✉ 通信和材料索取请发送至 Lan Luan 或 Chong Xie。lan.luan@rice.edu;chongxie@rice.edu。作者贡献 CX 构思并组织了整个研究;ZZ、HZ、XL、LL 和 CX 设计了实验,所有作者均参与其中;ZZ 和 XL 在 CX 的监督下设计和制作了 NET 设备;DFL、JEC 和 LF 与 SpikeGadgets LLC 合作设计了堆叠头戴式记录系统;ZZ 和 XL 在 JEC 和 DFL 的帮助以及 CX 和 LF 的监督下设计了 NET 探头与头戴式记录系统的集成;ZZ 和 XL 在 CX 的监督下开发并执行了手术程序;ZZ、XL 和 HZ 在 LS 和 FH 的帮助以及 CX 和 LL 的监督下进行了动物神经记录实验; HZ 和 ZZ 开发并实施了数据预处理,由 CX 监督,并得到了 JEC 和 LF 的意见;ZZ 和 HZ 执行了数据后分析,由 LL 和 CX 监督,并得到了 LF 的意见;ZZ 执行了组织学研究,由 CX 监督;ZZ、LL 和 CX 撰写并修改了手稿,得到了所有作者的意见。
遗传变异与感染易感性之间的关联长期以来一直在自由宿主中进行研究,以推断出塑造免疫基因遗传多态性的当代进化力。尽管对蛋白质与病原体衍生的配体相互作用,例如MHC(主要的组织相互作用复合物)或TLR(TLR样受体),但对免疫系统的传递臂知之甚少。细胞因子是触发和调节免疫反应的信号分子,是先天性和适应性免疫之间的关键联系。In the present study we investigated how genetic variation in cytokines in bank voles Myodes glareolus affects their susceptibility to infection by parasites (nematodes: Aspiculuris tianjensis , Heligmosomum mixtum , Heligmo- somoides glareoli ) and microparasites ( Cryptosporidium sp , Babesia microti , Bartonella sp . )。我们专注于三种细胞因子:肿瘤坏死因子(TNF),淋巴毒素α(LTα)和干扰素β(IFNβ1)。总体而言,我们确定了与线虫易感性相关的四个单核苷酸聚合物(SNP):两个位于ltα中的两个单核苷酸(SNP),其中两个位于IFNβ1中。其中一个变体是代名词,另一个位于内含子中。与寄生虫负载相关的每个SNP都位于选择的密码子中或旁边,三个密码子显示了阳性选择的签名,以及一个净化选择之一。我们的结果表明,细胞因子容易受到寄生虫驱动的选择,而非编码变体虽然在宿主寄生虫共同进化的遗传背景中通常被忽略,但可能在野生系统中感染的易感性中起作用。
1. 普林斯顿大学普林斯顿神经科学研究所,普林斯顿,美国。 2. 普林斯顿大学霍华德休斯医学研究所,普林斯顿,美国。 3. 普林斯顿大学分子生物学系,普林斯顿,美国 4. 约翰霍普金斯大学生物医学工程系,巴尔的摩,美国 5. 约翰霍普金斯大学 Kavli 神经科学发现研究所和成像科学中心数据科学数学研究所,巴尔的摩,美国 6. 北里奥格兰德联邦大学脑研究所;纳塔尔,巴西 7 康斯坦茨大学集体行为高级研究中心。 8 马克斯普朗克动物行为研究所,康斯坦茨 + 通讯作者:Carlos D Brody (brody@princeton.edu) 或 Adam Charles (adamsc@jhu.edu) * 同等贡献。
G蛋白 - 内向矫正的K(Girk)通道是G I/O-蛋白质 - 信号系统的靶标,可抑制细胞的兴奋性细胞。Girk通道作为同型(GIRK2和GIRK4)或具有非功能同源亚基(GIRK1和GIRK3)的异驱动器存在。尽管它们与多个条件有关,但缺乏区分不同少女通道亚型的选择性girk药物阻碍了对其精确的生理相关性和治疗性潜力的研究。在这里,我们报告了大脑GIRK1/2通道的高度特异性,有效且有效的激活因子。使用化学筛选和电生理测定法,我们发现该激活剂,溴硫氰基取代的小分子GAT1508是针对脑表达的GIRK1/2通道的特异性的,而不是心脏GIRK1/4通道。计算模型预测了通过实验性诱变实验验证的GAT1508结合位点,提供了有关基于尿素的化合物如何与通道激活所需的遥远GIRK1残基的见解。此外,我们还提供了计算和经验证据,表明GAT1508是通道 - 磷脂酰肌醇4,5-双磷酸磷酸盐的变构调节剂。通过脑部滑动电生理学,我们表明,亚阈值GAT1508浓度直接刺激基底外侧杏仁核(BLA)和potentiate baclofen诱导的电流中的Girk电流。值得注意的是,GAT1508在啮齿动物中有效地熄灭了条件恐惧,缺乏心脏和行为副作用,这表明其在创伤后应激失调的药物治疗中的潜力。总而言之,我们的发现表明小痣 -
