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通过合并贝叶斯网络
我们介绍了基于快速贪婪的等效搜索算法，通过合并本地学到的贝叶斯网络来学习基因调节网络的结构的新方法，用于学习基因调节网络的结构。该方法在Matthews相关系数方面与艺术的状态具有竞争力，该系数既考虑到精度和召回率，同时也可以在速度方面进行改进，扩展到数万个变量，并能够使用有关基因调节网络拓扑结构的经验知识。为了展示我们的方法扩展到大规模网络的能力，我们使用来自不同大脑结构的样本（来自艾伦人脑大脑图书馆）的数据来学习全人类基因组的基因调节网络。此外，这种贝叶斯网络模型应以专家的清晰度来预测基因之间的相互作用，遵循当前可解释的人工智能的趋势。为了实现这一目标，我们还提出了一种新的开放式可视化工具，该工具促进了大规模网络的探索，并可以帮助寻找感兴趣的体验测试节点。
UCT从Donald Gordon获得大量R200M捐赠... UCT学术领导着全球生物多样性和生态系统的努力 新研究强调了气候变化的不断效果 UCT与Futurize合作伙伴，以解决紧迫的医疗保健和 UCT领导的研究证实了四个长颈鹿物种，为... 铺平了道路。
下载神经科学研究所大楼的图片。收听简短的音频版本。开普敦大学（UCT）很高兴地宣布，唐纳德·戈登基金会（DGF）向唐纳德·戈登基金会（DGF）捐款2亿兰特，标志着该大学的神经科学研究所的变革性飞跃。这一重大贡献将在非洲和全球范围内加速创新的神经科学研究。将大脑视为21世纪探索的前沿，UCT的研究人员联合起来建立跨学科的神经科学研究所（NI），他们的愿景是为非洲创造未来的愿景，个人可以通过最佳的大脑健康来实现自己的全部潜力。这一愿景获得了资助机构和慈善家的大力支持，部分原因是在标志性的Groote Schuur医院校园内建立了最先进的设施。在2020年开业，神经科学研究所通过奖学金，奖学金和研究补助金促进了新兴研究人员职业的催化剂。在新时代，DGF ushers的历史贡献是该研究所的，将其推向了唐纳德·戈登神经科学研究所（DGNI）。正如神经科学研究所主任Graham Fieggen教授所描述的：“ NI最令人兴奋的方面是它如何发展了UCT的神经科学社区，并在全球范围内提高了我们研究的知名度。“校友和捐助者（例如唐纳德·戈登基金会）的支持对于UCT的2030年愿景至关重要，我们的目标是释放人类的目标唐纳德·戈登基金会（Donald Gordon Foundation）的这一具有里程碑意义的捐赠是对这一杰出的神经科学家及其工作影响的信心投票。” UCT研究与国际化副校长Sue Harrison教授补充说：“这将大大提高我们在深层纪律专业知识基础上进行世界一流的跨学科研究的能力。” UCT副校长（临时）名誉教授Daya Reddy强调了DGF的大规模财务增长
收件人：相关方 发件人：Anita Dunn 和 Mike Donilon 日期：2023 年 6 月 26 日，星期一 主题：拜登经济学正在改变失败的涓滴政策并改变我们的经济——并且受到绝大多数美国人的强烈支持 拜登总统在 2020 年竞选时承诺重建美国的中产阶级——并创建一个为长期被忽视和落后的家庭和社区服务的经济。 拜登总统在上任时就面临着迫在眉睫的经济危机，但他也意识到，仅仅回到疫情前的经济是不够的，这种经济带有数十年失败的涓滴政策的伤痕——在这种经济中，企业和富人获得大规模减税，而对美国人民的关键投资却被蚕食，工厂被关闭，好工作被转移到海外，整个社区被掏空，失去了希望和尊严，中产阶级生活的标志越来越遥不可及。这是国会共和党人至今仍在推行的经济议程。在总统签署防止灾难性违约的两党预算协议几周后，国会共和党人又开始为偏向富人和大公司的减税奠定基础，这将使赤字增加 3 万亿美元以上。总统上任时秉持着长期坚持的、根本不同的经济愿景——他决心翻开过去失败的涓滴政策的新篇章。两年后，有明确而有力的证据表明，拜登经济学既是一项取得成果的成功经济战略，也是绝大多数美国人大力支持的方法。