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使用HPMScore
摘要：跨膜蛋白（TMP）是一类用于生物学和特性目的的必需蛋白质。尽管结构数量越来越多，但可用序列数量的差距仍然令人印象深刻。选择专用函数以在数百个中选择最可能/相关模型是TMP的特定问题。的确，大多数方法主要集中在球形蛋白上。我们开发了一种评估TMP结构模型质量的替代方法。hpmscore使用无监督的学习方法考虑了序列和局部结构信息，称为混合蛋白模型。该方法在非常不同的TMP all-α蛋白上进行了广泛的评估。产生了不同质量的结构模型，从好质量到不良质量。hpmscore在识别更多退化模型的良好比较模型方面的表现要好，而浓度为46.9％的良好比较模型对40.1％，两者都占13.0％的结果。当所使用的比对高于35％时，HPM是最好的52％，而36％的涂料（两者均为12％）。这些令人鼓舞的结果需要进一步改进，尤其是当序列身份低于35％以下时。增强区域将是进行更大的训练集进行培训。已经实施了专用的Web服务器并提供给科学社区。可以与从比较建模到深度学习方法产生的结构模型一起使用。
接触蚀刻停止 a-SixNy：H 层：单多晶硅闪存数据保留的关键因素
氮化硅 a-Si x N y :H 接触蚀刻停止层通过作用于初始电荷损失现象，强烈影响单多晶硅非挥发性存储器中的数据保留性能。其改进需要通过实验设计方法分析流入等离子体增强化学气相沉积工艺参数。a-Si x N y :H 物理电学分析指出，必须避免富含硅的成分，尤其是其界面层，以减少 a-Si x N y :H 电荷量，从而提高数据保留率。事实上，a-Si x N y :H 靠近浮栅，其电荷调制可以充当寄生存储器，通过电容效应屏蔽浮栅中存储的电荷。© 2009 美国真空学会。DOI：10.1116/1.3071846
Scalable preparation of asymmetrical bilayer sulfide/halide electrolyte membranes for all-solid-state batteries with high voltage
抽象的全稳态电池（ASSB）被认为是提高电池安全性和能量密度的最有希望的候选者。硫化物电解质具有狭窄的电化学窗口，该窗口阻碍了其应用与高压阴极。具有高压耐力的卤化物电解质可以帮助解决此问题。在此，采用喷涂和污染方法的组合用作处理自由的LI 6 PS 5 Cl（LPSCL）不对称的电解质膜（19.23Ωcm2，75μm），用10μmLi3包含6（Licl）层装饰。LICL-LPSCL不对称的电解质膜增强了高压稳定性，使LINI 0.83 CO 0.83 CO 0.11 Mn 0.06 O 2（NCM811）和LI 1.2 Ni 0.13 CO 0.13 CO 0.13 CO 0.13 Mn 0.54 0.54 O 2（LRMO）Cathodes。NCM811 | LICL-LPSCL | NSI ASSB的初始库仑效率（ICE）为85.13％，在200个周期后的容量保留率为77.16％。Compared with the LPSCl membrane, the LICl-LPSCl membrane displayed high stability with the LRMO cathode as the charging cut-off voltage increased to 4.7 V, which improved the initial charge capacity from 143 to 270 mAh g −1 and achieved stable cycling of 160 mAh g −1 at 0.5 C. Additionally, we attempted continuous LICl-LPSCl membrane production and utilized the product to fabricate a基于LRMO的小袋型ASSB。LICL-LPSCL电解质膜的制造证明了其在Assbs中的可控和行业适应应用的潜力。