神经发育障碍(NDDS)是一组复杂的神经系统疾病和精神疾病。功能性和分子成像技术,例如静息状态功能磁共振成像(RS-FMRI)和正电子发射tomog-raphy(PET),可用于在人类和人类模型中成熟期间在成熟期间非侵入性和纵向测量网络活性。Here, we review the current knowledge on rs-fMRI and PET biomarkers in the study of normal and abnormal neurodevelopment, including intellectual disability (ID; with/without epilepsy), autism spectrum disorder (ASD), and attention deficit hyperactivity disorder (ADHD), in humans and rodent models from birth until adulthood, and evaluate the cross-species translational value of the imaging biomarkers.迄今为止,只有少数孤立的研究使用RS-FMRI或PET在婴儿期(神经发育的关键时期)中研究啮齿动物的神经发育(异常)。Further work to explore the feasibility of performing functional imaging studies in infant rodent models is essential, as rs-fMRI and PET imag- ing in transgenic rodent models of NDDs are powerful techniques for studying disease pathogenesis, developing noninvasive pre- clinical imaging biomarkers of neurodevelopmental dysfunction, and evaluating treatment-response in disease-specific models.
• Creation of transgenic or knock-out animals, other than rodents, made by stable introduction of foreign DNA • Breeding of transgenic or knock-out animals, other than rodents, made by stable introduction of foreign DNA • Purchase or transfer of transgenic or knock-out animals, other than rodents, made by stable introduction of foreign DNA • Experiments in which rDNA molecules are administered to a transgenic animal • Experiments in which viral vectors containing将rDNA分子施用对任何动物(转基因或其他方式)•将通过rDNA分子修饰的细胞(包括从转基因动物分离的细胞)施用的实验对任何动物(转基因或否则)施用•通过RDNA分子修饰的微生物对任何动物(否则)(否则)否则(否则)否(否则)
