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圆形RNA：癌症化学抗性的新生物标志物
抽象化学治疗药是晚期癌症患者的常规治疗方法。然而，随着化学治疗剂的持续应用，化学抗性通常可以预测不良的预后，近年来逐渐成为人们的关注。圆形RNA（CIRCRNA）是一类具有闭环结构的内源性非编码RNA（NCRNA），据报道是预后，诊断和治疗许多疾病，尤其是癌症的预后，诊断和治疗的明显靶标和标记。尽管数十种研究表明，circrnas在肿瘤中的药物抗性活性中起着重要作用，但尚未探索CircrNA影响化学耐药性的机制。在这篇综述中，我们描述了各种癌症中CircrNA和化学治疗剂的详细机制，并总结了对药物耐药性肿瘤的潜在治疗靶标。关键字圆形RNA;化学抗性；耐药性；癌症
FUS 改变携带 ALS 相关 P525L 突变的人类运动神经元中的 circRNA 代谢
摘要：RNA 代谢失调已成为导致肌萎缩侧索硬化症 (ALS) 疾病中运动神经元 (MN) 退化的关键事件之一。事实上，RNA 结合蛋白 (RBP) 或参与 RNA 代谢方面的蛋白质的突变占 ALS 常见形式的大多数。特别是，与 ALS 相关的 RBP FUS 突变对 RNA 相关过程的许多方面的影响已得到广泛研究。FUS 在剪接调控中起着关键作用，其突变严重改变了编码参与神经发生、轴突引导和突触活动的蛋白质的转录本的外显子组成。在本研究中，通过使用体外衍生的人类 MN，我们研究了 P525L FUS 突变对导致环状 RNA (circRNA) 形成的非规范剪接事件的影响。我们观察到 FUS P525L MN 中 circRNA 的水平发生变化，并且突变蛋白优先与下调 circRNA 两侧含有反向 Alu 重复序列的内含子结合。对于一部分 circRNA，FUS P525L 还会影响它们的核/细胞质分配，证实其参与了不同的 RNA 代谢过程。最后，我们评估了细胞质 circRNA 作为 miRNA 海绵的潜力，这可能与 ALS 发病机制有关。
环状RNA及其应用研究进展
环状RNA（circRNA）是一种新型的内源性非编码RNA（ncRNA），与microRNA（miRNA）一样，是一个迅速兴起的RNA研究课题。与传统的线性RNA（具有5'和3'端）不同，circRNA具有不受RNA外切酶影响的闭环结构。因此，circRNA具有持续表达并且对降解不太敏感。由于circRNA具有许多miRNA结合位点，因此消除其对靶基因的抑制作用可以大大增强其表达。circRNA通过特定的circRNA-miRNA相互作用在疾病的发生和进展中发挥重要调控作用。我们在本综述中总结了目前在阐明circRNA机制和生物合成方面的进展。特别是，circRNA主要可以作为miRNA海绵发挥作用，调节宿主基因表达和蛋白质运输。最后，我们讨论了基于circRNA的疗法的应用前景和重大挑战。
循环RNA：参与认知和认知疾病调节的新参与者
圆形RNA（CIRCRNA）是一种共价封闭的内源性单链RNA，被认为是基因异常剪接的副产物，而没有任何生物学功能。最近，随着高通量测序和生物信息学的发展，已经确定了成千上万的CircrNA及其差异性生物学功能。除了确定ciRCRNA在肿瘤进展，诊断和治疗中的巨大进展外，积累的证据表明，ciRCRNA富含大脑，尤其是在突触中，并随着生物体的发展或衰老而动态变化。由于突触在高阶认知功能中的特定作用，Circrnas不仅可能在正常的生理条件下参与认知功能，而且在其表达或位置异常调节后会导致与认知相关的疾病。因此，在这篇综述中，我们总结了研究circrna在认知功能中的作用的研究进步，以及它们参与其发生，发育，预后和治疗认知相关疾病，包括自闭症，抑郁症和阿尔茨海默氏症的救助。
从调节，翻译为生物标志物-NSF -PAR
摘要：CIRCRNA是一类调节性RNA，由于其结构稳定性和组织特异性表达，在调节性RNA研究领域中引起了极大的关注。通过后拼图形成的圆形构型产生了一个共价闭合结构，与线性RNA相比，对外核酸的耐药性具有更大的抗性。CIRCRNA的独特调节与几种生理过程以及几种人类疾病中病理生理过程的进步密切相关。尽管对圆形RNA的生物发生有很好的了解，但仍在探索其生物学作用的细节。随着有关CIRCRNA参与各种调节途径的研究数量的稳定增加，了解Circrna介导的调节的生物学和临床相关性已变得具有挑战性。鉴于Circrna研究在心脏和脉管系统的发展中的广阔景观，我们评估了心血管系统研究，作为一种模型，以批判性地回顾对Circrnas生物学相关功能的最新理解。我们以讨论当前功能研究的局限性进行了审查，并提供了潜在的解决方案，通过这些解决方案可以解决这些局限性，以识别和验证CIRCRNA在不同生理过程和疾病中的有意义和影响力的功能。
斯坦福 BIO-X 博士奖学金 2020
劳拉·阿玛雅·埃尔南德斯 斯坦福 Bio-X Bowes 研究员 干细胞生物学和再生医学 导师：Howard Chang（皮肤病学和遗传学）和 Bali Pulen dran（病理学和微生物学与免疫学） 具有双抗原/佐剂能力的环状 RNA 的体外转录用于疫苗开发 劳拉的项目结合了基因工程和免疫学，以解决疫苗反应原性和实现足够效力和功效的挑战。她将设计一种新颖的免疫策略，以环状 RNA（circRNA）作为免疫原和抗原。利用“外来”环状 RNA 在体内激活记忆反应的内在能力，劳拉将设计出也能翻译蛋白质的环状 RNA，以再生针对目标抗原的细胞免疫。劳拉将通过免疫研究来验证这项工作，以测试基于 circRNA 的疫苗的效力和持久性，希望改进它们以供将来使用。