基准为关联记忆的Hebbian学习规则
关联内存或内容可寻址内存是计算机科学和信息处理中的重要组成函数，同时它是认知和计算脑科学中的关键概念。已经提出了许多不同的神经网络架构和学习规则，以模拟大脑的关联记忆，同时研究关键组件功能，例如模式完成和竞争以及降低噪声。较少研究但同样重要的主动记忆功能是原型提取，其中训练集包括通过扭曲原型模式而生成的模式实例，而训练有素的网络的任务是回忆给定新实例的生成原型。在本文中，我们基于非模块化和模块化重复网络中使用的七个不同HEBBIAN学习规则的关联记忆功能，并在中度稀疏的二进制模式下进行赢家摄取的全部动态操作。总体而言，我们发现模块化网络具有最大的存储器为模式存储容量。流行的标准HEBB规则以最差的能力出现，而协方差学习则证明是强大但容量较低的，并且在测试的不同条件下，贝叶斯 - 赫比亚规则显示出最高的模式存储能力。
线虫秀丽隐杆线虫可以从其共存的真菌微生物组成员Barnettozyma Californica
线虫秀丽隐杆线虫在其环境中以细菌为食，并已成为微生物组研究的模型生物。然而，尽管在其自然栖息地中存在许多真菌物种，但秀丽隐杆线虫是否以及如何与同时发生的真菌相互作用仍然很大。在这里，我们将酵母Barnettozyma californica与秀丽隐杆线虫的中cosm隔离，并表征其基因组和与线虫的相互作用。我们发现B. californica被秀丽隐杆线虫摄入，可以用作食物来源的唯一，尽管很差。然而，当与大肠杆菌OP50一起使用时，真菌会导致人口增长和觅食行为改变，这表明这种真菌 - 细菌混合物比单独的细菌提供了更好的食物来源。这种效果在不同的天然秀丽隐杆线虫菌株之间有所不同，这表明线虫与加利福尼亚州的相互作用是基因组基础。分离的加州菌菌株的完全组装和注释的基因组并未表明其与秀丽隐杆线虫和/或大肠杆菌OP50相互作用的任何明显的候选基因。总的来说，我们的结果提供了一个有趣的例子，说明了自然相互作用的真菌，细菌和动物之间的复杂性和多层关系。
人类诱导性多能干细胞在纳米纤维膜阵列单层上向同步神经网络自动分化
Boxin Huang、Yong He、Elrade Rofaani、Feng Liang、Xiaochen Huang 等人。人类诱导多能干细胞在纳米纤维膜阵列单层上向同步神经网络自动分化。Acta Biomaterialia，2022 年，150，第 168-180 页。�10.1016/j.actbio.2022.07.038�。�hal-03818522�
中性工作记忆训练的脑电图相关性可改善考试焦虑中的注意力控制 Wei, Hua; Beuckelaer, A. de; Zhou, R. 2022，
注意力控制理论认为，高测试焦虑 (HTA) 个体的注意力控制能力受损。然而，通过工作记忆训练，有可能提高这类人的注意力控制能力。本研究调查了 20 天的工作记忆训练（使用情绪中性刺激）是否能提高 HTA 个体的注意力控制能力。在测试相关压力情况下，使用 Flanker 和 Go/Nogo 实验任务测量注意力控制的前后结果，并收集脑电图数据。结果仅显示，HTA 个体在进行中性工作记忆训练后（即结果后与结果前）的 Nogo alpha 功率显著下降。然而，我们未能提供证据证明中性工作记忆训练对 Flanker 和 Go/Nogo 任务中任务表现的提高具有有益的转移效应。因此，本研究表明，在执行 Go/Nogo 任务时，中性工作记忆训练与重要的神经生理相关因素明显相关，但转移效应相当有限。
被许可人和会员状态：24.01.2025
27 AIA Agricola Italiana Alimentare S.P.A. 37036 S. Martino B.A. IT鸡肉和土耳其27 AIA Agricola Italiana Alimentare S.P.A. 37036 S. Martino B.A.IT鸡肉和土耳其
