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马达加斯加长春花基因组的最新版本
摘要 马达加斯加长春花（Catharanthus roseus）属于夹竹桃科。这种药用植物原产于马达加斯加，可生产许多重要药物，包括单萜吲哚生物碱 (MIA) 长春新碱和长春花碱，用于世界各地治疗癌症。在这里，我们提供了一个新版本的 C. roseus 基因组序列，该序列是通过结合 Oxford Nanopore Technologies 长读和 Illumina 短读获得的。这个更连续的组装由 173 个支架组成，总长度为 581.128 Mb，N50 为 12.241 Mb。使用公开的 RNAseq 数据，预测并功能注释了 21,061 个蛋白质编码基因。总共 42.87% 的基因组被注释为可转座因子，其中大多数是长末端重复序列。随着对 MIA 产生植物基因组的了解日益增多，这个更新版本应该会简化进化研究，从而更好地了解 MIA 生物合成途径的进化。
来自Ash Yellows Group
“ Cantidatus Phytoplasma Fraxini”的Ashy1菌株起源于伊萨卡（美国纽约，美国纽约），并于白灰（Fraxinus Americana），并被转移到Catharanthus Roseus（5）。使用Dneasy血液和组织试剂盒（Qiagen，Hilden，Germany）制备了由感染的玫瑰花芽芽孢杆菌和叶子材料制备的测序模板。使用SMRTBELL PREP KIT 3.0（美国加利福尼亚州PACBIO）的SMRTBELL PREP KIT 3.0（美国）而没有其他DNA片段化制备了用于单分子实时（SMRT）的高保真库。在Max Planck Genome-Centre（德国科隆）的续集IIE设备（PACBIO）上对片段文库进行了测序，其结合KIT 2.0（PACBIO）和续集II测序套件2.0（PACBIO）。通过使用BLAST+ v2.2.2.9，MetAgenome Analyze（Megan）和一个数据核定的数据，通过BLAST+ v2.2.2.9，MetAgenome Analyze（Megan）v.6.18.2（6.18.2（6.18.2）（6）（6）（6.6.18.2（6）的候选，分类构造分类为“ candidatus phyto plasma”属，其中11,518个读取（5834中的N 50）被分配给“念珠菌Phyto等离子体”属。 GenBank的Tus Phytoplasma”和Catharanthus Roseus（登记：2024年1月）。 使用PACBIO-HIFI选项和估计的基因组大小为600 kb，将其余的读数与CANU v2.2（7）组装在一起。 实现了一个连续的圆形序列，具有67.17倍的覆盖率。 通过爆炸分析确认了> 10 kb的序列重叠。 随后，使用Artemis V18.2.0（8）手动删除序列重叠。 在Rast V2.0（9）中进行了完整染色体的注释，然后在Artemis v18.2.0（8）中进行手动策划，DNAA将DNAA设置为染色体的第一个基因。 未发现质粒。通过BLAST+ v2.2.2.9，MetAgenome Analyze（Megan）v.6.18.2（6.18.2（6.18.2）（6）（6）（6.6.18.2（6）的候选，分类构造分类为“ candidatus phyto plasma”属，其中11,518个读取（5834中的N 50）被分配给“念珠菌Phyto等离子体”属。 GenBank的Tus Phytoplasma”和Catharanthus Roseus（登记：2024年1月）。使用PACBIO-HIFI选项和估计的基因组大小为600 kb，将其余的读数与CANU v2.2（7）组装在一起。实现了一个连续的圆形序列，具有67.17倍的覆盖率。通过爆炸分析确认了> 10 kb的序列重叠。随后，使用Artemis V18.2.0（8）手动删除序列重叠。在Rast V2.0（9）中进行了完整染色体的注释，然后在Artemis v18.2.0（8）中进行手动策划，DNAA将DNAA设置为染色体的第一个基因。未发现质粒。使用BUSCO的151个单拷贝直系同源物（94％）的比较支持了注释的完整性（10）。在染色体组装中未考虑的读数对额外的分类套筒进行了进一步的分类，并筛选了ASHY1的肉体外DNA。默认参数用于所有软件，除非另有说明。
探索马达加斯加Periwinkle
