酸伏烷温度PE1 1---- 1 1 Povolo等,2012 Acinetobacter sp。 div>BT1 1 - - - - 1 Povolo et al., 2012 Fogravidus DSM 545 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 Povolo et al., 2013 Pseudomonas Hydrogenovora DSM 1749 1 - - - - 1 1 Samori et al., 2014 Pseudomonas Oleovorans DSM 1045 1 1 1 Favaro等,2019c div>BT1 1 - - - - 1 Povolo et al., 2012 Fogravidus DSM 545 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 Povolo et al., 2013 Pseudomonas Hydrogenovora DSM 1749 1 - - - - 1 1 Samori et al., 2014 Pseudomonas Oleovorans DSM 1045 1 1 1 Favaro等,2019c div>
1. 简介 生物炭是一种由生物废弃物在低氧或无氧条件下通过热解制成的生物产品(Lehmann 等人,2011 年)。生物炭对土壤和植物健康有多种有利影响,如提高土壤有机质含量(Chan 等人,2007 年)、土壤酶活性(Ma 等人,2019a、2019b)、土壤阳离子交换和持水能力(Novak 等人,2009 年;Yu 等人,2013 年;Kul,2022 年)、微生物多样性(Egamberdieva 等人,2016 年;Egamberdieva 等人,2020a、2020b)和植物养分获取(Cao 等人,2017 年)。有许多关于生物炭施用对植物生长、土壤肥力、植物保护和植物抗逆性的积极影响的报道(Frenkel 等人,2017 年;Postma 和 Nijhuis,2019 年)。这种积极影响可以通过土壤物理质量的提高、土壤保水能力、养分利用率以及参与养分循环的微生物多样性来解释(Kolton 等人,2011 年;Egamberdieva 等人,2017 年;Khan 等人,2021 年)。一些报告显示更高的微生物活性
假霉菌科的分类法最近发生了变化,导致描绘了三个新属(Atopomonas,halopseudomonas和stutzerimonas)。然而,假单胞菌属仍然是人口最密集的人群,并显示出广泛的遗传多样性。假单胞菌能够产生多种二级代谢产物,这些代谢产生了重要的生态功能,并在维持其生活方式方面产生了很大的影响。虽然经常检查土壤源性假单胞菌,但我们目前缺乏旨在探索海洋假单胞菌属的遗传多样性和代谢潜力的研究。在这项研究中,与来自三种海洋微藻培养物和RPOD的基于RPOD的系统发育的纤维菌株共隔离了23个假单胞菌菌株,可以将其分配给Pseudomonas oleovorans group(Pseudomonas chengduensis,pseudomonas chengduensis,pseudomonas toyotomonas totootomionensis and onse new sews)。我们将三个选定菌株的整个基因组测序与海洋假单胞菌基因组的清单相结合,以评估其系统发育分配并探索其代谢潜力。我们的结果表明,大多数菌株在物种水平上分配了错误,其中一半不属于假单胞菌属,而是属于卤素类或斯塔特氏菌属。我们强调了26种新物种(卤素瘤(n = 5),stutzerimonas(n = 7)和假单胞菌(n = 14))的存在,并描述了一个新物种,假单胞菌Chaetocerotis sp。nov。 (类型应变536 T = LMG 31766 T = DSM 111343 T)。最后,这项研究强调,海洋环境拥有大量的假核科,可以推动新的二级代谢产物的发现。We used genome mining to identify numerous BGCs coding for the production of diverse known metabolites (i.e., osmoprotectants, photoprotectants, quorum sensing molecules, siderophores, cyclic lipopeptides) but also unknown metabolites (e.g., ARE, hybrid ARE-DAR, siderophores, orphan NRPS gene clusters) awaiting chemical characterization.
Acinetobacter, Aeromonas, Bordetella, Brucella , Campylobacter, Eikenella, Francisella, Haemophilus, Helicobacter, Legionella, Pasteurella, Plesiomonas, Pseudomonas, Burkholderia, Stenotrophomonas, Chryseobacterium, Vibrio, HACEK, Bartonella, capnocytophaga)
