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<将小的RNA作为促进症中的调节分子
试剂的浓度是，标记的DNA丝的每个副本仅降解一次；由于灯丝以多个副本存在存在，因此从统计上考虑所有副本，丝的每个底部将至少降解一次，因此将根据切割位点产生不同长度的许多片段。
生物多样性通过新兴的时间壁ches
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年3月11日。 https://doi.org/10.1101/2023.02.17.529002 doi：Biorxiv Preprint
免疫抑制性血管壁基驱动巨噬细胞极化和胶质母细胞瘤的免疫疗法
癌症免疫受到白细胞与肿瘤和基质细胞的相互作用进行时空调节，导致免疫逃避和免疫疗法耐药性。在这里，我们确定了内皮细胞（EC）的独特的间充质类群体，该群体在胶质母细胞瘤（GBM）中形成了免疫抑制性血管生态位。我们揭示了一种在空间限制的，Twist1/Satb1介导的顺序转录激活机制，通过该机制，肿瘤ECS产生骨桥蛋白以促进免疫抑制巨噬细胞（Mφ）表型。Twist1的遗传学或药理消融逆转Mφ介导的免疫抑制并增强T细胞浸润和激活，从而导致GBM生长降低和扩展小鼠的存活，并使肿瘤对嵌合抗原受体TRAMEROR疗法敏感。因此，这些发现发现了控制tu-Mor免疫力的空间限制机制，并建议靶向内皮扭曲1可能为优化癌症免疫疗法提供了有吸引力的机会。
肿瘤微环境内的动态相互作用：CAFs 与肿瘤微环境之间的相互作用如何影响治疗耐药性
肿瘤微环境 (TME) 是一个由细胞、信号分子和细胞外基质成分组成的复杂生态系统，对癌症进展有重大影响。在 TME 的关键参与者中，癌症相关成纤维细胞 (CAF) 因其多样化和影响力的作用而受到越来越多的关注。CAF 是活性成纤维细胞，在各种癌症类型的 TME 中大量存在。CAF 通过促进血管生成、重塑细胞外基质和调节免疫细胞渗透，对肿瘤进展有重大贡献。为了影响微环境，CAF 通过旁分泌信号和直接细胞间相互作用与免疫细胞、癌细胞和其他基质成分进行串扰。这种串扰可导致免疫抑制、肿瘤细胞增殖和上皮-间质转化，从而导致疾病进展。新兴证据表明，CAF 在治疗耐药性（包括对化疗和放疗的耐药性）中起着至关重要的作用。CAF 可以通过分泌促进药物作用、增强 DNA 修复机制和抑制细胞凋亡途径的因子来调节肿瘤对治疗的反应。本文旨在了解 CAF 在 TME 内的多方面功能，讨论 CAF 与其他 TME 细胞之间的串扰，并阐明 CAF 对治疗耐药性的贡献。靶向 CAF 或破坏其与其他细胞的串扰有望克服药物耐药性并提高各种癌症类型的治疗效果。
水老化和有机碳源的质量驱动活性巴旋原核生物微生物组的小众分区
由于有机物（OM）源（1000 - 4000 m深度）的稀缺性，原核生物代谢被认为集中在源自表面的颗粒上。然而，活跃的巴旋原核生物群落的结构及其在环境梯度之间的变化如何仍未开发。结合16S rRNA基因和转录本测序，宏基因组学和底物摄取潜在测量值，我们旨在探讨水质量的衰老和OM影响的质量如何影响活性微生物组的结构，以及对社区功能的潜在影响。我们发现，在富含顽固性OM的较老的水质量中，分类群具有自由生活的生活方式对活性微生物组的相对贡献，这表明这些原核生物也可能在海洋广阔地区的沐浴型代谢中发挥作用。表现出较低的潜在代谢率，并且具有有限数量的两分量感觉系统，这表明它们具有较小的感知能力和对环境提示的反应。相比之下，与颗粒相关的原核生物携带的基因用于颗粒定植和碳水化合物利用，这些基因在具有自由生活的生活方式的原核生物中没有。一致地，我们观察到，与较高比例不稳定OM的水域相比，居住在较旧水域的原核生性群落显示出降低的颗粒能力，并具有更高的使用复杂碳源的能力。我们的结果提供了涉足贝类活性原核微生物组区域化的证据，并根据OM的质量揭示了细分市场分配。
水老化和有机碳源的质量驱动活性巴旋原核生物微生物组的小众分区
