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成功建立了基于病毒复制元素的衣原体叶绿体中的外源基因表达系统
此预印本版的版权持有人于2024年11月27日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.11.26.625556 doi：biorxiv Preprint
IDE161 是一种潜在的首创临床候选 PARG 抑制剂，选择性靶向具有复制压力和 DNA 修复脆弱性的实体肿瘤
A) 描绘了对 TOP1 和 PARG 双重抑制的拟议 MOA 的模型。B) 对 PRISM 化合物和 PARGi 的反应的 Spearman 相关图；橙色表示 TOP1 抑制剂，黑色表示其他。（插图）按 MOA 分组的顶级相关化合物的 Swarmplot（未显示少于 2 种化合物的 MOA）。拓扑异构酶抑制剂 (TOP)、法呢基转移酶 (FT)、微管蛋白聚合 (TP)、极光激酶 (AK)、胸苷酸合酶 (TS)。C) 使用 PAR MSD 测定法评估 PAR 链积累。值绘制为相对于 DMSO 对照的平均值 ± SD。使用 Student's t 检验进行统计分析；ns（不显著）、**（<0.01）、***（<0.001）。D）（左）使用基于抗 TOP1cc 抗体的免疫荧光测定法在指示时间点测量 TOP1-DNA 裂解复合物 (TOP1cc)。根据单个细胞中的 TOP1cc 平均强度值进行群体分箱和非线性曲线拟合。使用 Kruskal-Wallis 检验进行统计分析；****(<0.0001)。（右）使用基于抗 γ -H2AX 抗体的免疫荧光测定法检测核 γ -H2AX。值（平均值 ± SD）绘制为 γ -H2AX 平均强度范围的百分比群体。E）从 CldU 标记的 DNA 纤维测量结果显示，IDE161 和 CPT 介导的复制叉减慢。框表示中位数和 IQR。使用 Mann-Whitney U 检验进行统计分析；*(<0.05)，**** (<0.0001)。
CDK12损失驱动前列腺癌的进展，转录复制冲突和旁系同源性CDK13
Jean Ching-Yi Tien, 1,2 Jie Luo, 1,2,14 Yu Chang, 1,2,14 Yuping Zhang, 1,2,14 Yunhui Cheng, 1,2,14 Xiaoju Wang, 1,2 Jianzhang Yang, 3,4 Rahul Mannan, 1,2 Somnath Mahapatra, 1,2 Palak Shah, 1,2 Xiao-Ming Wang, 1,2 Abigail J. Todd, 1,2 Sanjana Eyunni, 1,2 Caleb Cheng, 1 Ryan J. Rebernick, 1,2 Lanbo Xiao, 1,2 Yi Bao, 1,2 James Neiswender, 5 Rachel Brough, 5 Stephen J. Pettitt, 5 Xuhong Cao, 1,2 Stephanie J.), arul@med.umich.edu (A.M.C.)https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2024.101758
练习DNA结构和复制答案键，不是火箭科学
与其他复合物分子一样，DNA由称为核苷酸的构件组成，它们将其链接在一起形成长链。每个链都包含一个确定其特征的特定核苷酸序列。DNA中核苷酸的序列携带并保留细胞内的遗传信息。现在，我们将研究DNA如何使用自己的序列来指导其合成以及RNA和蛋白质的创建，最终产生具有不同结构和功能的产品。在本节中，我们将探讨DNA的基本结构和功能。核酸的成分称为核苷酸。构成DNA的核苷酸被称为脱氧核糖核苷酸。每个脱氧核糖核苷酸都由一种称为脱氧核糖的五碳糖组成，一个磷酸基团和一个氮基碱，具有负责核酸链之间配对的环结构。五碳脱氧核糖分子中的碳原子的编号为1ʹ至5ʹ。DNA由两种类型的氮基组成：嘌呤和嘧啶。嘌呤，腺嘌呤（A）和鸟嘌呤（G）具有双环结构，并将六个碳环融合在一起。
从MMV大流行响应盒中发现了小分子的KSHV裂解复制抑制剂
