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精确的机器学习了解神经退行性疾病中的微RNA调节
微RNA（miRNA）是通过mRNA的降解或翻译抑制来调节基因表达的短（〜21 nt）非编码RNA。积累证据表明miRNA调节在多种神经退行性（ND）疾病的发病机理中的作用，例如，例如阿尔茨海默氏病，帕金森氏病，帕金森氏病，肌萎缩性侧面硬化症和亨廷顿病（HD）。几项旨在探讨miRNA调节在NDS中的作用的系统级别研究，但这些研究仍然具有挑战性。该问题的一部分可能与缺乏足够丰富或同质的数据有关，例如时间序列或在模型系统或人类生物样本中获得的细胞类型的数据，以说明上下文依赖性。该问题的一部分也可能与与miRNA和mRNA数据的准确系统级建模相关的方法学挑战有关。在这里，我们批判性地回顾了用于分析表达数据的机器学习方法的主要家族，强调了使用形状分析概念作为精确建模高度尺寸的miRNA和mRNA数据的添加价值，例如在研究HD过程中获得的概念，并详细介绍了这些概念和方法的潜在方法和方法来对这些概念和方法进行建模复杂的复杂信息数据。
分析方法-RSC发布
在所有生物标志物中，科学家们都越来越关注小小的miRNA（大约长度为22个核苷酸）非编码调节性RNA，可能会通过与mRNA相互作用来影响几乎所有人类疾病的发展和进展。15,16实际上，任何单个miRNA都可以通过广泛的miRNA - mRNA相互作用网络靶向并抑制数百个mRNA，因此会影响广泛的细胞和生物学过程。近年来，miRNA作为一种新型的生物标志物表现出了巨大的希望，用于检测各种疾病，包括癌症，17个疾病中的17种疾病，其中17种在炎性慢性疾病18等。19然而，由于其固有特征引起的某些技术困难，例如
多发性骨髓瘤药物疗效分析
图 2. 多发性骨髓瘤中失调的一组已确定的 miRNA，这些 miRNA 也在我们的初步尿液数据中被发现。（A）根据多发性骨髓瘤的既定生物标志物列表，我们展示了一个人在两个月间隔的三个时间点上发生的变化。除最后一个生物标志物外，所有生物标志物在多发性骨髓瘤中均上调（另见图 1 中的 miRNA 和（Pichiorri 等人，2008；Roccaro 等人，2009））；因此，对于这个特定的受试者，两个生物标志物 miR-181a-5p 和 miR-221-5p（均在图中圈出）正在向疾病状态转变，尽管变化很小（见颜色编码图例了解时间进展标记）。（B）多发性骨髓瘤中 miRNA 失调的示意图；治疗策略可以设计为应用药物治疗，改变 miRNA 的丰度水平，以纠正其潜在基因的表达。因此，尿液样本的纵向分析可以提供非侵入性药物疗效读出检测。
微小RNA促进胃癌化学耐药性
摘要 简介：尽管临床实践取得了长足进步，但胃癌 (GC) 仍然是全球第三大癌症死亡原因。耐药性的发生率仍然是有效治疗 GC 的障碍。尽管化学耐药性的分子机制已被广泛研究，但 miRNA 的基因调控和表达机制尚未完全了解。方法：搜索 PubMed、Scopus、Google Scholar 和 Embase 数据库的在线数据库以检索相关出版物。使用以下关键词：MicroRNA、非编码 RNA、miRNA、胃癌、耐药性和化学耐药性。结果：miRNA 在肿瘤的发生、进展和转移中起着关键作用，以及在介导 GC 化疗耐药性的途径的发展中起着关键作用。不幸的是，到目前为止，还没有一致、可靠的生物标志物可用于在开始治疗之前预测化疗的反应。讨论：在这篇综述中，我们想概述 GC 中的 miRNA 和 miRNA 促进的化学耐药机制，以开发个性化治疗方法来克服 GC 耐药性。
多发性骨髓瘤药物疗效分析
图 2. 多发性骨髓瘤中失调的一组已确定的 miRNA，这些 miRNA 也在我们的初步尿液数据中被发现。（A）根据多发性骨髓瘤的既定生物标志物列表，我们展示了一个人在两个月间隔的三个时间点上发生的变化。除最后一个生物标志物外，所有生物标志物在多发性骨髓瘤中均上调（另见图 1 中的 miRNA 和（Pichiorri 等人，2008；Roccaro 等人，2009））；因此，对于这个特定的受试者，两个生物标志物 miR-181a-5p 和 miR-221-5p（均在图中圈出）正在向疾病状态转变，尽管变化很小（见颜色编码图例了解时间进展标记）。（B）多发性骨髓瘤中 miRNA 失调的示意图；治疗策略可以设计为应用药物治疗，改变 miRNA 的丰度水平，以纠正其潜在基因的表达。因此，尿液样本的纵向分析可以提供非侵入性药物疗效读出检测。
miR-181c在tri- ...
