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肠道菌群：抗击结核病的关键因素
哺乳动物出生后不久，其胃肠道便会迅速被外来微生物密集占据，从而建立一个终生存在的微生物群落。这些共生肠道菌群具有多种功能，例如提供营养、处理摄入的化合物、维持肠道稳态以及塑造宿主的肠道结构。菌群失衡的特征是微生物群落失衡，与人类多种疾病密切相关，最近已成为健康预后的一个关键因素。结核病 (TB) 是一种传染性极强且可能致命的疾病，迫切需要改进预防、诊断和治疗策略。因此，我们旨在探索宿主的免疫防御、炎症反应、代谢途径和营养状况如何共同影响宿主对结核分枝杆菌感染的易感性或抵抗力的最新进展。本综述探讨了肠道微生物群的波动不仅影响这些生理过程的平衡，还间接影响宿主抵抗结核分枝杆菌的能力。这项研究强调了肠道微生物群在宿主-微生物相互作用中的核心作用，并为结核病预防和治疗方法的进步提供了新的见解。
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1.1.6培养微生物-AQA GCSE生物学（...
准备细菌培养的最后一步是什么？从瓶子上取出接种环。将瓶脖子穿过火焰，然后将盖子放回原处。部分提起板的盖子，并使用环将细菌散布在琼脂上。拆下环路并关闭盖子。如果环为金属，请通过火焰将其传递。如果是塑料，请安全处理。将盖子胶带粘在板上，将板倒置，然后在25°C的孵化器中放入孵化器中。
引用 Ye X, Yu F, Zhou J, Zhao C, Wu J 和 Ni X (2023) 使用 metatag 分析胃食管反流病儿童的肠道菌群
胃食管反流病(GERD)是指胃内容物反流至食管，引起相应食管症状和/或并发症的疾病，典型症状为烧心、反流、胸痛，还可引起慢性咳嗽、哮喘、吸入性肺炎、咽炎等食管外症状，严重影响患者生活质量。GERD在西方国家的发病率为10%～20%，在亚洲为5.2%～18.3%（Jung，2011）。根据内镜表现分为非糜烂性反流病(NERD)、反流食管炎(RE)和Barrett食管(BE)三种类型。传统观点认为GERD的病理改变主要是胃酸或十二指肠胆汁反流刺激食管黏膜产生的化学性损伤所致，随着病情进展，病变逐渐累及黏膜层、黏膜下层、肌层及浆膜层。但大多数GERD患者在内镜下并无黏膜损伤，提示可能存在其他致病过程（Boeckxstaens et al., 2014; D'Souza et al., 2021; Sharma and Yadlapati, 2021）。近期研究表明，肠道菌群与宿主免疫系统的相互作用在胃肠道疾病（包括食管相关疾病）的发病机制中起关键作用（Gorkiewicz and Moschen, 2018; Dicks, 2022）。肠道菌群的多样性、稳定性、弹性和对生理、病理和环境变化的响应性使其成为许多疾病的有用生物标志物、诊断工具或治疗靶点（Magnusdottir et al., 2017; von Frieling et al., 2018）。虽然对GERD患者菌群的研究取得了一些进展，但之前的研究大多集中在食管和胃内的微生物。研究表明，正常人食管菌群主要由厚壁菌门中的革兰氏阳性链球菌组成（Hunt and Yaghoobi，2017；Deshpande et al., 2018）。然而，研究发现GERD患者食管内以拟杆菌门、变形菌门和梭杆菌门中的革兰氏阴性厌氧菌和微量需氧菌为主（Yang et al.，2009；Yu et al.，2019）。此外，慢性炎症已被证明在多种胃肠道疾病（如BE和食管癌）的发展中发挥作用，而慢性炎症引起的肠道菌群变化则进一步加速疾病的发生和发展（Ghoshal et al.，2012）。脂多糖（LPS）是革兰氏阴性菌外膜的重要组成部分，可能通过诱导NF-κB的表达来促进组织炎症。在动物模型中，高脂饮食通过调节肠道菌群上调炎症信号通路中的 IL-8/CXCL1 来促进 BE 进展为食管癌（Munch et al., 2019），证实了肠道菌群在疾病进展中的作用。GERD 患者肠道菌群的组成和功能仍在很大程度上未知，并且已经证明肠道菌群通过将宿主营养物质转化为
膀胱癌肿瘤中微生物群的研究进度
微生物群也称为微生物群落，是人类微环境的关键组成部分。它主要位于各种器官中，包括肠道，皮肤，口腔，呼吸道和生殖道。微生物群与人体保持着共生的关系，对生理和病理功能的影响至关重要。有越来越多的证据将微生物环与人类癌症联系起来。与传统的信念相反，即正常人的尿道和尿液是无菌的，高通量测序技术和细菌培养方法的最新进展导致在健康个体的尿道中发现了特定的微生物群落。鉴于膀胱癌（BCA）的流行率是尿液系统的常见恶性肿瘤，研究人员将重点转移到探索疾病发展与肿瘤中独特的微生物群落之间的联系。 这种转变导致对微生物群在发作，进展，转移，预后以及早期检测的潜力中的作用进行了更深入的研究。 本文回顾了BCA肿瘤中有关微生物群的现有研究，并总结了有关不同微生物在该疾病各个方面的作用的发现。鉴于膀胱癌（BCA）的流行率是尿液系统的常见恶性肿瘤，研究人员将重点转移到探索疾病发展与肿瘤中独特的微生物群落之间的联系。这种转变导致对微生物群在发作，进展，转移，预后以及早期检测的潜力中的作用进行了更深入的研究。本文回顾了BCA肿瘤中有关微生物群的现有研究，并总结了有关不同微生物在该疾病各个方面的作用的发现。