Kaposi的肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）是原发性积液淋巴瘤（PEL），多中心Castleman疾病（MCD）和Kaposi的S肉瘤（KS）的病因。KSHV是每年有150万例新的感染相关癌症病例的肿瘤病毒之一。当前，尚无针对KSHV相关疾病的靶向疗法。通过开发基于KSHV ORF57蛋白检测的基于中型表型的ELISA筛选平台，我们为非胞毒性溶质抑制剂的KSHV裂解重复抑制剂进行了筛选疟疾风险投资（MMV）大流行反应盒。MMV1645152被鉴定为KSHV裂解复制的有前途的抑制剂，抑制了KSHV的立即和晚期的裂解基因表达，并阻止了或无需EBV confection的KSHV感染细胞系模型中非cytototoxic浓度在非cytotoxic浓度下的感染性KSHV VIRION颗粒的产生。MMV1645152对于开发针对KSHV相关的恶性肿瘤的未来治疗剂的发展是一个有希望的命中。
染色体和 DNA 复制工作表
为高中、初中和小学生命科学教师设计的 DNA 结构工作表、DNA 复制活动和课程计划可供免费下载。这些资源可满足各种教育需求。NGSS Life Science 网站提供各种精彩课程。通过单击“免费课程计划 (PDF)”链接或成为会员，教育工作者可以访问答案和可编辑文件。免费动物细胞课程包括人体系统疾病项目等项目。高中项目涉及学生通过 BLAST 活动了解突变蛋白质如何影响细胞、器官和器官系统，以镰状细胞病为例。这与 NGSS 标准 HS-LS1-1 和 HS-LS1-2 一致。NOVA 视频“破解生命密码”涵盖了人类基因组、突变、遗传变异、最高法院对基因专利的裁决、寻找疾病治疗方法和基因改造等主题。它与 NGSS 标准 HS-LS3-1 一致，由 WGBH 教育基金会和 Clear Blue Sky Productions 发布。免费的遗传伦理问题课程计划要求学生回答与遗传学（克隆、基因治疗）科学伦理相关的多项选择题，然后讨论每个问题的利弊。这与 NGSS 标准 HS-LS3-1 一致，由 Shannan Muskopf 发布。DNA 提取实验室允许高中生从他们的颊细胞中提取 DNA，以了解 DNA 的结构和 DNA 复制。该实验室包括有关 DNA 碱基配对及其与中心法则（DNA - 蛋白质 - 性状）的关系的问题。它与 NGSS 标准 HS-LS1-1 和 HS-LS3-1 一致，由 Ingrid Waldron 和 Jennifer Doherty 发布。DNA to Me 歌词项目要求高中生写一首关于 DNA、蛋白质合成和表型的诗歌或音乐歌词。该项目是学生所学 DNA 结构、DNA 碱基配对、基因、转录、翻译和表型的综合。它与 NGSS 生命科学发布的 NGSS 标准 HS-LS1-1、HS-LS1-6 和 HS-LS3-1 相一致。DNA 指纹识别犯罪现场项目涉及高中生检查犯罪现场证据，以确定谁应对食用女王特制进口的 Lindbergher 奶酪负责。学生模拟电泳和 DNA 指纹识别的过程。它与 Shannan Muskopf 发布的 NGSS 标准 HS-LS3-1 相一致。DNA 结构测验评估高中生对 DNA 结构的了解，包括双螺旋、核苷酸单体、DNA 聚合物、核酸生物分子、DNA 复制、互补链和碱基配对、脱氧核糖和磷酸骨架以及氮碱基（腺嘌呤、鸟嘌呤）。发现双螺旋结构：通过实践了解 DNA 结构和复制在这个互动实验室中，高中生制作 DNA 双螺旋结构的纸质模型。通过标记四种核苷酸（腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶）并练习氮碱基配对，学生对 DNA 复制有了更深入的了解。实验室还通过扭曲和盘绕模型来模拟超螺旋。通过这种动手实践的方法，学生可以探索分子生物学的关键概念，包括 DNA 结构、核酸（DNA、RNA）和基因表达。他们了解半保守复制、DNA 酶、基因突变、染色体突变、遗传疾病、原核生物和真核生物。通过使用引人入胜的 DNA 结构和复制工作表，教育工作者可以让学生更容易理解复杂的细胞过程。将这些资源纳入课程计划有助于教师提供坚实的科学和生物学基础，这对于高级课程的成功至关重要。这些工作表适合不同的学习风格，使教师能够量身定制教学并满足所有学生的需求。通过整合 DNA 结构和复制工作表，教师可以创建一个互动学习环境，促进对主题的深入理解。Quizizz 是一个有价值的平台，适合希望将 DNA 结构和复制工作表纳入课程的教育工作者。该平台提供广泛的资源，包括高质量的工作表、测验、抽认卡和互动游戏，旨在强化科学和生物学中的关键概念。