XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemmarkers
CDH1甲基化和乳腺癌中E-钙粘蛋白和其他标记的表达 第34卷，2024年ISSN 2594-5394 乳腺癌的组织学和分子分类
简介：由CDH1基因编码的E-钙粘着蛋白是与细胞粘附有关的糖蛋白，CDH1的甲基化可以防止有利于肿瘤浸润的蛋白质表达。这项研究研究了从乳腺癌患者的肿瘤和非肿瘤组织中提取的DNA中CDH1的甲基化。此外，通过免疫组织化学分析了E-钙粘蛋白，人表皮生长受体2（HER-2），雌激素受体（ER），孕酮受体（PR）和增殖KI-67（KI-67）的标志物的表达。方法：乳房切除术时诊断为乳腺癌的15名妇女肿瘤和非肿瘤乳腺组织的样本，以分析CDH1甲基化。提取DNA，通过Bisulfite方法修饰，并通过聚合酶链反应（PCR）扩增。通过免疫组织化学评估了E-钙粘蛋白，HER-2，ER，PR和KI-67的表达。结果：所有15例患者在肿瘤组织中均具有CDH1甲基化，而在非肿瘤乳腺组织中有9例CDH1甲基化。免疫组织化学分析表明，一名患者具有E-钙粘蛋白的表达，三个患有HER-2，五个患有ER，六个患有PR，九个患有KI-67。结论：我们的发现表明，CDH1基因甲基化阻止了乳腺肿瘤中的e-钙粘蛋白表达，曾经仅通过免疫组织化学分析测试的九名患者中只有一名显示了该蛋白质。在九名患者中观察到的非肿瘤乳腺组织中CDH1的甲基化可能表明存在浸润的肿瘤细胞或非肿瘤性遗传转化的细胞。
针对肝细胞癌的新型尿液游离 DNA 甲基化标记
开发了一种优化的针对肝细胞癌 (HCC) 的甲基化下一代测序检测方法，可直接从尿液中发现与 HCC 相关的甲基化标记物，以进行 HCC 筛查。从 31 名非 HCC 和 30 名 HCC 患者的发现队列中分离的尿液无细胞 DNA (ucfDNA) 用于生物标志物发现，鉴定出 29 个具有差异甲基化区域 (DMR) 的基因。开发了甲基化特异性 qPCR (MSqPCR) 检测方法以验证对应于 8 个基因 (GRASP、CCND2、HOXA9、BMP4、VIM、EMX1、SFRP1 和 ECE) 的选定 DMR。使用存档的 ucfDNA，发现 HCC 患者和非 HCC 患者的 GRASP、HOXA9、BMP4 和 ECE1 的甲基化存在显著差异 (p < 0.05)。使用逻辑回归模型，在 87 名非 HCC 患者和 78 名 HCC 患者的独立训练队列中，将这四种标记物与之前报道的 GSTP1 和 RASSF1A 标记物作为 6 种标记物组合进行评估。6 种标记物组合与 AFP 的 AUROC 为 0.908（95% CI，0.8656–0.9252），显著高于单独使用 AFP（AUROC 0.841（95% CI，0.778–0.904），p = 0.0026）。应用后向选择方法，发现 4 种标记物组合与 6 种标记物组合的性能相似，AFP 的敏感性为 80%，而单独使用 AFP 的敏感性为 29.5%，特异性为 85%。这项研究支持甲基化跨肾 ucfDNA 在 HCC 筛查中的潜在应用。
香蕉种质资源收集高密度标记数字目录
Aubry, S. (2019)。食品和农业植物遗传资源数字序列信息的未来。植物科学前沿，10，1046。https://doi.org/10.3389/fpls.2019.01046 Baurens, F.-C.、Martin, G.、Hervouet, C.、Salmon, F.、Yohomé, D.、Ricci, S.、Rouard, M.、Habas, R.、Lemainque, A.、Yahiaoui, N. 和 D'Hont, A. (2019)。重组和大型结构变异塑造了种间食用香蕉基因组。分子生物学与进化，36，97–111。 https://doi.org/10.1093/molbev/msy199 Carpentier, SC、Dens, K.、den Houwe, IV、Swennen, R. 和 Panis, B. (2007)。冻干是一种在蛋白质提取进行 2DE 分析之前储存和运输组织的实用方法吗？蛋白质组学，7，64-69。 https://doi.org/10.1002/pmic.200700529 Cenci, A.、Hueber, Y.、Zorrilla-Fontanesi, Y.、van Wesemael, J.、Kissel, E.、Gislard, M.、Sardos, J.、Swennen, R.、Roux, N.