2型糖尿病患者糖尿病的糖尿病微血管并发症发生率的非酒精性脂肪肝疾病：一种前瞻性队列研究
结果：发现NAFLD与糖尿病神经病和肾病的发生率有关（优势比：1.338（95％的置置间隔：1.091-1.640）和1.333（分别为1.007-1.764））。碱性磷酸酶酶与糖尿病神经病和肾病的较高风险有关（（风险估计：1.002（95％CI：1.001-1.003）和1.002（分别为1.001-1.004）））。此外，γ-谷氨酰胺转移酶与糖尿病性肾病的风险更高（1.006（1.002-1.009）。天冬氨酸氨基转移酶和丙氨酸氨基转移酶与糖尿病性视网膜病的风险成反比（0.989（0.979-0.998）和0.990（0.983-0.996））。此外，ARPI_T（1），ARPI_T（2）和ARPI_T（3）被证明与NAFLD相关（1.440（1.061-1.954），1.589（1.163-2.171）和2.673
共享微生物的培养基。pdf
差异化中性菌AremediaThatdisthatdisthatdistheDifferentGroupsofbacteriaandeven persitatientativativativativativativativativativativativativativativativativativative ofmicroganismissbaseedontheirbasedontheirbybiolbiologicalyceristical。Eg.,A).Bloodagarisbothadifferentialmediumandanenrichedone.Itdistinguishesbetween hemolyticandnonhemolyticbacteria.Hemolyticbacteria(e.g.,manystreptococciand staphylococciisolatedfromthroats)produceclearzonesaroundtheircoloniesbecauseofred bloodcelldestruction.
遇到微生物之间的主要相互作用
微生物群落的特性从微生物之间的相互作用以及微生物及其环境之间的相互作用出现。在生物体的规模上，微生物相互作用是由细胞或细胞 - 资源相遇引发的多步骤过程。微生物相互作用的定量和合理设计需要量化相遇率。通常可以通过相遇内核来量化遇到的率 - 捕获相遇率对细胞表型的依赖性的数学公式，例如细胞大小，形状，密度或运动性以及环境条件，例如湍流强度或粘度。虽然已经研究了一个多世纪的遭遇内核，但通常在微生物种群的描述中没有足够的意见。此外，仅在少数典型的遭遇场景中才知道内核公式。然而，遇到内核可以通过阐明遭遇率如何取决于关键表型和环境变量来指导实验努力来控制微生物相互作用。遭遇内核还提供了在微生物种群生态模型中使用的参数的物理基础估计。我们通过审查传统和最近确定的内核来描述微生物相互作用的这种面向相互作用的观点，这些内核描述了微生物之间的相遇以及水生系统中的微生物和资源之间的相遇。
微生物基因组的三种视图
局部重复是在小区域内发生的对称元素的出现（以100 bp为单位）。所有四种局部重复都可以参与特殊的DNA结构的形成 - 最著名的是十字形，可以通过倒重复序列形成。镜面重复序列可以形成非常不同的结构：分子内三链DNA，也称为triplex DNA和H-DNA [8]。加上三链部分，Triplex DNA还由一个单链部分组成，可以与另一个DNA混合；这被认为是同性重组的可能机制[21]。也存在与直接重复序列相关的特殊DNA结构，并且也存在重复的重复。直接重复可以形成所谓的滑动链DNA（S-DNA），这可能会导致框架移动muta-
根部渗出量有助于调节大甲氧基属中土壤微生物群落功能
结果：两种物种之间的土壤特性和根部特征存在显着差异，其中有土壤水含量（SWC）和根际和散装土壤中的土壤有机碳（SOC）（p <0.05）。虽然根部渗出液的代谢物分类相似，但它们的成分变化，而萜类化合物是主要的差分代谢物。土壤微生物结构和多样性也表现出显着差异，网络中具有不同的关键物种，并且主要与氮和碳周期有关的差异功能过程。在根渗出物介导的根性状，土壤微生物和土壤特性之间观察到了强相关性。 HA网络中发现的主要代谢产物包括糖和脂肪酸，而HP依赖于二级代谢产物，类固醇和萜类化合物。在根渗出物介导的根性状，土壤微生物和土壤特性之间观察到了强相关性。HA网络中发现的主要代谢产物包括糖和脂肪酸，而HP依赖于二级代谢产物，类固醇和萜类化合物。