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BE 559：生物医学数据科学和机器学习的基础（2025年春季）
课程目标：本课程采用一种实用的方法来分析生物医学数据。这样做，三个目标努力。首先，学生将熟悉不同分析方法的必要理论背景，使他们能够了解为什么某些方法在某些情况下是合适的以及为什么其他方法不适合。第二，学生将获得分析生物医学数据所需的实用，动手技能，包括数据管理，算法开发和适当的代码库开发。这些技能将使学生在学术研究和行业内的独立研究项目中做好准备。第三，学生将学习如何解释，可视化和总结分析结果后完成。应用分析方法只是科学发现的挑战的一半。本课程的第三个目标是培训学生将科学分析的结果收集到一种格式，该格式可以与其他研究人员共享并理解科学发现。
生物识别数据 - 螺旋 - 二元 - 识别识别1-0。 ...
有关此指南的内容关键数据保护概念生物识别识别我们如何证明我们遵守数据保护义务？我们如何合法处理生物特征数据？我们如何公平处理生物识别数据？准确性原理如何适用于生物识别数据？我们如何确保生物识别数据的处理是透明的？我们如何考虑对生物识别数据的权利请求？我们如何确保生物特征数据安全？
运动员的微生物组：其特征和多样性
摘要。运动员的微生物组在研究人员中最感兴趣，因为结肠的微生物组成在养分的吸收，维生素的合成和宿主体内的免疫反应中起着关键作用。这篇综述的目的是研究高性能运动员中的肠道微生物群与低活动性生活方式的人之间的关系，以及这些变化对与运动员的身体表现和运动表现相关的微生物代谢产生的影响。总共分析了42篇研究论文，其中包括11项专业研究，研究了不同类型的强烈体育活动对肠道微生物组成的影响，以及19项研究的重点是个人细菌和身体性能的相关性。肠道微生物组成已被发现与运动表现有关，并且可能会提高性能和恢复。体育活动已被证明会增加α多样性和微生物代谢产物，例如短链脂肪酸。运动之间的α多样性没有显着差异。运动员的微生物组的特征是较高量的短链脂肪酸，这可以是运动过程中的能量底物。短链脂肪酸的产生与直肠菌群spp有关。，粪便核酸杆菌。运动员的微生物组也证明了Prevotella spp。的存在，在运动员中，这可能与表现相关。已经表明，运动员中的Veillonella antypica的存在与耐力正相关。尽管发现这一发现是矛盾的，但专门从事各种运动的运动员的运动成就和健康与诸如Akkermansia Municiphila，Faecalibacterium prausnitzii，Eubacterium cantale，Eubacterium thacterium contale，Roseburia hominis，faecalibacterium prausnitzii有关。此外，已经表明，肠道的微生物组成和酶之间存在联系，这被认为是与运动员健康相关的代谢产生的关键
类风湿关节炎和肠道微生物组
类风湿关节炎（RA）是一种全身性自身免疫性疾病，其特征是关节肿胀，不适，僵硬，骨质疏松症和功能降低。遗传学，吸烟，灰尘吸入，高BMI，荷尔蒙和肠道菌群营养不良都是RA发作或发育的原因，但基本机制仍然未知。与健康对照相比，RA患者的肠道菌群组成显着不同。众所周知，人类肠道微生物群在宿主免疫系统的启动，维护和操作中起关键作用。肠道菌群营养不良对宿主免疫系统有局部或系统的不良影响，从而导致宿主对包括RA在内的各种疾病的敏感性。已经报道了益生菌的肠道菌群调节和免疫调节特性的研究，以确定其在RA的预防和疾病活性控制方面的潜在可能性。本综述总结了有关肠道菌群在RA发展和进展中的作用和潜在机制以及益生菌对RA的预防和治疗作用以及潜在机制的研究。此外，我们提出了在RA中应用益生菌在益生菌应用中的挑战和困难，为益生菌在预防RA方面的研究和应用提供了方向。
表演者：一种新型的PPG至ECG重建变压器，用于心血管疾病检测的数字生物标志物
