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铜绿假单胞菌噬菌体抗性菌株中防御系统的积累
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者（此版本于 2023 年 6 月 2 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.08.12.503731 doi：bioRxiv 预印本
铜绿假单胞菌激活凝集素靶向前药，实现自毁性抗生素释放
摘要：慢性铜绿假单胞菌感染的特征是生物膜形成，这是铜绿假单胞菌的主要毒力因子，也是广泛耐药性的原因。氟喹诺酮类药物是有效的抗生素，但与严重的副作用有关。两种细胞外铜绿假单胞菌特异性凝集素 LecA 和 LecB 是关键的结构生物膜成分，可用于靶向药物输送。在这项研究中，几种氟喹诺酮类药物通过可裂解的肽接头与凝集素探针结合，产生凝集素靶向前药。从机制上讲，这些结合物因此在全身分布中保持无毒，并且只有在感染部位积聚后才会被激活以杀死细菌。合成的前药在宿主血浆和肝脏代谢存在下被证明是稳定的，但在体外，在铜绿假单胞菌存在下，会以自毁方式迅速释放抗生素货物。此外，该前药在体外表现出良好的吸收、分布、代谢和消除（ADME）特性和降低的毒性，从而建立了第一个针对铜绿假单胞菌的凝集素靶向抗生素前药。■ 介绍
土壤结构对荧光荧光在微观>的土壤中蔓延的影响
土壤微生物与土壤中发生的许多过程密切相关，包括向植物供应养分，通过生长激素的产生来刺激植物的生长，控制植物病原体的活性，维持土壤结构的活性，并促进无机污染物的浸出和矿物质污染物的矿物质（beave and in。 2000; Hayat，Ali，Amara，Khalid和Ahmed，2010年；这些微生物社区具有巨大的新陈代谢和生理性质，这使它们能够在土壤环境中生活，适应和扩散，这些土壤环境也表现出极高的结构和化学异性恋（Madigan，Clark，Clark，Stahl，Stahl，＆Martinko，2010年）。尽管在肥沃的土壤中细菌丰度较高，但细菌仅占土壤表面的一小部分（Young，Crawford，Nunan，Otten，Otten和Spiers，2008年）。在土壤中，微生物倾向于聚集（Ekschmitt，Liu，Vetter，Fox和Wolters，2005年），在非常小的土壤中形成微生物热点（<1 cm 3）。在评论中，Kuzyakov和Blagodatskaya（2015）认为，大多数生物地球化学过程都在这些热点中进行。这种热点本质上是短暂的，并且来自物理，化学和微生物过程之间的复杂相互作用。这种活动热点的例子包括根际，碎屑和土壤骨料表面。微生物活性的热点不存在。上述过程需要各种条件的托管。在这些热点示例中，根际是最动态的，热点持续日子，而与土壤结构相关的热点可以更持久，并且可以持续几个月。土壤孔在形成诸如土壤结构之类的热点的形成中起着重要作用，形成了相互联系的网络，通过该网络，包括氧的扩散，酶的运输以及分离的有机物，细菌的迁移率和细菌之间的相互作用。许多研究人员在微生物量表上观察到细菌分布中的空间模式（Kizungu等，2001; Nunan，Wu，Young，Crawford，＆Ritz，2003;VieubléGonod，Chadoeuf，Chadoeuf和Chenu，＆Chenu，2006年）。，例如VieubléGonod等。（2006）观察到土壤中2,4-D（2,4二氯苯氧基酸）的矿化的异质模式，从田间到微栖息地量表时的可变性增加。
一种基于 SEVA、CRISPR-Cas3 辅助的假单胞菌基因组工程方法，可实现载体高效消除
