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BrainBeats：一个开源EEGLAB插件，用于共同分析脑血和心血管（ECG/PPG）信号
。cc-by-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2023年12月5日。 https://doi.org/10.1101/2023.09.25.559321 doi：Biorxiv Preprint
地热游戏球道分析，第2部分：GIS方法论
指定癌细胞态和对治疗反应的机制尚不完全理解。在这里，我们显示的表观遗传重编程塑造了Schwannomas的细胞景观，Schwannomas是外周神经系统最常见的肿瘤。我们发现的schwannomas由2个摩尔组组成，这些基团由神经rest或神经损伤途径的激活区别，这些神经损伤或神经损伤途径指定肿瘤细胞状态以及肿瘤免疫微环境的结构。此外，我们发现放射疗法是通过表观遗传学和代谢重编程的神经chwannomas与免疫增强的schwan- Nomas相互转化的舒适性。为定义造型群群的定义机制，我们开发了一种同时询问染色质访问性和基因表达的技术，以及在单核中的遗传和治疗性扰动。我们的结果阐明了一个理解肿瘤进化的表观遗传驱动因素的框架，并建立了对癌细胞的表观遗传和代谢重编程的范式，该癌细胞构成了免疫微环境对放射疗法的反应。
推进集成人工智能的并行编程，提高效率和自动化程度
摘要。本文深入探讨了人工智能 (AI) 在并行编程中的蓬勃发展，强调了其改变计算效率和开发人员体验格局的潜力。我们首先探讨了并行编程在现代计算中的基本作用及其带来的固有挑战，例如任务分配、同步和内存管理。人工智能的出现，尤其是在机器学习和深度学习中，为这些挑战提供了新颖的解决方案。我们讨论了人工智能在自动创建并行程序中的应用，重点是自动代码生成、自适应资源管理和增强开发人员体验。本文研究了特定的人工智能方法——遗传算法、强化学习和神经网络——及其在优化并行编程各个方面中的应用。此外，我们深入探讨了将这些人工智能方法结合起来以产生协同效应的前景，强调了提高效率和准确性的潜力。我们还强调了将人工智能技术与现有开发工具相结合的重要性，旨在将人工智能的好处带给更广泛的开发人员。本文最后展望了未来的研究方向，包括开发适应并行编程中不同任务和环境的自适应 AI 模型。这些进步有望使并行编程更加强大、更易于访问和更高效，为计算能力和创新的新时代铺平道路。
揭示帕金森病中神经自适应深部脑刺激编程的复杂性
在过去的三十年中，帕金森病 (PD) 的深部脑刺激 (DBS) 一直以连续开环方式应用，对特定患者一天内的状态或症状变化没有反应。最近神经刺激器技术的进步使得闭环自适应 DBS (aDBS) 成为 PD 的治疗选择，在不久的将来，刺激将以基于需求的方式进行调整。虽然 aDBS 在治疗运动症状方面具有巨大的临床潜力，但它也带来了更好地了解如何实施它以最大限度地发挥其益处的需求。从这个角度来看，我们根据对几种支持 aDBS 的研究神经刺激器的经验，概述了为 aDBS 编程几个关键参数的注意事项。从本质上讲，aDBS 取决于成功识别相关生物标志物，这些标志物可以实时可靠地测量，并与控制刺激适应的控制策略相结合。然而，诸如刺激允许适应的窗口以及刺激改变的速率等辅助参数对性能的影响同样巨大，并且会根据控制策略和患者而变化。标准化的 aDBS 编程协议对于确保其在临床实践中的有效应用至关重要。
生酮饮食可减轻 SARS-CoV-2 引起的系统性重编程和炎症