本文对马达加斯加·佩里温克尔（Madagascar Periwinkle）（Catharanthus Roseus）的复杂化学化妆和几种药用应用进行了深入研究，该植物赢得了现代医学领域研究人员和医学专家的兴趣。该物种最初原产于马达加斯加，但现在在全球分布，是生物活性化合物的重要仓库，即生物碱长葡萄碱和长春新碱。这些化学物质极大地彻底改变了癌症治疗的领域，特别是它们针对淋巴瘤和白血病的功效。这项研究广泛研究了植物的复杂化学成分，包括萜类吲哚生物碱，酚类和类黄酮。目的是阐明这些分子合成的过程并理解影响其形成的因素。此外，此摘要探讨了rose菌的更广泛的治疗潜力，超出了其公认的抗肿瘤特性。本文对研究植物在治疗糖尿病，打击感染，作用作为抗氧化剂和保护神经系统方面的功效的最新科学研究进行了全面分析。它对在实验室和动物环境中进行的研究进行了彻底的评估。该研究研究了在药物开发中使用这些植物化学物质的挑战和潜力，包括提取它们的技术，增强生物碱生产的生物技术方法以及发现新颖化合物的前景。这项努力的目的是通过合并可用的数据并识别需要进一步检查的领域来促进对马达加斯加Perewinkle未开发的治疗属性进行更多调查。主要目的是为各种人类疾病培养破裂的治疗方法。
植物抗癌药物的代谢工程
测序和转录组学的进步使得通过共表达分析可以发现酶，其中候选基因通过组织表达模式与已知途径酶的相似性来识别 — — 最近在 C.roseus 和 Podophyllumpeltatum 中的发现证明了这一点 [ 4 , 5 ]。自组织映射等机器学习方法进一步优化了候选基因 [ 6 ]。这些方法，加上对植物体内生物合成定位的更深入理解，以及单细胞代谢组学等技术的发展，进一步改善了候选基因的选择，加速了酶的发现 [ 7 ]。借助基于 OMIC 的工具（如 plantiSMASH）识别物理基因簇有助于阐明缺失的生物合成酶，如那可丁和长春花碱途径中的酶 [ 8–10 ]。然而，这种方法是有限的，因为许多植物生物合成途径几乎没有或没有基因聚集，如喜树碱生物合成途径[11]。基于同源性的克隆可以加速发现与已知生物合成酶具有直系同源功能的基因，例如在 Tabernanthe iboga 的 ibogaine 生物合成途径中鉴定出 C. roseus 脱羧酶直系同源物[12]。然而，途径的复杂性往往需要采用组合方法，例如 Gelsemiumsempervirens 氧化吲哚途径的发现[13]。
Mukhopadhyay 等人，J Adv Sci Res，2020；11 (2): 209-212
* 通讯作者：moumahuya1@yahoo.com 摘要 本研究从药用植物长春花 (长春花) 中分离细菌和真菌内生菌。共获得 13 种内生细菌分离株。筛选细菌分离株以产生植物生长促进剂（吲哚乙酸、固氮和磷酸盐溶解）以及针对强效人类病原体的抗菌剂。在这些分离株中，11 种细菌分离株产生吲哚-3-乙酸（浓度范围为 11-74 µg/ml），3 种分离株能够固氮，3 种分离株可在体外溶解不溶性磷酸三钙。在初步筛选中，5 种内生分离株的提取物通过琼脂孔扩散法体外测定似乎对 3 种病原体（大肠杆菌、葡萄球菌属、弧菌属）具有抗菌活性。
毛状根：生产植物产品的未开发潜力
虽然植物是宝贵天然产物的丰富来源，但生产这些产品用于商业应用往往具有挑战性。通常有机合成对于可行的商业产品来说过于昂贵，并且生物合成途径通常非常复杂，以至于将它们转移到微生物中并非易事或不可行。对于不适合农业生产天然产物的植物，毛状根培养物为生产平台提供了一个有吸引力的选择，该平台提供遗传和生化稳定性、快速生长和无激素培养基。代谢工程和合成生物学工具在设计毛状根以及生物反应器技术方面取得的进展已达到该技术的商业应用即将实现的地步。我们讨论了毛状根的不同应用。我们还以理解长春花毛状根中萜类吲哚生物碱途径的进展为例，说明了途径发现和途径工程方面的进展和挑战。
开发并验证一种新型 hplc 方法...
白血病 (ALL) 5 。长春花碱用于治疗乳腺癌、睾丸癌和神经母细胞瘤 6 。长春地辛是一种从长春花碱中提取的生物碱，已显示出对抗霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤、肺癌和乳腺癌的活性 7 。长春瑞滨用于治疗已发展到周围组织或身体其他部位的非小细胞肺癌 (NSCLC) 8 。根据最近的一项研究，长春胺是少数对活细胞有积极作用的生物碱之一。通过增加血流量和区域葡萄糖的吸收，它可以作为脑代谢增强剂，对缺血和缺氧具有神经保护作用，并具有抗氧化和抗凋亡特性。长春胺被认为是治疗镰状细胞病的潜在成分，因为它似乎可以作为活细胞中的氧载体 9 。长春胺是一种单萜吲哚生物碱（图1），主要存在于长春花叶中10。在本研究中，根据国际协调会ICH Q2（R1）指南11的建议，建立了高效薄层色谱法（HPTLC）对长春花叶甲醇提取物中的长春胺进行定量分析。
政府植物群生物多样性的调查。 KRGPG（Auto。）...
