(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年3月21日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.03.20.533577 doi:Biorxiv Preprint
大豆是一种从野生大豆(Glycine soja sied。&ZUCC)在东亚6,000至9,000年前,随着中国,韩国,日本和世界其他地区的人类食品和牲畜饲料的广泛生长。全球气候变化导致了大豆种植和育种方面的一系列挑战。随着高通量基因组测序技术的发展,有关大豆的基因组信息现在更容易获得,并且对分子繁殖很有用。然而,关于作物发育的表观遗传法规仍然在很大程度上尚未开发。在这篇综述中,我们总结了大豆对生物和非生物胁迫的适应性调节机制的最新覆盖,这在组蛋白修饰和microRNA(miRNA)方面尤其重要。最后,我们讨论了这种知识对组蛋白修饰和miRNA在大豆分子繁殖中的潜在应用,以在不断变化的环境中证明作物的性能。
主动上肢外骨骼是神经恢复的潜在强大工具。该潜力取决于几种基本控制模式,其中一种是透明度。在这种控制模式下,外骨骼必须遵循人类运动而不会改变它,从理论上讲,这意味着无效的相互作用工作。达到透明度的水平高,尽管不完美,既需要一种适当的控制方法,又需要对外骨骼对人类运动的影响进行深入评估。本文基于识别外骨骼动力学的识别,或者是在力反馈控制或结合下引入了三种不同的“透明”控制器的评估。因此,这些控制器可能会通过设计明显诱导不同水平的透明度。进行的调查可以更好地理解人类如何适应一定是不完事的透明控制器。一组14名参与者受到这三个控制者的束缚,同时在副臂平面进行运动。随后的分析是根据相互作用,运动学,肌电图和人体工程学反馈问卷进行的。结果表明,在执行透明的控制器较少的情况下,参与者的策略往往会引起相对较高的相互作用工作,并具有较高的肌肉活动,从而导致运动学指标的敏感性很小。换句话说,截然不同的残留互动工作并不一定会引起非常不同的运动运动学。这样的行为可以通过自然的人类倾向来解释以维护其首选的运动学的努力,应在将来的透明控制器评估中考虑到这一点。
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奥尔巴尼 - 纽约州公共服务委员会(委员会)今天指示国家燃气分销公司(NFG)采取许多措施来修改和改善其天然气系统的长期计划。修改包括参与程序的利益相关者的意见和建议。根据其决定,该委员会指示NFG提出试点项目测试热泵部署的不同情况,在其长期计划的年度更新中提供其他信息,并在其下一个长期计划申请中解决某些建议。nfg将在每年5月31日之前提供其长期计划的年度更新,并在2026年12月15日之前提交其下一个长期计划的下一次迭代。“委员会的开创性计划过程将减少该州天然气输送系统的温室气体排放,”委员会主席罗里·克里斯蒂安(Rory M. Christian)说。“对国家燃气和其他主要公用事业的长期计划进行严格的审查和开放利益相关者流程将确保天然气公用事业采取适当的行动以帮助实现州的温室气体减少目标。这些天然气计划将确保天然气公用事业继续提供安全,适当和可靠的服务,同时努力减少温室气体排放。”
迄今为止,大多数基因组编辑分析都是基于量化小插入和缺失。在这里,我们表明 CRISPR-Cas9 基因组编辑可以在不同的原代细胞和细胞系中诱导较大的基因修饰,例如缺失、插入和复杂的局部重排。我们使用不同的方法分析了造血干细胞和祖细胞 (HSPC) 中的大型缺失事件,包括克隆基因分型、液滴数字聚合酶链反应、具有唯一分子标识符的单分子实时测序和长扩增子测序分析。我们的结果表明,在 HSPC 中的 HBB(11.7 至 35.4%)、HBG(14.3%)和 BCL11A(13.2%)基因以及 T 细胞中的 PD-1(15.2%)基因的 Cas9 靶向切割位点处,高达数千个碱基的大量缺失以高频率发生。我们的发现对于推进基因组编辑技术治疗人类疾病具有重要意义,因为非预期的大规模基因修饰可能会持续存在,从而改变生物学功能并减少可用的治疗等位基因。
