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通过ARG衍生的IBD估算进化和人口参数
从基因组序列样本中的进化和人口统计学参数推断通常是通过首先推断出相同的逐种（IBD）基因组段进行的。通过基于祖先重组图（ARG）利用有效的数据编码，我们获得了与当前方法相比的三个主要优势：（i）无需在IBD段上施加长度的阈值，（ii）IBD可以定义IBD，而无需进行无需重新组合的损失，并且（III II II II III）可以定义IBD，并且（III II II II II III），并且（III II II III）可以进行统计学上的损失。一组序列对，与样本量线性缩放。我们首先在模拟数据中获得真实的IBD信息时首先演示有力的推论。对于从真实数据推断出的IBD，我们提出了近似贝叶斯计算推理算法，并使用它表明即使是较差的短IBD段也可以改善估计。我们的突变估计量估计器与以前发布的方法相似，尽管用于推断的数据降低了4000倍，我们发现了人类种群之间的显着差异。计算成本限制在我们的方法中模型的复杂性，但是我们能够结合未知的不明智参数和模型错误指定，仍然可以找到改进的参数推断。
引入热随机搜索和基准衍生的结构
在第三节中，讨论了AIRS依赖的随机敏感结构的产生。发现机器学习技术可以常规利用以通过分子动力学（MD）或结构预测来加速能源景观的探索，这是一场进一步的革命。从1990年代的早期尝试开始，9 Behler 10和CS’Anyi 11的开创性贡献刺激了各种机器学习的原子间潜力（MLIP）的发展。12中有以节目的数据衍生电位（EDDPS）13,14 - 在第四节中进行了审查，并以明确的目的是加速AIRSS。在第五节中，我将展示EDDP超过DFT的多个数量级加速度如何允许以前在计算上太昂贵的计算方式 - 这是对Airss，Hot-airss的新型扩展。热 - 利用长MD驱动的退火的整合，作为随机生成的结构的高通量优化的一部分。在第七节中，我引入了一种新的方法来生成随机敏感结构，这是基于构建尊重种间距离的结构的概念的基础，甚至在结构优化之前甚至可能较低的能量 - 请参见第六节。新方法是基于基于在EDDP环境/特征向量空间评估的参考结构（或潜在多个结构）的距离（或潜在的多个结构）的选择，并且需要对现有AIRSS/EDDP工作的几乎没有修改。在第七节中，这种新方法应用于两个具有挑战性的系统 - 碳和Mg 3 Al 2（Sio 4）3。最后，在第IX节中，人们认识到，第七节中引入的方法与现代化的基于模型的生成方法密切相关，这提供了与传统结构预测方法的联系点，尤其是AIRS。
使用人多能干细胞衍生的人类肢体骨骼发育进行建模
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年1月10日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.09.631479 doi：Biorxiv Preprint
“在P＆G化学药品上，我们一直在使用自然衍生的化学产品制造产品已有160多年的历史。我们的热情是充当可持续性的催化剂
“在P＆G化学药品上，我们一直在使用自然衍生的化学产品制造产品已有160多年的历史。我们的热情是通过我们创造的富有负责任的自然衍生的低碳产品来充当可持续业务增长的催化剂。我们的承诺是为P＆G和对我们信任的公司提供服务，以提供高质量，基于生物的产品和供应链可靠性。”
来自意大利中部和北部的Lepus Europaeus中的原骨基龙（Nematoda：protostrongylidae）的遗传变异性和种群结构分析
姜黄素以其潜在的健康益处而闻名；但是，在培训的预备阶段，证据仍然是对运动员补充的必要性的不满。这项研究旨在评估2G/天剂量的6周姜黄素补充剂对选定的炎症标志物，血细胞计数和脑衍生的神经营养因子（BDNF）水平在中年业余长距离跑步者中的作用。将三十个跑步者随机分配给姜黄素供应组（CUR，n = 15）或安慰剂组（PLA，n = 15）。在休息后，运动后立即收集静脉血液样本和运动后1小时。参与者进行了分级运动压力测试，在6周补充期之前和之后，倾斜度的倾斜角度越来越高。在休息后3分钟收集血液样本，并在恢复1小时后收集血液样本。结果显示，C反应蛋白（CRP），白介素6（IL-6），肿瘤坏死因子α（TNF-α），白介素-1β（IL-1β）或由于姜黄素供应仪而导致的血液形态学没有显着变化。然而，在CUR组补充后，BDNF水平升高了21％，而PLA组观察到5％。这些发现不支持补充姜黄素对炎症标记，血细胞计数或BDNF浓度的显着影响。有必要进行进一步的研究，以确定在培训周期的准备期间，耐力运动员补充姜黄素的潜在益处。
源自riluzole的新型萘基取代的氨基硫唑防止颞叶癫痫大鼠模型中的急性神经兴奋性损伤
结果：当在KA之前进行施用时，SKA-378（30mg/kg）并不能阻止癫痫持续状态（SE），但在3D后仍能阻止海马和其他边缘区域的神经损伤。在KA诱导的SE后1小时给予SKA-379，SKA-378，SKA-377，SKA-41或RILUZOLE时，也会减弱易受伤害的海马兴奋性（CA3/CA1）的神经损伤和抑制（HIRAR）神经元的神经元。对SKA-378和Riluzoles在体外运输阻滞的动力学分析表明，抑制是通过非竞争性的间接机制发生的。While sodium channel NaV1.6 antagonism blocks activity-regulated MeAIB transport and SKA- 378 is the most potent inhibitor of NaV1.6 (IC50=20µM) compared to NaV1.2 (IC50=118µM) in vitro , pharmacokinetic analysis suggests sodium channel blockade may not be the predominant mechanism of neuroprotection by these compounds in vivo .