、Carpentier, SC 和 Rouard, M. (2019)。古多倍体和异源多倍体对香蕉基因表达的影响。 BMC Genomics , 20 , 244, https://doi. org/10.1186/s12864-019-5618-0 Cenci, A., Sardos, J., Hueber, Y., Martin, G., Breton, C., Roux, N., Swennen, R., Carpentier, SC, & Rouard, M. (2020). 揭秘 ABB 异源三倍体香蕉中基因组间重组的复杂故事。《植物学年鉴》, 127 , 7–20。 https://doi.org/10.1093/aob/ mcaa032 D'Hont, A.、Denoeud, F.、Aury, J.-M.、Baaurens, F.-C.、Carreel, F.、Garsmeur, O.、Noel, B.、Bocs, S.、Droc, G.、Rouard, M.、Da Silva, C.、Jabbari, K.、Cardi, C.、Poulain, J.、Souquet, M.、Labadie, K.、Jourda, C.、Lengellé, J.、Rodier-Goud, M.、……Wincker, P. (2012)。香蕉（Musa acuminata）基因组和单子叶植物的进化。 Nature , 488 , 213. https://doi.org/10.1038/nature11241 Davey, JW, Davey, JL, Blaxter, ML, & Blaxter, MW (2010). RADSeq：下一代群体遗传学。Briefingings in Functional Genomics , 9 , 416–423. https://doi.org/10.1093/bfgp/elq031 Droc, G.、Lariviere, D.、Guignon, V.、Yahiaoui, N.、This, D.、Garsmeur, O.、Dereeper, A.、Hamelin, C.、Argout, X.、Dufayard, J.-F.、Lengelle, J.、Baaurens, F.-C., Cenci, A.、Pitollat, B.、D'Hont, A.、Ruiz, M.、Rouard, M.,
COVID-19 疫苗接种后功能性抗体反应增强的遗传标记
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证 它是永久可用的。 是作者/资助者，已授予 medRxiv 许可以显示预印本（未经同行评审认证）预印本 此版本的版权所有者于 2025 年 1 月 20 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.01.20.25320822 doi：medRxiv 预印本
周期性和大约EEG特征作为发育阅读障碍的潜在标记
摘要：发育阅读障碍（DD）是一种神经生物学条件，影响了读取和/或准确读取的能力。分析DD中静静态脑电图（EEG）活性可能会更深入地表征潜在的病理生理学和可能的生物标志物。到目前为止，研究DD中静止状态活性的研究提供了有限的证据，并且没有考虑功率谱的上流区分。在本研究中，（n = 26）和没有DD（n = 31）的成年人接受了阅读技能评估和静止状态的脑电图，以调查上周期活动的潜在变化，这对周期性的对应物和阅读表现的影响。在甲状腺枕通道中，DD参与者表现出明显不同的上膜活性活性，这是通过平板和较低功率谱图所索引的。这些多数措施与文本阅读时间显着相关，这表明与阅读困难的个体差异有联系。与典型的读取器相比，DD组在Beta频段中显示出明显降低的Aperiodic调整功率，这与单词读取精度显着相关。总的来说，在这里，我们提供的证据表明，DD参与者中内源性大道活性的改变，并与神经噪声假设增加一致。此外，我们确认内源性β节奏的改变，这些节奏是根据其潜在的与大细胞传播流的潜在联系来讨论的。
服用橄榄苦苷或羟基酪醇可改善肥胖小鼠的糖尿病标志物
方法：给雄性瑞士韦伯斯特小鼠喂食高脂饮食和链脲佐菌素以分别诱发肥胖症和糖尿病。诱导后，小鼠以 20 毫克/公斤体重的剂量接受橄榄苦苷或羟基酪醇治疗，持续 14 天。在整个治疗期间监测空腹血糖水平、胰岛素敏感性和葡萄糖耐量。此外，还进行了肝脏和胰腺的组织学检查。此外，还进行了计算机对接研究，以评估橄榄苦苷和羟基酪醇与关键代谢受体的相互作用，例如过氧化物酶体增殖激活受体γ (PPARγ)、羟基类固醇 11-β 脱氢酶 1 (HSD11B1) 和果糖双磷酸酶 1 (FBP1)。