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据 提供（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2023 年 6 月 29 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.06.29.547033 doi：bioRxiv 预印本
乙酯：在多药耐药性假单胞菌中，MEXAB-OPRM外排泵有效的抑制剂
铜绿假单胞菌中的耐药性已通过多种机制介导，它们中排出泵介导的耐药性是耐药性最重要的机制之一。MEXAB-OPRM外排泵，能够识别和排出细菌细胞中各种结构无关的化合物，赋予对铜绿假单胞菌中广泛的抗生素的抗性。本研究的目的是筛选在印度传统医学中使用的药物，以发现一些能够抑制铜绿假单胞菌中的Mexab-Oprm泵的有效化合物，并研究具有抗抗性抗生素的特征性外排泵抑制剂的协同作用（MDR）抗生素（MDR）抗生素（MDR）菌株。在本研究中使用了100个临床分离株，四个敲除和1个MTCC-741标准菌株。所有100个临床分离株均已处理用于抗生素易感性测定法和ETBR琼脂卡特轮测定法以测定MDR表型。总共筛选了40种植物，以存在具有外排泵抑制活性的化合物。用三种不同的抗生素进一步探索了表现出EPI活性的植物的协同作用。十种植物提取物已显示出相当大的EPI活性，并且在10个活性提取物中，只有一种末期佳肴果实的甲醇提取物显示出与A组（环丙沙星，四环素和氯霉素）的协同活性。T. chebula果实提取物的分馏和纯化提供了乙酸乙酯，该乙酸酯与A组抗生素以及显着的EPI活性一起显示了协同活性。本研究的结果得出的结论是，乙酸酯是铜绿假单胞菌中过度表达Mexab-Oprm外排泵的有效EPI，可以与耐药组A抗生素一起使用，以抗多药抗性P. eruginosa。
通过热诱导 ssDNA 重组技术对假单胞菌进行高效多位点基因组编辑
单链 DNA 重组工程在肠道细菌以外物种的基因组编辑中的应用受到重组酶效率和内源性错配修复 (MMR) 系统作用的限制。在这项工作中，我们建立了一个遗传系统，用于在生物技术相关菌株 EM42 的染色体中输入多种变化。为此，设计了 PL / c I857 系统的控制下，rec2 重组酶和 P. putida 的等位基因 mutL E36K PP 的高水平热诱导共转录。短时间热转移循环，然后用一套诱变寡核苷酸进行转化，可产生不同类型的基因组变化，每次修饰的频率高达 10%。相同的方法有助于超级多样化短染色体部分，以创建功能性基因组片段文库——例如核糖体结合位点。这些结果使得假单胞菌基因组工程的多重化成为可能，这是这种重要合成生物学底盘代谢重编程所必需的。
假单胞菌假单胞菌CECT 5344
摘要氰化物降解细菌假单胞菌伪钙化素cect 5344使用氰化物和不同的金属 - 氰化物配合物作为唯一的氮源。在氰基疾病的条件下，该菌株能够随着高达100 m m的汞生长，该菌株被细胞内积累。通过液态色谱分析进行定量蛋白质组学分析（LC-MS/MS）已应用于氰化物和汞菌株菌株的排毒5344的氧化氧化物替代氧化氧化剂的相关性，并突出氧化剂替代氧化剂的相关性，以阐明氰化物和汞对分子的分子体。和氰化物的同化，独立于存在或不存在汞。蛋白质在存在氰化物和汞存在下过度占主张的蛋白质包括汞转运蛋白，汞还原酶MERA，转录调节剂Merd，砷酸盐再培养酶和砷耐药蛋白和砷氧化物蛋白，硫氧还蛋白还原酶还原酶，谷胱甘肽s-转移蛋白与硫酸硫酸硫酸盐的硫酸盐和硫酸硫酸盐和硫酸硫酸盐和硫酸盐的硫酸盐和硫酸盐含量。和磷酸盐饥饿诱导的蛋白质phOH等。一项转换研究表明，从菌株CECT 5344基因组中存在的六个推定的MERR基因中，可能与汞耐药性/排毒抗性有关，只有MERR2基因在Cyanotrophic Condi-Condi-Coni-Coni-Condi-Coni-Coni-Condi-Conti-Diens下才有明显的诱导。