通过利用 Quizizz，教师可以创建一个动态的学习环境，满足学生的不同需求。此外，该平台还允许教育工作者跟踪学生的进度并确定可能需要额外支持的领域，确保学生获得全面而有效的学习体验。教师可以创建一个互动的学习环境，以促进对主题的深入理解。Quizizz 是一个有价值的平台，适合希望将 DNA 结构和复制工作表纳入课程的教育工作者。该平台提供广泛的资源，包括高质量的工作表、测验、抽认卡和互动游戏，旨在强化科学和生物学的关键概念。通过利用 Quizizz，教师可以创建一个动态的学习环境，满足学生的不同需求。此外，该平台还允许教育工作者跟踪学生的进度并确定可能需要额外支持的领域，确保学生获得全面而有效的学习体验。教师可以创建一个互动的学习环境，以促进对主题的深入理解。Quizizz 是一个有价值的平台，适合希望将 DNA 结构和复制工作表纳入课程的教育工作者。该平台提供广泛的资源，包括高质量的工作表、测验、抽认卡和互动游戏，旨在强化科学和生物学的关键概念。通过利用 Quizizz，教师可以创建一个动态的学习环境，满足学生的不同需求。此外，该平台还允许教育工作者跟踪学生的进度并确定可能需要额外支持的领域，确保学生获得全面而有效的学习体验。
IV-A1型CRISPR介导的基因表达和质粒复制的抑制的可视化
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本发布于2024年6月12日。 https://doi.org/10.1101/2024.06.12.598411 doi：Biorxiv Preprint
意见增强剂的非规范函数：RNA聚合酶III转录，DNA复制和V（d）J重组的调节
增强子是其他基于DNA的过程的关键调节因子，因为它们以高度调节的方式产生核小体耗尽区域的独特能力。增强子通过RNA聚合酶III（POL III）调节TRNA基因的细胞类型特异性转录。他们还负责原点复制复合复合物（ORC）与DNA复制起源的结合，从而调节原点利用，复制时机和依赖复制的染色体断裂。此外，增强剂通过增加重组激活基因（RAG）重组酶对靶位点的访问以及通过产生由RAG2 PHD域识别的三甲基化组蛋白H3-K4的局部区域来调节V（d）J重组。因此，增强子代表了解码基因组的第一步，因此它们调节生物学过程，这些过程与RNA聚合酶II（POL II）转录不同，没有专用的调节蛋白。
病毒组装抑制剂阻止气道上皮细胞中的SARS-COV-2复制
SARS-COV-2逃避疫苗和治疗剂的持续进化强调了对具有高遗传障碍的创新疗法的需求。因此，在SARS-COV-2病毒生命周期中识别新的药理学靶标有明显的兴趣。通过无细胞的蛋白质合成和组装筛选鉴定出的小分子PAV-104最近以某种方式针对病毒组装来靶向宿主蛋白质组装机械。在这项研究中，我们研究了PAV-104抑制人类气道上皮细胞中SARS-COV-2复制的能力（AEC）。我们表明，在永生的AEC中，PAV-104抑制了> 99％的SARS-COV-2变体的感染，而在空气界面（ALI）中培养的原代AEC中，代表体内的肺微环境。我们的数据表明，PAV-104抑制SARS-COV-2的产生，而不会影响病毒入口，mRNA转录或蛋白质合成。PAV-104与SARS-COV-2 Nucleocapsid（N）相互作用，并干扰其寡聚化，阻止粒子组装。转录组分析表明，PAV-104逆转了I型干扰素反应的SARS-COV-2诱导以及已知支持冠状病毒复制的核蛋白信号传导途径的成熟。我们的发现表明PAV-104是Covid-19的有前途的治疗候选者，其作用机制与现有的临床管理方法不同。
COPD中的心血管疾病和风险：最先进的审查 DNA复制终止期间姐妹染色单体内聚力 T细胞与化学免疫疗法相比 - UCL发现 计算精神病学系列Tobias U. Hauser 心血管疾病知识门户 b''
新复制的姐妹染色单体由粘蛋白复合物束缚在一起，但是姐妹染色单体内聚力如何与DNA复制协调不足。流行模型表明在复制之前与DNA结合的粘着蛋白通过复制通过粘着蛋白环的复制或通过重现叉子在复制叉后通过重壳组件的转移来确定凝聚力。通过可视化与预加载的粘蛋白复合物碰撞的单个复制叉，我们发现重质体将粘蛋白推向满足收敛的重新分散体的位置。虽然在DNA复制终止期间去除收敛的重新分裂，但粘蛋白仍保持在新生的DNA上。我们证明了这些粘着蛋白分子将新复制的姐妹DNA系在一起。我们的结果支持了一个新模型，其中在DNA复制终止期间建立了姐妹染色单体内聚。