炎症诱导的肥大细胞衍生的神经生长因子
诱发性外阴痛 (PV) 的特征是局部慢性外阴疼痛。它与外阴反复发炎、肥大细胞 (MC) 积聚和神经元发芽的病史有关。然而，外阴炎症如何促进脊髓神经元发芽和基因表达适应，从而导致过敏和疼痛感的机制尚不清楚。在这里，我们发现与没有 PV 的女性 (n = 4) 相比，患有 PV 的女性 (n = 8) 的外阴组织以 MC 积聚和神经元发芽为特征。此外，我们在 PV 动物研究中观察到了这些变化。因此，我们发现反复的外阴酵母多糖炎症刺激会导致持久的机械和热外阴高敏性，这是由外阴神经元中 MC 的积累、神经元的发芽、疼痛通道 (TRPV1 和 TRPA1) 的过度表达以及脊髓/背根神经节 (DRG) (L6-S3) 中与神经可塑性、神经炎症和神经生长因子 (NGF) 相关的基因表达的长期增加所介导的。然而，在外阴炎症期间使用富马酸酮替芬 (KF) 稳定 MC 活性来调节 NGF 通路会减弱 NGF 和组胺的局部增加，以及脊髓中促炎细胞因子和 NGF 通路转录的升高。此外，炎症期间的 KF 治疗可调节外阴神经元中的 MC 积累、神经元过度支配和 TRPV1 和 TRPA1 通道的过度表达，从而防止外阴疼痛的发展。对炎症期间 NGF 通路的彻底检查表明，使用 NGF 非肽抑制剂 (Ro08-2750) 阻断 NGF 活性可调节与神经可塑性和脊髓 NGF 通路相关的基因的上调，以及调节神经元发芽和疼痛通道的过度表达，从而降低外阴过敏水平。另一方面，刺激外阴的 NGF 通路会促进神经元发芽、疼痛通道的过度表达以及与神经可塑性、神经炎症和脊髓 NGF 相关的基因表达增加，导致持久的外阴过敏。总之，我们的研究结果表明，炎症引起的外阴异常性疼痛是由外阴中的 MC 积累、神经元萌发和神经调节介导的。此外，慢性外阴疼痛可能涉及脊髓基因表达的长期适应，这可能在中枢敏化和疼痛维持中起着关键作用。令人惊讶的是，在炎症的关键时期调节 NGF 通路可通过调节前庭和脊髓中的神经元变化来防止外阴疼痛的发展，这表明 NGF 通路在 PV 发展中起着根本性的作用。
引用：Klaihmon，P.，Khuhapinant，A.，Kheansaard，W.，Pattanapanapanapanasat，K。（2024）。细胞来源的微粒的内在化触发内皮
与非跨性切除术和健康的个体相比，在进行脾切除术的Thalassexymia患者中，循环MPS的水平显着升高，并且这些MPS中的大多数来自血小板和红细胞。10,11 Thalassexymia MPS的蛋白质组学分析表明，它们含有高水平的活性氧，热休克蛋白和其他伴侣蛋白，这可能促进thalassemia患者观察到的TEE过程。12我们还发现，Thalassexymia MPS对血小板激活和白细胞 - 血压 - 骨骼聚集的促凝作用。13最近，Kheansaard等。 通过增强促凝介质，炎症细胞因子以及内皮粘附分子的表达，证实了来自脾脏的患者的MPS诱导内皮细胞激活和随后的内皮单位细胞粘附。 14然而，尚未记录通过暴露于MP的上调的其他内皮促炎标记。 我们认为，对某些促炎基因（包括IL1B，IL6，CXCL8，CD40和CCL2）以及其细胞因子的更详细研究可能会提供一些重要的线索，以了解来自β-硫代硫0-甲状腺肿/HBE患者在寄生虫细胞上的潜在MPS的潜在作用。 因此，此处报道的研究的基本原理。13最近，Kheansaard等。通过增强促凝介质，炎症细胞因子以及内皮粘附分子的表达，证实了来自脾脏的患者的MPS诱导内皮细胞激活和随后的内皮单位细胞粘附。14然而，尚未记录通过暴露于MP的上调的其他内皮促炎标记。我们认为，对某些促炎基因（包括IL1B，IL6，CXCL8，CD40和CCL2）以及其细胞因子的更详细研究可能会提供一些重要的线索，以了解来自β-硫代硫0-甲状腺肿/HBE患者在寄生虫细胞上的潜在MPS的潜在作用。因此，此处报道的研究的基本原理。
通过调节WNT和FGF18信号传导，增强了HPSC衍生的中脑多巴胺神经元的产率和亚型身份。 tae wan kim 1,2.3 *＃，jinghua