在过去的几十年中，miRNA被认为是控制许多关键和基本信号通路的关键性细胞风湿病。这些小的非编码RNA在调节基因表达中起着基本作用，积累了MIRNA调节多种信号传导途径的MIRNA能力，曾经改变的信号传导途径可以导致许多代谢性疾病的发展。此外，miRNA在维持线粒体稳态和炎症反应中具有至关重要的作用。在许多研究的miRNA中，高度保守的miR-181家族，特别是miR-181c是一个有趣的研究领域。在当前的综述中，我们将概述MiR-181c参与的三条道路，其功能及其在发展糖尿病，肥胖症，血管生成受损和衰老中的作用。此外，本综述将在这些疾病模型中对关键标记MiR-181c触发器或目标提供关键见解。最后，这篇评论旨在更好地了解miR-181c家族，希望它可以为不同的代谢疾病开放新的治疗途径。
引用Amber S和Zahid S（2024），这是一种识别阿尔茨海默氏病参与的miR-153的潜在下游靶标的硅方法。 fron
因此，识别信息性生物标志物仍然是一个重大挑战。自过去十年以来，作为各种重要生物学过程的调节剂，表观遗传机制变得广泛突出，而这些过程的核心是微核酸（miRNAS）（Mirnas）（Filipowicz等，2008）。miRNA属于小型非编码RNA类，该类别通过靶mRNA降解或翻译抑制在转录后调节基因表达（Pu等，2019）。miRNA：mRNA双链形成需要两个序列中八个核苷酸种子区域之间的互补性。双链体针对多核糖体进行调节，以调节mRNA翻译过程，或者针对储存/降解的P体型（Filipowicz等，2008）。miRNA可以控制近60％的蛋白质编码基因的表达，因此，这些被认为是各种疾病早期诊断的重要生物标志物。它们作为有效生物标志物的潜力可以从独特的分泌特性中得出，因为它们在没有细胞对细胞接触的各种细胞类型中调节多个基因的表达（Schwarzenbach等，2014）。除了它们在组织中的存在外，miRNA还分泌在细胞外流体，血浆和唾液中，因此可以作为疾病诊断的潜在无侵入性标记物（François等，2019）。关于miRNA参与人类疾病的初步证据起源于癌症研究。miR-153与各种疾病有关，例如高血压，骨肉瘤，胶质母细胞瘤和其他各种癌症。各种表达的促进研究表明，与对照相比，癌症样品中不同miRNA的表达异常（Calin等，2002）。在AD中始终发现受管制的miRNA包括： miR-9，miR-29，miR-34，miR-107，mir-181，mir-186，mir-146a，mir-155和mir-153（Femmminella et al。，2015）。miR-153通过kCNQ4的下调有助于高血压状态（Carr等，2016）。miR-153表达的增加升高了神经发生和改善的认知（Qiao等，2020）。此外，与年龄匹配的对照样本相比，在早期，中，中度和严重的AD病例中还观察到了miR-153的表达水平的显着降低。此外，在miR-153和β斑块负担之间观察到了反相关性，使其成为潜在的疾病生物标志物和新型药物靶标（Long等，2012）。miR-153-3p的异位表达通过增加IL-1β，TNF-α和IL-6的释放，并通过调节GPR55表达来降低神经干细胞分化，从而诱导了炎症（Dong等，2023）。