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假霉菌科的分类法最近发生了变化，导致描绘了三个新属（Atopomonas，halopseudomonas和stutzerimonas）。然而，假单胞菌属仍然是人口最密集的人群，并显示出广泛的遗传多样性。假单胞菌能够产生多种二级代谢产物，这些代谢产生了重要的生态功能，并在维持其生活方式方面产生了很大的影响。虽然经常检查土壤源性假单胞菌，但我们目前缺乏旨在探索海洋假单胞菌属的遗传多样性和代谢潜力的研究。在这项研究中，与来自三种海洋微藻培养物和RPOD的基于RPOD的系统发育的纤维菌株共隔离了23个假单胞菌菌株，可以将其分配给Pseudomonas oleovorans group（Pseudomonas chengduensis，pseudomonas chengduensis，pseudomonas toyotomonas totootomionensis and onse new sews）。我们将三个选定菌株的整个基因组测序与海洋假单胞菌基因组的清单相结合，以评估其系统发育分配并探索其代谢潜力。我们的结果表明，大多数菌株在物种水平上分配了错误，其中一半不属于假单胞菌属，而是属于卤素类或斯塔特氏菌属。我们强调了26种新物种（卤素瘤（n = 5），stutzerimonas（n = 7）和假单胞菌（n = 14））的存在，并描述了一个新物种，假单胞菌Chaetocerotis sp。nov。 （类型应变536 T = LMG 31766 T = DSM 111343 T）。最后，这项研究强调，海洋环境拥有大量的假核科，可以推动新的二级代谢产物的发现。We used genome mining to identify numerous BGCs coding for the production of diverse known metabolites (i.e., osmoprotectants, photoprotectants, quorum sensing molecules, siderophores, cyclic lipopeptides) but also unknown metabolites (e.g., ARE, hybrid ARE-DAR, siderophores, orphan NRPS gene clusters) awaiting chemical characterization.
海洋假单胞科的基因组多样性和代谢潜力
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