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对强迫症的心理治疗和药理治疗的结构神经影像学标记的系统综述
识别与治疗反应和治疗性变化的假定机制相关的个体差异因素可能会改善对强迫症（OCD）的治疗。我们对心理疗法的结构神经影像学标记（即形态计量学，结构连通性）和OCD的药物治疗反应的系统综述26符合条件的出版物（平均研究总计n = 54±41.6 [范围：11-175] [范围：11-175]； OCD组n = 29±19±19±19），以及成人的脑海中，以及成人的脑海中，成人的脑海中，成人的脑海中，适用于Adection n = 29±19）。作为与治疗相关的大脑结构变化。研究结果在整个研究中不一致。前扣带回皮层内（3/5区域，2/8全脑研究）和眶额皮层（5/10区域，2/7全脑研究）中的显着关联是最常见的，但后期性和方向性并不总是一致的。治疗反应的结构性神经影像学标记当前不具有临床实用性。给出越来越多的证据表明，复杂行为与大脑结构之间的关联的特征是小但有意义的效果，可能需要更大的样本。多元方法（例如机器学习）也可以改善神经影像数据的临床预测效用。
2型糖尿病患者的炎症和氧化应激标志物晚期颈动脉粥样硬化
保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。（未经同行评审证明）是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以永久显示预印本。此预印本版的版权持有人于2023年7月13日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.07.13.23292592 doi：medrxiv preprint
靶向扩增子深度测序用于监测肯尼亚西部的抗疟药耐药性标志物
摘要 恶性疟原虫的分子监测对于追踪新出现的突变和已发现突变的趋势非常重要，应作为抗疟药耐药性的早期预警系统。2019 年，在肯尼亚西部八个县对学童进行了恶性疟原虫疟疾调查，从调查中获取了干血斑。实时 PCR 鉴定出 500 个恶性疟原虫阳性样本，这些样本在五个耐药位点进行了扩增，以进行靶向扩增子深度测序 (TADS)。重要的 kelch 13 突变的缺失与 2019 年前肯尼亚的发现相似，在密码子 569 和 578 中观察到低频突变。氯喹抗性转运蛋白基因密码子 76 和 145 为野生型，表明寄生虫分别对氯喹和哌喹敏感。基于密码子 86、184 和 199 的多药耐药基因 1 单倍型主要存在于单倍型 NYT 和 NFT 的混合感染中，分别由缺乏氯喹压力和使用苯芴醇驱动。磺胺多辛-乙胺嘧啶耐药性谱是 Pfdhfr（51I 59R 108N）和 Pfdhps（436H 437G 540E）三重突变的“超级耐药”组合，导致磺胺多辛-乙胺嘧啶无效。TADS 突出显示了低频变异，从而可以尽早识别新的突变、Pfmdr1 密码子 199S 和 Pfdhfr 密码子 85I 以及新出现的 164L 突变。TADS 的附加价值在于它能够准确地识别混合基因型感染并进行抗疟药耐药性标志物的高通量监测。
激素受体和HER2作为乳腺癌的前瞻性分子标记的作用：更新
摘要本综述提供了有关当前方法，原理和作用机理，用于检测乳腺癌进展和复发预后的治疗性能分子标志物，包括雌激素受体（ER），孕激素受体（PR）和人类胚芽生长因子受体2（HERS 2）。的确，激素受体，即ER，PR，原癌基因HER2是基本的分子标记物，用于治疗实践，被识别和确定的预后因素和反应的预测指标。可以通过使用免疫疗法化学（IHC）和原位杂交（FISH）来检测这些标记，这些（FISH）是建立，更快且具有成本效益的检测方法的。这些分子标志物以及临床病理预后参数可以最好地预测癌症复发和进展的预后。最后，作为分子标记物的激素受体和HER2具有主要的治疗意义，并且有能力参与未来的药物开发技术。版权所有ª2020年，重庆医科大学。Elsevier B.V.这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。
基于磁共振成像和机器学习的创伤后癫痫神经解剖学标记
a 南加州大学洛杉矶分校生物医学工程系 b Ming Hsieh 南加州大学洛杉矶分校电气与计算机工程系 c 南加州大学洛杉矶分校 Leonard Davis 老年医学学院 d 南加州大学洛杉矶分校放射学系 e 南加州大学洛杉矶分校神经病学系
色素位点作为查加斯病媒介 Rhodnius prolixus 基因组编辑的标记
。CC-BY 4.0 国际许可，根据 未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者（此版本于 2020 年 4 月 29 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.04.29.067934 doi：bioRxiv 预印本
reglm：使用自回归语言模型设计现实的监管DNA