增加了miR-153在海马中破坏突触1的表达，并受损的谷氨酸能囊泡转运受损，从而导致大鼠慢性脑灌注不足（Zhang等，2020）。由于miR-153在包括AD在内的神经元疾病中的重要作用，至关重要的是要确定与该miRNA相同的分子靶标，以阐明导致疾病表型的基本机制。由于miRNA在与疾病相关的过程中的重要性需要改善miRNA目标预测的速度。由于当前的实验程序的局限性，有关miRNA的调节和治疗作用的数据很少（Jaberi等，2024）。可用于揭示具有相对灵敏度和特异性的大部分miRNA的分子靶标的分子靶标的
MiRNA-16-1 抑制 Mcl-1 和 Bcl-2 并使慢性淋巴细胞白血病细胞对 BH3 模拟物 ABT-199 敏感
MicroRNA（miRNA）是一小群内源性单链非编码RNA，长度为20-22个核苷酸，参与多种细胞过程，如细胞存活、细胞死亡、分化和增殖。它们通过直接结合特定靶mRNA起作用，从而抑制基因表达（15，16）。多项研究表明，miRNA被认为是多种癌症（如结肠癌和乳腺癌）的重要诊断和治疗生物标志物（17，18）。此外，miRNA参与几乎所有的血液学过程，表明miRNA在CLL中发挥着重要作用（19-21）。在大多数CLL病例中都观察到了遗传异常。这些畸变包括中等风险的11q缺失、低风险的13q缺失和高风险的17p缺失（22）。13q14缺失是最常见的遗传畸变，在超过
MicroRNA 及其在乳腺癌骨转移中的作用
摘要 乳腺癌晚期会出现骨转移，导致患者生活质量下降，死亡率增加。目前对骨转移的治疗只是姑息性的，仍需确定有效的治疗靶点。微小RNA（miRNA）是一大类非编码小RNA，它们调节细胞内的基因表达。有趣的是，某些miRNA的表达与骨转移进展的几个阶段有关，凸显了这些小RNA在转移性疾病过程中的重要性。在这篇综述中，我们旨在总结miRNA及其mRNA靶点在驱动乳腺癌骨转移方面的最新发现。此外，我们讨论了使用miRNA作为乳腺癌骨转移的直接治疗靶点或高级疗法的可能性，以及它们作为骨转移的预测生物标志物的潜力，以便早期诊断和更好地为癌症患者量身定制治疗方案。
miR-21、miR-34 和 miR-155 的重要更新
基于微小 RNA (miRNA) 的疗法对癌症治疗大有希望，但表达多变性、脱靶效应和临床效果有限等挑战已导致许多临床试验退出。本综述通过研究 miR-21、miR-34 和 miR-155 探讨了基于 miRNA 的疗法所面临的挫折，强调了它们的功能复杂性、脱靶效应以及有效提供这些疗法的挑战。此外，它还强调了为克服这些挑战而在递送方法、联合疗法和个性化治疗方法方面取得的最新进展。本综述强调了涉及 miRNA 的复杂分子网络，特别是它们与其他非编码 RNA（例如长链非编码 RNA (lncRNA) 和环状 RNA (circRNA)）的相互作用，强调了 miRNA 在癌症生物学和治疗策略中的关键作用。通过解决这些障碍，本综述旨在引导未来的研究利用 miRNA 疗法的潜力有效靶向癌症途径，增强抗肿瘤反应，并最终改善精准癌症治疗的患者预后。