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通过计算建模和模拟的爆炸创伤性脑损伤的临床模式
在现代军事冲突中爆炸脑损伤无处不在，发病率显着和死亡。然而，爆炸超压波引起人类特定颅内损伤的机制尚不清楚。审查了接触BLAST的服务成员的神经角膜神论者和神经外科医生的临床经验，揭示了对脑血管的损伤模式，表现为蛛网膜下腔出血，假脑膜瘤，早期弥漫性弥漫性大脑肿瘤。此外，在以下组织界面处的爆炸性脑损伤受害者（TBI）的受害者的精神病学病例系列（TBI）显示出独特的星形胶质疤痕模式：亚皮拉神经胶质板，血管周围，周围性脑膜周围和脑灰白色界面。BLAST TBI中临床和神经病理发现的统一特征是材料界面的损伤的共同点，无论是固体液体还是固差界面。这激发了以下假设：BLAST TBI是颅内机械界面处的损伤。为了研究颅内界面动力学，我们使用模型的人头简化但包含Gyri，Sulci，脑脊液（CSF），心室和脉管系统的模型进行了新的计算模拟，并具有高空间分辨率。模拟是在混合欧拉（Lagrangian仿真套件）中进行的（通过Zapotec耦合到Sierra Mechanics）。由于较大的计算网格，模拟需要高性能计算资源。这些空化事件与亚型神经胶质板处的高界面应变速率相邻。在多种曝光场景中进行了二十个模拟，包括150、250和500 kPa的超压，1 ms超压持续时间 - 在材料模型参数（脑剪切特性，颅骨弹性模块）中，多次爆炸暴露（前爆炸，侧面爆炸和壁爆炸）在材料模型参数（脑剪切特性，脑剪切特性）中。所有模拟都可以预测CSF内（脑脉管系统驻留的地方）内的流体空化，空化发生在深层且扩散成脑硫。较大的过压模拟（250和500kPa）表现出脑室内的气蚀，这也与邻近的高脑室应变率有关。此外，嵌入式核内血管结构的模型（直径较小至0.6 mm），可预测的血管内空化，邻近高血管周围应变率。
酶抑制与药物化学杂志
1。Arber DA，Orazi A，Hasserjian RP等。髓样肿瘤和急性白血病的国际共识分类：整合形态学，临床和基因组数据。血。2022; 140（11）：1200-1228。doi：10.1182/blood.2022015850 2。Mesa RA，Verstovsek S，Cervantes F等。原发性骨髓纤维化（PMF），后多环虫病骨髓纤维化（PV后MF），后必需的血小板性脊髓脑纤维纤维化（POST -ET MF），BLAST PMF（PMF -BP）：国际骨髓纤维化研究和治疗的国际工作组对术语的共识（IWG -MRT）。leuk res。2007; 31（6）：737-740。 doi：10.1016/j.leukres.2006。 12.002 3。 Passamonti F，Mora B.骨髓纤维化。 血。 2023; 141（16）：1954-1970。 doi：10.1182/Blood.2022017423 4。 naymagon L，Mascarenhas J.髓纤维化相关的贫血：当前和新兴的治疗策略。 hemasphere。 2017; 1（1）：E1。 doi：10.1097/hs9.0000000000000001 5。 Tefferi A，Lasho TL，Jimma T等。 一千名主要骨髓纤维化患者：蛋黄酱诊所的经验。 Mayo Clin。 2012; 87（1）：25-33。 doi：10.1016/j.mayocp.2011.11.001 6。 Tefferi A，Hudgens S，Mesa R等。 使用具有骨髓增生性肿瘤相关的骨髓纤维化和贫血的癌症治疗 - 催化含量的功能评估。 Clin Therapeut。 2014; 36（4）：560-566。 doi：10.1016/j.clinthera.2014.02.016 7。 Passamonti F，Cervantes F，Vannucchi AM等。2007; 31（6）：737-740。doi：10.1016/j.leukres.2006。12.002 3。Passamonti F，Mora B.骨髓纤维化。血。2023; 141（16）：1954-1970。doi：10.1182/Blood.2022017423 4。naymagon L，Mascarenhas J.髓纤维化相关的贫血：当前和新兴的治疗策略。hemasphere。2017; 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军事破坏中的爆炸暴露与肠道渗透性生物标志物与肠道渗漏相关的关联
1 James J. Peters VA医疗中心，布朗克斯，纽约州10468，美国； qingkun.liu@mssm.edu（Q.L.）; zhaoyu.wang@mssm.edu（Z.W.）; Shengnan.sun@mssm.edu（S.S.）2美国纽约州西奈山的伊坎医学院； yongchao.ge@mssm.edu 3美国马里兰州20910年银泉沃尔特·里德陆军研究所； Christina.R.Lavalle.ctr@health.mil（C.R.L.）; Walter.S.Carr.Civ@health.mil（W.C.）4落基山精神疾病，研究，教育和临床护理，美国Aurora退伍军人事务部，美国80045，美国； lisa.brenner@va.gov（l.a.b。）; andrew.hoisington@va.gov (A.H.) 5 Anschutz Medical Campus, University of Colorado, Aurora, CO 80045, USA 6 Department of Systems Engineering and Management, Air Force Institute of Technology, Wright-Patterson Air Force Base, OH 45433, USA * Correspondence: fatemeh.haghighi@mssm.edu † These authors contributed equally to this work.
