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适用于啮齿动物、非人类灵长类动物和人类的多模态 MRI 数据的通用脑提取网络 (BEN)
摘要 准确提取磁共振成像 (MRI) 数据中的脑组织对于分析大脑结构和功能至关重要。虽然已经优化了几种常规工具来处理人脑数据，但目前还没有可推广的方法来提取啮齿动物、非人类灵长类动物和人类的多模态 MRI 数据的脑组织。因此，开发一种灵活且可推广的方法来提取跨物种的整个脑组织将使研究人员能够更有效地分析和比较实验结果。在这里，我们提出了一个领域自适应的半监督深度神经网络，称为脑提取网络 (BEN)，用于提取跨物种、MRI 模态和 MR 扫描仪的脑组织。我们已经在 18 个独立数据集上评估了 BEN，包括 783 个啮齿动物 MRI 扫描、246 个非人类灵长类动物 MRI 扫描和 4601 个人类 MRI 扫描，涵盖五个物种、四种模态和六种具有不同磁场强度的 MR 扫描仪。与传统工具箱相比，BEN 的优越性体现在其稳健性、准确性和通用性上。我们提出的方法不仅为跨物种提取脑组织提供了通用解决方案，而且显著提高了图谱配准的准确性，从而有利于下游处理任务。作为一种新型的全自动深度学习方法，BEN 被设计为一种开源软件，可在临床前和临床应用中实现跨物种神经影像数据的高通量处理。
啮齿动物中的全面心脏代谢风险评分估计方法
心脏代谢疾病是世界上发病和死亡率的主要主要原因之一。个体中一系列代谢风险因素的共存，促使Reven将其视为一种称为“ X综合征”的综合征。该术语后来演变了，健康状况今天称为“心脏代谢综合征”（CMS）。在过去几年中，对CMS的病理生理学的理解取得了重大进展。能够充分评估心脏代谢风险（CMR）对于正确诊断，预防和更好地管理CMS至关重要，因为这可能有助于减慢其进展和并发症。这在潜在治疗策略的临床前和临床评估中也可能有用。已经开发了几种方法来评估在慢性和临床环境中发展心脏代谢疾病的风险。但是，这些方法应用于涉及啮齿动物的简短和实验设置时的局限性。因此，该评论旨在重新定义和突出要重新考虑心脏代谢综合征定义中的主要风险因素；并提出了一种评估啮齿动物中CMR的综合估计方法。这与对CMS一词的适当利用和实验环境中治疗靶标的深入评估有关。1。背景自1988年以来，已经在临床和基础研究环境中对代谢和心血管疾病之间的相互作用进行了深入研究。为此，已经开发了许多计算器系统。在本课程中，用来描述患者同时发生的代谢和心血管疾病簇的术语已经发展。的确，这首先被Reaven [1]称为“综合症X”，随后将其重命名为“代谢综合征”，因为胰岛素抵抗，血压血压，高血压和肥胖之间的关联变得更加明显[2-5]。在过去的几十年中，“代谢综合征”一词被重新调整为“心脏代谢综合征”（CMS），因为代谢功能障碍对发展心血管疾病（CVD）的风险的显着贡献，以及对病因和病理学机制的相似之处[CVD）[6-7]。评估心脏代谢风险（CMR）对于确定发展心血管和其他代谢事件并开始适当治疗的风险至关重要[8-9]。但是，它们在临床环境中大多是相关的，而在动物实验的背景下存在几个局限性，因为某些参数无法在短期实验中测量。面临这些局限性，有必要在实验动物中开发更全面的CMR估计方法
自由生活啮齿动物中的细胞因子基因多态性和寄生虫敏感性：非编码变体的重要性
遗传变异与感染易感性之间的关联长期以来一直在自由宿主中进行研究，以推断出塑造免疫基因遗传多态性的当代进化力。尽管对蛋白质与病原体衍生的配体相互作用，例如MHC（主要的组织相互作用复合物）或TLR（TLR样受体），但对免疫系统的传递臂知之甚少。细胞因子是触发和调节免疫反应的信号分子，是先天性和适应性免疫之间的关键联系。In the present study we investigated how genetic variation in cytokines in bank voles Myodes glareolus affects their susceptibility to infection by parasites (nematodes: Aspiculuris tianjensis , Heligmosomum mixtum , Heligmo- somoides glareoli ) and microparasites ( Cryptosporidium sp , Babesia microti , Bartonella sp . )。我们专注于三种细胞因子：肿瘤坏死因子（TNF），淋巴毒素α（LTα）和干扰素β（IFNβ1）。总体而言，我们确定了与线虫易感性相关的四个单核苷酸聚合物（SNP）：两个位于ltα中的两个单核苷酸（SNP），其中两个位于IFNβ1中。其中一个变体是代名词，另一个位于内含子中。与寄生虫负载相关的每个SNP都位于选择的密码子中或旁边，三个密码子显示了阳性选择的签名，以及一个净化选择之一。我们的结果表明，细胞因子容易受到寄生虫驱动的选择，而非编码变体虽然在宿主寄生虫共同进化的遗传背景中通常被忽略，但可能在野生系统中感染的易感性中起作用。
基于人工智能的啮齿动物脑肿瘤 MRI 自动分割，一项多中心研究
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LAB_077 啮齿动物的情境和提示恐惧条件作用