发现自由糖化胺和糖化尿素是糖尿病性肾病的潜在标志物Rashdajabeen Q Shaikh Q Shaikh 1,2＃，Sancharini das 1＃Fernandes 2,3，Shalbha Tiwari 4，Shalbha Tiwari 4，Unikrishnan Ag 4，Unikrishnan Ag 4，Mahesh Jkulkar J Kulkar 1,2 * sci affliations 1,2 * sci affliations 1 Bio Cai affliations 1 Bio affliations 1 Bio affliations 1 Bio affliations 1 Bio affliations 1 Bio affliations 1 bio CSIR-National Chemical Laboratory，Pune-411008，印度2号科学与创新性研究学院（ACSIR），加兹阿巴德，印度201002年Ghaziabad，印度3号，CSIR-National Chemical Laboratory 3有机化学部，Pune-411008，印度411008，印度411008
微卫星的不稳定性和不匹配修复蛋白缺乏效率：相等的预测标记？
当前的临床指南建议将不匹配修复（MMR）蛋白免疫组织化学（IHC）或分子微卫星不稳定性（MSI）测试作为免疫疗法的预测标记。大多数病理指南都将MMR蛋白IHC视为黄金标准测试，以鉴定具有MMR缺乏症的癌症，并仅建议在特殊情况下进行分子MSI测试或筛查林奇综合征。但是，文献中有一些数据表明两种测试类型可能不相等。例如，分子流行病学研究报告了各种癌症类型中有缺乏的MMR（DMMR）和MSI的速率不同。此外，对这两种测试的直接比较表明，MMR IHC和MSI测试之间的差异相对频繁，尤其是在非直肠直肠癌和非内膜癌症中，对于异常的DMMR表型。也有分散的临床数据表明，如果患者选择基于DMMR与癌症的MSI状态，则免疫检查点抑制剂的效率是不同的。所有这些观察结果都提出了当前的教条，即DMMR表型和遗传MSI状态是免疫疗法的相等预测标记。
用于手指小米的新型基于GBS的SNP标记及其在遗传多样性分析中的使用
eleusine coracana（L。）Gaertn。（通常称为纤维小米）是一种用于食物和饲料的多功能作物。基因组工具对于作物基因库的表征及其基因组主导的繁殖需要。基于高通量测序的表征代表多种农业生态学的纤维细胞种质，被认为是确定其遗传多样性的有效方法，从而提出了潜在的繁殖候选者。在这项研究中，使用基因分型（GBS）方法同时鉴定新型的单核苷酸多态性（SNP）标记和基因型288纤维小米辅助量，从埃塞俄比亚和津巴布韦收集。使用5,226个BI-Callelic SNP在个人和组水平上进行表征，最小等位基因频率（MAF）高于0.05，分布在2,500个纤维小米参考基因组的2,500支支架上。SNP的多态性信息含量（PIC）平均为0.23，其中四分之一的PIC值超过0.32，这使得它们非常有用。基于地理位置的288个加入分为七个种群和种质交换的潜力显示，观察到的杂合性范围狭窄（HO; 0.09 - 0.11）和预期的杂合性（HE），其范围超过了Twofold，从0.11到0.26。等位基因在不同群体中独有的等位基因也得到了识别，这值得进一步研究其与理想性状的潜在关联。在AMOVA，群集，主要坐标和人口结构分析中，埃塞俄比亚和津巴布韦附属之间的高遗传分化很明显。分子方差的分析（AMOVA）揭示了基于地理区域，原产国，流动式，泛质类型和易耐受性的种类群之间的高度显着遗传分化（p <0.01）。菲格尔小米附属的遗传多样性水平在埃塞俄比亚内部的位置中适度变化，北部地区的加入水平最低。在邻居加入聚类分析中，这项研究中包括的大多数改进的品种都非常紧密，这可能是因为它们是使用遗传学上不同的种质和/或以类似性状（例如谷物产量）选择的。通过来自两国不同地区的跨植物上不同的遗传学加入来重组等位基因，可能会导致出色品种的发展。
甲状腺癌治疗中的药物重新定位
生物压力是稳定稻米生产的主要威胁之一。气候变化会影响时空和空间上的害虫爆发的转移。遗传改善了水稻中生物胁迫抗性的方法是一种具有成本效益和环境友好的控制疾病和害虫的方式。通过标记辅助选择（MAS）在本地精英品种中快速部署可用的基因/等位基因（MAS）对于稳定的高产量水稻生产至关重要。在这篇综述中，我们专注于合并所有可用的克隆基因/等位基因，以赋予对水稻病原体（病毒，细菌和真菌）和虫害的耐药性，相应的供体材料以及与识别基因相关的DNA标记。迄今为止，仅针对主要的生物胁迫克隆了48个基因（独立基因座）：棕色Planthopper的7个基因（BPH），爆炸的23个基因，13个用于细菌疫病的基因，病毒的五个基因。图形上将48个基因的物理位置映射在12个水稻染色体上，以便育种者可以轻松地发现所有生物抗性抗性基因和任何其他靶性状基因的靶基因的位置和距离。为克隆基因的有效使用，我们收集了与识别基因相关的所有公开可用的DNA标记（〜500个标记）。对于其他生物应力尚无可用的克隆基因，我们提供了简短的信息，例如供体种质，定量性状基因座（QTL）和相关论文。本综述中描述的所有信息都可以促进稳定的高产水稻生产大米中生物胁迫耐药性的快速遗传改善。