拜登经济学植根于一个简单的理念，即我们需要从中部向外、从下往上发展经济——而不是自上而下。在这个经济中，我们在美国创造更多，赋予美国工人权力并对其进行投资，并促进竞争以降低工薪家庭的成本。实施这一经济愿景和计划——并果断地翻开涓滴经济时代的新篇章——一直是拜登总统任期内的决定性项目。周三，拜登总统将在芝加哥发表重要讲话，强调他的通过扩大中产阶级来发展经济的战略如何为美国人民带来利益。在未来的几周和几个月里，总统、内阁成员和政府高级官员将继续在全国各地奔走，直接向美国人民宣传拜登经济学和总统的“投资美国”议程，并呼吁那些想通过重拾过去失败的涓滴政策来拖累我们国家倒退的人。为了启动这一冲刺，拜登总统今天将宣布向所有 50 个州、领地和领地提供超过 400 亿美元的基础设施资金。以及哥伦比亚特区，让美国每个人都能享受到价格合理的高速互联网。就像富兰克林·德拉诺·罗斯福通过农村电气化法案将电力供应到美国的每个家庭一样，这一声明是拜登总统为全国工薪阶层和中产阶级家庭直接提供投资、就业和机会的更广泛努力的一部分。
收件人：相关方 发件人：Anita Dunn 和 Mike Donilon 日期：2023 年 6 月 26 日，星期一 主题：拜登经济学正在改变失败的涓滴政策并改变我们的经济——并且受到绝大多数美国人的强烈支持 拜登总统在 2020 年竞选时承诺重建美国的中产阶级——并创建一个为长期被忽视和落后的家庭和社区服务的经济。 拜登总统在上任时就面临着迫在眉睫的经济危机，但他也意识到，仅仅回到疫情前的经济是不够的，这种经济带有数十年失败的涓滴政策的伤痕——在这种经济中，企业和富人获得大规模减税，而对美国人民的关键投资却被蚕食，工厂被关闭，好工作被转移到海外，整个社区被掏空，失去了希望和尊严，中产阶级生活的标志越来越遥不可及。这是国会共和党人至今仍在推行的经济议程。在总统签署防止灾难性违约的两党预算协议几周后，国会共和党人又开始为偏向富人和大公司的减税奠定基础，这将使赤字增加 3 万亿美元以上。总统上任时秉持着长期坚持的、根本不同的经济愿景——他决心翻开过去失败的涓滴政策的新篇章。两年后，有明确而有力的证据表明，拜登经济学既是一项取得成果的成功经济战略，也是绝大多数美国人大力支持的方法。拜登经济学植根于一个简单的理念，即我们需要从中部向外、从下往上发展经济——而不是自上而下。在这个经济中，我们在美国创造更多，赋予美国工人权力并对其进行投资，并促进竞争以降低工薪家庭的成本。实施这一经济愿景和计划——并果断地翻开涓滴经济时代的新篇章——一直是拜登总统任期内的决定性项目。周三，拜登总统将在芝加哥发表重要讲话，强调他的通过扩大中产阶级来发展经济的战略如何为美国人民带来利益。在未来的几周和几个月里，总统、内阁成员和政府高级官员将继续在全国各地奔走，直接向美国人民宣传拜登经济学和总统的“投资美国”议程，并呼吁那些想通过重拾过去失败的涓滴政策来拖累我们国家倒退的人。为了启动这一冲刺，拜登总统今天将宣布向所有 50 个州、领地和领地提供超过 400 亿美元的基础设施资金。以及哥伦比亚特区，让美国每个人都能享受到价格合理的高速互联网。就像富兰克林·德拉诺·罗斯福通过农村电气化法案将电力供应到美国的每个家庭一样，这一声明是拜登总统为全国工薪阶层和中产阶级家庭直接提供投资、就业和机会的更广泛努力的一部分。
结果显示对德克萨斯州和国家具有“巨大”的价值
