靶向免疫检查点的抽象背景免疫疗法在癌症治疗中越来越关注,强调了对预测性生物标志物的需求。圆形RNA(CIRCRNA)已成为肿瘤免疫的关键调节剂,尤其是在PD-1/ PD-L1途径中,并且在预测免疫疗法功效方面具有潜力。然而,尚未完全了解CIRCRNA在癌症免疫疗法中的详细作用。现有数据库专注于CIRCRNA概况或免疫疗法队列,但目前尚无平台可以探索Circrnas和抗肿瘤免疫疗法之间的复杂相互作用。结合了CircRNA概况,免疫疗法反应和临床结果的全面资源对于促进我们对Circrna介导的肿瘤免疫相互作用并发展有效的生物标志物至关重要。解决这些差距的方法,我们构建了癌症circrna免疫体图(TCCIA),这是第一个结合了circrna概况,免疫疗法反应数据以及跨多层类型的临床结果的数据库。TCCIA的构建涉及将标准化的预处理应用于原始测序FASTQ文件,以基于四种已建立的Circrna检测工具的合奏方法来表征Circrna概况,分析肿瘤免疫原型型,并通过免疫检查点构成的免疫疗法响应数据(ICBS)进行了免疫疗法响应数据(ICBS)。结果TCCIA包括从ICBS治疗的25个同类群体以及其他治疗方式中获得的4,000多个临床样本。数据库为研究人员和临床医生提供了一个基于云的平台,该平台可以在ICB的背景下对Circrna数据进行交互式探索。The platform offers a range of analytical tools, including browse of identified circRNAs, visualization of circRNA abundance and correlation, association analysis between circRNAs and clinical variables, assessment of the tumor immune microenvironment, exploration of tumor molecular signatures, evaluation of treatment response or prognosis, and identification of altered circRNAs in immunotherapy-sensitive and resistant tumors.为了说明TCCIA的效用,我们通过采用大规模黑色素瘤和膀胱癌同龄人的分析来展示两个例子,包括CIRCTMTC3和Circmga,这些例子在癌症免疫疗法中展现了不同Circrna表达的不同影响和临床意义。
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