济途径5-8.5方案中，增加将增加5.5-6.2摄氏度。结论：该研究成功地开发了一个在共享的社会经济途径的情况下，为Zarqa河流域中未来温度预测的统计缩减模型。分析表明，扎尔卡河流域预计会经历以较高温度和降水降低的气候，而二十一世纪后期预期的温度显着升高。这些发现可能会为区域水文和环境建模提供宝贵的见解，并有助于评估生态系统可持续性。
tocantins-araguaia盆地中的斑洋鱼类多样性
迁徙鱼与人类社会有着密切的联系。在Tocantins- Araguaia盆地中，一个以高生物多样性，原产性和环境退化为标志的地区，几乎没有关于这些鱼类的信息。在这种情况下，本研究调查了potamodomous鱼类的分类学和功能多样性，目的是编译第一个物种清单，并检查物种丰富度，组成和功能多样性的模式。根据Tocantins-Araguaia和Amazon盆地的鱼类多样性的最新文献分配了每个物种的迁徙状况。这项研究巩固了77种Potamodomous鱼类（三个订单，12个家庭和41个属）的清单，其中包括八个流行性，三个受到威胁和两个非本地物种。pimelodidae总结了大多数物种，其次是Serrasalmidae和Curimatidae。大多数物种被归类为培养基（42）和长距离（32）移民，很少进行大陆迁移（3）。大多数物种广泛分布在盆地中，导致物种丰富度，组成和功能多样性的空间变化很小。但是，特征组成在物种，家庭和迁徙量表之间各不相同。这是该盆地中迁徙鱼类的第一个广泛评估，有可能生成基本信息以支持渔业管理，环境规划和保护计划。
社会同步行为中主观经验的感觉运动基础
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是此预印本版本的版权持有人，该版本发布于2025年2月10日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.09.637302 doi：Biorxiv Preprint
对基本海洋过程的有限理解正在阻碍海洋二氧化碳去除
在这里，我们关注的是四个基于海洋的CDR，我们认为，这不仅是由科学家提倡的，而且在许多情况下也是由私人Sector提倡的，而无需对基础的典型科学进行尽职调查。我们认为这些方法的支持者不仅要对海洋碳循环的运作方式不完整或不正确，而且还具有提供重大气候益处所需的上规模。这样的升级将其他海洋过程带入发挥作用，这可能无效拟议的CDR方法的有效性。在每种情况下，错误理解和知识差距都会影响碳偏移方案的信用性。我们的案例研究是：基于钙化的方法，海草种植的扩展，沿海蓝色碳修复和“重新野生”鲸鱼种群。我们认为，所有这些行动的非气候益处都大大超过了它们对基于海洋的CDR的适度（或不存在）可能的贡献。