2022 年，休斯顿航道及其码头还为全国提供了 340 万个就业岗位，其中包括 150 万个德克萨斯州的就业岗位。自 2018 年以来，在休斯顿港两个公共码头集装箱活动强劲增长的推动下，海运货物活动的增长为德克萨斯州带来了近 19 万个新就业岗位，并为德克萨斯州带来了超过 1000 亿美元的经济价值。坎波主席对休斯顿港的员工、合作伙伴、社区、利益相关者、劳工和行业表示自豪和深切的感谢，包括国际码头工人协会、美国海岸警卫队和美国陆军工程兵团，以及港口委员会对支持这一“增长轨迹”的指导和承诺。这项研究的积极成果进一步巩固了港口委员会继续投资休斯顿港未来的道路。该报告的数据还将帮助休斯顿港规划设施和基础设施。马丁联合公司已经代表全球港口进行了 1100 多项经济和规划研究。完整报告可通过此链接访问。执行董事 Roger Guenther 向港口委员会提交的报告呼应了研究结果：“今年，休斯顿港的集装箱出口量继续超过 2022 年的历史水平。”截至 4 月，休斯顿港的两个公共集装箱码头共处理了 1,026,260 个满载的 20 英尺当量单位 (TEU)，今年早些时候就超过了 100 万大关，这是有史以来的第一次。全年装卸集装箱总计 1,241,910 TEU。然而，执行董事警告说，“与 2022 年创纪录的货运量相比，我们继续看到进口集装箱货运量略有下降”，预计“集装箱货运量将按预期和预算正常化”。下一次港口委员会例会将于 2023 年 6 月 27 日举行。关于休斯顿港一百多年来，休斯顿港一直拥有并经营着休斯顿航道沿线的公共码头和码头，包括该地区最大的散货设施和美国最高效的两个集装箱码头。休斯顿港是航道的倡导者和战略领导者。休斯顿航道综合体及其 200 多个私人码头和 8 个公共码头统称为休斯顿港，是美国最大的水运吨位港口，也是休斯顿地区、德克萨斯州和美国的重要经济引擎。休斯顿港支持在德克萨斯州创造近 150 万个就业岗位，在全国创造 340 万个就业岗位，在德克萨斯州创造总额为 4,390 亿美元的经济活动，在全国产生 9,060 亿美元的经济影响。欲了解更多信息，请访问网站 PortHouston.com。联系人：Lisa Ashley-Daniels，公共关系总监，办公室电话：713-670-2644；手机：832-247-8179；电子邮件：lashley@porthouston.com
模拟正在形成的大质量恒星周围的圆盘和磁流出 - II。大质量原恒星喷流的动力学
背景。形成大质量恒星会发射磁源流出物，这实际上是寻找大质量恒星形成地点的标志。然而，直到最近几年，才有可能对这种磁驱动流出物的形成和传播进行理论和观察研究。目的。通过这项工作，我们旨在详细研究从大质量恒星形成早期阶段驱动高度准直流出的机制，以及这些过程如何受到形成大质量恒星的原生环境特性的影响。方法。我们进行了一系列 31 次模拟，旨在建立这些机制的统一理论图景，并确定不同环境的影响如何改变它们的形态和动量输出。磁流体动力学模拟还考虑了欧姆耗散作为非理想效应、自重力和尘埃和气体热吸收和发射的扩散辐射传输。我们从一个坍缩的云核开始，它被最初均匀的磁场穿过，并且正在缓慢旋转。我们在球坐标系中使用了二维轴对称网格。结果。在模拟中，我们可以清楚地区分快速的磁离心发射和准直喷流（速度 ≳ 100 km s − 1 ）和由磁压驱动的更宽的磁塔流，后者会随时间而变宽。我们详细分析了流动的加速度，以及它在几百个天文单位的距离处被磁力重新准直。我们量化了磁制动对外流的影响，这会缩小系统后期演化的外流腔。我们发现，尽管自重力和介质热力学不可扩展，但我们的结果会随着云核的质量而变化，原则上可以用于这种质量的一系列值。我们观察到，对于大质量原恒星的诞生环境的各种假设，都存在相同的喷流驱动机制，但随着时间的推移，它们的形态和机械反馈会发生变化，从而达到更大的尺度。
联合国呼吁对巴基斯坦洪水恢复做出大规模响应
卡拉奇：周一，在卡拉奇国家银行板球场举行的三场系列赛的首场单日赛中，巴基斯坦以六个小门之差击败新西兰。巴基斯坦选择先投球，将新西兰的得分限制在 255 分，随后在 48.1 轮比赛中追平目标。法赫尔·扎曼、巴巴尔·阿扎姆和穆罕默德·里兹万各得半个世纪，帮助巴基斯坦追平目标。此前，纳西姆·沙阿在单日赛板球比赛中获得了第二个五分，新西兰为巴基斯坦设定了 256 分的目标。在卡拉奇的 50 轮比赛中，沙阿获得 5-57 的成绩，客队被限制在 255-9。穆罕默德·里兹万在对阵新西兰的首场单日赛中为巴基斯坦奋力拼搏，球技出色。巴基斯坦队原本要追逐 256 分，但在状态极佳的 Fakhar Zaman 和 Babar Azam 出局后，Rizwan 为巴基斯坦队提供了支持。他打出了第七个 ODI 50 分，为巴基斯坦队在追逐分数方面奠定了完美的基调。这位守门员击球手的表现受到了高度赞扬。