由于有机物（OM）源（1000 - 4000 m深度）的稀缺性，原核生物代谢被认为集中在源自表面的颗粒上。然而，活跃的巴旋原核生物群落的结构及其在环境梯度之间的变化如何仍未开发。结合16S rRNA基因和转录本测序，宏基因组学和底物摄取潜在测量值，我们旨在探讨水质量的衰老和OM影响的质量如何影响活性微生物组的结构，以及对社区功能的潜在影响。我们发现，在富含顽固性OM的较老的水质量中，分类群具有自由生活的生活方式对活性微生物组的相对贡献，这表明这些原核生物也可能在海洋广阔地区的沐浴型代谢中发挥作用。表现出较低的潜在代谢率，并且具有有限数量的两分量感觉系统，这表明它们具有较小的感知能力和对环境提示的反应。相比之下，与颗粒相关的原核生物携带的基因用于颗粒定植和碳水化合物利用，这些基因在具有自由生活的生活方式的原核生物中没有。一致地，我们观察到，与较高比例不稳定OM的水域相比，居住在较旧水域的原核生性群落显示出降低的颗粒能力，并具有更高的使用复杂碳源的能力。我们的结果提供了涉足贝类活性原核微生物组区域化的证据，并根据OM的质量揭示了细分市场分配。
组合组学揭示了杜罗葡萄酒产区真菌和细菌的微生物生态位与葡萄酒挥发性特征之间的关联
葡萄酒微生物群落建立了复杂的生态系统，调节香气化合物的形成，但只有少数研究寻求特定微生物与葡萄酒挥发性物质之间的相关性。本研究结合了代谢条形码和代谢组学，以识别与杜罗河标志性地区 3 个著名品种的葡萄酒挥发性特征相关的真菌和细菌微生物生态位。在整个自然发酵过程中，鉴定了三个主要的微生物生态位，并且 Hanseniaspora - Saccharomyces 的演替时间取决于品种。最大的生态位包括 Hansenias pora、Aureobasidium、Alternaria、Rhodotorula、Sporobolomyces、Massilia、Bacillus、Staphylococcus 和 Cutibacterium，它们与 7 种代谢物呈正相关，即乙偶姻、乙酸异戊酯、丙酸乙酯、c-3-己烯醇、苯乙醚和 4-乙基苯酚。发酵酵母S. cerevisiae、Torulaspora delbrueckii和Meyerozyma caribbica与γ-丁内酯、t-威士忌内酯、异戊醇、癸酸乙酯、异丁酸乙酯、琥珀酸二乙酯、异戊酸、4-乙基愈创木酚和4-丙基愈创木酚呈强相关性。 Lachancea quebecensis 与几种致病真菌（青霉菌、白粉病菌、核盘菌、曲霉菌、Mycosphaerella tassiana）和细菌（假单胞菌属、酸拟杆菌、泛菌、Steno trophomonas 和 Enhydrobacter）聚类，与各种单萜醇和降异戊二烯类化合物（包括芳樟醇和 β-紫罗兰酮）呈正相关，此外还与苯甲醇、二乙酰、乙酸异丁酯、乙基香草酸酯和甲基香草酸酯呈正相关。代谢物-微生物群相关性表明品种特异性可能是区域芳香特征的基础。
转移前微环境形成中的活跃靶点
目前，肿瘤转移仍然是导致癌症患者高复发率和高死亡率的主要原因。目前尚无针对转移性癌症患者的临床有效治疗策略。近年来，越来越多的证据表明，转移前微环境（PMN）在驱动肿瘤转移中起着至关重要的作用。然而，由于PMN的形成涉及原发性肿瘤和转移性靶器官之间大量复杂的通讯和潜在机制，因此对PMN的形成仍然缺乏清晰而详细的了解。尽管包括肿瘤外泌体和细胞外囊泡在内的许多成分在影响PMN进化中的作用已被充分证实，但癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤微环境中控制PMN形成的作用常常被忽视。成纤维细胞通过调节外泌体、代谢等方式引发PMN的形成，这一发现已得到越来越多的认可。本文主要总结不同来源的成纤维细胞影响PMN进化的潜在机制，并进一步强调针对成纤维细胞阻止PMN形成的潜在策略。
SVZ干细胞小细胞小众，函数和...
新皮层发育取决于神经干细胞和祖细胞增殖和分化以在成年大脑中产生不同种类的神经元的固有能力。这些祖细胞可以区分为顶端祖细胞，这些祖细胞在心室区和基础祖细胞中占据干细胞生态位，这些祖细胞占据了室室（SVZ）中的干细胞生态位。在发育过程中，室室中提供的干细胞生态位使基底祖细胞的增殖和自我更新增加，这可能是人类新皮层扩张的基础。然而，在发育中的新皮层中形成SVZ干细胞生态位的成分尚未完全了解。在这篇综述中，我们将讨论SVZ干细胞生态位的潜在组成部分，即细胞外基质组成和脑脉管系统，以及它们在胎儿新皮质发育过程中建立和维持这种利基市场中可能的关键作用。我们还将强调基底祖细胞形态在保持SVZ干细胞壁中的增殖能力方面的潜在作用。最后，我们将专注于使用脑器官对i）了解基底祖细胞的独特特征，尤其是基础radial胶质的； ii）SVZ干细胞生态位的研究成分； iii）提供了有关如何改善脑器官（尤其是器官SVZ）的未来方向，并使其更可靠的人类新皮层发育和进化研究模型。