环状 RNA (circRNA) 是一大类非编码 RNA。尽管已鉴定出数千种环状转录本,但其中大多数的生物学意义仍未得到探索,部分原因是缺乏生成功能丧失动物模型的有效方法。在本研究中,我们重点研究了 circTulp4,这是一种源自 Tulp4 基因的丰富 circRNA,在大脑和突触区室中富集。通过创建 circTulp4 缺陷小鼠模型,我们在其中突变了负责生成 circTulp4 的剪接接受体位点,但不影响线性 mRNA 或蛋白质水平,我们能够进行全面的表型分析。我们的结果表明,circTulp4 在调节神经元和大脑生理学、调节兴奋性神经传递的强度和对厌恶刺激的敏感性方面至关重要。该研究提供的证据表明,circRNA能够调节神经元中的生物学相关功能,并在表型的多个层面上产生调节作用,为circRNA在神经过程中的调控作用建立了原理证明。
圆形RNA(CIRCRNA)是共价锁定的非编码RNA的新类别,主要源自外显子或蛋白质编码基因内含子的后拼图。除了其固有的高总体稳定性外,还显示出通过多种转录和转录后机制对基因表达具有强大的功能作用。此外,circrnas似乎在大脑中特别丰富,能够影响产前发育和产后大脑功能。然而,对于长期影响大脑产前酒精暴露(PAE)及其与胎儿酒精谱系障碍(FASD)的相关性(FASD)的潜在参与(FASD)。使用ciRCRNA特定的量化量化,我们发现Circhomer1是一种依赖于Homer蛋白质同源物1(Homer1)并在产后脑中富集的活性依赖性的Circrna,在男性额叶层和Hippocampus中显着下调,在男性额叶和海马的小鼠中被构成了Modest的男子paee。我们的数据进一步表明,H19的表达是一种富含胚胎的脑部脑增强长的非编码RNA(LNCRNA),在雄性PAE小鼠的额叶皮层中显着上调。此外,我们还显示了Circhomer1和H19的发育和大脑区域特异性表达的相反变化。最后,我们表明H19的敲低导致circhomer1的稳健增加,但在人胶质母细胞瘤细胞系中没有线性homer1 mRNA表达。综上所述,我们的工作发现了PAE后CircRNA和LNCRNA表达的显着性和脑区域特异性改变,并引入了与FASD潜在相关性的新型机械见解。
RNA 测序技术的最新进展使我们能够发现一种新的 RNA 物种,即环状 RNA(circRNA;图 1)。环状 RNA 已被确定为自然存在的广泛且多样的内源性非编码 RNA 家族,它们可能调节哺乳动物的基因表达(Huang 等人,2017 年),并因神经退行性疾病和癌症而受到干扰(Chen 等人,2016 年)。它们是异常稳定的 RNA 分子,具有细胞类型或发育阶段特异性的表达模式。已鉴定出数千种环状 RNA,其中大多数研究测序了大脑和疾病组织样本。然而,迫切需要了解环状 RNA 的表达模式及其在外周、非大脑、健康组织中的特性,不仅在人类中,而且在用作复杂疾病研究实验模型的其他哺乳动物物种中也是如此。为了应对这一挑战,该项目旨在研究来自三种哺乳动物物种(包括人类、猕猴和小鼠)的十种不同外周组织类型的环状转录组景观。
癌症是对人类健康和寿命的主要威胁。化学疗法是抑制癌细胞增殖的有效方法,但是越来越多的癌症患者容易产生对各种化学治疗剂的抗性,包括铂,紫杉醇,阿德里米霉素和5-氟尿菌等。在过去的几十年中,在化学治疗药物的研究和开发中取得了显着进步,包括靶向治疗药物和免疫检查点抑制剂;但是,耐药性仍然严重限制了这些药物在癌症治疗中的应用和效率。最近,新兴研究强调了循环RNA(CIRCRNA)在通过调节相关miRNA和靶向基因的表达来表达癌细胞在增殖,迁移,侵袭,尤其是化学上的作用。在这篇综述中,我们全面总结了CIRCRNA在癌症耐药性中的潜在作用和机制,包括药物的EF液,凋亡,与TME(肿瘤微环境),自噬和自动噬菌体和DNA损伤修复功能障碍的干预。此外,我们强调了Circrnas作为癌症的新治疗靶标和预后生物标志物的潜在价值。
摘要尽管在监测流行病学和最终结果计划中反映出肺癌患者的人口水平死亡率显着降低,但在领先的国家数据库肺癌(NSCLC)中,国家数据库肺癌(NSCLC)一直是最常见的癌症,最常见的癌症导致了癌症的诊断范围,并在全球范围内造成了最终的诊断症状。尽管创新的单疗法及其组合在临床试验中不断测试,但后期肺癌的五年生存率仍然只有5%(英国癌症研究)。此后,对肺癌的早期诊断和治疗反应预测的研究对于改善这些患者的整体存活至关重要。圆形RNA(CIRCRNA)是一种重新发现的RNA类型,具有稳定的结构和高组织特异性表达。证据表明,异常的ciRCRNA表达在癌变和肿瘤进展中起重要作用。有必要进一步研究以评估EV和血小板衍生的CircrNA作为基于液体活检的肺癌检测的读数的价值。本综述讨论了CIRCRNA的起源和生物学,并分析了他们在NSCLC中的目前景观,重点是液体活检,以说明不同的方法论
