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DNA中的核糖核苷单磷酸盐数据库
抽象动机：核糖核苷单磷酸盐（RNMP）是嵌入基因组DNA中的最丰富的非标准核定体。如果无法控制DNA中RNMP的存在，则可能导致基因组不稳定性。DNA中RNMP的实际正函数主要未知。考虑到RNMP嵌入与各种疾病和癌症之间的关联，近年来，DNA中RNMP的嵌入现象已成为近年来的重要研究领域。结果：我们介绍了RNMPID数据库，这是第一个揭示RNMP插入特征，链偏置和首选掺入模式的数据库，这些数据库是来自不同遗传背景的细菌至人类细胞的基因组DNA中的首选掺入模式。RNMPID数据库使用不同RNMP映射技术的数据集。它为研究人员提供了坚实的基础，以阐明多种来源的基因组DNA中嵌入的RNMP的特征及其与细胞功能的关联，以及将来的疾病。它还显着使研究人员在遗传学和基因组学领域的研究人员旨在将研究与RNMP嵌入数据融为一体。可用性：RNMPID可以在网络上自由访问，网址为https://www.rnmpid.org。联系人：xph6113@gmail.com或storici@gatech.edu
立体选择性共轭氰化物通过将光毒素和有机催化
*电子邮件：p.melchiorre@unibo.t对反应的选择性的精确控制是一个基本目标。尽管在实现立体控制方面已经获得了巨大的进步，但底物内官能团（化学选择性）的选择性操纵仍然是一个挑战。醛的氰化作用提供了一个说明性的例子：1,2-将亲核氰化物添加到醛基团中是立体选择性cat-alytic过程的第一个例子之一。相比之下，即使是在紫红色的变体中，也是线性α，β-未饱和醛的共轭氰化物仍然存在染料。主要难度在于在首选氰化物1,2粘合方面达到1,4化学选择性。在这里，我们报告了一种不对称的催化方法，以实现二烷的独家结合氰化。手性有机催化剂具有可见光激活的光蛋白-DOX催化剂的协同作用促进了抑制的单电子还原，从而诱导了正式的极性反转。在特征上具有亲核的手性自由基被具有完美的1,4化学选择性和良好立体控制的亲电氰化物源拦截。
手术视频中的精细粒度多级多级跟踪
准确的工具跟踪对于计算机辅助干预的成功至关重要。以前的努力通常会严格地对工具轨迹进行建模，从而俯瞰外科手术程序的动态性质，尤其是跟踪诸如身体外和相机外视图之类的场景。在解决此限制时，新的CholectRack20数据集提供了详细的标签，以三个角度说明多个工具轨迹：（1）术中，（2）体内和（3）可见性，代表不同类型的工具轨迹时间。这些细粒标签可增强跟踪灵活性，但也提高了任务复杂性。由于高视觉相似性，尤其是在同一类别的工具中，遮挡或重新插入身体后的工具仍然具有挑战性。这项工作认识到工具操作员在区分工具轨道实例中的关键作用，尤其是属于同一工具类别的工具轨道实例。但是，在手术视频中未明确捕获操作员的信息。因此，我们提出了Surgitrack，这是一种利用Yolov7进行精确工具检测的新型深度学习方法，并采用了注意机制来对工具的起源方向进行建模，作为其操作员的代理，以重新识别工具。为了处理各种工具轨迹的观点，Surgitrack采用了协调的两分匹配图，最大程度地减少冲突并确保准确的工具身份关联。cholectrack20的实验结果证明了外科手术的有效性，优于实时推理能力的最先进方法和最先进的方法。这项工作为手术工具跟踪设定了新的标准，为在微创手术中提供了更适合适应性和精确的帮助。
利用蛋白质的网络的演变来逆转认知
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年3月2日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.28.640897 doi：Biorxiv Preprint
基于3D成像的totost中种系的分析
为了成像生发摇篮和卵泡，我们开发了一种完整的卵巢免疫标记方案，并结合了C-ECI清除方案（2）。协议完成后，我们必须使用轻板燃烧成像（Apex Platform，Oniris，Nantes）将样品转移到3D成像中。没有这种琼脂糖安装，可见且分散注意力的螺钉，螺钉施加的压力可能会损坏样品。
动态CD8+ T细胞与巨噬细胞和单核细胞的成功癌症免疫疗法
Alessandro Alunni，Constance Pierre，Jorge Torres-Paz，Natacha Cliaire，AurianeLanglumé等。发展，生长与分化，2023，65（9），pp.517-533。10.1111/dgd.12896。hal-04265637
多路复用的单分子实验揭示了Cas9基因组编辑器的核小体入侵动力学
摘要：单分子测量值提供了对分子过程的详细机械见解，例如在基因组调节中，DNA访问受核小体和染色质机械控制。然而，作用于定义的染色质底物上的核因子的实时单分子观察对于定量和可重复性执行具有挑战性。在这里，我们提出XSCAN（染色质关联的多路复用单分子检测），一种通过同时对核小体库的成像并行化单分子实验的方法，其中每种核小体类型在其核体DNA中携带一个可识别的DNA序列。并行实验。我们使用这种方法来揭示Cas9核酸酶在入侵染色质DNA作为PAM位置的函数时如何克服核小体屏障。
Bioevocs-在患有嗜酸性食管炎的儿童和年轻人中测试“鼻烟”
普通的英语摘要背景和研究旨在许多儿童和年轻人来我们诊所的肚子（胃肠道系统）有问题。我们进行特殊测试以找出他们的疾病是什么，以便我们知道他们需要什么治疗。我们看到的一种重要疾病是嗜酸性粒细胞性食管炎（EOE）。这是当食道的衬里变得酸痛（发炎）导致吞咽问题，食物粘在食道和持续的胃鼠回流中。目前，当儿童完全入睡时（在全身麻醉下），我们需要对这种疾病重复进行一次或多个相机测试（内窥镜检查）。内窥镜检查是我们用相机看肚子里的肚子。它是在全身麻醉下完成的，因此患者没有任何感觉。到目前为止，对于EOE没有床头测试（生物标志物），可以告诉我们出于任何原因而发炎的食道和肚子是否发炎。这意味着当需要EOE需要改变治疗（药物或饮食）时，我们都必须重复内窥镜检查。我们想看看做一个简单的凳子样品是否有助于更多地通知我们药物或饮食是否有效。新测试测量了许多不同的气体（挥发物），使粪便闻起来。挥发物来自肠道的内容物和衬里，并直接或间接地受到粪便中的肠道细菌的影响，我们可以用特殊的仪器在实验室中对其进行测量。挥发物也将受到营养/营养化合物的营养和代谢的影响。如果成功，这可能意味着我们不需要那么多内窥镜。有些疾病改变了挥发物，我们想看看测量它们是否给我们一种额外的方法来了解主动EOE。此外，新的测试可能使我们能够以积极，更健康的方式来分辨药物或饮食是否改变肠道细菌。我们还想看看，当发现拥有EOE的年轻人中，是否再次测量挥发物，是监测治疗是否有效的好方法。最后，测量粪便中的挥发物可能会告诉我们更多有关导致EOE和Gullet（食管）疾病的原因。