爆炸效应子PWL2是一种毒力因子，可修饰宿主蛋白HIPP43的细胞定位以抑制免疫
。cc-by-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本发布于2025年1月9日。 https://doi.org/10.1101/2024.01.20.576406 doi：Biorxiv Preprint
在硅中鉴定出的抗真菌植物类黄酮，其可能控制由Magnaporthe oryzae引起的水稻爆炸
1概念系生物科学系遗传工程和生物技术系，吉大港大学，纽约市，孟加拉国，2个生物技术和遗传工程学院，Sylhet农业大学，Sylhet，Sylhet，Sylhet，Bangladesh，Bangladesh，3印度，美国西弗吉尼亚大学，美国西弗吉尼亚大学，美国摩根镇4计算机科学与电气工程系，美国，美国科学技术科技大学的生物化学和生物技术系5研究（BCSIR），孟加拉国纽约市8号应用化学与化学工程系，吉大港大学，吉大港，孟加拉国吉大港大学，孟加拉国9，孟加拉国研究所9，孟加拉国加西普尔，孟加拉国10，生物技术学院，生物技术学院和基因工程研究所（IBGE）孟加拉国加兹普尔
锌指（ZIF）折叠效应子形成一个功能多样的家族，横跨爆炸真菌的谱系oryzae
丝状植物病原体将效应子蛋白传递到宿主细胞中，以抑制宿主防御反应并操纵代谢过程以支持定殖。这些效应子的进化和分子功能提供了有关发病机理的知识，并可以提出减少病原体造成的损害的新型策略。 然而，效应蛋白具有高度可变，共享弱序列相似性，尽管可以根据其结构进行分组，但迄今为止，只有少数几个结构保守的效应子家族在功能上表征了。 在这里，我们证明了锌指褶皱（ZIF）分泌的蛋白质在爆炸真菌麦芽汁中形成功能多样的效应子家族。 这个家族依靠锌指基序来用于蛋白质稳定性，并且在爆炸真菌谱系中无处不在感染13种不同的宿主物种，形成了不同的效应子部落。 在多个m中存在 canonical ZIF效应子AVR-PII的同源物AVR-PII。 oryzae谱系。 真菌的小麦感染菌株也具有像宿主exo70蛋白质并激活免疫受体PII一样的AVR-PII。 此外，ZIF部落可能在其与之结合的蛋白质上有所不同，表明功能多样化和复杂的效应子/宿主相互作用。 总的来说，我们发现了一个新的效应子家族，其蛋白质折叠在M的谱系中具有功能多样化。 oryzae。 这项工作扩大了我们对M多样性的理解。这些效应子的进化和分子功能提供了有关发病机理的知识，并可以提出减少病原体造成的损害的新型策略。然而，效应蛋白具有高度可变，共享弱序列相似性，尽管可以根据其结构进行分组，但迄今为止，只有少数几个结构保守的效应子家族在功能上表征了。在这里，我们证明了锌指褶皱（ZIF）分泌的蛋白质在爆炸真菌麦芽汁中形成功能多样的效应子家族。这个家族依靠锌指基序来用于蛋白质稳定性，并且在爆炸真菌谱系中无处不在感染13种不同的宿主物种，形成了不同的效应子部落。canonical ZIF效应子AVR-PII的同源物AVR-PII。oryzae谱系。真菌的小麦感染菌株也具有像宿主exo70蛋白质并激活免疫受体PII一样的AVR-PII。此外，ZIF部落可能在其与之结合的蛋白质上有所不同，表明功能多样化和复杂的效应子/宿主相互作用。总的来说，我们发现了一个新的效应子家族，其蛋白质折叠在M的谱系中具有功能多样化。oryzae。这项工作扩大了我们对M多样性的理解。oryzae效应子，植物发病机理的分子基础，最终可能有助于发展新的病原体抗性来源。
使用矿山爆炸优化（MBO）多层神经网络（MLPNN）模型
大数据分析[1，2]是当今的新兴技术之一，在许多应用系统中广泛使用。具体来说，由于其成本效益，有效的操作和数据质量，它对医疗保健领域产生了重大影响。心脏[3，4]是人体的重要器官，它是心血管系统的中心。根据最近的报道，由于这种可怕的疾病，近1790万人可能会丧生[5，6]。因此，预测心脏病是为患者提供早期治疗以挽救生命的问题更为必要的。通常，心脏病分为不同类型，例如心脏病，心律不齐，中风，心力衰竭等。与心脏病相关的不同类型的风险因素[7-9]如图1所示。
研究文章便携式爆炸算法库及其针对命令行，Python和R
基本的本地对准搜索工具（BLAST）是生物信息学中一种多功能且常用的序列分析工具。BLAST允许跨核苷酸和氨基酸序列进行快速，灵活的序列相似性搜索，从而导致了不同的应用，例如蛋白结构域的识别，矫形器搜索和系统发育注释。大多数BLAST实现都是命令行工具，它们作为逗号分隔的值文件产生输出。但是，我们的工具箱仍然缺少一种类似爆炸的算法的便携式，模块化和可嵌入的实现。在这里，我们提出了nsearch，一种命令行工具和C ++ 11库，该库提供了类似BLAST的功能，可以轻松地嵌入任何应用程序中。作为此便携性的一个示例，我们提供了Blaster，该爆炸器利用NSearch为R编程语言提供类似本机爆炸的功能，以及为Python提供类似功能的NPY搜索。这些软件包允许将类似BLAST的功能嵌入到较大的框架中，例如闪亮或Django应用。基准表明，NSearch，NPysearch和Blaster在速度和准确性上与其他常用的现代爆炸实现（例如VSearch and Blast+）相当。我们设想了针对数据科学中常用的其他语言（例如朱莉娅）的类似实现，以促进序列相似性比较。nsearch，Blaster和NPysearch可在BSD 3.0许可下免费使用，并在Github Conda，Cran（Blaster）和PYPI（NPysearch）上使用。