药理学行业正在不断生产大量新型抗生素。同时,在过去几十年中,对药物的耐药性升高(Nascimento等,2000)。基因交换可能通过不同的机制(例如换位)发生在细菌中,当抗性基因与编码基因的酶是gird时发生的那样(Stockert和Mahfouz,2012)。公共卫生在世界范围内受到微生物对抗生素的抗药性的威胁,因为它降低了药物效应,并随后增加了发病率,死亡率和治疗成本(Abd El-Kalek和Mohamed,2012年)。为了克服这一障碍,许多研究表明了植物提供抑制细菌种类的有效方法。例如,对细菌菌株进行了测试,对细菌菌株进行了测试, ,对金黄色葡萄球菌和铜绿假单胞菌进行了高抑制作用(Al-Zahrani等,2016; Mohammed等,2016)。 此外,torilis Anthriscus提取物的抗细菌特性的重要性是对静脉注射的Podagraria,Pseudomonas glycinea,Heracleum sphondyilium,daucus carota,对金黄色葡萄球菌和铜绿假单胞菌进行了高抑制作用(Al-Zahrani等,2016; Mohammed等,2016)。 此外,torilis Anthriscus提取物的抗细菌特性的重要性是对静脉注射的Podagraria,Pseudomonas glycinea,Heracleum sphondyilium,daucus carota,对金黄色葡萄球菌和铜绿假单胞菌进行了高抑制作用(Al-Zahrani等,2016; Mohammed等,2016)。此外,torilis Anthriscus提取物的抗细菌特性的重要性是对静脉注射的Podagraria,Pseudomonas glycinea,Heracleum sphondyilium,daucus carota
引用出版的版本:Shepherd,MJ,Horton,JS&Taylor,TB 2022,'Pseudomonas荧光症中的近确定性突变热点是由多个相互作用的基因组特征构成的”,《分子生物学和进化》,第1卷。39,否。6,MSAC132。https://doi.org/10.1093/molbev/msac132https://doi.org/10.1093/molbev/msac132
fi g u r e 2在O. Moubata微生物群落中的假单胞菌的组装模式。假单胞菌的局部连接在:(a)OMMG和(b)OMSG中。模块内和模块之间的连接,四个组的Zi-pi图:(c)OMMG和(d)OMSG。在存在下以及假单胞菌在O. Moubata Mg中的伪莫诺纳斯(Pseudomonas)删除后的子网络:(e)OMMG WP和(f)OMMG WOP。(g)Venn图显示了O. Moubata -mg(M1 -M2)中模块组成的比较。(h)可以用于OMMG(WP-WOP)。在存在下以及假单胞菌在O. Moubata -sg中删除的M1和M2的子网络:(i)OMSG WP和(J)OMSG WOP。(k)Venn图显示了O. Moubata -SG(M1 -M2)中模块组成的比较。(L)对于OMSG(WP-WOP)。在子网络中,节点代表细菌分类单元,边缘中的颜色代表强(蓝色)或负(红色)相关性(SPARCC> 0.75或<-0.75)。
cetrimide琼脂碱预期使用cetrimide琼脂碱是一种用于从PU,痰,痰,排水口选择性分离铜绿假单胞菌的培养基。摘要铜绿假单胞菌在所有正常的实验室培养基上都可以很好地生长,但是从环境部位或人,动物或植物来源的特定隔离生物可以在培养基上进行,该培养基含有选择性剂,还包括一种成分,以增强色素的产生。最有选择性的培养基取决于该物种对各种抗菌剂的固有抗性。cetrimide抑制了许多微生物的生长,同时允许铜绿假单胞菌发展出典型的菌落。cetrimide是一种季铵盐,它充当阳离子清洁剂,可在接触点减少表面张力,并具有沉淀剂,络合和变性对细菌膜蛋白的作用。它对包括铜绿假单胞菌以外的假单胞菌物种在内的多种微生物表现出抑制作用。King等人开发了培养基,用于增强假单胞菌的增生性氨基蛋白蛋白的产生。cetrimide琼脂是对技术琼脂(中A)的修饰,添加了0.1%cetrimide用于选择性分离铜绿假单胞菌。后来,由于高度纯化的锡酰胺的可用性,其在培养基中的浓度降低了。在37°C进行18-24小时的孵育。铜绿假单胞菌是唯一已知是排泄pyocyanin的假单胞菌或革兰氏阴性棒的物种。因此,这些介质对于鉴定铜绿假单胞菌很重要。铜绿假单胞菌的特征性产生是蓝色,水溶性的,非荧光苯丙胺色素与其殖民形态和氨基乙烯酮的特征性葡萄气味相关的。这些培养基用于检查铜绿假单胞菌的化妆品和临床标本,以及评估消毒剂对该生物体的疗效。原理c甲酰亚胺(氯咪铵溴化铵)是季铵化合物,阳离子洗涤剂,对包括铜绿假单胞菌以外的假单胞菌种类的多种细菌抑制。它会导致氮和磷从铜绿假单胞菌以外的细菌细胞释放。培养基中氯化镁和硫酸钾刺激了焦酸的产生。明胶的胰腺摘要提供氮化合物。配方 *成分g/l明胶20.0硫酸钾10.0氯化钾1.4 cetrimide 1.4 cetrimide 0.3琼脂13.6最终pH(在25°C下)7.2±0.2 *调整为适合性能的储存和稳定性储存量低于30°°C,并准备好了,在隔离的中等范围内,在紧密的中等范围内,并准备好了2°C,并准备好了2°C,并准备了2°C and coive n downed n Medued n deard earder in n deard n Medud artere°C和2 2°C。避免冷冻和过热。在标签上到期日之前使用。打开后,保持粉末状培养基闭合以避免补水。样品的类型临床样品 - 血液,尿液,脓液,痰液;水样品采集和处理样品可确保所有样品都正确标记。按照确定的准则遵循适当的技术来处理样品。某些样品可能需要特殊处理,例如立即制冷或免受光的保护,遵循标准程序。样品必须在允许的持续时间内存储和测试。
结果:鉴定了24个革兰氏阳性分离株,其中10(F1-F10)在模拟胃肠道液中显示出可靠的生存能力。这10种菌株对CACO-2细胞表现出极好的粘附力和强大的自动凝集特性。他们还具有拮抗和聚集病原体的能力(金黄色葡萄球菌ATCC 25923,Salmonella braenderup H9812,Escherichia coli ATCC 25922和Pseudomonas pseudomonas pao1)和Aeruginosa pao1),erauginosa pao1),所有菌株均可依靠2 o 2 o 2 o 2 o 2 o 2 o的能力。清除1,1-二苯基-2-苯羟基(DPPH)自由基,表明一定水平的抗氧化活性。安全性测试没有溶血活性,除了F6以外,所有其他人对抗生素均高度敏感,对16种抗生素的敏感性超过62.5%。非常明显地,F4(Reuteri乳酸杆菌)和F10(Brevis乳杆菌)在模拟的胃肠道中表现出异常的生存力,并与强大的生长潜力相结合,增强的粘附效率,显着的抗体和抗氧化特性。