1干细胞生物学中心，2个发育生物学计划，纪念斯隆 - 凯特林癌症中心，纽约，纽约，纽约，10065，美国。3大韩民共和国Daegu Gyeongbuk科学技术学院（DGIST）跨学科工程系（DGIST）。4神经外科部，5癌生物学和遗传学计划，纪念斯隆 - 凯特林癌症中心，纽约，纽约，纽约，10065，美国。6哥伦比亚大学医学中心神经病学系，纽约，美国。 7计算机生物医学研究所，血液学/肿瘤科，医学系，威尔·康奈尔医学院，纽约，纽约，纽约，纽约，纽约，10065，美国。 8纽约州纽约的计算生物学三机构博士学位课程。 9神经科学计划，纽约州威尔·康奈尔医学院医学科学研究生院6哥伦比亚大学医学中心神经病学系，纽约，美国。7计算机生物医学研究所，血液学/肿瘤科，医学系，威尔·康奈尔医学院，纽约，纽约，纽约，纽约，纽约，10065，美国。 8纽约州纽约的计算生物学三机构博士学位课程。 9神经科学计划，纽约州威尔·康奈尔医学院医学科学研究生院7计算机生物医学研究所，血液学/肿瘤科，医学系，威尔·康奈尔医学院，纽约，纽约，纽约，纽约，纽约，10065，美国。8纽约州纽约的计算生物学三机构博士学位课程。9神经科学计划，纽约州威尔·康奈尔医学院医学科学研究生院
引文 Zhou Z, Lin Y, Liu N, Zhang Y, Li B 和 Wang Y (2025) 内皮细胞衍生的细胞外基质在定向 PCL 上的梯度涂层
心血管疾病（CVD）是世界上最常见的疾病之一，具有高致病性和高死亡率的特点（Vong等，2018；Wang等，2022a；Qian等，2021）。CVD的临床治疗主要包括三种方式：药物治疗，这是最广泛的治疗方式，也是CVD治疗的基础；介入治疗，包括射频消融和心脏起搏治疗；外科治疗，包括搭桥治疗和心血管移植（Abdelsayed等，2022；Lunyera等，2023；Krahn等，2018）。血管移植主要用于恢复或建立新的血流通路，以维持或改善组织或器官某个区域的血液循环，例如因创伤或切除导致血管段缺损，或动脉栓塞或淋巴阻塞而需要“搭桥”形成循环系统的情况（Xing et al.，2021；Zhao et al.，2023）。血管移植要求供应血管具有与受体血管相同的外径和足够的长度。移植物也面临供区血液循环受损（缺血或淤滞）等问题。因此，迫切需要高性能的人工血管移植来替代自体血管进行血流重建。目前小口径人工血管（<6 mm）主要用于冠状动脉搭桥术、外周血管搭桥术、血管创伤（缺损≥2 cm）、血液透析的组织血管通路、器官功能恢复等（Asakura等，2019；Wang等，2021；Wu等，2018），但人工血管移植可导致吻合口血栓形成、内皮增生等严重并发症，影响管腔通畅性（Oliveira等，2020；Teebken和Haverich，2002；Zhuang等，2020）。此外，目前的人工血管支架虽然具备一定的力学性能和生物相容性或能提供血管再生所需的生化信号，但在模拟天然血管的结构和功能方面还存在明显的不足，现有的支架往往不能充分模拟天然血管网络的拓扑结构，并会诱导细胞爬行，从而影响血管支架在临床应用中的效果（Liang等，2016；Cheng等，2022）。因此，为提高小口径人工血管的通畅性，通过材料选择、表面改性等提高生物相容性/内皮化/力学性能成为重点研究方向。静电纺丝技术可以制备具有高比表面积和孔隙率的微/纳米纤维，可以模拟细胞外基质，促进细胞黏附、增殖和分化，为细胞提供良好的生长环境。该接收装置的设计可以制备不同直径的管状结构，是制备小直径人工血管支架的理想方法（姚等，2022；郭等，2023；宋等，2023；王等，2022b）。特别是利用该技术制备的血管支架可以负载生物因子，提高血管支架的生物相容性，促进血管快速内皮化。虽然目前的人工血管支架已经具备一定的力学性能、生物相容性或能提供血管再生所需的生化信号，但如何结合现有支架的优势，将生物因子负载于血管内，实现血管再生，是当前血管支架研究的热点。