1 cnc-Center,Coimbra大学的神经科学与细胞生物学,3004-517 Coimbra,葡萄牙2中心,创新生物医学和生物技术中心(CIBB),科普布拉大学,3004-517 COIMBRA,COIMBRA,COIMBRA IMISISC,IIIISBRAING,II IIIII,3004-517诺丁汉大学药学院,诺丁汉大学NG7,英国5号,诺丁汉大学医学院,诺丁汉大学,英国诺丁汉大学6,英国6号,诺丁汉大学6,诺丁汉大学6号研究所(IMED.ULISBOA)BON,BON,葡萄牙7葡萄牙alho@ff.ulisboa.pt(A.N.C.); mattea.finelli@nottingham.ac.uk(m.j.f.)†这些作者对这项工作做出了同样的贡献。•这些作者也为这项工作做出了同样的贡献。
靶向核酸酶聚集、规律间隔的短回文重复序列/CRISPR 相关蛋白 (CRISPR/Cas) 系统最近已成为一种重要的基因操作方法。由于它易于在各种生物体中通过 RNA 编程靶向 DNA/蛋白质结合,因此这种原核生物防御系统是一种多功能工具,在研究领域具有许多应用,并且在农业和临床改进方面具有很高的潜力。本综述将简要介绍导致其发现和适应的历史。我们还介绍了它的一些限制,以及为克服这些限制而进行的修改,特别关注最常见的 CRISPR/Cas9 介导的非同源末端连接修复。[BMB 报告 2020;53(7):341-348]
摘要:尽管RNA的下一代测序(NGS)广泛使用,但多个RNA核苷酸修饰的同时直接测序和定量映射仍然具有挑战性。质谱(MS)的测序可以直接序列所有RNA修饰,而无需限于特定的测序,但是它需要很少有TRNA可以提供的完美MS梯子。在这里,我们描述了一种MS梯子互补测序方法(MLC-SEQ),该方法避免了完美的阶梯要求,从而可以在单核苷酸精度下对全长异质细胞TRNA进行全长异质细胞TRNA的测序。与基于NGS的方法(失去RNA修改信息)不同,MLC-Seq保留了RNA序列多样性和修改信息,揭示了新的详细的化学计量tRNA修饰谱及其在使用DealKylating酶ALKB治疗时进行的更改。也可以将其与参考序列结合使用,以提供对总TRNA样品中不同TRNA和修改的定量分析。MLC-Seq可以实现RNA修改的系统,定量和特定于位点的映射,从而揭示了TRNA的真正完整信息内容。■简介
2-HG:D-2-羟基戊二酸。4-HNE:4-羟基-2-壬烯醛。4-ONE:4-氧代-2-壬烯醛。BEAS-2B:用 Ad12-SV40 2B 转化的支气管上皮。CAF-1:染色质组装因子-1。CYP2E1:细胞色素 P450 家族 2 亚家族 E 成员 1。DDR:DNA 损伤反应。DSB:双链断裂。EMT:上皮间质转化。ER:雌激素受体。EWS:尤文氏肉瘤。GLO1:乙二醛酶 1。GSH:谷胱甘肽。GSNO:亚硝基谷胱甘肽。HAT:组蛋白乙酰转移酶。HDACi:组蛋白去乙酰化酶抑制剂。HDACs:组蛋白去乙酰化酶。HFD:组蛋白折叠域。 HIRA:组蛋白细胞周期调节剂。HMT:组蛋白甲基转移酶。HUVEC:人脐静脉内膜细胞。IDH:异柠檬酸脱氢酶。IL:白细胞介素。jmjCs:jumonji 蛋白。LOXL2:赖氨酰氧化酶样 2。LSD1:赖氨酸特异性脱甲基酶 1。LTQ:赖氨酸酪氨酸醌结构域。MGO:甲基乙二醛。MnSOD:锰超氧化物歧化酶。MS:质谱法。NAC:n-乙酰半胱氨酸。NSCLC:非小细胞肺癌。ONOO -:过氧亚硝酸盐。oxiPTMs:氧化翻译后修饰。PARP:聚 ADP 核糖聚合酶。PDXs:患者来源的异种移植。PTMs:翻译后修饰。 RNOS:活性氧和活性氮氧化物。ROS:活性氧。SAHF:衰老相关异染色质灶。SAM:S-腺苷甲硫氨酸。SLE:系统性红斑狼疮。TNBC:三阴性乳腺癌细胞。V/ST:伏立诺他/替莫唑胺。α-KG:α-酮戊二酸