TCCIA：探索癌症免疫疗法中circrna的综合资源 MSS/PMMR转移性结直肠癌的反应反应对组合免疫疗法的反应的多组分分子表征 基因表达亚型与结果的关联和... gamma delta t细胞中的急性髓样白血病 e001235.full.pdf CX-072（PACMILIMAB），Probody®PD
靶向免疫检查点的抽象背景免疫疗法在癌症治疗中越来越关注，强调了对预测性生物标志物的需求。圆形RNA（CIRCRNA）已成为肿瘤免疫的关键调节剂，尤其是在PD-1/ PD-L1途径中，并且在预测免疫疗法功效方面具有潜力。然而，尚未完全了解CIRCRNA在癌症免疫疗法中的详细作用。现有数据库专注于CIRCRNA概况或免疫疗法队列，但目前尚无平台可以探索Circrnas和抗肿瘤免疫疗法之间的复杂相互作用。结合了CircRNA概况，免疫疗法反应和临床结果的全面资源对于促进我们对Circrna介导的肿瘤免疫相互作用并发展有效的生物标志物至关重要。解决这些差距的方法，我们构建了癌症circrna免疫体图（TCCIA），这是第一个结合了circrna概况，免疫疗法反应数据以及跨多层类型的临床结果的数据库。TCCIA的构建涉及将标准化的预处理应用于原始测序FASTQ文件，以基于四种已建立的Circrna检测工具的合奏方法来表征Circrna概况，分析肿瘤免疫原型型，并通过免疫检查点构成的免疫疗法响应数据（ICBS）进行了免疫疗法响应数据（ICBS）。结果TCCIA包括从ICBS治疗的25个同类群体以及其他治疗方式中获得的4,000多个临床样本。数据库为研究人员和临床医生提供了一个基于云的平台，该平台可以在ICB的背景下对Circrna数据进行交互式探索。The platform offers a range of analytical tools, including browse of identified circRNAs, visualization of circRNA abundance and correlation, association analysis between circRNAs and clinical variables, assessment of the tumor immune microenvironment, exploration of tumor molecular signatures, evaluation of treatment response or prognosis, and identification of altered circRNAs in immunotherapy-sensitive and resistant tumors.为了说明TCCIA的效用，我们通过采用大规模黑色素瘤和膀胱癌同龄人的分析来展示两个例子，包括CIRCTMTC3和Circmga，这些例子在癌症免疫疗法中展现了不同Circrna表达的不同影响和临床意义。
乳腺癌：环状 RNA 在临床前体内模型中介导疗效
摘要。为了确定乳腺癌的新靶点和治疗方式，我们在文献中搜索了在临床前乳腺癌相关体内模型中有效的环状 RNA (circRNA)。通过我们的搜索，我们确定了 26 个上调和 6 个下调的 circRNA，它们在乳腺癌相关的临床前体内模型中起着作用。我们讨论了已确定的 circRNA 的重建和抑制，以及在化学耐药性、增殖抑制和转移背景下确定的靶点的药物性和验证。由细胞因子和高迁移率族蛋白抑制剂、核因子 ĸB 和 Hippo 信号传导驱动的途径成为肿瘤生长和转移的重要驱动因素。三叶因子 1 在雌激素受体阳性乳腺癌转移中的作用也值得进一步研究。此外，粘蛋白 19 已成为乳腺癌治疗的一个未开发的靶点。
与诊断和发展阿尔茨海默氏病有关的Circ_0001535的原始研究生物信息学和实验鉴定
背景：阿尔茨海默氏病（AD）是一种疾病，经常发生在老年人群中。仍然缺乏针对这种疾病的诊断和治疗方法，需要进行更多的研究。此外，对AD中的圆形RNA（CIRCRNA）的功能知之甚少。方法：在这项研究中，下载了基因表达综合（GEO）数据库的AD的RNA表达数据。通过逆转录质量PCR（RT-QPCR）测量健康参与者和AD患者脑脊液样品中CIRCRNA的表达水平。用接收器操作特征曲线（ROC）分析了差异表达的CIRCRNA的诊断值。途径。使用染色质免疫沉淀（CHIP）和RNA结合蛋白免疫沉淀（RIP）分析，验证了Circ_0001535和E2F转录因子1（E2F1）或E2F1和二氢叶酸还原酶（DHFR）之间的直接相互作用。细胞计数KIT-8（CCK8）和流式细胞仪用于识别CIRC_0001535/E2F1/DHFR轴对AD细胞增殖和凋亡的功能。结果：总共有12个CIRCRNA与AD诊断有关。AD患者和对照组之间7个CIRCRNA的表达水平有所不同。CRIC_0001535在这些CIRCRNA中具有最大的诊断价值。因此，在本研究中，Circ_0001535被视为关键的Circrna。E2F1/DHFR轴预计由Circ_0001535调节。E2F1/DHFR轴预计由Circ_0001535调节。此外，IP分析实验结果表明，E2F1可以与DHFR的启动子区域结合，并受CIRC_0001535的调节。体外结果表明，Circ_0001535过表达可以促进DHFR的表达，而E2F1敲低可以抑制SH-SY5Y细胞中的DHFR表达。最后，救援实验表明，Circ_0001535可以减少β25-35诱导的SH-SY5Y细胞增殖，并通过E2F1/DHFR轴促进凋亡。结论：我们在广告中的研究可以提供有关特定ciRCRNA在AD环境中的作用的重要信息，并指出AD中治疗干预的特定未来领域。