摘要 准确提取磁共振成像 (MRI) 数据中的脑组织对于分析大脑结构和功能至关重要。虽然已经优化了几种常规工具来处理人脑数据,但目前还没有可推广的方法来提取啮齿动物、非人类灵长类动物和人类的多模态 MRI 数据的脑组织。因此,开发一种灵活且可推广的方法来提取跨物种的整个脑组织将使研究人员能够更有效地分析和比较实验结果。在这里,我们提出了一个领域自适应的半监督深度神经网络,称为脑提取网络 (BEN),用于提取跨物种、MRI 模态和 MR 扫描仪的脑组织。我们已经在 18 个独立数据集上评估了 BEN,包括 783 个啮齿动物 MRI 扫描、246 个非人类灵长类动物 MRI 扫描和 4601 个人类 MRI 扫描,涵盖五个物种、四种模态和六种具有不同磁场强度的 MR 扫描仪。与传统工具箱相比,BEN 的优越性体现在其稳健性、准确性和通用性上。我们提出的方法不仅为跨物种提取脑组织提供了通用解决方案,而且显著提高了图谱配准的准确性,从而有利于下游处理任务。作为一种新型的全自动深度学习方法,BEN 被设计为一种开源软件,可在临床前和临床应用中实现跨物种神经影像数据的高通量处理。
小型啮齿动物会给农场带来问题,例如基础设施损坏、农作物损失或病原体传播。后者对人类和牲畜都构成威胁。野生啮齿动物和牲畜之间的频繁接触有利于病原体传播,因此了解小型哺乳动物的运动模式对于制定预防损害和健康问题的策略非常重要。微型近距离记录器是一种新开发的用于监测小型哺乳动物空间行为的工具。蓝牙低功耗 (BLE) 信号的强度可用作野生啮齿动物与牲畜饲养地点密切接触的指标,这对于识别可能的传播途径很重要。该方法研究侧重于该技术在农业环境中的使用以及在用于畜牧业的农业环境中测试和校准该技术的试运行。结果表明,记录器的电池寿命主要受预设扫描间隔的影响。短扫描间隔会导致电池寿命缩短,应根据目标物种的活动模式最大化。栖息地会影响 BLE 信号强度,导致室内信号强度高于室外。记录器位置的高度对牲畜圈内的信号强度有积极影响。信号接收通常随着距离的增加而减小,并且不同记录器的信号接收也不同,因此需要进行校准。在特定栖息地的距离内,BLE 近距离记录系统可以识别小型哺乳动物之间以及动物与特定结构之间的接触。这些结果支持在畜牧业环境中使用基于 BLE 的系统,并为经过验证的技术提供了大量证据。此外,这种方法可以为可能的病原体传播途径提供有价值的见解。
Natalie Brunette 1,2,3,* , Connor Weidle 1,2,* , Samuel P Wrenn 1,2,4 , Brooke Fiala 1,2,5 , Rashmi Ravichandran 1,2 , Kenneth D Carr 1,2 , Samantha E Zak 6 , Elizabeth E Zumbrun 6 , Russell R Bakken 6 , Michael Murphy 1,2,7 , Sidney Chan 1,2,Rebecca Skotheim 1,2,Andrew J Borst 1,2,Lauren Carter 1,2,8,Colin E Correnti 1,2,10 1,2,10,John M Dye 6,David Baker 1,2,11,Neil P King 1,2,†1,2,†,Lance J Stewart 1,2,1,2设计,华盛顿大学,西雅图,西雅图,华盛顿州98195,美国3现在的地址:美国西部西雅图,华盛顿州西雅图市98102,美国4现在的地址:Bonum Therapeutics,西雅图,华盛顿州98102,美国5现在地址:阿斯特拉赛尼卡,Icosavax,Icosavax Inc.,西雅图,西雅图,华盛顿州98102,US 6 US陆军医疗研究机构(US)
针对小鼠和大鼠基因分型的组织收集指南的目的:遗传修饰的啮齿动物的正确遗传鉴定对于研究的效率和可重复性以及减少研究项目中涉及的动物的数量至关重要。基因型最常通过对年轻啮齿动物组织提取的DNA的分析来确定。从历史上看,组织活检(例如,Pinna,尾巴和远端的Phalanx)一直是使用的最常见方法,但是必须仔细执行活检,因为它们有可能导致某种程度的疼痛和/或困扰(1-3)。已经描述了使用毛囊,血液,粪便,眼泪样本或口服拭子的其他侵入性较小但技术上更具挑战性的测试方法(1,4-15)。研究人员应使用对其研究实用的侵入性最少的方法,并应收集可靠结果所需的最小样本。及时收集和分析组织可以在断奶前确定所需的小鼠/大鼠,并将促进更有效地使用笼子空间。首席调查员必须确保对执行这些技术程序的个人进行足够的培训。进行基因分型的样本收集时,应考虑以下准则,以最大程度地降低交叉污染的风险并确保使用高质量的DNA样品来产生准确的结果: