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由于有机物(OM)源(1000 - 4000 m深度)的稀缺性,原核生物代谢被认为集中在源自表面的颗粒上。然而,活跃的巴旋原核生物群落的结构及其在环境梯度之间的变化如何仍未开发。结合16S rRNA基因和转录本测序,宏基因组学和底物摄取潜在测量值,我们旨在探讨水质量的衰老和OM影响的质量如何影响活性微生物组的结构,以及对社区功能的潜在影响。我们发现,在富含顽固性OM的较老的水质量中,分类群具有自由生活的生活方式对活性微生物组的相对贡献,这表明这些原核生物也可能在海洋广阔地区的沐浴型代谢中发挥作用。表现出较低的潜在代谢率,并且具有有限数量的两分量感觉系统,这表明它们具有较小的感知能力和对环境提示的反应。相比之下,与颗粒相关的原核生物携带的基因用于颗粒定植和碳水化合物利用,这些基因在具有自由生活的生活方式的原核生物中没有。一致地,我们观察到,与较高比例不稳定OM的水域相比,居住在较旧水域的原核生性群落显示出降低的颗粒能力,并具有更高的使用复杂碳源的能力。我们的结果提供了涉足贝类活性原核微生物组区域化的证据,并根据OM的质量揭示了细分市场分配。
由于有机物(OM)源(1000 - 4000 m深度)的稀缺性,原核生物代谢被认为集中在源自表面的颗粒上。然而,活跃的巴旋原核生物群落的结构及其在环境梯度之间的变化如何仍未开发。结合16S rRNA基因和转录本测序,宏基因组学和底物摄取潜在测量值,我们旨在探讨水质量的衰老和OM影响的质量如何影响活性微生物组的结构,以及对社区功能的潜在影响。我们发现,在富含顽固性OM的较老的水质量中,分类群具有自由生活的生活方式对活性微生物组的相对贡献,这表明这些原核生物也可能在海洋广阔地区的沐浴型代谢中发挥作用。表现出较低的潜在代谢率,并且具有有限数量的两分量感觉系统,这表明它们具有较小的感知能力和对环境提示的反应。相比之下,与颗粒相关的原核生物携带的基因用于颗粒定植和碳水化合物利用,这些基因在具有自由生活的生活方式的原核生物中没有。一致地,我们观察到,与较高比例不稳定OM的水域相比,居住在较旧水域的原核生性群落显示出降低的颗粒能力,并具有更高的使用复杂碳源的能力。我们的结果提供了涉足贝类活性原核微生物组区域化的证据,并根据OM的质量揭示了细分市场分配。
生物信息学简介,了解数据类型的生活中心教条,信息技术简介,不同的主要和次要序列数据库的简介。Data mining in different sequence databases, Introduction to DNA and protein alignment, types of alignment and their usage, Local alignment and its programs, Primer designing, Restriction mapping, gene finding in prokaryotes and eukaryotes, Data retrieval from Biological literature databases, 3D structure database, how to analyze 3D structure of protein in software, Multiple sequence alignment and phylogenetic tree development,在测序中分析包装文件。
1。描述了基因化学的历史。2。原核生物和真核生物中的基因结构对比。3。展示了DNA复制的机理和酶学(解旋酶,原始酶,DNA聚合酶,DNA连接酶)。4。对比原核生物和真核生物中的DNA复制。5。定义RNA的结构并赋予RNA亚型的功能。6。研究分子生物学的中心教条。7。解释转录过程。8。解释了细胞核中转录后修饰的过程。9。解释转录的控制,包括操纵子模型。10。解释翻译的机制并提供了启动,伸长和终止的细节。能力3:学生将通过:
1。原核生物和真核细胞的结构和功能的一般特征。2。催化和生物合成。细胞代谢中的分解代谢和合成代谢途径。能量代谢。ATP。 光合作用。 3。 DNA的结构和功能。 染色体DNA及其包装。 染色体的全球结构。 4。 人类基因组。 基因组测序项目。 种群遗传学。 5。 表观遗传学。 表观遗传调节的机制。 6。 原核生物和真核生物中的DNA复制。 DNA聚合酶。 7。 原核生物和真核生物中的转录。 原核生物和真核RNA聚合酶的类型。 转录因子。 8。 真核生物中的RNA处理。 剪接,替代剪接。 变形,自剪接的内含子。 9。 原核生物和真核生物中的翻译。 核糖体。 翻译因素。 折叠和伴侣。 蛋白质的翻译后修饰。 10。 真核细胞周期。 有丝分裂和减数分裂。 11。 细胞膜。 膜的组成。 膜蛋白。 膜运输原理。 载体蛋白和主动膜转运。 离子通道。 12。 分子技术。 聚合酶链反应。 基因组编辑。ATP。光合作用。3。DNA的结构和功能。染色体DNA及其包装。染色体的全球结构。4。人类基因组。基因组测序项目。种群遗传学。5。表观遗传学。表观遗传调节的机制。6。原核生物和真核生物中的DNA复制。DNA聚合酶。7。原核生物和真核生物中的转录。原核生物和真核RNA聚合酶的类型。转录因子。8。真核生物中的RNA处理。剪接,替代剪接。变形,自剪接的内含子。9。原核生物和真核生物中的翻译。核糖体。翻译因素。折叠和伴侣。蛋白质的翻译后修饰。10。真核细胞周期。有丝分裂和减数分裂。11。细胞膜。 膜的组成。 膜蛋白。 膜运输原理。 载体蛋白和主动膜转运。 离子通道。 12。 分子技术。 聚合酶链反应。 基因组编辑。细胞膜。膜的组成。膜蛋白。膜运输原理。载体蛋白和主动膜转运。离子通道。12。分子技术。聚合酶链反应。基因组编辑。限制酶。13。细胞信号的一般原理。主信号通路和分子。14。免疫系统:先天和适应性。器官和免疫系统的细胞。抗体。疫苗。15。DNA修复。单元格周期检查点。程序性细胞死亡(凋亡)。
该课程安排在主要/次要微生物生物技术中,并基于课程一般微生物学(第二学士学位)和一般微生物学提供的基础:原核生物,真菌和酵母菌的多样性。学科的“分子微生物生态学”源于微生物生态学中分子生物技术的逐步引入。本课程的起点是对各种自然生态系统中微生物生物多样性的分子探索。对于特定的微生物群或亚群,将讨论多样性,代谢功能和人口水平的跨互相关之间的关系。本课程的目的是使学生熟悉细胞和人群水平上天然生态系统的微生物多样性,并证明这种多样性与功能之间的植物,植物,植物,植物,植物,水生生态系统的多样性之间的联系。原核生物将是主要重点。
2023 Ex officio member of the Executive Board of The Committee on the Systematics of Prokaryotes Described from Sequence Data (SeqCode) 2023 Chair of the Registry and Nomenclature Working Group of the SeqCode 2022 Board of Experts from the Austrian Microbiome Initiative (AIMICI) 2022 Member of the SeqCode Steering Committee 2017 Best PhD Thesis Sigma Xi Award, Georgia Institute of Technology, USA 2016 ISME Travel Award, ISME 16, International Society for Microbial Ecology 2015 School of Biology Graduate Excellence Award, Georgia Institute of Technology, USA 2010 Fellowship granted by the Languedoc Region to outstanding international students, France 2009 Scientific Mission to the Institute of Research for Development (IRD), Evaluation- Orientation of Scientific Cooperation (ECOS) program, France 2004 Department of Biology “ Matrícula de Honor ”哥伦比亚国立大学,哥伦比亚奖