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在精密医学和机器学习的背景下研究胃肠道微生物组的多摩学方法
人类胃肠道（肠道）微生物组在维持宿主健康中起着至关重要的作用，并且越来越被认为是精确医学的重要因素。高通量测序技术已彻底改变了 - 组数据的生成，促进了人类肠道微生物组的表征，并具有出色的分辨率。通过揭示有关功能基因，微生物组成，聚糖和代谢产物的信息，对各种 - 组数据的分析，包括荟萃分析，元基因组学，糖基因组和代谢组学。这种多词方法不仅为肠道微生物组在各种疾病中的作用提供了见解，而且还促进了微生物生物标志物用于诊断，预后和治疗的鉴定。机器学习算法已成为从复杂数据集中提取有意义的见解的强大工具，并且最近通过有效地识别微生物特征，预测疾病状态并确定潜在的治疗靶标，将其应用于宏基因组学数据。尽管有这些快速的进步，但仍然存在一些挑战，例如关键知识差距，算法选择和生物信息学软件参数化。在这个迷你审查中，我们的主要重点是宏基因组学，同时认识到其他 - 词素可以增强我们对生物功能多样性及其与宿主的相互作用的理解。我们旨在探索当前的多词，精密医学和机器学习的交集，以促进我们对肠道微生物组的理解。一种多学科的方法有望在精确医学时代改善患者的结果，因为我们揭示了微生物组与人类健康之间的复杂相互作用。
使用CR-51标记为红细胞的胃肠道出血的定量确定
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f -IU印第安纳波利斯学者
摘要：胃肠道（GI）疾病在整个美国都有很高的患病率。筛选和诊断方式通常很昂贵且侵入性，因此，人们不会有效地利用它们。缺乏适当的筛查和诊断评估可能会导致诊断性延迟，诊断时更晚期疾病以及发病率和死亡率更高。对肠道微生物组的研究表明，营养不良或有机体组成的不利改变是在各种胃肠道疾病的临床症状发作之前。gi疾病诊断研究导致朝着非胃肠道筛查的非侵入性方法的转变，包括测量挥发性有机化合物（VOC）的变化的化学检测测试，这些测试是细菌代谢的副产品，导致粪便的独特气味。这些工具中的许多都是昂贵的，不动的台式仪器，需要训练有素的个人来解释结果。这些属性使它们难以在临床环境中实施。另外，电子鼻子（电子鼻）是相对便宜的手持设备，可利用多传感器阵列和模式识别技术来分析VOC。The purpose of this review is to (1) highlight how dysbiosis impacts intestinal diseases and how VOC metabolites can be utilized to detect alterations in the microbiome, (2) summarize the available VOC analytical platforms that can be used to detect aberrancies in intestinal health, (3) define the current technological advancements and limitations of E-nose technology, and finally, (4) review the围绕几种肠道疾病的文献可以使用顶空VOC检测或预测疾病。
基于乳酸杆菌的直接喂养微生物产物对肠道微生物群和胃肠道形态变化的影响
简单的摘要：本研究旨在表征和比较从出生到断奶的乳制犊牛中肠道微生物群的发展，重点是直接喂养的微生物（DFM）产物的影响，这些微生物（DFM）含有三种含有三种乳酸菌菌株（LAB）的菌株。将四十四只荷斯坦 - 弗里斯犊牛随机分配到治疗（TRT）和对照组（CON）组。trt犊牛每天接受DFM的每日剂量，而Con Con Calves接受了安慰剂并用作对照。粪便样品和尸检进行分析。trt犊牛在断奶时表现出更高的活体重，并且平均每天的活体重增加和饲料摄入量与饲料量相比。trt犊牛还表现出更大的特定肠道段（十二指肠，肥胖，网状）和增强的瘤胃和肠发育的权重。在TRT组中，微生物多样性更为明显，八个属的相对丰度差异。这项研究表明，补充基于实验室的DFM积极影响小牛的体重，肠道发育和微生物多样性。建议进一步研究以探索DFM产品与肠粘膜相关的微生物群之间的潜在关联。
评论文章资源受限环境下的胃肠内窥镜人工智能：现实检验
人工智能 (AI) 在胃肠病学的不同领域得到了越来越多的探索，特别是在内窥镜图像分析、癌症筛查和预测模型方面。考虑到内窥镜医师处理的大量数据和所进行的关键分析的复杂性，人工智能被广泛吹捧为常规内窥镜检查不可或缺的一部分。然而，在资源受限的环境中将人工智能应用于内窥镜检查仍然充满问题。我们使用 PubMed 数据库对涵盖人工智能在内窥镜检查中的应用以及在资源受限的环境中遇到的困难的文章进行了广泛的文献综述。我们试图在本综述中总结可能阻碍人工智能在此类环境中应用的潜在问题。希望这篇综述能让内窥镜医师和卫生政策制定者在尝试将人工智能在技术先进的环境中的进步推广到在多个层面受到限制的环境中之前，对这些问题进行思考。关键词：人工智能、自动检测、计算机辅助检测、深度学习、发展中国家、病变检测、卫生资源、卫生服务可及性。欧亚肝胃肠病学杂志 (2020): 10.5005/jp-journals-10018-1322
硫磺乳菌多糖对胃肠道益生菌生长及体外消化的影响评价