妊娠期及婴儿时期母亲压力的神经内分泌和免疫标志物
Sarah Nazzari 1,2、Pasco Fearon 2、Frances Rice 3、Francesca Ciceri 1、Massimo Molteni 1、Alessandra
多模式成像以识别人类亲社会行为的大脑标记
人类如何实现如此高度的亲社会行为是一个引人注目的主题。探索人类亲社会性的神经基础已在近几十年来引起了人们的重大关注。然而，人类亲身社会性的基础神经机制仍有待阐明。为了解决这一知识差距，我们分析了15场经济游戏中的多模式脑成像数据和数据。结果揭示了大脑特征和亲社会行为之间的几个重要关联，包括较强的半球连通性和较大的call体体积。更大的功能分离和整合，以及较少的髓磷脂图与较厚的皮质相结合，与亲社会行为有关，尤其是在社会大脑区域内。当前的研究表明，这些指标是人类亲社会行为的大脑标志物，并为人类亲社会行为的结构和功能性大脑基础提供了新的见解。
与人脑形态相关的血浆代谢标记的地图
抽象背景：代谢过程构成了大脑发育，功能和维护的基础。尽管积累了代谢在脑部健康中至关重要的作用的证据，但迄今为止，尚未全面研究代谢活性的循环标记与普通人群体内脑形态之间的联系。方法：我们对24,940个英国生物库参与者的代谢组和MRI数据进行了单变量回归，以估算249个循环代谢标记的个体和联合关联，并通过91种全球和区域皮质厚度，表面积，表面积和亚皮层体积进行了91次测量。我们研究了已鉴定的空间模式与神经递质的脑图的相似性，并利用孟德尔随机分组来发现代谢物与大脑之间的因果关系。结果：颅内体积和总表面积与循环脂蛋白和糖蛋白乙酰基高度显着相关，相关性最高为.15。具有混合效应方向的各个标记有很强的区域关联，其不同模式涉及额叶和颞皮质厚度，脑干和心室体积。门德尔随机化提供了双向因果效应的证据，其中大多数标记会影响额叶和时间区域。讨论：结果表明循环代谢标记与全球和区域脑形态的不同模式之间的双向双向因果关系很强。产生的协会地图集提供了更好地理解代谢途径在结构性大脑发育和维持中的作用，包括健康和疾病。
社论：植物基因分型：从传统标记到现代技术
与外部植物性状不同，肉眼的肉眼无法区分构成负责这些表型特征的基本遗传材料的基因型。使基因型可以进行研究，并在植物育种和相关主题中进一步理解和使用，已经可以使用各种基因分型方法。植物基因分型始于相当复杂的方法，基于使用标记的探针直接杂交DNA片段来鉴定需要大量靶DNA的特定基因（如限制片段长度多态性或RFLP的情况下）。几年后，它们演变为一系列相对简单，更便宜的基于PCR的方法。These latter reached a peak with very polymorphic and straightforward markers, like microsatellites or SSR (Simple sequence repeats), which were then followed by DNA sequencing and fragment analysis, PCR and qPCR, allele-speci fi c molecular probes and primers, and today ' s modern and advanced microchip-DNA technology involving hundreds to thousands of simultaneous reactions.我们的知识和植物基因分型进展的当前状态在此研究主题中进行了更新，在该主题中，我们详细介绍了用于针对不同植物物种感兴趣的各种基因的可用方法和技术。从传统分子标记到现代微阵列技术，我们的研究主题涵盖和解决了广泛而多样的领域。纳入了各种科学方法和研究思想，旨在更好地了解植物基因分型的更好的理解和实际应用。Yin等。 chinensis makino）。Yin等。chinensis makino）。这导致了随后的14篇发表论文。如上所述，SSR标记是一种简单，通用且直接的分子工具，用于植物基因分型。使用的SSR标记用于实用识别和非头卷心菜的独特性测试（Brassica Campestris ssp。这是一个非常重要的测试，它建立了独特的，统一性和稳定性（DU），这是授予植物品种权利（PVR）所需的基本因素。作者测试了287个SSR标记，用于423种非头卷心菜品种的基因分型，并使用了四种荧光染料，FAM，HEX，HEX，TAMRA和ROX，用于远期引物的标签。重要的是，两种方法