A bioinformatic analysis allowed the identi fi cation of putative MerR2 binding sites in the promoter regions of the regulatory genes merR5 , merR6 , arsR , and phoR , and also upstream from the structural genes encoding glutathione S -transferase ( fosA and yghU ), dithiol oxidoreductase ( dsbA ), metal resistance chaperone ( cpxP ），以及参与法规传感（Vird）等的氨基酸/肽挤出机。
新型假单胞菌产物在体外刺激气道上皮细胞中的白介素-8
由于在囊性纤维化患者的痰中发现了高浓度的IL-8，因此我们假设铜绿假单胞菌（PA）诱导呼吸道上层细胞和单核细胞中IL-8的产生。因此，我们与人类转化的支气管上皮细胞（16-HBE）或单核细胞一起孵育了PA培养物的植物。已与PA超代孵育6小时的16-HBE细胞的培养物具有趋化活性，该抗体受到对人IL-8的抗体的抑制。PA上清液诱导原代支气管上皮细胞，16-HBE细胞和单核细胞产生IL-8。与PA上清液孵育后，16-HBE细胞显示IL-8基因表达水平显着升高。负责IL-8生产的PA产品抵抗冻结，沸腾和蛋白水解。该产品不可提取脂质，并且存在于1 kD滤液中。我们得出的结论是，PA的小分子质量产物刺激了16-HBE细胞和单核细胞的IL-8产生，并且在Expo-DA后16-HBE产生的趋化活性主要归因于IL-8。（J.Clin。投资。1994。93：26-32。）关键词：上皮 - 细胞因子表达 - 囊性纤维化 *内毒素 *趋化性
参考：DSHB3010技术数据表产品：Cetrimide琼脂（假单胞菌选择性琼脂）
*根据需要进行调整和 /或补充，以满足性能标准方向，将45.3 g粉末悬浮在1升蒸馏水中，并加入10毫升甘油。将其烧开并分配到合适的容器中。在121°C的高压釜中灭菌15分钟。描述锡酰胺琼脂是基于铜绿假单胞菌菌株对季铵化合物（QAC）的耐药性。用肉基三乙基氨基氨溴化物A以1G/L的浓度为1g，但非常贫穷和缓慢。0,2-0,3 g/L的抑制剂浓度似乎不会影响化脓性物种的生存能力。，但它确实抑制了伴随的细菌，包括革兰氏阳性和革兰氏阴性生物。可能在抑制浓度较低的抑制浓度下形成的其他假单胞菌也受到抑制。在30-35°C下孵育18-72小时，PS存在着重要的优势。铜绿可对任何其他抗性微生物都显着，建议在42°C下进行第一个隔离，在48小时时延长孵育，因为在这些情况下，抑制其他微生物几乎是总的。技术根据当前的国家或国际标准，已建立和测试的协议或根据每个实验室建立和接受的程序进行。质量控制
硝基化动力学的失调促进硝化应力，并有助于心脏代谢心力衰竭，并保留的射血分数
1。乌干达西部坎帕拉国际大学生物医学科学学院微生物学系2.生物化学系生物医学科学系，坎帕拉国际大学，西部校园乌干达3.乌干达西部校园坎帕拉国际大学盟军健康科学学院医学实验室科学系4。乌干达西部校园坎帕拉国际大学生物医学科学学院解剖学系5。生理学系，生物医学科学学院，坎帕拉国际大学，西部校园，乌干达6。坎帕拉国际大学出版与扩展系，P。O。Box 20000，乌干达。 7。 坎帕拉国际大学出版与扩展系，P。O。 Box 71 Western校园，乌干达Box 20000，乌干达。7。坎帕拉国际大学出版与扩展系，P。O。Box 71 Western校园，乌干达Box 71 Western校园，乌干达