成员（Matsushima's Lab。）教师教授兼董事长Kouji Matsushima，医学博士，博士
导致细胞社会的变化。为了克服这一局限性，在这个项目中，我们通过使用基于BD Rhapsody的新型单细胞RNA-SEQ（SCRNA-SEQ）方法来分析单细胞水平的发炎组织 - tas-seq。（Shichino等人2022，Commun。 Biol .1：602）。 就基因敏感性，检测细胞群体的检测和细胞 - 细胞相互作用的敏感性而言， tas-seq比其他主要的SCRNA-SEQ技术优于其他主要的SCRNA-SEQ技术。 通过使用这项技术，我们分析了二氧化硅诱导的肺纤维化模型，我们发现C1Q是肺间隙巨噬细胞的特定标记，C1Q充当了硅胶诱导的肺纤维化中的纤维化介质（Ogawa等人。 2022，生物化学。 生物。 res。 社区。 599：113-119）。 此外，我们开发了Tas-Seq，Tas-Seq2的更新版本，其中基因检测灵敏度及其实用性得到了增强。 tas-seq2不仅可以应用于基于纳米韦尔的系统（例如 bd rhapsody），但也要基于液滴的系统（例如 10x铬）和基于板的系统（例如 smart-seq2）。 tas-seq2在小鼠脾脏和人类冷冻的PBMC样品中，比原始10x Chroumimum V3（10x Tas-Seq2）的基因比原始10x chroumimus V3（10x Tas-Seq2）高1.5-2倍。 现在，我们正在开发用于高分辨率空间转录组学立体声的Tas-Seq2，用于分析固定细胞，并将其细胞吞吐量增加10-100倍。 此外，我们正在收集人间质肺病患者，纤维化大鼠肺和鼠2022，Commun。Biol .1：602）。tas-seq比其他主要的SCRNA-SEQ技术优于其他主要的SCRNA-SEQ技术。通过使用这项技术，我们分析了二氧化硅诱导的肺纤维化模型，我们发现C1Q是肺间隙巨噬细胞的特定标记，C1Q充当了硅胶诱导的肺纤维化中的纤维化介质（Ogawa等人。2022，生物化学。生物。res。社区。599：113-119）。 此外，我们开发了Tas-Seq，Tas-Seq2的更新版本，其中基因检测灵敏度及其实用性得到了增强。 tas-seq2不仅可以应用于基于纳米韦尔的系统（例如 bd rhapsody），但也要基于液滴的系统（例如 10x铬）和基于板的系统（例如 smart-seq2）。 tas-seq2在小鼠脾脏和人类冷冻的PBMC样品中，比原始10x Chroumimum V3（10x Tas-Seq2）的基因比原始10x chroumimus V3（10x Tas-Seq2）高1.5-2倍。 现在，我们正在开发用于高分辨率空间转录组学立体声的Tas-Seq2，用于分析固定细胞，并将其细胞吞吐量增加10-100倍。 此外，我们正在收集人间质肺病患者，纤维化大鼠肺和鼠599：113-119）。此外，我们开发了Tas-Seq，Tas-Seq2的更新版本，其中基因检测灵敏度及其实用性得到了增强。tas-seq2不仅可以应用于基于纳米韦尔的系统（例如bd rhapsody），但也要基于液滴的系统（例如10x铬）和基于板的系统（例如smart-seq2）。tas-seq2在小鼠脾脏和人类冷冻的PBMC样品中，比原始10x Chroumimum V3（10x Tas-Seq2）的基因比原始10x chroumimus V3（10x Tas-Seq2）高1.5-2倍。现在，我们正在开发用于高分辨率空间转录组学立体声的Tas-Seq2，用于分析固定细胞，并将其细胞吞吐量增加10-100倍。此外，我们正在收集人间质肺病患者，纤维化大鼠肺和鼠我们还建立了博来霉素诱导的肺纤维化模型的时间顺序scrna-seq数据中细胞 - 细胞通信的时间网络分析，并通过使用遗传修饰的小鼠来验证集线器细胞和相关的细胞外分子，并验证分子的作用。我们还建立了体内器官系统，该系统概括了博来霉素诱导的肺损伤的反应，并发现离体系统还可以诱导与鼠模型中无法观察到的与人类IPF相关的细胞集。
