来自同一物种的微生物菌株由于其不同的基因含量而具有不同的功能特征。作为最高分辨率,菌株主要是特定于宿主的,因此掩盖了公正的关联,并阻碍了演绎研究。在这里,我们以公正的,独立的方式全面地以一致宣布的亚种分辨率定义了人类肠道微生物群,并证明我们可以在全球范围内概括到全球范围内的不同种群,同时保持特异性并提高培养基可重复性。我们开发了Panhashome,这是一种基于草图的方法,用于快速亚种量化和鉴定驱动种子内变化的基因,并表明亚种在物种水平上携带不可检测的信息。通过大肠癌荟萃分析(CRC)数据集,我们确定了与疾病相关的亚种,其兄弟姐妹亚种没有。基于亚种的机器学习CRC诊断算法通过利用唯一的亚种级信息来优于物种水平的方法。该亚种目录允许鉴定基因,这些基因将亚种之间的功能差异作为机械理解微生物组 - 表型相互作用的基本步骤。
fi g u r e 2一系列推定的事件导致在另一个遥远相关的非目标物种中插入功能性基因驱动盒(如果没有杂交的情况下)。Div> dna以灰色为灰色和DNA,以温暖的颜色:粉红色:cas9基因,橙色:grna基因和棕色:相邻序列。是Draque方程的不同参数。在代表的情况下,一条线(长插入元素)和一个可转座元素(TE)用作同源指导修复的侧翼序列。请注意,也可以使用非目标主机中存在的其他序列
•本第四版的技术审查委员会辩论了持续使用样本(在第三版中作为标准用作),考虑到在写作和成本方面的效力时,请记住实践。•有许多论文比较不同的调查方法。许多人认为静态调查更有效(Stahlschimidt和Bruhl(2012),Braun de Torrezet al。(2017)和Teetset Al。(2019年),而其他人则得出结论,方法组合很重要(Perks and Goodenough(2021)。
利用两个线粒体 DNA 片段和六个核基因,我们确认了在西班牙西南部安达卢西亚(韦尔瓦市)捕获的一条形态中间的蛇,是雌性 Natrix astreptophora 和雄性 N. maura 的 F1 杂交种。这两个亲本物种在 2150 万年前分化,这就是它们的杂交能力惊人的原因。由于 N. astreptophora 的稀有性和西班牙西南部 N. maura 的数量丰富,使得 N. astreptophora 雌性很难找到同种雄性,因此促成了种间交配。面对之前发表的 N. astreptophora 和 N. maura 之间古老基因流动的基因组特征,我们的发现提出了一个问题:偶尔的杂交是否仍有助于这两个深度分化的古老类群之间持续交换遗传信息。
最初发表于:Jetzer, Tania;Studer, Luka;Bieri, Manuela;Greber, Urs;Hemmi, Silvio (2023)。B 和 C 类工程化人类腺病毒报告了早期、中早期和晚期病毒基因表达。《人类基因治疗》,34(23- 24):1230-1247。DOI:https://doi.org/10.1089/hum.2023.121
自生产和使用以来,化石燃料就影响了生态系统,从而对其生物多样性造成了重大损害。细菌生物修复可以为该环境问题提供解决方案。在这项研究中,新物种异翅目Peretonis sp。nov。在体外和硅分析中,在碳氢化合物降解和生物表面活性剂生产方面,已将4D.3 T与其他密切相关的物种进行了表征和比较。生物表面活性剂在微生物碳氢化合物降解中起着重要作用,通过乳化碳氢化合物并使其可用于微生物降解机制。进行的测试显示了所有菌株的阳性结果或多或少。在合成生物表面活性剂中,所有测试的菌株均显示出三种互补测定(CTAB,溶血和E 24%)中的生物表面活性剂活性,并且在大多数等异端菌菌株中都预测了在硅中的Rhamnolipid合成基因。关于碳氢化合物降解,所有分析的异翅目菌株都提出了推定的基因,这些基因负责芳香族和烷烃碳氢化合物的有氧和厌氧降解。总体而言,我们的结果突出了异翅目属的代谢多样性和生化鲁棒性,该属被认为在碳氢化合物生物修复领域中引起了人们的关注。
在最初发表的文章的版本中,第一和第二个隶属关系不正确,现在已被修改为农业与生物技术学院,吉安吉大学,杭州,中国,中国,国家生物学和水稻生物学和育种国家的主要实验室,农业和农业杂交生物学杂交生物学,ZHENG CORPATIAN和RACE繁殖。中国杭州。参考。14和30,该期刊名称被错误地赋予了农作物健康杂志,现在已被修改为作物健康。 这些更正已对本文的HTML和PDF版本进行了更正。14和30,该期刊名称被错误地赋予了农作物健康杂志,现在已被修改为作物健康。这些更正已对本文的HTML和PDF版本进行了更正。
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。它是制作
到2050年,预计全球97亿人口将增加粮食需求,特别是对于主食作物。气候变化,随着温度的极大波动,严重影响了在热带和亚热带地区生长的冷敏感亚洲大米(Oryza sativa L.)。因此,了解对冷应激具有独特耐受性的两个亚洲水稻亚种的响应机制对于提高作物的冷耐受而言很重要。因此,这项研究检验了我们的假设,以解决Japonica如何比Indica更好地忍受冷暴露:(1)Japonica有选择地调整抗氧化活性以相反的活性氧(ROS),而Indica迅速提高了抗氧化活性; (2)Japonica增加了抗氧化剂,以防止长时间暴露后的损害,而Indica未能这样做; (3)japonica减慢了吸水,以维持寒冷期间最少的光合作用,而Indica的摄取机制则被损害; (4)泛素化蛋白Osubc7的过表达可提高冷敏感剂的冷耐受性。要检验这些假设,本研究研究了两种不同冷处理下两种亚种采用的酶促抗氧化活性和水吸收策略。结果揭示了管理ROS和抗氧化活性的独特策略,Japonica表现出波动的抗氧化活性,以潜在地激活防御途径,而Indica表现出快速但可能过度且昂贵的ROS清除反应。此外,这项研究探讨了冷候选基因OSUBC7在冷应激反应和生产力中的作用。此外,观察到对比的水吸收模式,与japonica中度下降相比,Indica饰品在寒冷下显着降低,表明相对结果。在冷敏感康复中的OSUBC7过表达通过提高生长速率,糖代谢和叶绿素含量来增强植物对冷应激的韧性,最终有助于更有效的恢复和更高的生存能力。此外,Osubc7显示出潜在的开花和产量参与,这表明在生产力中起着有希望的作用。总而言之,这项工作证明了亚洲水稻亚种对冷压力的复杂反应机制,强调了ROS感知和管理的重要性,吸水策略以及改善冷应激耐受性的遗传因素。这些发现提供了对这两种亚种的自适应策略的见解,并有助于制定有效的策略,以提高波动环境中的作物冷耐受性。