背景:循环RNA(CIRCRNA)吸引了对癌症研究的日益兴趣。需要澄清ciRCRNA在进展,转移和耐药性中的调节作用和机制。我们先前的研究表明,阿替尼在ESCC治疗中的关键作用。然而,circrnas和apatinib耐药性之间的相关性尚不清楚。方法:使用ESCC患者的3对肿瘤和副组织进行RNA测序。Western印迹分析,RNA免疫沉淀(RIP),双酸酶酶报告基测定,凋亡和动物测定,以确认HSA_CIRC_0003823的作用和特定机制,以及其对ESCC中apatinib sensitivity的影响。结果:我们的结果表明,HSA_CIRC_0003823在ESCC中高度表达,并且预后不良。进一步的结果表明HSA_CIRC_0003823促进了ESCC的增殖和转移能力。在机理实验部分中,通过靶向microRNA-607(miR-607)来促进ESCC的进展,而HSA_CIRC_0003823通过靶向CRISP3。此外,我们发现沉默HSA_CIRC_0003823提高了apatinib的灵敏度。HSA_CIRC_0003823通过miR-607/CRISP3轴导致apatinib抗性。结论:在这项研究中,我们阐明了HSA_CIRC_0003823的功能及其在促进ESCC通过miR-607/CRISP3轴上促进肿瘤进展,转移和apatinib抗性中的作用。
摘要 环状RNA(CircRNA)是最近发现的一类竞争性内源性RNA,具有通过microRNA吸收来控制基因表达的能力。关于环状RNA在癌症发展中的潜在作用的研究有很多。最近,研究描述了环状RNA在癌症中的重要作用,表明它们作为致癌基因促进癌症发生或作为肿瘤抑制因子减少疾病的发生。最近发现的环状RNA adam9被认为参与了包括癌症在内的多种生理和病理过程。从这个方面来看,多种人类恶性肿瘤中都发现了Circ-ADAM9的异常表达,这表明Circ-adam9在肿瘤发生中起着重要作用。本综述总结了最近对circ-adam9在不同癌症中的作用的研究,并讨论了其作为新型生物标志物的潜在预后、诊断和治疗价值。
胰腺癌是全球第八大癌症死亡原因。包括吉西他滨、5-氟尿嘧啶、阿霉素和顺铂在内的化疗,免疫检查点抑制剂的免疫治疗以及靶向治疗已被证明可以显著改善晚期胰腺癌患者的预后。然而,大多数患者对这些治疗药物产生了耐药性,导致患者生存期缩短。导致胰腺癌耐药性的详细分子机制仍不清楚。越来越多的证据表明,非编码 RNA(ncRNA),包括微小 RNA(miRNA)、长链非编码 RNA(lncRNA)和环状 RNA(circRNA),参与胰腺癌的发病机制和耐药性的发展。在本综述中,我们系统地总结了各种 miRNA、lncRNA 和 circRNA 对胰腺癌耐药性的新见解。这些结果表明,针对肿瘤特异性 ncRNA 可能为胰腺癌治疗提供新的选择。
摘要:病理性心脏肥大是心力衰竭的重要原因之一。环状RNA(circRNA)已被研究与心脏肥大有关;然而,circRNA调节心脏肥大的机制仍不清楚。在本研究中,我们在心脏肥大中发现了一种新的环状RNA,命名为circCacna1c。用盐酸异丙肾上腺素(ISO)处理成年雄性C57BL/6小鼠和H9c2细胞以建立肥大模型。我们发现circCacna1c在ISO诱导的肥大心脏组织和H9c2细胞中上调。Western印迹和定量实时聚合酶链式反应表明,沉默circCacna1c可抑制ISO诱导的H9c2细胞中的肥大基因表达。从机制上讲,circCacna1c 在双荧光素酶报告基因检测中与 miR-29b-2-5p 竞争性结合,而 miR-29b-2-5p 在 ISO 诱导的肥大性心脏组织和 H9c2 细胞中下调。miR-29b-2-5p 抑制活化 T 细胞的核因子、细胞质钙调磷酸酶依赖性 1 (NFATc1),以控制肥大性基因表达。沉默 circCacna1c 后,miR-29b-2-5p 的表达增加,这通过抑制 NFATc1 表达来降低肥大性基因表达。总之,这些实验表明 circCacna1c 通过 miR-29b-2-5p/NFATc1 轴促进 ISO 诱导的病理性肥大。
一组患有视网膜色素变性 (RP) 的患者携带多种剪接体成分的突变,包括 PRPF8 蛋白。在这里,我们确定了小鼠 Prpf8 的两个等位基因,它们可复制或模仿 RP 患者中发现的异常 PRPF8——替代 p.Tyr2334Asn 和扩展蛋白质变体 p.Glu2331ValfsX15。表达异常 Prpf8 变体的纯合小鼠在前 2 个月内因大量颗粒细胞丢失而出现小脑进行性萎缩,而其他小脑细胞则不受影响。我们进一步表明,在两种 Prpf8-RP 小鼠品系的小脑中,一组 circRNA 均失调。为了确定使小脑对 Prpf8 突变敏感的潜在风险因素,我们在前 8 周监测了几种剪接蛋白的表达。我们观察到 WT 小脑中所有选定的剪接蛋白均下调,这与神经退化的开始相吻合。在表达突变 Prpf8 的小鼠品系中,剪接蛋白表达的减少更加明显。总之,我们提出了一个模型,其中在出生后组织成熟过程中,剪接体成分的生理性减少使细胞对异常 Prpf8 的表达敏感,随后 circRNA 的失调会引发神经元死亡。