近几十年来，胃肠道被认为是人体最大的免疫器官。胃肠道具有多样化的微生物群，已成为疾病治疗的重要靶点（ Xu et al.，2023；Li et al.，2024）。实验证据表明，高血压、胰岛素抵抗、肥胖、高血糖、高血脂等代谢紊乱与肠道菌群密切相关（Shao et al.，2022；Zhang H. et al.，2023；Ouyang et al.，2024；Li et al.，2024）。Makki et al.（2018）发现高脂饮食会降低微生物多样性，改变肠道微生物代谢，导致代谢综合征的发生。Li et al.（2019）研究通过调节高脂饮食诱导的大鼠的肠道菌群，可预防高脂血症和高胆固醇血症，提示改善胃肠道健康可能是治疗疾病的新策略。益生菌是胃肠道中占主导地位的菌群，有助于改善食物的消化。植物乳杆菌乳酸杆菌、酪丁酸梭菌、青春双歧杆菌、嗜热链球菌是胃肠道中重要的细菌，其中乳酸杆菌为兼性厌氧革兰氏阳性菌，有报道指出，乳酸杆菌可以改善肠道炎症，预防疾病的发生或加重，也可用于治疗精神疾病和
探索胃肠道肿瘤中免疫系统与遗传学之间的动态串扰
摘要：胃肠道肿瘤（GIST）代表了癌基因成瘾的范式模型。尽管突变状态对临床结果产生了众所周知的影响，但我们仍需要将知识扩展到影响GIST患者影响行为异质性异质性的其他因素。越来越多的研究表明，肿瘤微环境（TME）主要由肿瘤相关的巨噬细胞（TAMS）和淋巴细胞（TILS）和基质分化（SD）人群，对预后和对治疗的反应具有显着影响。有趣的是，即使当前对免疫反应在这种情况下的作用的了解仍然有限，但最近的临床前和临床数据强调了TME在GIST中的相关性，在不久的将来对临床实践的可能影响。此外，免疫检查点的表达（例如PD-L1，PD-1和CTLA-4）及其与GIST中的临床表型的关系正在成为潜在的预后生物标志物。展望未来，这些变量与要点的潜在肿瘤微环境有关，尽管仅限于仍在努力的试验，可能会导致潜在的免疫疗法使用，或者在晚期TKI-Cractory GIST中单独或与靶向治疗结合使用。本综述旨在加深对突变状态与要点免疫微环境之间潜在联系的理解。
与运动相关的胃肠道疾病：从菌群到营养素的可能作用，叙事分析
1乌尔比诺·卡洛（Urbino Carlo Bo）的生物分子科学系，意大利乌尔比诺（Urbino）61122； Alexander.bertuccioli@uniurb.it（A.B.）; giordano.zonzini@uniurb.it（g.b.z。）; marco.cardinali@uniurb.it（m.c。）2 Microbiota International Clinical Society，意大利10123年； maxCazzaniga66@gmail.com（M.C。 ）; f.dipierro@vellejaresearch.com（F.D.P. ）; auroragreateti@gmail.com（A.G.）; jajamatera74@gmail.com（M.R.M. ）; ialilia.cavecchia@gmail.com（i.c。） 3科学与研究部，Velleja Research，20125年，米兰4，意大利47921 Insurby and Insurbia Insurbia大学里米尼市47921 Insurbia大学里米尼市内医学系47921，Insurbia大学，意大利21100 Varese，意大利瓦雷斯； nicola.zerbinati@uninsubria.it（N.Z。 ）; luigina.guasti@uninsubria.it（l.g。） *信函：pchiaramaria@gmail.com2 Microbiota International Clinical Society，意大利10123年； maxCazzaniga66@gmail.com（M.C。）; f.dipierro@vellejaresearch.com（F.D.P.）; auroragreateti@gmail.com（A.G.）; jajamatera74@gmail.com（M.R.M.）; ialilia.cavecchia@gmail.com（i.c。）3科学与研究部，Velleja Research，20125年，米兰4，意大利47921 Insurby and Insurbia Insurbia大学里米尼市47921 Insurbia大学里米尼市内医学系47921，Insurbia大学，意大利21100 Varese，意大利瓦雷斯； nicola.zerbinati@uninsubria.it（N.Z。）; luigina.guasti@uninsubria.it（l.g。）*信函：pchiaramaria@gmail.com
社论：胃肠癌诊断和治疗中的高级分子靶标，II卷
在我们的研究主题中，题为“胃肠道癌的诊断和治疗中的高级分子靶标，第二卷”，我们设法发表了15篇文章，原始研究，案例研究和文献评论。本社论综合了15项研究的进步，突出了胃肠道肿瘤学中创新的诊断和治疗策略。案例研究强调了稀有癌症的靶向方法，例如Smarca4降低的肿瘤和转移性肝细胞癌，强调了Precision Medicine的作用。一些最初的研究揭示了结直肠癌中的生物标志物，例如鸡皮凋亡和血管生成标志物，预测免疫疗法反应的甲基化亚型以及区分胃肿瘤的新型成像技术。关于社会经济因素的研究揭示了有组织的筛查在减少胃癌差异中的作用。对鸟苷酸环化酶-C信号的系统综述提出了新的结直肠癌疗法。，这些研究论文在胃肠癌癌症中提高了精度肿瘤学和健康公平性（图1）。