生酮饮食 (KD) 已在众多临床研究和动物疾病模型中证明具有调节免疫反应和促进全身抗炎状态的益处。我们在此研究了生酮饮食对 SARS-CoV-2 感染后小鼠全身毒性的影响。我们的数据表明，在生酮饮食下，SARS-CoV-2 可减少体重减轻，并提高动物的整体存活率。多器官转录重编程和代谢重组的减弱表明生酮饮食可启动和减轻病毒引起的全身变化。我们观察到心脏中金属蛋白酶减少，炎症稳态蛋白转录增加，血清促炎症细胞因子（即 TNF- α、IL-15、IL-22、G-CSF、M-CSF、MCP-1）、炎症代谢标志物（即犬尿氨酸/色氨酸比率）和炎症前列腺素降低，表明 KD 感染动物的全身炎症减少。综上所述，这些数据表明 KD 可以改变 SARS-CoV-2 感染后动物的转录和代谢反应，改善小鼠健康状况，减少炎症，恢复氨基酸、核苷酸、脂质和能量货币代谢。
扩展新皮层并通过体内瞬态重编程
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年11月27日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.11.27.568858 doi：Biorxiv Preprint
使用生成人工智能工具 Copilot 作为基于 Excel 的健康经济模型中的 VBA 编程助手
在发表了许多赞美诗[3]之后，我们希望：1）测试卫生经济学家如何在 MS-Excel / Visual Basic for Applications (VBA) 中利用 Copilot 开发成本效益模型；2）提请大家关注在卫生经济学编程中使用 AI 的一些非编程问题。
远程编程对帕金森病深部脑刺激的影响：一项回顾性研究
两组患者的编程疗程次数没有显著差异，但 RP 组中有 3 名患者的 RP 疗程（21、16、42 次；轻微异常值）远高于平均次数（中位数：5.5 [IQR：3.5–18.5]）。这可能是由于他们主观认为症状控制不佳，尽管他们的 U3 改善率并不差于平均水平（31%、64%、45%）。RP 提供的就医便利可能会增加编程请求。Zhang 等 [14] 报告称，在 COVID-19 的封锁措施之后，编程疗程数量有所增加，在 909 次未进行 DBS 调整的 RP 疗程中，52 次报告大多令人满意，这表明随着患者逐渐恢复，对 RP 的需求将会增加
自动编程，符号计算，机器学习：我的个人观点
摘要在本说明中，我对三个领域的自动编程，符号计算和机器学习的相互作用介绍了我的个人观点。编程是为给定问题找到（希望）正确的程序（算法）的活动。编程在所有领域都是自动化的核心，被认为是最具创造力的人类活动之一。但是，在编程历史上已经很早就开始“跳到编程的元级别”，即开始开发自动化或半自动化的程序，即编程过程。该区域具有各种名称，例如“自动编程”，“自动化算法合成”等。开发编译器可以被认为是自动编程中问题的早期示例。自动推理者证明针对规范的程序的正确性是自动编程中主题的一个高级示例。自然语言中问题规范中生产（令人惊讶的好）程序是自动编程的最新示例。随着技术成熟程度的提高，编程倾向于成为最重要的活动。因此，自动化编程可能是ThemostExcitingandRelevantTechnologiceEndeAvortoDay.italsowillhaveenormousact在软件行业的全球就业市场上。大致看到自动编程的两种主要方法：
高效的Cas9介导的转录编程
Cas9 是一种 RNA 引导的核酸内切酶，通过相关引导 RNA (gRNA) 与其靶基因座之间的互补性将其引导至特定 DNA 序列 1,2 。Cas9 可以通过 gRNA 引导至几乎任何任意序列，只需要靠近靶标的短原型间隔区相邻基序 (PAM) 位点 3–5 。通过突变分析，已经生成了缺乏核酸内切酶活性但仍保留与 DNA 相互作用能力的 Cas9 变体 2,6,7 。这些核酸酶无效 (dCas9) 变体随后被用效应结构域（例如转录激活结构域 (AD)）功能化，使 Cas9 能够用作转录水平细胞编程的工具 6,8–10 。在天然染色体环境下对特定靶标进行强有力的表达诱导编程的能力将为无数应用提供变革工具，包括开发治疗干预、基因筛选、激活内源性和合成基因回路、以及诱导细胞分化 11-13 。