心电图（ECG）是一种捕获心脏活动的电测量，是诊断心血管疾病（CVD）的金标准。但是，由于ECG需要使用用户参与，因此不可避免地进行心脏监测。相比之下，光电学（PPG）提供了易于收集的数据，但其精度有限限制了其临床用法。为了确定这两个信号的优势，最近的研究不适合将PPG信号重新构成到ECG的各种深度学习技术；但是，缺乏文本信息以及降低噪声生物医学信号的能力最终会限制模型的影响。在这项研究中，我们提出了一种基于变压器的新型体系结构，可从PPG重建ECG，并将PPG和重建的ECG与CVD检测的多种方式相结合。此方法是第一次在生物医学波形重构上进行了变压器序列到序列转换，并结合了PPG和ECG的优势。我们还创建了基于斑块的注意（SPA），这是一种效率方法，用于编码/解码生物医学波形。通过获取各种序列长度并捕获交叉点连接，SPA最大程度地提高了本地特征和全局上下文反复的信号操作。所提出的体系结构在BIDMC数据库上生成了0.29 RMSE的状态性能，以重新构建PPG到ECG，超过了先前的研究。我们还在模拟III数据集上评估了该模型，在CVD检测中达到了95.9％的精度，并在PPG-BP数据集中评估了该模型，在相关的CVD糖尿病检测中达到了75.9％的精度，表明其一般能力。作为一种概念证明，一种名为Pearl（原型）的耳环可穿戴式可穿戴，旨在扩大护理点（POC）医疗保健系统。
引用Niemela L，Lamoury G，Carroll S，Morgia M，Yeung A和OH B（2024）探索肠道微生物组之间关系中的性别差异
严重抑郁症，也称为重度抑郁症（MDD），是一种普遍的心理和情感疾病，影响了全球估计有1.85亿人（1）。世界卫生组织将抑郁症分类为2008年全球疾病的第四个领先负担，预测表明，到2030年，它可能成为第二个领先的原因（2）。妇女受到不成比例的影响，与男性相比，患病率几乎翻了一番（1），这是发达国家和发展中国家都观察到的趋势（3）。各种理论（例如生物心理社会模型）试图阐明这种性别差异的根本原因，指出激素的差异（4、5），神经递质（5、6）和大脑结构（7，8）。最近的研究还探索了肠道微生物组和抑郁症之间的复杂关系，从而通过肠脑轴揭示了潜在的联系（9 - 31）。尽管已经取得了显着的进步，但仍然缺乏证据，以精确地阐明了驱动这些差异的机制或性别特定生物标志物的潜力。“肠道营养不良”的概念 - 肠道微生物组组成和功能的异常变化 - 作为MDD和其他精神疾病发病机理的潜在参与者的吸引力（9 - 31）。通过各种途径，包括神经，免疫和代谢机制，肠道微生物组与大脑之间的复杂通信为进一步探索提供了有希望的途径。最近的研究强调了MDD和对照组的个体之间肠道菌群组成的差异，这表明潜在的性别差异需要进一步研究（19，32 - 35）。此范围审查旨在探讨有关严重抑郁症与肠道微生物组之间关系的现有证据，尤其是在女性的背景下，同时总结了肠道微生物组的性别特定于男性和女性受试者的性别差异。
对中药在癌症免疫疗法中的作用的文献计量和可视化分析
结果：癌症免疫疗法研究中TCM的发表率从1994年到2018年稳步增长，从2018年到2023年迅速增长。中国和TCM大学在这一领域取得了最大的研究进步。研究最多的癌症类型是肝脏，肺和结直肠癌。然而，很少有关于上呼吸道肿瘤，宫颈癌和黑色素瘤的研究，这值得更多关注。研究趋势已逐渐从体内和体外模型转变为临床效率。同时，研究重点从化合物TCM制剂或成分类别转变为特定的药效成分，以及从细胞因子转变为免疫检查点的相应靶标。一般而言，分子对接与多摩学分析相结合是TCM中一种流行而流行的研究方法，用于癌症免疫疗法，帮助研究人员更全面，准确地了解TCM在癌症免疫疗法中的机制。通过分析文献，很明显，基于TCM的免疫疗法应在整个癌症过程中有助于有效的维持或辅助治疗，而不仅仅是在后期阶段。
https://doi.org/10.15159/ar.21.131关于在建筑材料中使用天然纤维的文献计量分析G.M.G. Ferreira 1，D。Cecchin1，* 从屠杀猪的盲肠样品中分离出的弯曲杆菌的抗菌抗性 能源管理在农业部门的作用