24。灌木25。天上印度指示27。女士Palm Excel女士Aralia bexoana polysciascinas srub 29。Croton Codiaum Verietaum 30。jasminum srub 36。Rheo Tradescania 38。竹Daccaena Sandriana Srub 41。Potiary Pica 44。红色树篱光照射。
使用三叉戟（L.）Hallier f。及其抗菌活性
Jisa Ann Sabu，Brijithlal nd和Renjitha rs摘要在本文中，我们使用Merremia Tridentata（L.）Hallier f的铜氧化铜（CUO）纳米颗粒进行了绿色合成。 ，用作上限和还原剂。生物合成的CuO纳米颗粒的特征是紫外可见光谱和X射线衍射（XRD）。将生物合成纳米颗粒的体外抗菌活性与三叉菌的乙醇和乙酸乙醇提取物进行了比较。生物合成的CuO纳米颗粒显示出对枯草芽孢杆菌（MTCC No. 2413），Klebsiella肺炎（MTCC No.3384）的显着抑制活性（MTCC No.3384），脊柱葡萄球菌（MTCC No.87）和Escherichia Coli（Escherichia Coli（MTCC No.443）与其他提取物相比，分别为11 mm。可以将来自三方Merremia的生态友好的基于植物的CuO纳米颗粒的有效抗菌活性作为针对测试的病原体的一种补救措施。关键字：三叉戟，绿色合成，纳米颗粒，氧化铜，抗菌活性引入纳米技术是一个前进的科学领域，它结合了纳米颗粒的特殊活动，大小范围为1-100 nm（Simon等，2022）[19] [19]。为了合成纳米颗粒，已经建议生物或绿色方法来解决物理和化学方法的局限性。植物部分，例如叶子，水果，花，根等。用于制备提取物以执行绿色合成（A. M. Al-Faouri等，2021）[1]。纳米颗粒将使它们在生物医学领域的应用中受益（Bhavyasree等，2022）[4]。生物形成或绿色合成产生的纳米医学可以增强药物的安全性（Mittal等，2022）[11]。纳米药物的潜在益处，包括提高功效，生物利用度，主动靶向能力，更大的剂量反应，药物递送，增强的溶解度，保留效应和较小的毒性会导致化学疗法，放射治疗，靶向治疗，靶向治疗和手术使用纳米颗粒使用Nanoparticles的治疗发展（Sevastre et evastre et naptre et ana，2012）[16] [23] [16] [16]。纳米颗粒目前用于靶向细菌的多药物抗药性（MDR）菌株，该菌株几乎显示出对几乎所有抗生素作用方式的抗性。与抗生素不同，纳米颗粒的作用是通过细胞壁接触而不是穿透细胞发生的。这使细菌对纳米颗粒的抗性较小，并标志着基于纳米颗粒的材料有效治疗细菌感染的重要性（Amin等，2021）[3]。在生物医学区域，生物相容性的CuO纳米颗粒表现出有效的抗菌，抗真菌，抗病毒，抗寄生虫，抗糖尿病和抗氧化活性（Naz等，2023）[13]。由于表面积且大小较小，与常规药物相比，低剂量的CuO纳米果足以表现出其效力（Sulaiman等，2022）[20]。Cuo纳米颗粒的绿色合成在Catharanthus Roseus（Dayana，K.S。et al。，2021）[7]，Gloriosa Superba（Naika等，2015）[12]，Lantana Camara（Chowdhury，R。等，2020）[5] [5]，Camellia sinensis（Jeronsia，J.M.等，2019）[8] Calotropis gigantean a（Sharma，J.K。等，2015）[17] [17]，Psidum Guajava（Das，D。＆Goswami，S.，S。，2019年，2019年）[6]，olidenceo cardamomum（olidenceo cardamomum（Venkatramanan et al。，2020），sarace ean ean ean ean ean ean ean。 Vera（Kumar等，2015）[10]，ixora coccinea（Yedurkar等，2017）[24]，Ocimum Basilicum（Altikatoglu等，2017）[2]。