比较基因组学揭示了大规模混乱基因组的进化起源
摘要 纤毛虫是经历广泛程序性基因组重排的微生物真核生物，这是一种自然的基因组编辑过程，可将较长的生殖系染色体转换为较小的富含基因的体细胞染色体。三种研究较为深入的纤毛虫包括 Oxytricha trifallax 、 Tetrahymena thermophila 和 Paramecium tetraurelia ，但只有 Oxytricha 谱系具有大量乱序基因组，其在发育过程中的组装需要数十万个精确编程的 DNA 连接事件，代表了已知生物中最复杂的基因组动态。在这里，我们通过检查 Oxytricha 谱系中不连续和乱序基因的起源和进化来研究这种复杂基因组的出现。本研究比较了来自三个物种的六个基因组，即 Euplotes woodruffi、Tetmemena sp. 和模型纤毛虫 O. trifallax 的生殖系和体细胞基因组。我们对 E. woodruffi 的生殖系和体细胞基因组（它是一个外群）以及 Tetmemena sp 的生殖系基因组进行了测序、组装和注释。我们发现 Tetmemena 的生殖系基因组与 Oxytricha 的一样具有严重的杂乱和中断：13.6％的基因位点需要程序性易位和/或倒位，一些基因在发育过程中需要数百个精确的基因编辑事件。这项研究表明，早期分化的螺旋藻 E. woodruffi 也有一个杂乱的基因组，但只有大约一半的基因位点（7.3％）是杂乱的。此外，它的杂乱基因不太复杂，共同支持了 Euplotes 作为此谱系中可能的进化中间体的地位，处于积累复杂的进化基因组重排的过程中，所有这些都需要大量修复来组装功能性编码区。比较分析还表明，混乱的基因座通常与局部重复有关，支持了通过许多小的 DNA 重复和衰减事件来产生复杂的、混乱的基因组的渐进模型。
大质量引力黑洞的隧穿辐射和量子熵
时间反演性质与量子力学中蕴含的幺正理论相吻合，这一结果揭示了广义相对论与量子力学的不相容性，并导致了“信息悖论”。黑洞信息悖论已被列为本世纪十大物理难题之一，但物理学家们始终坚持信息永远不会丢失。二十多年后，Parikh和Wilczek建议将霍金辐射视为量子隧穿效应，并认为势垒由发射粒子自身的能量决定，因此粒子从黑洞辐射时满足能量守恒。他们用这种方法计算了粒子的修正辐射光谱
大规模并行报告分析中基于序列的条形码偏差校正
大规模并行报告基因检测 (MPRA) 是一种高通量方法，用于评估数千个候选顺式调控元件 (CRE) 的体外活性。在这些检测中，候选序列被克隆到由独特 DNA 序列标记的报告基因的上游或下游。然而，标签序列本身可能会影响报告基因的表达，并导致测量的顺式调控活性出现重大潜在偏差。在这里，我们提出了一种基于序列的方法来校正标签序列特异性效应，并表明我们的方法可以显著减少这种变异源并提高 MPRA 对功能性调控变体的识别。我们还表明我们的模型可以捕获与 mRNA 转录后调控相关的序列特征。因此，这种新方法不仅有助于提高 MPRA 实验中对调控信号的检测，而且还有助于设计更好的 MPRA 协议。
量子引力以暗粒子形式局部大规模激发
我们渐近地构造了一个静态球形激发态，该激发态在可重正化量子引力中无奇点，具有无背景性质。其直径由量子引力的关联长度给出，比普朗克长度长 2 个数量级，外部有史瓦西尾。内部的量子引力动力学采用非微扰高阶修正表达式来描述，该表达式假设了动力学在强耦合的边缘消失的物理要求。运行耦合常数是非线性和非局域性的表现，通过将其近似为依赖于径向坐标的平均场来管理。如果质量是普朗克质量的几倍，我们可以建立一个包含运行效应的引力势线性化运动方程组，并获得激发态作为其解。它可能是暗物质的候选者，并将为黑洞物理学提供新的视角。