https://doi.org/10.15159/ar.21.131关于在建筑材料中使用天然纤维的文献计量分析G.M.G.Ferreira 1，D。Cecchin 1，*，A.R.G.de azevedo 2，i.c.r.p.Valadão1，K.A。Costa 3，T.R。Silva 4，F。Ferreira 5，P.I.S。Amaral 6，C.M。huther 1，F.A。Sousa 7，J.O。Castro 8，P.F.P。Ferraz 8和M.A.Teixeira 1 1联邦Fluminense University（UFF），农业工程与环境系，Street Passo daPátria，n。 156，BOA VIAGEM，NITERói-RJ，巴西2北Fluminense州立大学（UENF），土木工程系，Goytacazes Campos，RJ，巴西，3联邦Fluminense University（UFF），生产工程系，工人大道，n。 420，Vila Santa Cecilia，Volta Redonda-RJ，巴西4 North Fluminense State University（UENF），高级材料实验室（LAMAV），AV。alberto lamego，2000，28013-602 Campos dos goytacazes-rj，巴西·弗林宁斯大学（UFF），冶金工程系（VMT） 130-000 Alfenas-MG，巴西7 Semag/Aracruz，AV。Morobá，n。 20，BR 29192-733 BairroMorobá-es，巴西8联邦拉夫拉斯大学（UFLA），大学校园，邮政SCODE 3037 LAVRAS，MG，BRABASIL *通信：Daianececchin@id.uff.uff.uff.uff.br.br.br receaved：Feburoy 2 ND，2021年，2021年；接受：2021年8月3日；出版：2021年8月30日摘要。由于人口对可持续性主题的兴趣越来越大，因此与民用建筑领域的主题相关的出版物有所增长。农业废物已成为一个环境问题，由于自然纤维的特性和改善其产品机械性能的可能性，因此自然纤维在废物的再利用中找到了空间。为了达到可持续的建筑需求，以及重复使用废物的需求，研究开始分析天然纤维在建筑材料中的应用。通过搜索术语“天然纤维”和“建筑材料”术语限制在主要WOS集合中的“天然纤维”和“建筑材料”术语时，通过搜索“天然纤维”和“建筑材料”术语进行的研究提供了。 使用Vosviewer（VOS）软件中的BiblioMetrics分析了与出版物，文件的原产国，文件的原产国，作者使用的关键字以及每个文档的引用数量。 分析的结果表明，多年来与该主题相关的文件的增加，该地区研究最多的国家分别是中国（16），美国（14）和巴西（11）。 对关键词进行分析后提出的结果表明，自然纤维（61个出现），机械性能（44个出现）和复合材料（31例出现）是分析的中出现最高的单词。。使用Vosviewer（VOS）软件中的BiblioMetrics分析了与出版物，文件的原产国，文件的原产国，作者使用的关键字以及每个文档的引用数量。分析的结果表明，多年来与该主题相关的文件的增加，该地区研究最多的国家分别是中国（16），美国（14）和巴西（11）。对关键词进行分析后提出的结果表明，自然纤维（61个出现），机械性能（44个出现）和复合材料（31例出现）是分析的
Taylor Biomass Energy，LLC -Nyserda
我们感谢有机会对气候行动委员会（CAC）（CAC）于2021年12月31日发布的范围范围计划（“草案”）发表评论。我们认为草案是一个很棒的起点，但是在最终范围计划之前，必须进一步解决许多项目。此计划影响我们的客户，员工，家庭和业务必须在纽约州生活，工作和玩耍的所有领域。由于我们在纽约东南部 - 哈德森山谷的战略地点，我们进一步关注。我们的业务必须与宾夕法尼亚州，新泽西州和康涅狄格州保持经济竞争。这三个州尚未分享或纳入纽约州迄今为止所领导的领导。我们担心的是，纽约州将在周围邻国中间成为一个荒凉的岛屿，他们将从我们的巨大努力，痛苦和费用中获得好处。换句话说，他们在任何纽约州要求的计划和要求上都花费了最少的钱，并从我们所有的减排福利中获得了所有的收益，并没有付出最少的收入。纽约人负担不起对纽约州社会的全部费用，除非我们有其他州复制相同的计划，时间表和费用。