• 行为评估最好在专门的行为套件中进行。 • 环境应远离可能影响动物行为的不受控制的外部刺激，例如人流、不必要的噪音和强光。 • 应分别测试雄性和雌性啮齿动物，每次只测试一种性别的啮齿动物。如果可能，应先测试雄性，最好在不同的日子进行，但至少要彻底清洁两性之间的啮齿动物。除非啮齿动物已经关在铁丝笼或类似笼子中，并且两性啮齿动物都在同一个房间。 • 实验者不能使用气味强烈的除臭剂或香水，并且必须有处理啮齿动物的经验，并接受过行为范式和所用设备的培训。 • SOP 的变化。如果您正在进行消退或回忆测试，恐惧条件化可能会随着提示刺激类型、给予的电击量和强度、试验间隔时间的变化而变化。任何超出本 SOP 详细说明的内容都必须向 AEC 说明，以获得他们的批准。 • 如果想要使用新气味，您必须在开始实验之前与行为设施经理讨论此事。• 16000Hz 音调已经过测试并被证明是有效的；此音调有经过验证的放大器设置。如果使用不同的声音提示，用户有责任使用分贝计确定合适的放大器设置。每个盒子中的声音不应比约 75-80dB 安静得多（因为动物可能难以区分背景噪音）或大声得多（因为震耳欲聋的声音本身可能令人厌恶）。
自由活动啮齿动物在执行认知任务时的慢性脑功能超声成像
1. 普林斯顿大学普林斯顿神经科学研究所，普林斯顿，美国。 2. 普林斯顿大学霍华德休斯医学研究所，普林斯顿，美国。 3. 普林斯顿大学分子生物学系，普林斯顿，美国 4. 约翰霍普金斯大学生物医学工程系，巴尔的摩，美国 5. 约翰霍普金斯大学 Kavli 神经科学发现研究所和成像科学中心数据科学数学研究所，巴尔的摩，美国 6. 北里奥格兰德联邦大学脑研究所；纳塔尔，巴西 7 康斯坦茨大学集体行为高级研究中心。 8 马克斯普朗克动物行为研究所，康斯坦茨 + 通讯作者：Carlos D Brody (brody@princeton.edu) 或 Adam Charles (adamsc@jhu.edu) * 同等贡献。
基于mRNA的SARS-COV-2疫苗候选CVNCOV诱导高水平的病毒中和抗体，并介导啮齿动物的保护
M.F-M。是德国Tübingen的Curevac AG的管理委员会成员和雇员。 S.R.，B.P.，N.R.，K.S。 和S.O.M. 是Curevac AG的雇员，德国Tübingen，这是一家公开上市的公司，开发了基于RNA的疫苗和免疫治疗药。 所有作者均可在公司中持有股票或股票期权。 S.R.，B.P.，N.R.，K.S.，M.F-M。发明人获得了MRNA疫苗接种及其使用的几项专利。M.F-M。是德国Tübingen的Curevac AG的管理委员会成员和雇员。S.R.，B.P.，N.R.，K.S。 和S.O.M. 是Curevac AG的雇员，德国Tübingen，这是一家公开上市的公司，开发了基于RNA的疫苗和免疫治疗药。 所有作者均可在公司中持有股票或股票期权。 S.R.，B.P.，N.R.，K.S.，M.F-M。发明人获得了MRNA疫苗接种及其使用的几项专利。S.R.，B.P.，N.R.，K.S。和S.O.M. 是Curevac AG的雇员，德国Tübingen，这是一家公开上市的公司，开发了基于RNA的疫苗和免疫治疗药。 所有作者均可在公司中持有股票或股票期权。 S.R.，B.P.，N.R.，K.S.，M.F-M。发明人获得了MRNA疫苗接种及其使用的几项专利。和S.O.M.是Curevac AG的雇员，德国Tübingen，这是一家公开上市的公司，开发了基于RNA的疫苗和免疫治疗药。所有作者均可在公司中持有股票或股票期权。S.R.，B.P.，N.R.，K.S.，M.F-M。发明人获得了MRNA疫苗接种及其使用的几项专利。S.R.，B.P.，N.R.，K.S.，M.F-M。发明人获得了MRNA疫苗接种及其使用的几项专利。
小分子GAT1508激活了脑特异性GIRK1/2通道异构体，并促进了啮齿动物中有条件的恐惧灭绝
G蛋白 - 内向矫正的K（Girk）通道是G I/O-蛋白质 - 信号系统的靶标，可抑制细胞的兴奋性细胞。Girk通道作为同型（GIRK2和GIRK4）或具有非功能同源亚基（GIRK1和GIRK3）的异驱动器存在。尽管它们与多个条件有关，但缺乏区分不同少女通道亚型的选择性girk药物阻碍了对其精确的生理相关性和治疗性潜力的研究。在这里，我们报告了大脑GIRK1/2通道的高度特异性，有效且有效的激活因子。使用化学筛选和电生理测定法，我们发现该激活剂，溴硫氰基取代的小分子GAT1508是针对脑表达的GIRK1/2通道的特异性的，而不是心脏GIRK1/4通道。计算模型预测了通过实验性诱变实验验证的GAT1508结合位点，提供了有关基于尿素的化合物如何与通道激活所需的遥远GIRK1残基的见解。此外，我们还提供了计算和经验证据，表明GAT1508是通道 - 磷脂酰肌醇4,5-双磷酸磷酸盐的变构调节剂。通过脑部滑动电生理学，我们表明，亚阈值GAT1508浓度直接刺激基底外侧杏仁核（BLA）和potentiate baclofen诱导的电流中的Girk电流。值得注意的是，GAT1508在啮齿动物中有效地熄灭了条件恐惧，缺乏心脏和行为副作用，这表明其在创伤后应激失调的药物治疗中的潜力。总而言之，我们的发现表明小痣 -